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2。多素（蛋白质和RNA）的空间表型在苯酚融合2.0
5.2使用ViewRNA测定2.0上的ViewRNA分析，对肿瘤3和肿瘤4区域的靶向空间RNA分析。与HNSCC样品的肿瘤3相比，淋巴细胞激活和募集面板的标记在肿瘤4中高度表达[图A和B]。肿瘤4中CXCL9和CXCL13的局部模式表明，细胞因子通过募集CD8 T+细胞促进了抗肿瘤活性。同样，来自免疫激活和反应签名面板的RNA靶标位于肿瘤4中，包括干扰素[图C和D]。STAT1和CD3的定位表明激活了各种细胞过程，例如免疫反应和对靶向癌细胞靶向癌细胞的凋亡4。在肿瘤4中发现的成熟TLS中也发现了这些标记的较高定位[图E和F]。
通过胰岛炎中的脂质信号传导ADP-核糖基水解酶ARH3对β细胞死亡调节 1型糖尿病患者的24小时能量消耗 COVID-19患有先天免疫错误患者的疫苗接种可减少与COVID-19相关的住院和重症监护需求：USIDNET报告 对种子休眠和发芽中的小麦III类过氧化物酶基因基因锥虫基因的功能分析 成功的非整倍性（PGT-A）和单基因疾病（PGT-M）的成功组合植入前基因检测（PGT-M）用于肾移植后常染色体显性多囊肾脏疾病：病例报告
IL-1β + IFN-γ）持续48 h，（ii）在CT1上暴露于CT1的人类胰岛，以及（III）在糖尿病前（6周龄）与年龄匹配或小鼠的NOD小鼠的胰岛（III）胰岛。为了验证6周龄是否对应于NOD小鼠的初始T1D发育阶段，我们对NOD和NOR小鼠的胰岛进行了蛋白质组学分析（表S4-5），并将结果与Endoc-βH1细胞的蛋白质组学数据进行了比较。我们观察到炎症标记的上调，例如抗原转运蛋白TAP1，转录因子STAT1和干扰素诱导的鸟烯基结合蛋白GBP2（图S1）。没有样品降低胰岛素水平（图S1），证实了Nod小鼠的胰岛炎症，但仍处于糖尿病前期
长链非编码 RNA LUCAT1 是人类干扰素反应的负反馈调节剂
长链非编码 RNA 是包括免疫反应在内的生物过程的重要调节因子。lncRNA 的免疫调节功能主要在小鼠模型中得到揭示，而对 lncRNA 在人类免疫反应中的了解有限。在这里，我们鉴定出 lncRNA LUCAT1，它在受脂多糖和其他先天免疫刺激刺激的人类髓系细胞中上调。在髓系细胞中靶向删除 LUCAT1 会增加响应 LPS 的 I 型干扰素刺激基因的表达。相反，增加 LUCAT1 表达会导致可诱导的 ISG 反应降低。在活化细胞中，LUCAT1 在细胞核中富集，并与染色质结合。此外，LUCAT1 通过与细胞核中的 STAT1 相互作用来限制干扰素刺激基因的转录。总之，我们的研究强调了 lncRNA LUCAT1 作为诱导后反馈调节因子的作用，其功能是抑制人类细胞的免疫反应。
分析肠上皮细胞对隐孢子虫的反应突出了IFN-γ对寄生虫限制的时间影响
IFN-γ的产生对于控制多种肠道感染至关重要，但是它对肠上皮细胞（IEC）的影响尚不清楚。隐孢子虫寄生虫仅感染上皮细胞，并且干扰素激活IEC中转录因子Stat1的能力是寄生虫清除所必需的。在这里，在感染过程中使用单细胞RNA测序在感染过程中促进IEC，发现在感染过程中，脑海中肠细胞的比例增加，并诱导IFN-γ依赖性基因信号，而未感染和感染细胞之间是可比的。这些分析是通过体内研究补充的，这表明寄生虫对照需要IEC的IEC表达。出乎意料的是，用IFN-γ的IFNG - / - 小鼠的治疗表明对这种细胞因子的IEC反应与寄生虫负担的延迟减少相关，但不会影响寄生虫的发展。这些数据集提供了对IFN-γ对IEC的影响的洞察力，并提出了一个模型，其中IFN-γ信号传导对未感染的肠上皮细胞对于控制隐孢子虫很重要。
基于GWAS和转录组数据的生物信息学分析多发性硬化症和干燥综合征的共同机制及候选药物
结果：基于GWAS数据，发现14个枢纽共同易感基因（HLA-DRB1、HLA-DRA、STAT3、JAK1、HLA-B、HLA-DQA1、HLA-DQA2、HLA-DQB1、HLA-DRB5、HLA-DPA1、HLA-DPB1、TYK2、IL2RA、MAPK1），8种药物靶向2个或2个以上的基因，28条共同易感通路，15种药物靶向3个或3个以上的通路。基于转录组数据，发现3个枢纽共同DEG（STAT1、GATA3、PIK3CA）与3种药物，10条共同风险通路与435种药物。“JAK-STAT信号通路”同时被纳入共同易感通路和共同风险通路。 GWAS 数据和转录组数据中的药物有 133 个重叠，包括 JAK-STAT 抑制剂。此外，我们发现 IL2RA 和 HLA-DRB1 被确定为中心常见易感基因，是用于治疗 MS 的达克珠单抗和格拉替雷的靶点，这表明达克珠单抗和格拉替雷可能对 SS 有治疗作用。
针对巨噬细胞的代谢传感开关GPR84用于癌症免疫疗法
