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RFS+：一种临床适应性和计算高效的策略，用于增强脑肿瘤分割
摘要：从生态和功能的角度来看，Sanfranciscensis是一种酸味微生物群的重要且主导的细菌种类。尽管该物种在全球酸面团中的不同菌株的普遍存在，但仍需要阐明该物种的遗传多样性背后的驱动因素。在这项研究中，从酸面团样品中分离出14 f。sanfranciscensis菌株，以评估代谢性状的遗传多样性和变异。比较了这14个和31个其他菌株（从NCBI数据库获得）基因组。平均而言，基因组大小和GC含量的值分别为1.31 MBP和34.25％。在45 F. sanfranciscensis菌株中，每个菌株中存在162个核心基因和0至51个独特的基因。核心基因的主要功能与核苷酸，脂质转运和氨基酸以及碳水化合物代谢有关。核心基因的大小占14 F. sanfranciscensis菌株的泛基因组大小的41.18％，即0.70 Mbp为1.70 Mbp。参与碳水化合物利用和抗生素耐药性的14个菌株之间存在遗传变异。此外，还注释了与exodysac-achides生物合成相关的基因，包括epsabd，wxz，wzy。IIA型和IE CRISPR-CAS系统，Pediocin PA-1和Lacticin_3147_A1细菌素操纵子也在F. sanfranciscensis中发现。这些发现可以帮助选择理想的F. sanfranciscensis菌株来开发标准化的启动培养物进行酸面团发酵，并期望为消费者提供更高的质量和营养价值。
微藻菌株的隔离和表征能够在复杂的生物量水解物中生长的工业应用
在经济上生产藻类生物量仍然是商业化藻类产品的主要瓶颈之一。这项工作的目的是确定可以在纤维素废物流的成本效益培养基上生长的新藻类菌株，表征这些菌株产生高工业价值的化合物的潜力，并确定能够轻松遗传转化的菌株。在这里，我们报告说，在最初隔离的45个菌株中，根据它们有效生长有机废物（玉米秸秆水解物）作为碳源的能力；叶绿体sp。，desmodesmus sp。和衣原体Debaryana。在每种菌株上进行了未靶向的代谢组学，鉴定出具有商业兴趣的高相对可怕舞的代谢产物，例如乳酸，乳酸-2,3-二醇，氨基酸，氨基酸，tartaric酸，Tri酰基甘油以及含有不同的，单糖浆和多核的脂肪和多型脂肪酸的脂肪和脂肪酸的脂肪和脂肪，并依赖于脂肪酸，并依赖于脂肪酸盐，并依赖于脂肪酸。菌株还产生了工业相关性的碳水化合物。叶绿体sp。使用标准的简单转换方案在遗传上可以转化。这些结果表明，随着进一步的发展，这些菌株可以利用纤维素生物量的废物流进行高价值商业化合物的经济生产打开大门。
南瓜种子提取物的抗生素针对富含致癌细菌的强生物膜生产菌株的菌株
这项研究通过生态学方法来解决龋齿，强调使用天然成分保持平衡的口服微生物组并产生稳定的免疫口腔。关于微生物群落，饮食习惯和口腔卫生实践之间的相互作用，该研究突出了南瓜种子提取物的潜在益处，包括其抗炎性，抗菌和抗氧化特性。与传统的化学干预措施不同，这种方法促进了可持续和自然的口腔健康。这项研究使用了南瓜种子提取物和两种类型的细菌形式的天然成分，即Sanguinis ATCC链球菌ATCC 10556和嗜酸乳杆菌ATCC 4356，它们包括在强生生物膜生产国类别中。该研究使用的工具是一个微板读取器，波长为490 nm，用于在两种细菌中读取生物膜。这项研究的结果是，在45％南瓜种子提取物的浓度下，具有抗脂肪膜活性可抑制sanguinis at canguinis atcc 10556的生长（MBIC），价值为52.42％，其浓度为45％的45％南瓜种子提取物的浓度为60.6.60.6. 60.60.60.10.10.60.6 （MBEC）为51.45％。对于所有生物膜测量组，方差分析测试的结果均显着。这项研究得出的结论是，南瓜种子具有良好的抗生素活性，用于sanguinis stanguinis atcc 10566和嗜酸乳杆菌ATCC 4356。得出的结论是，南瓜种子含有L-精氨酸化合物，可以触发口腔环境中的变化到更稳态的pH。
对金黄色葡萄球菌菌株的比较分泌组分析，其内部疗法内感染患病率
