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深海海绵衍生的环境 DNA 分析揭示了偏远北极生态系统的底栖鱼类生物多样性
Agersnap, S.、Sigsgaard, EE、Jensen, MR、Avila, MDP、Carl, H.、Møller, PR、Krøs, SL、Knudsen, SW、Wisz, MS 和 Thomsen, PF (2022)。利用公民科学和 eDNA 宏条形码监测沿海海洋鱼类的国家级“生物多样性调查”。海洋科学前沿，第 9 卷，第 1-17 页。Altschul, SF、Gish, W.、Miller, W.、Myers, EW 和 Lipman, DJ (1990)。基本局部比对搜索工具。分子生物学杂志，第 215 卷，第 403-410 页。Ashelford, KE、Chuzhanova, NA、Fry, JC、Jones, AJ 和 Weightman, AJ (2005)。据估计，目前公共存储库中保存的 20 个 16S rRNA 序列记录中至少有 1 个包含大量异常。应用与环境微生物学，71，7724–7736。Auster, PJ (2005)。深水珊瑚是鱼类的重要栖息地吗？在 A. Freiwald 和 JM Roberts（编辑），冷水珊瑚和生态系统（第 747–760 页）。Springer Berlin Heidelberg。https://doi. org/10.1007/3–540–27673-4 Beng, KC 和 Corlett, RT (2020)。环境 DNA (eDNA) 在生态学和保护中的应用：机遇、挑战和前景。生物多样性与保护，29，2089–2121。Benson, DA (2004)。GenBank。核酸研究，33，34–38。Bessey, C.、Neil Jarman, S.、Simpson, T.、Miller, H.、Stewart, T.、Kenneth Keesing, J. 和 Berry, O. (2021)。被动式 eDNA 收集可增强水生生物多样性分析。通讯生物学，4，236。Brandt, MI、Pradillon, F.、Trouche, B.、Henry, N.、Liautard-Haag, C.、Cambon-Bonavita, MA、Cueff-Gauchard, V.、Wincker, P.、Belser, C.、Poulain, J.、Arnaud-Haond, S. 和 Zeppilli, D. (2021)。评估使用环境 DNA 估计深海生物多样性的沉积物和水采样方法。科学报告，11，7856。 Brodnicke, O.、Meyer, H.、Busch, K.、Xavier, J.、Knudsen, S.、Møller, P.、Hentschel, U. 和 Sweet, M. (2022)。出版物的采样元数据：“深海海绵衍生的环境 DNA 分析揭示了偏远北极生态系统的底栖鱼类生物多样性”。Zenodo。https://doi.org/10.5281/zenodo.7326708 Burian, A.、Mauvisseau, Q.、Bulling, M.、Domisch, S.、Qian, S. 和 Sweet, M. (2021)。提高 eDNA 数据解释的可靠性。分子生态资源，21，1422–1433。 Busch, K., Beazley, L., Kenchington, E., Whoriskey, F., Slaby, BM, & Hentschel, U. (2020). 玻璃海绵 Vazella pourtalesii 的微生物多样性对人类活动的响应。保护遗传学，21，1001–1010。Busch, K., Hanz, U., Mienis, F., Mueller, B., Franke, A., Roberts, EM, Rapp, HT, & Hentschel, U. (2020). 站在巨人的肩膀上：海山如何影响海水和海绵的微生物群落组成。生物地球科学，17，3471–3486。 Busch, K.、Slaby, BM、Bach, W.、Boetius, A.、Clefsen, I.、Colaço, A.、Creemers, M.、Cristobo, J.、Federwisch, L.、Franke, A.、Gavriilidou, A.,Hethke, A., Kenchington, E., Mienis, F., Mills, S., Riesgo, A., Ríos, P., Roberts, EM, Sipkema, D., … Hentschel, U. (2022)。全球深海海绵微生物组的生物多样性、环境驱动因素和可持续性。