最初,tRNA仅被认为是氨基酸的转运蛋白。通过发现抑制器tRNA发生了变化。1965年,Engelhardt等人。 实验表明,抑制器tRNA可以识别停止密码子和插入氨基酸,从而绕过翻译终止过程。 随后的研究进一步揭示了真核生物中抑制器tRNA的读取机理,并在基因治疗中显示了其潜力。1965年,Engelhardt等人。实验表明,抑制器tRNA可以识别停止密码子和插入氨基酸,从而绕过翻译终止过程。随后的研究进一步揭示了真核生物中抑制器tRNA的读取机理,并在基因治疗中显示了其潜力。
氨基酰基-TRNA和GTP结合的翻译伸长因子EF-TU识别核糖体的A位点密码子取决于多肽(P)和出口(E)密码子位点中存在的密码子和TRNA物种。为了了解密码子环境如何影响tRNA结合的EF-TU识别密码子识别的效率,开发了一个遗传系统,可以通过慢速翻译密码子组合选择快速翻译。选择通过慢速翻译的UCA-UAC对,两侧是Histi Dine密码子,从而在必需的TRNA Leuz的D-STEM中分离了A25G碱基取代突变体,该突变体识别UUA和UUG亮氨酸密码子。Leuz(A25G)替换允许通过包括UCA密码子在内的所有密码子对进行更快的翻译。插入。这项工作是根据trpt tRNA中的Hirsh UGA非理性抑制剂G24a突变所做的,它提供了遗传证据,即通过伸长因子TU进行的GTP后水解校对校验拟合步骤可以通过TRNA物种铰链区域中的结构相互作用来控制。我们的结果支持一个模型,在该模型中,mRNA翻译中的tRNA弯曲成分允许EF TU时间增强其区分cognate和接近同名mRNA密码子之间的tRNA相互作用的能力。
人类遗传疾病通常是由复合杂合性突变引起的,其中突变基因的每个等位基因都具有不同的遗传病变。但是,由于缺乏适当的模型,对此类突变的研究受到阻碍。在这里,我们描述了在强制性酶二聚体中的复合异伴变体的动力学模型,该变体在一个单体中包含一个突变,而第二个单体中的另一个突变中包含一个突变。该酶由人YarS2编码用于Mito-trosyl-tRNA合成酶(MT-Tyrrs),该酶是氨基化酪氨酸到MT-TRNA Tyr的氨基酰基。yarS2是MT-氨基酰基-TRNA合成酶的基因的成员,其中致病性突变的疾病严重程度与酶活性之间的相关性有限。我们在YARS2中识别一对与新生儿死亡有关的化合物杂合变体。我们表明,虽然每个突变在MT-TYRR的同型二聚体中导致氨基酰化的最小缺陷,但反式跨性别的两个突变会协同降低酶活性,从而更大。因此,这种动力学模型准确地概括了疾病的严重程度,强调了其研究YARS2突变的效用及其对具有复合杂合突变的其他疾病的泛化潜力。
生命的起源和居住在包括我们自己的地球的物种的多样性是一个有趣的问题,它伴随着人类历史到当今。今天,数据库中基因组序列的令人惊叹的积累以及用于深入分析的无数生物信息学工具[1-3],清楚地表明,地球上生命的迷人生活史写在所有活物体的pangenome中。比较分歧DNA,RNA和/或蛋白质序列与共同祖先的比较,使我们能够将该历史的理论重建回到我们星球上的第一种自主细胞类型,该细胞在我们的星球上具有脂质包膜内具有核酸合成的核酸合成和核糖体的核酸群中的元素群体,该核酸属于蛋白质的概括[4] [5-7]。
摘要 转移 RNA (tRNA) 在蛋白质生物合成中起着核心作用。转录后 RNA 修饰影响 tRNA 的功能和稳定性。在这些修饰中,RNA 编辑是生命三个领域中广泛存在的 RNA 修饰。作用于 tRNA 的腺苷脱氨酶 (ADAT) 家族的蛋白质是在 20 多年前发现的。它们在 tRNA 成熟过程中催化腺苷脱氨为肌苷 (A - 到 - I) 或胞苷脱氨为尿苷 (C - 到 - U)。研究最多的例子是原核或真核 tRNA 反密码子中 tRNA 摆动位置的 TadA 或 ADAT2 / 3 介导的 A - 到 - I 转换。本综述提供了有关不同生命领域中 tRNA 的 A 到 I 和 C 到 U 编辑的详细信息,介绍了有关 DNA 编辑的 ADAT 的最新发现,最后评论了 ADAT3 基因突变与智力障碍之间的关联。