抽象金黄色葡萄球菌是一种主要的病原体，导致奶牛内疗法内感染和乳腺炎。S.金黄色金黄色基因型（GT）的扩散和持续存在的能力可能很大。虽然毒力基因的关联与流行病学行为的关联尚不清楚，但已经假定了分泌蛋白的作用。我们表征了六个属于两个基因型的金黄色葡萄球菌菌株的分泌组，该基因型具有相反的Herd患病率，GTB（高）和GTS（低）（低），对应于序列类型（ST）8和398，这是通过高分辨率串联串联质谱和具有蛋白质组发现者的差异分析的。可通过具有标识符PXD029571的ProteOmeXchange获得数据。在720个已识别的蛋白质中，有98个在GTB/ST8中是独特或更丰富的GTS/ST398。GTB/ST8释放了更多的免疫球蛋白结合蛋白，补体和抗菌肽抑制剂，肠毒素和代谢酶，而GTS/ST398则释放了更多的白细胞素，血素，脂肪酶，脂肪酶和肽酶。此外，GTB/ST8释放了Von Willebrand因子蛋白，葡萄球菌酶和结块因子B，而GTS则释放了葡萄球菌凝结酶和结块。因此，GTB/ST8的秘密表明，与其流行病学特征一致的细胞损伤和炎症的免疫逃避和慢性倾向以及GTS/ST398的秘密群。因此，GTS/ST398分泌物在体外对牛PBMC的细胞毒性明显更大。我们的发现证实了细胞外毒力因子在金黄色葡萄球菌发病机理中的关键作用，并强调了研究其差异释放的必要性，从而增加了基因运输量，以更好地理解金黄色葡萄球菌基因型与阶段的生物学行为的关系，并可能是疾病的严重性。
野生乳酸杆菌菌株的基因组表征揭示了较低的多样性，但典型性
摘要：研究给定物种的多样性可以为自动启动培养物的发展提供线索。然而，很少有研究集中在乳酸杆菌delbrueckii菌株的种内多样性上，这是一种对乳制品行业技术上重要的乳酸细菌。出于这个原因，分离并表征了来自圣尼克尔保护的原产地名称（PDO）区域的乳酸杆菌菌株。遗传多样性是基于核心基因组系统发育重建和pangenome分析确定的，而表型评估涵盖了蛋白水解和挥发性复合生产潜力。总共15 L. delbrueckii ssp。乳酸化获得了独特的新菌株。遗传分析和进一步的蛋白水解活性测量表明，这些圣奈克菌株之间的变异性较低，而在Delbrueckii SSP中观察到了实质性的遗传变异性。乳酸亚种的整体。菌株之间的挥发性化合物纤维略有不同，一些菌株产生的挥发性化合物可能会引起奶酪伏鸟的发育特别感兴趣。与总体亚种的多样性相比，圣奈克菌株之间的遗传多样性相对较小，它们的独特特征和与公开可用的基因组的明显分化将其定位为开发自卫星启动培养奶酪生产的有前途的候选者。
新型的野生型Pediococcus和Lactiplantibacillus菌株作为益生菌候选者，以管理与肥胖相关的胰岛素抵抗
1分子生物学与遗传学系，德拉斯民主大学，希腊68100 Alexandroupolis； swmalouparaskevi@gmail.com（P.S.）; iprapa@mbg.duth.gr（i.p.）; elastyl@gmail.com（E.S.）; aikspiridopoulou@gmail.com（K.S.）; gskavdis@mbg.duth.gr（G.S.）; mgrigor@mbg.duth.gr（M.E.G.）2克里特岛克里特大学医学院实验室医学系临床化学实验室，希腊克里特岛71003； eleftheriaier@hotmail.com（e.i。 ）; tsatsani@uoc.gr（C.T。） 3应用技术中心应用科学研究所，希腊塞萨洛尼基57001； riafeidaki@gmail.com（k.f. ）; Argiriou@certh.gr（A.A.）4阿埃吉亚大学食品科学与营养系，希腊81400，希腊5 QLC，26442 Patras，希腊； panas@qlc.gr 6分子生物学与生物技术研究所，希腊赫拉克里昂71100 *通信：ikourkou@mbg.duth.gr;电话。 ： +30-25510-30633†这些作者对这项工作也同样贡献。2克里特岛克里特大学医学院实验室医学系临床化学实验室，希腊克里特岛71003； eleftheriaier@hotmail.com（e.i。）; tsatsani@uoc.gr（C.T。）3应用技术中心应用科学研究所，希腊塞萨洛尼基57001； riafeidaki@gmail.com（k.f.）; Argiriou@certh.gr（A.A.）4阿埃吉亚大学食品科学与营养系，希腊81400，希腊5 QLC，26442 Patras，希腊； panas@qlc.gr 6分子生物学与生物技术研究所，希腊赫拉克里昂71100 *通信：ikourkou@mbg.duth.gr;电话。： +30-25510-30633†这些作者对这项工作也同样贡献。
留尼汪岛新分离的 Dysmorphococcus 菌株作为高价值类胡萝卜素潜在来源的研究
