antoea物种在陆地和水生环境中都是无处不在的细菌,并且已经在动物,昆虫和人类中分离出来,尽管31种公认的物种(1)中的大多数都与植物相关(2)。先前在人类感染中报道的pantoea物种包括P. groclomer- Ans,P。ananatis,P。Brenneri,P。Calida,P。Comcpicua,P。dispersa,P。Eucrina和P. septica; P. groclomerans是最常见的(2)。P。Stewartii是Stewart在甜玉米和玉米中的枯萎病因,于1890年代后期首次被发现。研究人员根据宿主范围提出了2个亚种,基于宿主范围:Stewartii和Indologenes(3)。与Stewartii的亚种不同,亚种元素对玉米是非致病性的,而是在其他具有农艺意义的农作物中引起疾病,例如Foxtail Mil-Let-Let,Pearl Millet和洋葱。由于这种生物体(尤其是Stewartii的亚种)对经济上关键的作物构成风险,因此许多国家将P. stewartii归类为隔离有机体(4,5)。
摘要:亚马逊雨林是物种数量和众多的近卫生关系中的超多样性生态系统。为了表征占主导地位和经济重要的亚马逊物种,巴西坚果树(Bertholletia Excelsa Bonpl。),在基因组水平上,从单个个体的叶子中引发了高覆盖的长阅读测序数据。基因组组装揭示了一个意外的发现:两个可以分配给染色体的圆形重叠群和pantoea stewartii菌株的质粒。比较基因组学表明,该菌株属于独立元素亚种,并与从新热带棕榈bactris gasipaes kunth的患病叶片中分离出的其他菌株高度同步。对致病性相关基因的研究揭示了质粒中没有整个III型分泌系统基因簇,质粒否则与已知在Dracaena Sanderiana Mast中引起疾病的分离物的质粒高度相似。相反,检测到与植物生长有关的几种基因,包括参与吲哚-3-乙酸(IAA)产生的基因,磷酸盐溶解和辅助载体的生物合成。总而言之,我们报告了未经培养的Stewartii亚种的基因组。与巴西坚果树相关的植物菌株,并可能是植物生长的细菌。