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在全球帕金森的遗传学计划（GP2）
引言帕金森氏病（PD）是一种具有复杂病因的多因素疾病。最大的全基因组关联研究（GWAS）包括37,688例病例，18,618例代理案例（未受影响的第一级亲戚）和140万个来自欧洲血统的控制，以及在78个基因组区域中确定的90个独立风险信号；其中38个是新颖的信号1。尽管有这些进展，但PD GWAS目前受到规模的限制，关注欧洲人群以及与临床表型数据的集成有限。基于2019 GWAS数据的功率计算表明，加入额外的〜99,000个案例将使效应大小较小的变体有助于多基因风险（p-值切断：1.35×10 - 3），以达到全基因组范围内的意义。因此，将PD GWA扩展到至少这种大小将导致识别额外的风险基因座并改善PD的遗传预测。可以使用双研究或统计遗传学方法来估计PD的遗传力，并被认为在欧洲人群中占22％至40％。已知的基因组广泛的基因座目前解释了PD 1的遗传力的16％。使用多基因风险评分分析（包括未达到基因组宽重要的基因座）表明，可能有大量的基因座导致尚未定义的PD风险。我们的功率分析表明，将需要99,000个PD病例以80％的功率定义基因座，次要等位基因频率为0.21，并且与当前的最新分析相似。在PD中观察到的表型的变异性可能具有遗传基础2 - 4。对基因型和临床结果之间关联的了解将使临床医生能够为患者提供更准确的预后。了解负责特定PD特征的基因到表型路径将提供一个机会，以开发针对表型的治疗
与零星的主要进行性失语症进行比较
主要的进行性失语症最常见的是一种零星的疾病，但在某些情况下，它可能是遗传性的。这项研究旨在与零星疾病中的规范非流动性，语义和徽标亚型相比，在原发性渐进性失语症的遗传形式的临床，认知和成像表型下。遗传原发性进行性失语症的参与者被从国际多中心遗传额颞痴呆痴呆倡议研究中巡回，并与健康对照组以及一群零星的原发性进步失语症进行了比较。使用遗传额颞痴呆倡议语言，行为，神经精神病学和运动量表评估症状。 参与者还接受了认知评估和3 t体积T1加权MRI。 一个C9ORF72（2％），1 MAPT（6％）和17 GRN（44％）有症状的突变载体诊断为主要进行性失语症。 在GRN队列中，有47％的人诊断出非流量变异的主要进行性失语症，而53％的原发性失语症综合征不符合三种子类型中的任何一个，称为诊断标准，称为原发性渐进性失语症。 遗传非流动变体的表型主要与零星的非浮雕变体主要进行性失语症重叠，尽管存在相关的非典型帕金森氏症综合征的存在是零星的特征，这是零星的特征和不是遗传疾病。 遗传和零星原发性进行性失语症之间存在重叠的症状使用遗传额颞痴呆倡议语言，行为，神经精神病学和运动量表评估症状。参与者还接受了认知评估和3 t体积T1加权MRI。一个C9ORF72（2％），1 MAPT（6％）和17 GRN（44％）有症状的突变载体诊断为主要进行性失语症。在GRN队列中，有47％的人诊断出非流量变异的主要进行性失语症，而53％的原发性失语症综合征不符合三种子类型中的任何一个，称为诊断标准，称为原发性渐进性失语症。遗传非流动变体的表型主要与零星的非浮雕变体主要进行性失语症重叠，尽管存在相关的非典型帕金森氏症综合征的存在是零星的特征，这是零星的特征和不是遗传疾病。遗传和零星原发性进行性失语症之间存在重叠的症状主要的渐进性失语症 - 而不是其他明智的群体与散发性亚型不同，在相对较大的表达中，语法/语法受损，以及其他语言缺陷。在遗传非流量变异的主要进行性失语组中，MRI在MRI上看到的萎缩模式与零星的非流动变体主要进行性渐进性失语群体重叠，尽管皮质的后部受累更加后，而较高的主要渐进性则与另外一项指定的群体相关，特别是在相关方面，特别是在彼此之间进行了互动，并且彼此之间存在着奇异的原则。还有眶额皮质和内侧颞叶的萎缩。
- novel-sporadic鼠标模型的开发 -
