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相关的pp2c磷酸酶PIC3和PIC12对番茄的免疫力负调节丁香假单胞菌的免疫力
。cc-by-nd 4.0国际许可在A未获得Peer Review的认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（本版本发布于2024年5月13日。; https：//doi.org/10.1101/2024.02.02.08.579555 doi：biorxiv Preprint
丁香假单胞菌和柔软腐烂的果皮细菌种群的比较丰度和多样性在整个Durance河流集水区中从其法国阿尔卑斯山到其delta
河流，小溪，溪流是在将源头与插座连接起来的土地覆盖物中发生的生物，化学和物理过程的集成商。在流域中人类和动物病原体的动态已在各种情况下进行了广泛研究，从而优化了疾病风险的降低。并行，有一种新兴的意识，即可能还可以通过地表水传播作物病原体，尤其是在用于灌溉时。但是，在整个过程中，没有关于潜在的植物病原体存在的程度 - 也没有关于其动态的程度。在这里，我们比较了假单胞菌（PSY）和软腐烂的果皮杆菌（SRP）种群的季节性动态，沿着Durance River的270公里，从上游高山河（Alpestream Alpine）到达了与Rhone河的下游农业生产区。在2016年和2017年秋季，冬季，春季和夏季在21个地点收集的168个样品中，在所有采样地点均检测到PSY菌株，在人口密度的156个样品中，在最高10 5细菌L -1的人口密度下都检测到PSY菌株。相比之下，在98个样品中检测到SRP菌株，主要来自河的南部，人口密度不超过3´10 4细菌L -1。在每个采样位点表征的生物学和化学参数中，温度是唯一解释了两个物种复合物种群大小的可变性的唯一因素。PSY密度随温度升高而降低，而SRP密度随温度升高而增加。SRP的河流种群主要由多功能胸膜杆菌和水生假子组成，它们的流行病学重要性鲜为人知。仅观察到少数几个因其流行病学影响而被称为其流行病学影响的果蝇菌株。相比之下，所有地点的PSY种群都是由从其他研究中以广泛宿主范围及其地理和栖息地无处不在的遗传谱系为主的。我们的观察结果表明，可以利用对SRP的河水进行监视来发出诊断和管理反应，以避免疾病爆发。相反，由于这组细菌，由于没有规则和广泛的疾病暴发，整个集水区的持续存在表明，监视应集中在土地使用，河水条件和农艺学实践的未来变化上，这些实践可能会破坏当前在检查中持Psy暴发的机制。
评估控制溃疡病植物的几种策略......
丁香假单胞菌引起的疾病 Reyhaneh Ravanbakhshian-HabibAbadi、Mandana Behbahani*、Hassan Mohabatkar 伊斯法罕大学生物科学与技术学院生物技术系 摘要 丁香假单胞菌是一种革兰氏阴性细菌，可导致多种植物的多种疾病。抑制丁香假单胞菌生长的策略包括保护性措施；然而，由于其传播迅速，控制这种疾病很复杂。若干抗菌剂可以预防这种疾病，如化合物、生物制剂、次生代谢产物、纳米颗粒、噬菌体和抗菌肽 (AMP)。控制这种疾病最有效的方法是化学防治。使用铜化合物和抗生素是减轻溃疡病症状的常规做法。然而，由于化学品和杀菌剂造成的环境污染以及丁香假单胞菌不同致病变种的耐药性，需要其他的细菌病原体控制方法。在体外条件下，使用拮抗细菌的生物防治已显示出对抗丁香假单胞菌的良好效果。新的研究重点是利用植物的次生代谢产物来控制植物疾病。研究表明，当精油被像中孔二氧化硅这样的纳米粒子保护着免于降解和蒸发时，可以提高它们的抗菌活性。使用纳米粒子，尤其是银，是控制丁香假单胞菌的一种合适策略。