在癌症,遗传和表观遗传学改变会导致转录程序失调,这使得癌细胞高度依赖基因表达的某些调节剂。这样的调节剂,例如转录因子(TFS),几乎是癌症的罪魁祸首(1)。例如,slug和蜗牛参与上皮到间质转变(EMT)(2),而STAT3是EGFR途径下游的主要效应器之一(3)。最近,非编码RNA(miRNA,LNCRNA等)已被揭示为重要的转录调节剂,其改变与多种机制有关,导致癌变,肿瘤进展或耐药性(4-8)。最新是一种关键现象,导致治疗失败并降低患者的生存率。大多数化学疗法药物都会诱导DNA损伤,最终促进癌细胞的死亡。转录因子或染色质调节剂的改变会影响肿瘤应对这种损害的能力,进而影响其生存率,从而使其对治疗具有抵抗力(9)。存在几个例子,但一个众所周知的情况是涉及核因子kappa b(nf-k b)蛋白。NF-K B途径的激活与多种化疗药物(包括氟嘧啶(10),紫杉烷(11)或白丁衍生物(12)中的多种化学疗法药物有关(12)。分别在thelastcase,TranscriptionFactorssuchasfoxo,Runx1andRunx2playimportanTrolersIntrolersIntrolerSinmediatiandimatianmediatiandimiatiation对Lapatinib,Quizartinib或Vemurafenib的抗性(14)。与化学疗法相似,抗药性治疗方法与癌细胞对这种药物的敏感性降低通常与驱动器癌基因的改变,关键信号通路的激活以及通过不同的信号传导途径(13)有关(13)。最近,基于免疫检查点阻塞的免疫疗法已被批准用于治疗几种恶性肿瘤,包括非小细胞肺癌,黑色素瘤或大肠杆菌癌具有微卫星不稳定的疾病(15)。尽管它们无疑且引人注目会导致某些环境,但肿瘤经常会对它们产生抵抗力。再次,转录调节剂已被证明参与了这种抗抑郁力。 STAT1调节在黑色素瘤中PD-L1的表达和RUNX1-ETO减少CD48,从而减少NK细胞杀伤(16)。此外
传染病每年导致全球超过 1700 万人死亡。[1] 当病原体进入宿主时,细胞因子和趋化因子充当宿主组织细胞和免疫系统之间信息交换的介质。[2] 多项研究报告称,在感染的早期阶段,血液中的促炎趋化因子会升高 [3,4],包括目前正在发生的 COVID-19 大流行。[5,6] 感染事件后细胞因子和趋化因子积累的时间曲线决定了宿主内感染的时间进程和严重程度。因此,监测细胞因子和趋化因子的时间曲线有助于症状前检测和患者分层,从而实现循证临床管理。干扰素诱导蛋白 (IP-10) 和肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体 (TRAIL) 与 C 反应蛋白 (CRP) 结合被认为是病毒或细菌感染患者高度相关的生物标志物。[7,8] 据报道,在细菌和病毒感染期间,这些生物标志物的血液水平会升高,从而导致包括脓毒症和急性呼吸窘迫综合征在内的严重疾病。[9] Oved 等人描述了 IP-10、TRAIL 和 CRP 的组合作为确定和分类细菌或病毒感染的分类方法。[7] 据报道,COVID-19 阳性患者的 IP-10 水平也有所升高。[10,11] 此外,在由 SARS CoV、SARS CoV2 和中东呼吸综合征 (MERS) 冠状病毒引起的严重急性呼吸综合征 (SARS) 中也观察到了 IP-10 水平升高。 [6,12—14] IP-10 被认为是呼吸道感染的明确标志,因为肺上皮气道细胞是 IP-10 的主要产生者。[13,14] 图 1 A 概述了涉及上皮细胞中 IP-10 产生的信号通路,该通路导致激活细胞防御。在受感染的宿主中,模式识别系统导致干扰素-γ 和肿瘤坏死因子-α (TNF-α) 的刺激,这反过来又通过 JAK/STAT1 机制导致 IP-10 的释放。[15] 这种机制激活 T h1 细胞对病原体攻击的先天免疫力。[16,17] TRAIL 在免疫疗法中起关键作用,在诱导细胞凋亡方面至关重要。[18,19] 图 1B 提供了