在数十年的AD研究中，动物模型是了解AD发病机理和测试治疗方法的调节机制的重要工具[9]。最常用的实验AD动物模型是基于啮齿动物的，并且通过过表达与家族性AD有关的遗传突变来产生转基因小鼠模型[10，11]。这些小鼠模型基本上显示了AD患者的某些关键组织病理学，但它们都没有捕获AD病理，生化和行为特征的各个方面[12，13]。此外，大多数基于遗传突变的家族性AD小鼠模型代表了人类AD患者永远不会发生的极端情况。因此，迫切需要模仿晚期AD的适当模型来弥合基础研究和临床翻译之间的差距。
阿尔茨海默氏病的遗传和零星形式的空间和单核转录组分析
阿尔茨海默氏病（AD）的发病机理取决于环境和可遗传的因素，其分子病因仍然不清楚。在这里，我们提出了对后期发作的零星AD和唐氏综合症（DSAD）的空间转录组（ST）和单核转录组调查。研究DSAD提供了一个机会，可以增强我们对AD转录组的理解，并可能弥合遗传小鼠模型和零星AD之间的差距。我们确定了可能是皮质层依次限定病理积累的转录组变化。空间共表达网络分析揭示了短暂性和区域限制的疾病过程，包括在皮质上层层中失调的神经胶质炎症程序，与AD遗传风险和淀粉样蛋白相关的过程有关。细胞 - 细胞通信分析在信号网络失调中进一步上下文化了该基因程序。最后，我们从淀粉样蛋白AD鼠标模型中生成了ST数据，以识别具有构象上下文的淀粉样蛋白淀粉样蛋白 - 淀粉样蛋白转录组的变化。
在常染色体显性和零星阿尔茨海默氏病中区分淀粉样ββ
淀粉样蛋白β沉积是散发性阿尔茨海默氏病和常染色体主导的阿尔茨海默氏病的标志性病变之一，后者是由淀粉样蛋白β处理中涉及的基因突变引起的。尽管淀粉样蛋白β沉积是散发性阿尔茨海默氏病和常染色体主导的阿尔茨海默氏病的核心，但这些阿尔茨海默氏病亚型的某些差异在与淀粉样ambeta的空间模式方面存在观察到。Previous work has shown that the spatial pattern of amyloid-beta in individuals spanning the sporadic Alzheimer ' s disease spectrum can be reproduced with high ac- curacy using an epidemic spreading model which simulates the diffusion of amyloid-beta across neuronal connections and is constrained by individual rates of amyloid-beta production and clearance.然而，尚未研究是否可以以相同的方式对稀有的常染色体式阿尔茨海默氏病中的淀粉样蛋白-Beta沉积进行建模，如果是这样，如果是这样，淀粉样蛋白贝塔（Alzheimer）的淀粉样蛋白β的传播模式多么一致。我们利用流行病扩散模型作为数据驱动的方法，用于探测淀粉样蛋白β的传播模式在三个不同的大型成像数据集中的淀粉样蛋白β传播模式（2种散发性阿尔茨海默氏病，1个常染色体典型的阿尔茨海默氏病）。我们分别评估了每个数据集中的个体和个体内模型性能，并进一步识别了淀粉样蛋白β扩散的最可能受试者特异性的表述。我们将流行病扩散模型分别应用于阿尔茨海默氏病神经影像学计划（n = 737），开放式成像研究系列（n = 510）和主要遗传的阿尔茨海默氏症网络（n = 249），其中后两个使用相同的管道处理。使用在零星阿尔茨海默氏病的先前作品中定义的epcentres，流行病扩散模型对所有三个数据集中的淀粉样蛋白β沉积的区域模式进行了适度的预测。我们进一步发现，虽然大多数淀粉样蛋白β的最有可能的中心 - 积极对象与默认模式网络重叠，但常染色体占主导地位的13％
miRNA 在综合征型和散发型升主动脉瘤中作为生物标志物和新型治疗策略靶点的关键作用