然而，高浓度的银纳米粒子是有毒的。建议使用噬菌体和 AMP 作为控制农业细菌感染（包括丁香假单胞菌）的替代品。噬菌体和次生代谢产物的联合治疗已显示出更高的功效，有可能克服抗药性。然而，噬菌体和 AMP 价格昂贵且有限。最后，使用低浓度的次生代谢产物和纳米粒子具有经济效益和抗菌活性，而没有植物毒性。关键词：生物制剂；次生代谢产物；纳米粒子；噬菌体；抗菌肽简介 丁香假单胞菌是一种革兰氏阴性微生物，可导致植物发生各种疾病，包括一些水果、谷物和花卉，导致斑点、斑块和枯萎病等疾病 [1, 2]。丁香假单胞菌有两个有组织的生长阶段：附生阶段，此时细菌生活在植物组织的外部部分（通常在地上）；内生阶段，此时细菌进入植物组织并接管细胞间质外体空间 [3]。宿主中形成的病变与群体感应控制的毒力因子有关 [4]。
GACA调节共生并介导假单胞菌中的生活方式过渡
pseudomonas stutzeri rch2 pseudomonas sp。WCS358假单胞菌sp。ch409 syringae dc3000假单胞菌syringae es4326假单胞菌fuscovaginae irri 6609 pseudomonas fuscovaginae fuscovaginae se-1 pseudomonas psseudomonas protegens Protegens Pf-5 pseudomonas sp。pb100 pseudomonas sp。pb105 pseudomonas simiae wcs417 pseudomonas sp。WCS374假单胞菌sp。N2E3假单胞菌sp。CH267假单胞菌sp。 CH235荧光菌群PF0-1假单胞菌sp。 CH229假单胞菌sp。 PB103 Pseudomonas sp pb106 pseudomonas vancouverensis dha51 pseudomonas sp.gw456-l13 pseudomonas sp。 PB101假单胞菌sp。 UW4假单胞菌sp。 PB120假单胞菌sp。 N1B4假单胞菌DF41假单胞菌伪虫sp。 N2C3假单胞菌sp。 N2E2假单胞菌sp。 WCS365假单胞菌NFM421铜绿假单胞菌PA14 PSEUDOMONAS铜绿假单胞菌PAO1 pseudomonas eruginosa eruginosa lesb58CH267假单胞菌sp。CH235荧光菌群PF0-1假单胞菌sp。CH229假单胞菌sp。 PB103 Pseudomonas sp pb106 pseudomonas vancouverensis dha51 pseudomonas sp.gw456-l13 pseudomonas sp。 PB101假单胞菌sp。 UW4假单胞菌sp。 PB120假单胞菌sp。 N1B4假单胞菌DF41假单胞菌伪虫sp。 N2C3假单胞菌sp。 N2E2假单胞菌sp。 WCS365假单胞菌NFM421铜绿假单胞菌PA14 PSEUDOMONAS铜绿假单胞菌PAO1 pseudomonas eruginosa eruginosa lesb58CH229假单胞菌sp。PB103 Pseudomonas sp pb106 pseudomonas vancouverensis dha51 pseudomonas sp.gw456-l13 pseudomonas sp。PB101假单胞菌sp。UW4假单胞菌sp。PB120假单胞菌sp。N1B4假单胞菌DF41假单胞菌伪虫sp。N2C3假单胞菌sp。 N2E2假单胞菌sp。 