《自然通讯》，第 13 卷，第 5160 页。Cai, W., Harper, LR, Neave, EF, Shum, P., Craggs, J., Arias, MB, Riesgo, A., & Mariani, S. (2022)。圈养海绵中的环境 DNA 持久性和鱼类检测。《分子生态资源》，第 22 卷，第 2956-2966 页。Callahan, BJ, McMurdie, PJ, Rosen, MJ, Han, AW, Johnson, AJA, & Holmes, SP (2016)。 DADA2：从 Illumina 扩增子数据进行高分辨率样本推断。《自然方法》，13，581–583。Cárdenas, P.、Rapp, HT、Klitgaard, AB、Best, M.、Thollesson, M. 和 Tendal, OS (2013)。分类学、生物地理学和 DNA 条形码
意大利国家内部地区战略（SNAI）-IRIS
摘要：海洋化合物代表具有潜在抗癌作用的新药来源。在其中，包括属于Irciniidae家族的海绵，已被证明对不同的人类癌细胞发挥细胞毒性作用。在这里，我们第一次研究了从海绵，ircinia ramosa（Porifera，dictyocer-atida和irciniidae）提取物的治疗作用（称为ISP），对A375人类黑色素瘤细胞的治疗作用。我们发现ISP损害了A375黑色素瘤细胞的增殖，通过caspase依赖性凋亡诱导细胞死亡，并在细胞周期的G1阶段诱导了细胞，如流量细胞仪和QPCR分析所证明。使用DCF-DHA和线粒体探针观察到，ISP的促凋亡效应与ROS产生和线粒体调制的增加有关。此外，我们进行了伤口愈合，侵袭和克隆生成测定，发现ISP能够限制A375迁移，侵袭和克隆原性。重要的是，我们观察到，ISP处理调节了与EMT相关的上皮标记，E-CAD和N-CAD的表达，揭示了ISP在调节A375迁移和侵袭中的作用的机制。总的来说，这项研究提供了第一个证据，以支持Ircinia ramosa Sponge提取物作为治疗人类黑色素瘤的潜在治疗资源。
基于代谢组的多样性和生物学活性，从印度洋海绵Scopalina Hapalia分离出的微生物的优先级，以发现天然产物
1天然产品化学和生物技术实验室，科学技术学院，LaRénounionof LaréUnion，15 AvenueRenéCassin，CS 92003大道，CS 92003，CEDEX 09，97744法国SAINT-DENIS，法国2号，法国2瑞士3日内瓦大学药学学院，CMU-RUE MICHEL-SERVET 1，CH-1211 Geneva，瑞士4 4自然物质化学研究所（ICSN），CNRS UPR 2301，UNIVER 2301，UNIGERITURITUAL 2301，UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY，1，AV。 de la terrasse，Cedex，91198法国Gif-Sur-Yvette，5药物认知实验室，药学系，中心互联网互联网，li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament（cirm），李氏大学，夸蒂尔·H·皮塔尔（Quartier h），pitalier h pital pital hippocrate，hippocrate，hippocrate 15，bat，bat。 b36，校园du sart-tilman，B-4000 Liege，比利时 *通信：mireille.fouillaud@univ-reunion.fr1天然产品化学和生物技术实验室，科学技术学院，LaRénounionof LaréUnion，15 AvenueRenéCassin，CS 92003大道，CS 92003，CEDEX 09，97744法国SAINT-DENIS，法国2号，法国2瑞士3日内瓦大学药学学院，CMU-RUE MICHEL-SERVET 1，CH-1211 Geneva，瑞士4 4自然物质化学研究所（ICSN），CNRS UPR 2301，UNIVER 2301，UNIGERITURITUAL 2301，UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY，1，AV。de la terrasse，Cedex，91198法国Gif-Sur-Yvette，5药物认知实验室，药学系，中心互联网互联网，li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament（cirm），李氏大学，夸蒂尔·H·皮塔尔（Quartier h），pitalier h pital pital hippocrate，hippocrate，hippocrate 15，bat，bat。b36，校园du sart-tilman，B-4000 Liege，比利时 *通信：mireille.fouillaud@univ-reunion.fr