越来越多的证据表明，表观遗传学在调节所有类型主动脉瘤的发病机制中也起着关键作用。众所周知，表观遗传因素会调节基因表达。这种机制似乎很有趣，尤其是了解遗传易感性和遗传因素与主动脉瘤和散发性动脉瘤复杂病理生理学的关系；事实上，后者是遗传因素和可改变的生活方式因素（即营养、吸烟、感染、吸毒、饮酒、久坐的生活方式等）密切相互作用的结果。表观遗传因素包括 DNA 甲基化、翻译后组蛋白修饰和非编码 RNA。在这里，我们的注意力集中在 miRNA 在综合征型和散发型胸主动脉瘤中的作用。它们既可以作为生物标志物，也可以作为新治疗策略的靶点。
常染色体显性和零星阿尔茨海默氏症的白质超强度的病因
（1）马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州波士顿的马萨诸塞州妇女医院（2）华盛顿大学，位于美国密苏里州圣路易斯，美国密苏里州圣路易斯医学院，（3）美国梅奥诊所，放射学，美国明尼苏达州罗切斯特，美国明尼苏达州，印第安纳州阿尔茨海姆研究中心，印第安纳州印第安纳州纽约市，德国神经退行性疾病中心（DZNE）的临床脑研究，Tübingen，D-72076Tübingen，德国Tübingen，（6）埃默里大学医学院，乔治亚州亚特兰大，乔治亚州亚特兰大，（7）Neuroscience Research Australia，澳大利亚，澳大利亚，澳大利亚，澳大利亚，澳大利亚，澳大利亚；和新南威尔士大学的生物医学科学学院，澳大利亚新南威尔士州悉尼，（8）布朗大学布朗大学阿尔普特医学院，美国普罗维登斯，美国，（9）（9）Ludwig-Maximilians-universitätmunchen神经病学系，穆尼奇（Munich），Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich，Munich clister，Munich clister，Munich clister，Munich clister，Munich emich of Munich of Munich of Munich of Munichians-Universitätmuniversität阿根廷布宜诺斯艾利斯的Fleni神经学研究所（11）英国痴呆症研究所，UCL，伦敦，英国，英国，（12）梅奥诊所，美国佛罗里达州杰克逊维尔，美国密歇根大学，密歇根大学，密歇根州安阿伯，密歇根州安阿伯，美国密歇根州，
零星营养性侧硬化症的遗传变异性
随着基因疗法的出现，肌萎缩性侧索硬化症（ALS），基因测试激增了这种缓解。尽管在家族性ALS中，C9orf72，SOD1，FUS和TARDBP的基因测试经验丰富，但探索所有ALS相关基因（SALS）中所有ALS相关基因的遗传变异的大型研究仍然很少。鉴于SAL的复杂遗传结构，在诊断环境中的基因测试是具有挑战性的，其中有一些遗传变异型具有较大和小的效应大小。缺乏基因面板中遗传变异和患者律师律师的解释指南。我们旨在通过将美国医学遗传学和基因组学学院（ACMG）标准应用于全基因组测序数据，从6013个零星ALS患者和2411个匹配的Project Project对照组中，对ALS基因的遗传变异性进行了彻底的表征。我们研究了90个ALS相关基因的遗传变异，并应用了定制的ACMG标准来鉴定病原体IC和可能的致病变异。的变体。此外，我们使用扩展猎人工具确定了C9orf72，ATXN1，ATXN2和NIPA1中重复扩展的长度。我们发现C9orf72在5.21％的SALS患者中重复扩张。在50个ALS相关的基因中，我们没有识别出任何致病性或可能的致病性变异。在5.89％中发现了一种致病性或可能的致病变体，大多数在SOD1，TARDBP，FUS，NEK1，OPTN或TBK1中发现了大多数。在17.33％的病例中检测到ATXN1，ATXN2，NIPA1和/或UNC13A中的孤立危险因素。