抽象引入是肿瘤微环境的主要组成部分之一，与肿瘤相关的巨噬细胞（TAM）具有对T细胞的深刻抑制活性，并促进肿瘤从免疫检查点阻滞治疗中逃脱。因此，将这种促肿瘤型转换为抗肿瘤的表型是增强对癌症的适应性免疫力的重要策略。然而，已经描述了癌症促肿瘤分化的大量机制，代谢转换为TAMS的抗肿瘤性特性是难以捉摸的。来自多个肿瘤模型的单细胞转录组数据的无偏分析的材料和方法，我们发现了抗肿瘤的TAMS唯一表达特异性脂肪酸受体的高度升高水平，G蛋白偶联受体84（GPR84）。小鼠中GPR84的遗传消融导致巨噬细胞的促炎极化受损，同时增强其抗炎表型。 相比之下，其激动剂（6-N- octylaminouracil（6-OAU））通过增强的STAT1途径激活了促炎表型。 此外， 6-OAU治疗显着降低了肿瘤的生长，并提高了抗PD-1治疗的抗肿瘤功效。 总体而言，我们报告了先前未欣赏的脂肪酸受体GPR84，它是策划抗肿瘤巨噬细胞极化的重要代谢感应开关。 GPR84的药理学激动剂有望重塑并逆转免疫抑制性TME，从而恢复癌症的反应性，以克服对免疫检查点阻滞的抵抗力。小鼠中GPR84的遗传消融导致巨噬细胞的促炎极化受损，同时增强其抗炎表型。相比之下，其激动剂（6-N- octylaminouracil（6-OAU））通过增强的STAT1途径激活了促炎表型。6-OAU治疗显着降低了肿瘤的生长，并提高了抗PD-1治疗的抗肿瘤功效。总体而言，我们报告了先前未欣赏的脂肪酸受体GPR84，它是策划抗肿瘤巨噬细胞极化的重要代谢感应开关。GPR84的药理学激动剂有望重塑并逆转免疫抑制性TME，从而恢复癌症的反应性，以克服对免疫检查点阻滞的抵抗力。GPR84的药理学激动剂有望重塑并逆转免疫抑制性TME，从而恢复癌症的反应性，以克服对免疫检查点阻滞的抵抗力。
利用微生物生产植物源抗癌药物
TME 和周围细胞中的 MHC-II + DCs。为了研究髓系细胞表达的 PD1 在骨髓生成和肿瘤生长中的作用，作者生成了髓系细胞特异性 PD1 缺陷小鼠。这些小鼠对肿瘤生长的抵抗力与整体 PD1 缺陷小鼠相同。与整体 PD1 缺陷小鼠类似，髓系细胞 PD1 缺陷小鼠在 TME 中表现出更少的 MDSC 和更多的巨噬细胞和 DC。髓系谱系承诺的这种免疫原性偏差与 IRF8 增加有关，IRF8 是一种与骨髓生成有关的主要转录因子。Strauss 等人的工作与之前的研究一致，表明 MDSC 诱导因子（如 G-CSF）下调 IRF8 会导致 TME 中的骨髓生成转向 MDSC [ 7 ]。 G-CSF 刺激缺乏 PD1 的 MPC 可增强 ERK1/2、mTORC1 和 STAT1 通路的激活，这些通路已知可促进免疫原性髓系分化。然而，还需要更多努力来阐明如何通过 IRF8 对缺乏 PD1 的 MPC 进行转录编程。
IFT88通过沿果蝇cilia
心脏免疫微环境的调节对于诸如心肌梗塞（MI）之类的缺血性事件后的恢复至关重要。内皮细胞（EC）可以具有免疫调节功能；然而，MI之后的EC与心脏中的免疫环境之间的相互作用仍然很少理解。我们确定了成人和小儿心力衰竭（HF）组织中的EC特定的IFN反应性和免疫调节基因特征。对经过MI的鼠心脏的单细胞差异分析发现了与人类HF中类似的免疫基因特征的EC人群（IFN-EC）。IFN-EC富含复制阶段的小鼠心脏，并表达编码免疫反应转录因子（IRF7，BATF2和STAT1）的基因。单细胞染色质可及性研究表明，在IFN-EC签名基因上，这些TF基序的富集。IFN-ECs通过IFN-ECs对免疫调节配体基因表达的表达表明，再生阶段心脏中IFN-EC和巨噬细胞之间的双向信号传导。我们的数据表明，EC可以在心脏损伤后采用免疫调节签名以伴随赔偿反应。这些特征在人类HF和鼠MI模型中的存在表明，EC介导的免疫调节在MI中急性损伤引起的应激和HF中慢性不良改造引起的应激方面具有潜在的作用。
唐氏综合症的基因表达研究
摘要：唐氏综合症是人类中研究良好的非整倍性疾病，与各种疾病表型有关，包括心血管，神经系统，血液学和IM-COMALOGITY疾病过程。本评论本文旨在讨论胎儿发育过程中基因表达研究的研究。进行了描述性综述，其中包括1960年9月至2022年9月在PubMed数据库上发表的所有论文。我们发现，在羊水中，发现某些基因（例如Col6a1和dscr1）受到影响，从而导致表型颅面变化。此外，还确定了其他基因，例如GSTT1，CLIC6，ITGB2，C21ORF67，C21ORF86和RUNX1在羊水中受到影响。在胎盘中，观察到了MEST，SNF1LK和LOX等基因的失调，这反过来影响了神经系统的发育。在大脑中，基因DYRK1A，DNMT3L，DNMT3B，TBX1，OLIG2和AQP4的失调已被证明有助于智力障碍。在心脏组织中，发现GART，ETS2和ERG基因表达失调会引起异常。此外，观察到Xist，Runx1，Son，Erg和Stat1的失调，导致骨髓增生性疾病。了解基因的差异表达提供了对DS遗传后果的见解。对这些过程的更好理解可能为发展遗传和药理学疗法的发展铺平道路。