研究论文 LncRNA XIST 充当 MicroRNA-520 海绵，通过 CeRNA 网络介导 BAX 来调节 NSCLC 细胞中的顺铂耐药性
背景：近年来，LncRNA作为竞争性内源性RNA（ceRNA）的一员，在肺癌耐药中发挥着重要作用。本研究旨在利用全面的ceRNA网络识别顺铂耐药肺癌细胞的潜在生物标志物。方法：GSE6410（GPL-201）分析了A549 NSCLC细胞中顺铂耐药基因表达变化。GSE43249（GPL-14613）包括源自顺铂耐药A549肺细胞的非编码RNA表达谱。在线分析工具GEO2R分析了差异表达的mRNA和miRNA（DEmRNA和DEmiRNA）。为了探索差异表达mRNA的功能富集意义，我们使用了GO（基因本体）和KEGG（京都基因和基因组百科全书）通路分析。通过 miRDB、Targetscan、Starbase 和 miRWalk 寻找靶向 miRNA，采用 Kaplan-Meier 曲线法对靶向 RNA 的临床生存率进行分析（ P<0.05），Starbase 数据库预测了潜在的 lncRNA 介导的靶向 miRNA。最后利用 cytoscape3.7.2 构建了 lncRNA、miRNA、mRNA 的新型 ceRNA 网络。结果：118 个差异表达的 mRNA 构成了介导的 ceRNA 网络的基础。DAVID 和 Kaplan-Meier 筛选出凋亡调节因子 BAX，维恩图显示 8 个 miRNA 共同调控 BAX。Starbase 预测 lncRNA XIST 介导的 miRNA。最后，lncRNA XIST 可能是调节肺癌细胞顺铂耐药性的有用生物标志物，进一步探讨了 BAX 可能影响肿瘤浸润免疫细胞。结论：LncRNA XIST在BAX调控顺铂耐药过程中与miRNA 520竞争性结合，参与p53信号通路引起细胞凋亡。
孕妇小麦和毛豆粉复合蒸蛋糕的化学成分及感官评价
最佳怀孕的关键因素是能量平衡。世界卫生组织 (WHO) 指出，怀孕期间的建议能量摄入量为每天 200 至 300 千卡。毛豆富含有益的维生素和矿物质，是孕妇的重要蛋白质来源。蒸海绵蛋糕是印度尼西亚最受欢迎的小吃之一。本研究旨在表征毛豆蒸海绵蛋糕的化学成分和感官评价。本研究采用完全随机设计，分为三个配方阶段。小麦和毛豆粉的比例为 100:0（对照组）、75:25（配方 A）和 50:50（配方 B）。蒸海绵蛋糕是按照标准烘焙程序制作的。对所有毛豆蒸海绵蛋糕的变化都进行了近似分析、能量、纤维、矿物质和抗氧化活性。感官特性的接受程度由二十五名半标准小组成员进行评估。使用SPSS 25版进行数据分析，并使用de Garmo的有效性指数检验确定最佳配方。方差分析显示碳水化合物、脂肪、蛋白质、总能量、钙和所有感官参数均存在显著差异（p值≥0.05）。从营养价值和接受程度结果来看，配方A被选为最佳配方。配方A的蛋白质含量为7.01％，碳水化合物含量为45.55％，脂肪含量为3.27％，能量含量为239.63 kcal/100g。总纤维为3.33％，由可溶性和不溶性纤维组成。配方A在颜色、质地和普遍接受度方面也是评审员最喜欢的。一份配方A蒸毛豆海绵蛋糕（50克）的能量含量为119.82 kcal，满足孕妇孕中期所需额外能量的40％。
户外水上运动营活动计划
- 类似于鸭子、鸭子、鹅 - 围坐成一圈，一个人先拿一块满满的海绵，绕着圈子走，说“滴，滴，滴……”，让一小滴水滴到圈内人的头上 - 当他们到达他们想追的人时，他们会说“滴”，并将剩余的海绵挤到那个人的头上
评估伪细菌中基因表达的载体及其在Aplysina Marine Sponge研究中的应用多蛋白质结构与flodmason
蛋白质结构是超出序列的保守，这使得多重结构比对（MSTA）对于分析远距离相关的蛋白质必不可少。计算预测方法已大大扩展了我们可用蛋白质结构的存储库，需要快速准确的MSTA方法。在这里，我们介绍了一种渐进式MSTA方法，该方法利用了成对结构对准器Foldseek的结构字母，用于多次对齐数十万个蛋白质结构。foldmason计算置信度得分，提供交互式可视化，并在准确的结构预测时代提供了大规模蛋白质结构分析的必要速度和准确性。使用flaviviridae糖蛋白，我们证明了Foldmason的MSTAS如何支持暮光区下方的系统发育分析。foldmason是免费的开源软件：foldmason.foldseek.com和web服务器：search.foldseek.com/foldmason。