WCS365假单胞菌NFM421铜绿假单胞菌PA14 PSEUDOMONAS铜绿假单胞菌PAO1 pseudomonas eruginosa eruginosa lesb58N2C3假单胞菌sp。N2E2假单胞菌sp。 WCS365假单胞菌NFM421铜绿假单胞菌PA14 PSEUDOMONAS铜绿假单胞菌PAO1 pseudomonas eruginosa eruginosa lesb58N2E2假单胞菌sp。WCS365假单胞菌NFM421铜绿假单胞菌PA14 PSEUDOMONAS铜绿假单胞菌PAO1 pseudomonas eruginosa eruginosa lesb58
植物
摘要：研究表观遗传调控与抗生物胁迫之间的关系为植物保护和作物改良提供了替代方法。为了阐明番茄对灰葡萄孢菌的反应机制，我们进行了染色质免疫沉淀 (ChIP) 分析，结果显示沿着早期诱导基因 SlyDES、SlyDOX1 和 SlyLoxD（编码氧化脂质途径酶）以及 SlyWRKY75（编码激素信号转录调节剂）的 H3K9ac 标记增加。这种组蛋白标记比之前研究的 H3K4me3 分布更为明显。RNAPol-ChIP 分析反映了与组蛋白修饰增加相关的实际基因转录。抗 P. syringae 的氧化脂质相关基因中标记的不同模式支持病原体特异性谱，而 SlyWRKY75 中没有出现显著差异。内含子结合 miR1127-3p 对 SlyWRKY75 的表观遗传调控得到了对照植物中 SlyWRKY75 前 mRNA 存在的支持。有趣的是，研究发现，在 B. cinerea 和 P. syringae 的响应下，mRNA 会积累，而 miRNA 的减少只发生在 B. cinerea 上。内含子区域呈现出与两种致病系统中的基因其余部分相似的标记模式，B. cinerea 上的 miRNA 结合位点的 H3K4me3 除外。我们定位了编码 Sly-miR1127-3p 的基因，该基因在 B. cinerea 的启动子上呈现出降低的 H3K4me3。
研究用微生物定植的微塑料的冰成核活性
微塑料（MPS）是一种新兴的污染物，具有许多未知的健康和环境后果。MPS进入环境后，它们会暴露于自然风化中，这可以改变其润湿性并增加其裸露的表面积。表面积的增加为微生物提供了底物，进而改变了MPS的表面特征。此外，在沉积之前，可以轻松地将MPS雾化和长距离进行。当MP在大气中，它们不仅与其他污染物相互作用，而且还可以充当冰核颗粒（INP），为云形成和影响降水提供了基础。实际上，最近的一项研究发现云中存在的MP。To evaluate the hypothesis that MPs may act as INPs, polystyrene microplastics varying in size (1 µ m to 100 µ m) and surface roughness were subjected to a freezing droplet assay from 0 ◦ C to approximately -14 ◦ C. A subset of these MPs were then added to the culture of a known bacterial ice nucleator, Pseudomonas syringae , which has been shown to play a role in水周期。这些用丁香假单胞菌培养的MP也暴露于相同的冷冻液滴测定中，并将结果与单独的MPS进行比较。我们的结果表明，MPS上生物膜的大小，粗糙度和存在会影响其作为INP的能力。这些结果对在整个环境中建模MPS及其对云和气候的影响有影响。
RNP复合物对细菌的作物保护...