明显更多的病例至少携带了一种致病性或可能的致病性变异（优势比1.75; p值1.64×10-5）。在71.83％的情况下，我们没有找到任何遗传线索。 发现了2.88％的变体。 这项研究提供了大量萨尔群体中的致病性和可能致病性遗传变异的清单。 总体而言，我们在38个已知ALS基因中发现了11.13％的ALS患者中的病原和可能的致病变异。 与寡聚假说一致，我们发现在对照组合的情况下，变体的组合明显更多。 许多未知意义的变体可能会导致ALS风险，但是缺乏可靠识别和称重的诊断算法。 这项工作可以作为咨询和ALS基因面板组装的资源。 鉴于对ALS的基因测试的兴趣日益增长，需要进一步表征SAL的遗传结构。在71.83％的情况下，我们没有找到任何遗传线索。发现了2.88％的变体。这项研究提供了大量萨尔群体中的致病性和可能致病性遗传变异的清单。总体而言，我们在38个已知ALS基因中发现了11.13％的ALS患者中的病原和可能的致病变异。与寡聚假说一致，我们发现在对照组合的情况下，变体的组合明显更多。许多未知意义的变体可能会导致ALS风险，但是缺乏可靠识别和称重的诊断算法。这项工作可以作为咨询和ALS基因面板组装的资源。鉴于对ALS的基因测试的兴趣日益增长，需要进一步表征SAL的遗传结构。
散发性乳腺癌中的线粒体基因组
乳腺癌是女性中最常见的恶性肿瘤，大多数偶发地发生，没有遗传性倾向。然而，零星的乳腺癌比遗传形式的研究较少，迄今为止，几乎没有任何预测性生物标志物存在于前者。此外，尽管据报道线粒体DNA变异与乳腺癌有关，但人群中的发现并不一致。因此，我们就散发性乳腺癌患者和僧伽罗种族的健康对照（n = 60对匹配对）进行了一项案例控制研究，以表征与该疾病相关的编码区域变体并识别任何潜在的生物标志物。线粒体基因组在30对中进行了完全测序，并在其余30对中测序了选定的区域。使用了几种硅内工具来评估观察到的变体的功能意义。在患者和对照组中发现了许多变体。错误的义务变体是多态性或稀有变体。患者和健康对照组之间的患病率没有显着差异（与年龄，体重指数和绝经状态相匹配）。MT-Cyb，MT-ATP6和MT-ND2基因显示出更高的突变率。较高比例的绝经前患者带有错义和致病性变异。在基因中看到了错义变体的独特组合，这些组合主要发生在MT-ATP6和MT-CYB基因中。这种独特的组合仅在患者中发生在肥胖患者中很常见。线粒体DNA变异可能在肥胖和培育前的乳腺癌作用中起作用。分子动力学模拟表明，MT-CO3基因中的突变体，MT-ATP6基因中的T146a的突变体可能比其野生型对应物更稳定。
使用脑MRI MRI
图1在疾病的早期和晚期阶段，具有不同SCJD亚型患者的代表性扩散加权图像。（第一行）具有MM1亚型的患者的早期DWI，该患者在左顶叶皮层（包括前后节）和前额叶皮质丝带中表现出高强度。不同的MM1患者的晚期DWI显示出左脑半球的大多数皮质的不对称参与，与尾状头部，左扣带回和左岛群体结合。（第二行）患有MM2C亚型的患者的早期DWI，在左侧顶叶皮层中出现超强度，包括前神经。不同MV2C患者的晚期DWI显示皮质色带不对称受累；纹状体和丘脑被幸免。（第三行）患有VV1亚型的患者的早期DWI，在左顶皮层中表现高强度，左扣带回和绝缘。不同VV1患者的晚期DWI表现出大脑皮层和右纹状体的广泛不对称受累。thalami和大多数左脑皮质都幸免了。（第四行）MV2K亚型患者的早期DWI，他在纹状体的纹状体和微妙的双侧超强度中表现出了不对称的高强度。不同的MV2K患者的晚期DWI表现出纹状体和整个丘脑中不对称的高强度，以及左额叶皮层和岛菌的轻度参与。顶层皮质幸免。（最后一行）患有VV2亚型患者的早期DWI，在尾状的头部和壳质的前部出现了不对称的DWI高强度，以及丘脑中非常微妙的高强度。具有VV2的不同患者的晚期DWI显示了纹状体和丘脑的广泛超强度，以及左回扣和前额叶皮层。scjd，零星的克鲁特兹菲尔特 - 贾科布疾病； DWI，扩散加权成像。