在GWAS基因座附近发现的从头变体的功能注释,有或没有left裂的嘴唇sarah W. Curtis 1,Laura E. Cook 3,Kitt Paraiso 3,Kitt Paraiso 3,Axel Visel 2,3,Axin L. Cotney 4,Justne L. Cotney 4,Justney 5 J. Leslie-Clarkson 1 * 1-人类遗传学系,埃默里大学医学院,亚特兰大,佐治亚州亚特兰大,30322 2-美国能源部联合基因组研究所,劳伦斯·伯克利国家实验室,加利福尼亚州伯克利,加利福尼亚州伯克利,3-环境基因组和系统生物学部,加利福尼亚州伯克利,加利福尼亚州伯克利。4- - 费城儿童医院,宾夕法尼亚州费城儿童医院研究所,19104年5月5日 - 爱荷华州爱荷华大学儿科学系,爱荷华州,爱荷华州,52242 6-流行病学系,约翰·霍普金斯·布卢姆伯格公共卫生部,巴尔蒂群岛,哥伦比亚省,约翰斯·霍普金斯·布卢姆伯格(Johns Hopkins Bloomberg)宾夕法尼亚州匹兹堡匹兹堡大学生物学,15261 8-匹兹堡大学人类遗传学系,宾夕法尼亚州匹兹堡,匹兹堡,15621 9-匹兹堡生物统计学和健康数据科学系,匹兹堡,匹兹堡,匹兹堡,宾夕法尼亚大学,15261年,宾夕法尼亚大学15261年。颅面出生缺陷,影响700分的分娩,有强大的遗传基础,家庭内部复发风险很高。 因此,我们从1,409个三重点重新分析了现有的DNV数据集,其OFC经过了已知的OFC相关基因座的靶向测序。 然后,我们通过在人类颅面发育过程中从预测的表观遗传功能数据集中提供了这些DNV的注释。- 费城儿童医院,宾夕法尼亚州费城儿童医院研究所,19104年5月5日 - 爱荷华州爱荷华大学儿科学系,爱荷华州,爱荷华州,52242 6-流行病学系,约翰·霍普金斯·布卢姆伯格公共卫生部,巴尔蒂群岛,哥伦比亚省,约翰斯·霍普金斯·布卢姆伯格(Johns Hopkins Bloomberg)宾夕法尼亚州匹兹堡匹兹堡大学生物学,15261 8-匹兹堡大学人类遗传学系,宾夕法尼亚州匹兹堡,匹兹堡,15621 9-匹兹堡生物统计学和健康数据科学系,匹兹堡,匹兹堡,匹兹堡,宾夕法尼亚大学,15261年,宾夕法尼亚大学15261年。颅面出生缺陷,影响700分的分娩,有强大的遗传基础,家庭内部复发风险很高。因此,我们从1,409个三重点重新分析了现有的DNV数据集,其OFC经过了已知的OFC相关基因座的靶向测序。然后,我们通过在人类颅面发育过程中从预测的表观遗传功能数据集中提供了这些DNV的注释。尽管以前的许多研究都将常见的,非编码的遗传基因座与OFC相关联,但在OFC案例中,先前对从头变异的研究(DNV)的研究重点是编码可能对蛋白质结构产生功能影响的变体,并且对非编码DNV对OFC形成的贡献也没有被忽略,并且已被忽略了。在预测的增强子或启动子区域内。两个DNV落在相同的增强子区域(HS1617)之内,这超出了偶然性的预期(p = 0.0017)。预计由这些DNV引起的序列变化将创建在转录因子PAX6和ZBTB7A的参考序列中未见的结合位点,并破坏了STAT1和STAT3的结合位点。该增强子区域与HHAT,SERTAD4和IRF6在同一拓扑相关的域内,所有这些区域都参与颅面发育。这三个基因在人神经rest细胞中高度表达。HHAT和IRF6的基因敲除小鼠具有异常的胚胎发育,包括left裂,IRF6及其周围的变体与人类OFC的非综合症和综合综合症形式有关。综上所述,这表明非编码DNV有助于OFC的遗传结构,在增强子区域中,OFC Trios的DNV负担在已知的OFC相关基因附近。总的来说,这增加了我们对OFC形成基础的遗传机制的理解。