摘要：某些次级类胡萝卜素，如虾青素和角黄素，在人类营养、食品、健康和化妆品以及饲料和水产养殖领域具有越来越大的经济价值，特别是因为它们具有多种生物活性，例如其显著的抗氧化特性。本研究致力于评估在光生物反应器中培养从留尼汪岛生物多样性中新分离的 Dysmorphococcus 菌株以生产这些有价值的叶黄素的可行性。结果表明，所有这些菌株都能够在环境压力下产生和积累角黄素和虾青素。其中，一株与其他 Dysmorphococcus 菌株相比，其形态、遗传和生化特性非常有趣，在 3 L 台式光生物反应器中进一步培养，发现其产生的富含类胡萝卜素的生物质浓度最高，产量分别约为 4 g L − 1 dw 和 0.055 g L − 1 d − 1 dw。我们还发现，生物质中含有高达 1.2 mg g − 1 dw 的角黄素和 0.7 mg g − 1 dw 的不同形式的虾青素，主要是虾青素单酯。我们发现这些类胡萝卜素的生产率低于之前报道的其他微藻物种的生产率，我们建议需要进一步优化培养和胡萝卜素生成诱导过程，以提高生产率，并使这种局部分离的 Dysmorphococcus 菌株可用于未来商业化生产天然角黄素和虾青素。
limosilactobacillus reuteri菌株PTA-126787和PTA-126788对酒精诱导的泄漏肠模型中肠屏障完整性和免疫稳态
肠壁是第一道防线，可防止从管腔进入系统环境的各种有害物质。障碍功能受损，随之而来的有害物质转移到系统性循环（“渗漏肠”）中是许多胃肠道，自身免疫，心理和代谢疾病的中心主题。益生菌已成为维持肠道完整性并解决“肠道渗漏”的有前途的策略。在体内分析中使用硅，体外和鸟类，我们先前表明，从肉鸡鸡具有良好的安全prifiles具有良好的安全性。与最近的一项研究一致，在这里我们表明，路易特林。每天对Sprague Dawley大鼠大鼠进行高剂量的高剂量R. Reuteri 3630和3632，但发现没有不良影响是安全的。更重要的是，通过下调炎症细胞因子并上调鼠标渗漏肠胃肠道肠道肠道的抗炎细胞因子，通过下调炎症细胞因子和上调抗炎细胞因子，从而显着降低了与酒精诱导的肠道相关的标记。而L. reuteri 3630细胞和上清液没有激活，但L. reuteri 3632细胞但没有上清液显示AHR的激活，AHR是调节肠道和免疫稳态的关键转录因子。L. reuteri 3630在乳酸杆菌物种的典型形态学中是奶油白色，而L. reuteri 3632显示出独特的橙色色素沉着，即使在传播了480代后，也稳定。我们确定了L. Reuteri 3632中的稀有聚酮化合物生物合成基因簇，该基因可能编码为橙色颜料的二级代谢产物。类似于Reuteri 3632细胞，纯化的橙色代谢物激活了AHR。全部，这些数据提供了有关系统发育相关性，安全性，功效的证据，以及R. Reuteri 3630和3632的可能作用机理之一，用于潜在的益生菌应用，以解决人类中“漏水”和相关的病理。
liječenjeuznapredovalog zatajivanja srca
这项研究的目的是评估从土耳其Tulum分离的乳杆菌科的益生菌特性。十种乳杆菌科的菌株。在分类学上识别如下：lactiplantibacillus plantarum subsp。plantarum（6），乳酸乳杆菌（2），乳酸酶乳杆菌（1）和乳酸乳酶casei（1）。评估了它们的益生菌特性，抗菌活性以及对模拟胃肠道状况（例如低pH，胃蛋白酶，胰岛素和胆汁盐）的耐受性。结果表明，10种乳酸细菌菌株具有较高的自动聚集，凝聚和疏水性能。抗生素耐药性和溶血活性确定用于菌株的安全评估。 还检测到表现出高抗菌活性的选定分离株和去除胆固醇的能力。 这些细菌也具有抗氧化活性。 因此，这十种提取的乳酸细菌是有望用作益生菌的潜在候选者。 在这项综合研究中，发现了Plantarum Sm27，L。plantarum S74和L. paracasei Ru39-7具有最好的益生菌特性。 有关从传统发酵的图卢姆奶酪中分离出的乳酸杆菌科的益生菌和功能特性的重要信息，这些乳酸菌株可用作丰富的益生菌细菌来源。 发现可以将益生菌细菌与传统发酵奶酪分离。抗生素耐药性和溶血活性确定用于菌株的安全评估。还检测到表现出高抗菌活性的选定分离株和去除胆固醇的能力。这些细菌也具有抗氧化活性。因此，这十种提取的乳酸细菌是有望用作益生菌的潜在候选者。在这项综合研究中，发现了Plantarum Sm27，L。plantarum S74和L. paracasei Ru39-7具有最好的益生菌特性。有关从传统发酵的图卢姆奶酪中分离出的乳酸杆菌科的益生菌和功能特性的重要信息，这些乳酸菌株可用作丰富的益生菌细菌来源。发现可以将益生菌细菌与传统发酵奶酪分离。
在连续培养中进化的大肠杆菌菌株甲酸属依赖型的遗传和生物催化基础
Valley Delmech，Nadia Perthat，Oriane Monet，外国Marion，Darii Ecataria和Al。插入Methabolia，2022，72，pp.200-214。10.1016/j.ymben.2022.03.010。