•含有Cas9和GRNA的纳米配方，将外源喷涂到感染植物上。•核糖核蛋白（RNP）络合物的递送，该复合物靶向特定细菌毒性基因HRPX，HRPG，HRPB和HOPP1。•用于不同疾病的GRNA复合物的个体或组合。•所提出的技术靶向病原体毒力因子，以防止细菌枯萎病，导致小米的xanthomonas oryzae pv oryzae（XOO）在水稻上，细菌斑点，引起丁香肌pv。番茄dc3000在拟南芥和细菌枯萎病上，在马铃薯上引起拉尔斯托尼亚溶剂。•RNPS纳米配方具有增强的渗透和效率。•将RNP应用的管道和SOPS靶向细菌中的其他基因
茉莉酸的生物合成和信号传导机制的演变
假单胞菌丁香和早期的土地植物谱系。Curr Biol 29：2270-2281。iChihara，I，Shiraishi，K，Sato，H等。 （1977）冠状动脉结构。 J AM Chem Soc 99：636-637。 Inagaki，H，Miyamoto，K，Ando，N等。 （2021）在Momilactone中解密的OPDA signaling成分 - 产生苔藓的calohypnum plumiforme。 前植物科学12：688565。 Katsir，L，Schilmiller，AL，Staswick，Pe等。 （2008）COI1是jasmonate和细菌毒力性冠状动脉的受体的关键成分。 Proc Natl Sci Acad USA 105：7100-7105。 Koeduka，T，Ishizaki，K，Mwenda，CM等。 （2015）来自利弗沃特的牛龙氧化物合酶的生化特征和绿色的微藻毛乳杆菌可深入了解植物CYP74家族的进化差异。 Planta 242：1175-1186。iChihara，I，Shiraishi，K，Sato，H等。（1977）冠状动脉结构。J AM Chem Soc 99：636-637。Inagaki，H，Miyamoto，K，Ando，N等。 （2021）在Momilactone中解密的OPDA signaling成分 - 产生苔藓的calohypnum plumiforme。 前植物科学12：688565。 Katsir，L，Schilmiller，AL，Staswick，Pe等。 （2008）COI1是jasmonate和细菌毒力性冠状动脉的受体的关键成分。 Proc Natl Sci Acad USA 105：7100-7105。 Koeduka，T，Ishizaki，K，Mwenda，CM等。 （2015）来自利弗沃特的牛龙氧化物合酶的生化特征和绿色的微藻毛乳杆菌可深入了解植物CYP74家族的进化差异。 Planta 242：1175-1186。Inagaki，H，Miyamoto，K，Ando，N等。（2021）在Momilactone中解密的OPDA signaling成分 - 产生苔藓的calohypnum plumiforme。前植物科学12：688565。Katsir，L，Schilmiller，AL，Staswick，Pe等。 （2008）COI1是jasmonate和细菌毒力性冠状动脉的受体的关键成分。 Proc Natl Sci Acad USA 105：7100-7105。 Koeduka，T，Ishizaki，K，Mwenda，CM等。 （2015）来自利弗沃特的牛龙氧化物合酶的生化特征和绿色的微藻毛乳杆菌可深入了解植物CYP74家族的进化差异。 Planta 242：1175-1186。Katsir，L，Schilmiller，AL，Staswick，Pe等。（2008）COI1是jasmonate和细菌毒力性冠状动脉的受体的关键成分。Proc Natl Sci Acad USA 105：7100-7105。Koeduka，T，Ishizaki，K，Mwenda，CM等。 （2015）来自利弗沃特的牛龙氧化物合酶的生化特征和绿色的微藻毛乳杆菌可深入了解植物CYP74家族的进化差异。 Planta 242：1175-1186。Koeduka，T，Ishizaki，K，Mwenda，CM等。（2015）来自利弗沃特的牛龙氧化物合酶的生化特征和绿色的微藻毛乳杆菌可深入了解植物CYP74家族的进化差异。Planta 242：1175-1186。
角质层可以是植物免疫的活跃成分吗？
于2023年8月14日收到了2023年10月30日上次修订，2023年11月7日接受。缩写：ACP-酰基载体蛋白； COA-辅酶A;潮湿 - 损伤相关的分子模式； ER-内质网; FAE -FA延伸酶； FAS-脂肪酸；牛 - 过表达； PAMPS-病原体相关的分子模式； PTO DC3000 -Pseudomonas syringae Pathovar番茄DC3000; ROS-活性氧； SAR-系统性获得的阻力； VLC-非常长的链； VLCFA-非常长的链脂肪酸。致谢：这项工作得到了南波希米亚大学赠款机构的支持027/2023/p [TK]以及教育，青年和体育部（MEYS）OP -EU运营计划项目编号cz.02.2.69/0.0/0.0/18_053/0016975-1 [MJ]。我们感谢štěpánJe营业的英文编辑和评论。我们使用语法©作为打字助手。利益冲突：作者声明他们没有利益冲突。