。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经Peer Review的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年2月16日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.02.12.12.637845 doi:Biorxiv Preprint
将大型 DNA 序列精确插入基因组的技术对于各种研究和治疗应用至关重要。大型丝氨酸重组酶 (LSR) 可以介导多千碱基 DNA 序列的直接、位点特异性基因组整合,而无需预先安装着陆垫,但目前的方法存在插入率低和脱靶活动率高的问题。在这里,我们提出了一个全面的工程路线图,用于联合优化 DNA 重组效率和特异性。我们结合定向进化、结构分析和计算模型来快速识别附加突变组合。我们通过供体 DNA 优化和 dCas9 融合进一步提高了性能,从而实现了同时招募目标和供体。顶级工程 LSR 变体在内源性人类基因座上实现了高达 53% 的整合效率和 97% 的全基因组特异性,并有效整合大型 DNA 货物(测试高达 12 kb),以在具有挑战性的细胞类型(包括非分裂细胞、人类胚胎干细胞和原代人类 T 细胞)中稳定表达。这种合理设计 DNA 重组酶的蓝图使得精确的基因组工程成为可能,而不会产生双链断裂。
非整倍性通常对细胞存活和生长构成挑战。然而,最近的研究发现了异倍性对某些调节基因突变的细胞有益的例外。我们的研究表明,缺乏纺锤体检查点基因BUB3的细胞表现出精选染色体的非整倍性。与野生型细胞相比,BUB3和BUB1的主轴检查点并不是萌芽的酵母,但BUB3和BUB1的损失增加了Chro Mosome错误分析的可能性。与普遍的假设相反,即由于生长缺陷,非整倍性细胞将胜任,我们的发现表明,bub3δ细胞在许多世代中始终保持特定染色体的脑倍倍倍。我们研究了这些额外的Chromo躯体在BUB3δ细胞中的持久性是由某些基因的有益表达升高而导致的,还是仅仅是耐受性。我们确定了涉及染色体分离和细胞周期调节的几个基因,这些基因赋予了对Bub3缺乏细胞的优势。总的来说,我们的结果表明,特定基因通过非整倍性的增益可能为染色体隔离保真度较差的菌株提供生存优势。
过去 20 年来,我们对基因调控特异性的认识发生了深刻变化。以前,人们认为调控因子控制着少数基因,通过“钥匙和锁”机制以精确的特异性识别。但最近,对调控因子结合位点占有率(无论是在 DNA 还是 RNA 靶标上)的全基因组探索揭示了每个研究调控因子的大量分子靶标列表。如此差的生化特异性表明每个调控因子控制许多基因,共同影响生物表型。在这里,我提出了第三种模型,即调控因子的生物特异性仅部分归因于“钥匙和锁”生物化学。相反,调控因子在微观尺度上影响许多基因,但大多数相互作用的生物学后果在中观尺度上被减弱:只有少数调控事件从微观传播到宏观尺度,其他调控事件因稳态机制而变得无关紧要。该模型得到了 microRNA 文献的充分支持,数据表明它扩展到其他调控因子。它一方面调和了来自生物化学和比较基因组学的矛盾观察结果,另一方面又调和了来自体内遗传学的矛盾观察结果,但这种概念上的统一却被常见的误解和违反直觉的图形显示模式所掩盖。要深刻理解基因调控,需要澄清概念,以及更适合的统计分析和图形表示。
在磁力-3研究(队列A)中,Elranatamab导致三级暴露的患者的ORR为61%,PFS的中位数为〜15个月,这些患者的中位数为5个先前的线。7靶向其他肿瘤抗原(IE,FC受体(例如5(FCRL5))和G蛋白偶联受体家族C第5组成员D [GPRC5D])在复发MM中也表现出令人鼓舞的活性。8最近,基于Monumental-1研究的结果,塔尔奎塔马布(Talquetamab)是另一位靶向GPRC5D的双重攻击性GPRC5D的Talquetamab。9,10在患有晚期,T细胞的患者中 - 重定向剂 - 未指导骨髓瘤(n = 145; 69%三级难治性,中位数为5个先前的线),tal- quetamamb(0.8 mg/kg bieweek)单位药物表现出72%的ORR为72%和中位数PF,为14个月14个月14个月。在暴露于T细胞 - 重定向剂(n = 51)的患者中,塔尔奎塔amab的ORR为64%,中位反应时间为11.9个月。尽管这种有利的效率证明了,但几乎三分之一的患者对双期治疗没有反应(初级分析)。此外,大多数用双科抗体治疗的反应患者最终会发展出疾病进展(获得性抗药性)。本综述旨在描述导致双感染性耐药性的肿瘤内部和肿瘤 - 肢体机制。