缩写:5-FU,5-氟尿嘧啶;AA-CoA,花生四烯酸辅酶 A;ABCC1,ATP 结合盒,C 亚家族(CFTR/MRP),成员 1;ACC,无定形碳酸钙;ACLS4,酰基辅酶 A 合成酶家族 4;AdA-CoA,肾上腺酸辅酶 A;ALDH,醛脱氢酶;AML,急性髓细胞白血病;APC,抗原处理细胞;ARE,抗氧化反应元件;ART,青蒿素;BAX,BCL-2 相关 X 蛋白;BCL-2,B 细胞淋巴瘤 2;BTIC,脑肿瘤起始细胞;CBR,临床受益率;CLL,慢性淋巴细胞白血病;CNSI-Fe(II),碳纳米颗粒负载铁;CQ,氯喹;CRPC,去势抵抗性前列腺癌; CSC,癌症干细胞;CTL,细胞毒性 T 淋巴细胞;CuET,二乙基二硫代氨基甲酸铜 (II);DAMP,损伤相关分子模式;DFO,去铁胺;DHA,双氢青蒿素;DLAT,丙酮酸二氢硫酰赖氨酸残基乙酰转移酶成分;DMT1,二价金属转运蛋白 1;DOX,阿霉素;DRD2,多巴胺 D2 受体;DSF,双硫仑;EGFR,表皮生长因子受体;EMT,上皮-间质转化;ER,内质网;ETO,依托泊苷;FDX1,铁氧还蛋白 1;FER-1,铁抑制蛋白 1;FMN,基于框架的纳米剂;FPN1,铁转运蛋白 1;FTH1,铁蛋白重链 1; FTL1,铁蛋白轻链 1;GPX4,谷胱甘肽过氧化物酶 4;GSH,谷胱甘肽;GSS,谷胱甘肽合成酶;H 2 O 2,过氧化氢;HNC,头颈癌;HO-1,血红素加氧酶-1;ICD,免疫细胞死亡;ICIs,免疫检查点抑制剂;IDH1,异柠檬酸脱氢酶 1;IFN-γ,干扰素-γ;IREB2,铁反应元件结合蛋白 2;IREs,铁反应元件;IRP-2,铁调节蛋白 2;IRPs,铁调节蛋白;JAK,Janus 酪氨酸激酶;KEAP1,kelch 样 ECH 相关蛋白 1;KRAS,Kirsten 大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物;LA,硫辛酸; LC3II,微管相关蛋白 1 轻链 3α;LDH,乳酸脱氢酶;LiMOFs,锂基金属有机骨架;LIPRO-1,利普司他丁 1;LOX,脂氧合酶;LPCAT3,溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶 3;MDA,丙二醛;MFC-Gem,载吉西他滨的碳质纳米粒子;MGMT,甲基鸟嘌呤甲基转移酶;MMNPs,磁性介孔二氧化硅纳米粒子;MMP-2,金属蛋白酶-2;MnFe 2 O 4 ,锰铁氧体;mRNAs,信使 RNA;NEPC,神经内分泌前列腺癌;NF- κ B,活化 B 细胞的核因子 κ 轻链增强子;NFS1,半胱氨酸脱硫酶;NK,自然杀伤细胞; NOX,NADPH 氧化酶 1;NRF2,核因子红细胞 2 相关因子 2;NSCLC,非小细胞肺癌;OC1,耳蜗毛细胞;OS,总生存率;P62,隔离小体 1;PET,正电子发射断层扫描;P-GP,P-糖蛋白;PCC,持久癌细胞;PCN(Fe) MOFs,Fe 3 + 卟啉金属有机骨架上的 PEG;PD-L1,程序性死亡配体 1;PDAC,胰腺导管腺癌;PEG,聚乙二醇;PGE2,前列腺素 E2;PGRMC1,孕酮受体膜成分 1;PHPM,ROS 敏感聚合物;PTX,紫杉醇;PUFA,多不饱和脂肪酸;PUFA-OOH,磷脂多不饱和脂肪酸过氧化物;RIPK-1/2/3,受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1/2/3;ROS,活性氧;RR,反应率;siRNA,小干扰 RNA;siSLC7A11,SLC7A11 siRNA;SLC3A2,溶质载体家族 3 成员 2;SLC40A1,溶质载体家族 40 成员 1;SLC7A11,溶质载体家族 7 成员 11;STAT1,信号转导和转录激活因子 1;TAM,肿瘤相关巨噬细胞;TCA,三羧酸循环;TFR,转铁蛋白受体;TME,肿瘤微环境; TMZ,替莫唑胺;TP53,细胞肿瘤抗原 p53;TRADD,肿瘤坏死因子受体 1 型相关死亡结构域蛋白;TTP,进展时间;US FDA,美国食品药品管理局;UTRs,非翻译区;VDAC,电压依赖性阴离子通道;xCT,谷氨酸-胱氨酸反向转运蛋白;Z-VAD-FMK,羧苄氧缬氨酰丙氨酰天冬氨酰-[O-甲基]-氟甲基酮;γ-GCS,γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶。 * 通讯作者。电子邮箱地址:mateusz.kciuk@biol.uni.lodz.pl (M. Kciuk)。