* 电子邮件:camille.benaroch@inria.fr 简介:运动想象 (MI) 任务调节 EEG 活动,尤其是在 α 和 β 频带 (8-30 Hz) 中。在 BCI 校准期间,通常使用数据驱动方法来选择这些频带中的特征,而很少考虑由此产生的人类表现。这种方法能达到最佳性能吗?为了回答这个问题,本研究调查了机器学习选择的特定受试者频带的特征(平均频率 (FB-Mean) 和长度 (FB-Length))与在线 BCI 用户表现之间的关系。
表型组学,即高维生物体表型分析,是一种量化复杂发育对高温反应的解决方案。'能量代理性状'(EPT)通过视频像素值波动来测量表型,即不同时间频率下的能量值谱。尽管它们已被证明可有效测量复杂且动态发育生物的生物学特性,但它们在评估不同物种的环境敏感性方面的效用尚未得到检验。利用 EPT,我们评估了三种淡水蜗牛胚胎的相对热敏感性,这三种蜗牛的发育事件时间存在显著差异。在 20°C 和 25°C 的两个温度下,每小时对 Lymnaea stagnalis、Radix balthica 和 Physella acuta 的胚胎进行视频拍摄,记录它们的胚胎发育过程。视频用于计算它们胚胎发育期间以及发育过程中各个生理窗口内的 EPT。发育过程中能量光谱的变化表明,不同物种之间的热敏感性存在明显差异,表明 R. balthica 胚胎的胚胎生理和行为总体敏感性相对较高,发育窗口特异性热响应反映了可观察生理的个体发育差异,以及温度引起的生理事件时间变化。EPT 可以比较高维光谱表型,为持续评估发育个体的敏感性提供了独特的能力。这种综合性和可扩展的表型分析是更好地了解不同物种早期生命阶段敏感性的先决条件。
“转录组(即内皮细胞中所含的 RNA)已经得到了相当全面的绘制,”慕尼黑大学医院中风和痴呆症研究所所长、SyNergy 卓越集群首席研究员、慕尼黑大学教授 Martin Dichgans 说道。“目前缺少的是细胞中完整蛋白质组(蛋白质组)的相应数据。”
神经性厌食症(AN)是一种精神病,特别影响着青少年,主要是女性。这种麻烦的特征是对体重增加和畸形恐惧症的强烈恐惧,这导致了严重的饮食修复和极端的体重减轻行为,例如清除和不适当的体育活动。这种麻烦也涉及认知和情感障碍(美国精神病学协会,2013年)。在当前的病理生理假设中,微生物群和低分率炎症会影响微生物群 - 核脑轴的饮食行为(Gorwood等,2016)。审查了微生物数据,并证明了丁酸酯产生物种的减少,有利于粘蛋白降解细菌(Di Lodovico等,2020; Prochazkkova等,2021)。甲烷摩托杆菌史密斯(Smithii)似乎与体重不足和营养不良的患者有关,并且与An相关。在最近的一项评论中显示了门的显着下降和介绍:与健康对照组相比,富公司的丰富性,尤其是罗斯伯里亚,乳酸菌,链球菌和闭合膜的丰度较低(Carbone等人,2021年)。微生物组中细菌丰度的差异出现在限制性和暴饮暴食的亚型之间(Montexone等,2021)。这种微生物状态可能会干扰原位营养代谢,并诱导较少的保护性粘液层。所有这些都会影响肠道屏障的生理,其次,低级有害系统性炎症(Seitz等,2020)。在An中的渗漏肠综合症上未显示共识数据。基于活性的动物模型表现出肠道通透性(Achamrah等,2016;Jésus等,2014),而人类的研究尚未揭示出肠道通透性标记的增加(Kleppe等,2022; Monteleone等,2004)。在疾病的早期阶段,免疫状态似乎是炎症性的。与健康的
蚊子依靠其微生物群进行B维生素合成。我们以前发现,埃及埃及第三类幼虫清除了其微生物群的发育受损,尤其是由于缺乏叶酸(维生素B9)。在这项研究中,我们发现饮食中的饮食补充饮食的补充含有七种B族维生素并不能改善蚊子的发育成功,而是对由此产生的成年人的性别比例产生了显着影响,并富集了雌性蚊子在Bivimin and bivimin治疗的幼虫中出现的雌性蚊子。对男性和雌性幼虫的转录组分析在维生素治疗后鉴定出某些性别调节的基因。在用单个B族维生素治疗无菌幼虫时,我们检测到与生物素(维生素B7)暴露有关的特定毒性作用。然后,我们提供了无菌幼虫的生物素剂量,并表明雄性对生物素毒性的浓度比女性敏感。gnotobiotic幼虫暴露于受控的低细菌数量或以较慢的生长为特征的细菌显示出雄性富含雄性的成年人口,这表明雄性比女性所需的细菌衍生的养分少于雌性。这些发现表明,在幼虫发育过程中,蚊子具有性别特异性营养要求和毒性阈值,这会影响成年人的性别比。