1)Suzuki,T。(2021)tRNA修改的扩展世界及其疾病相关性。nat。修订版mol。细胞生物。 ,22,375 - 392。 2)Chujo,T。&Tomizawa,K。(2021)人类转移RNA模量:由转移RNA修改中的畸变引起的疾病。 febs J.,288,7096 - 7122。 3)Asano,K.,Suzuki,T.,Saito,A.,Wei,F.-Y.,Ikeuchi,Y.,Numata,T.,Tanaka,R.,tanaka,R.,Yamane,Y. (2018)与牛磺酸降低和人类疾病相关的tRNA修饰的代谢和化学调节。 核酸res。 ,46,1565 - 1583。 4) (2011)CDKAL1对TRNA(LYS)修饰的词置换会导致小鼠2型糖尿病的发展。 J. Clin。 投资。 ,121,3598 - 3608。 5) (2021)FTSJ1的损失渗透了大脑中特定的翻译效率,并且与X连锁的智力障碍有关。 SCI。 adv。 ,7,EABF3072。 6)Tresky,R.,Miyamoto,Y.,Nagayoshi,Y.,Yabuki,Y.,Araki,K.,Takahashi,Y.,Komohara,Y. (2024)TRMT10A功能障碍Perturbs密码子蛋氨酸和谷氨酰胺的平移,并损害小鼠的脑功能。 nucl。 酸res。细胞生物。,22,375 - 392。2)Chujo,T。&Tomizawa,K。(2021)人类转移RNA模量:由转移RNA修改中的畸变引起的疾病。febs J.,288,7096 - 7122。3)Asano,K.,Suzuki,T.,Saito,A.,Wei,F.-Y.,Ikeuchi,Y.,Numata,T.,Tanaka,R.,tanaka,R.,Yamane,Y.(2018)与牛磺酸降低和人类疾病相关的tRNA修饰的代谢和化学调节。核酸res。,46,1565 - 1583。4)(2011)CDKAL1对TRNA(LYS)修饰的词置换会导致小鼠2型糖尿病的发展。J. Clin。 投资。 ,121,3598 - 3608。 5) (2021)FTSJ1的损失渗透了大脑中特定的翻译效率,并且与X连锁的智力障碍有关。 SCI。 adv。 ,7,EABF3072。 6)Tresky,R.,Miyamoto,Y.,Nagayoshi,Y.,Yabuki,Y.,Araki,K.,Takahashi,Y.,Komohara,Y. (2024)TRMT10A功能障碍Perturbs密码子蛋氨酸和谷氨酰胺的平移,并损害小鼠的脑功能。 nucl。 酸res。J. Clin。投资。,121,3598 - 3608。5)(2021)FTSJ1的损失渗透了大脑中特定的翻译效率,并且与X连锁的智力障碍有关。SCI。 adv。 ,7,EABF3072。 6)Tresky,R.,Miyamoto,Y.,Nagayoshi,Y.,Yabuki,Y.,Araki,K.,Takahashi,Y.,Komohara,Y. (2024)TRMT10A功能障碍Perturbs密码子蛋氨酸和谷氨酰胺的平移,并损害小鼠的脑功能。 nucl。 酸res。SCI。adv。,7,EABF3072。6)Tresky,R.,Miyamoto,Y.,Nagayoshi,Y.,Yabuki,Y.,Araki,K.,Takahashi,Y.,Komohara,Y.(2024)TRMT10A功能障碍Perturbs密码子蛋氨酸和谷氨酰胺的平移,并损害小鼠的脑功能。nucl。酸res。,52,9230 - 9246。7)Blanco,S.,Dietmann,S.,Flores,J.-V.,Hussain,S.,Kutter,C.,Humphreys,P.,Lukk,M.,Lombard,P.,Treps,L.,Popis,M。等。(2014)TRNA的异常甲基化将细胞应激与神经发育疾病联系起来。Embo J.,33,2020 - 2039。
最近,有报道称,一种独特的非编码 RNA(称为转移 RNA 衍生的小 RNA (tsRNA))具有多种分子功能,包括在介导免疫的细胞中。由于分子量低,tsRNA 以前很难检测,因此一直被忽视,直到现在。在这篇综述中,我们深入研究了 tsRNA 的生物发生及其多种生物学功能,从转录调控到 mRNA 翻译的调节。我们重点介绍了当前证据表明它们参与免疫反应,以及 tsRNA 如何调节免疫以影响肿瘤生长和扩散、自身免疫性疾病病理和病原体感染。我们推测 tsRNA 可能作为细胞稳态和疾病的诊断标记物,并且 tsRNA 的治疗靶向可能对一系列人类疾病有益。更好地了解 tsRNA 在哺乳动物免疫系统中的功能将使我们能够利用 tsRNA 有效地进行临床治疗以应对人类健康问题。
一个联合研究小组,由治疗药物和疫苗开发中心的KIGA TSUNETARO组成(吉吉医学院医学院传染病学系的访问教授,访问教授,吉吉医学院医学院)等,已经巧妙地阐明了一种新的机制,可以巧妙地利用TRNA来促进细菌效应。这一发现可以鼓励进一步发展噬菌体疗法,并导致实现创新疗法的多药抗性细菌,这些疗法不太可能对传统的抗生素有效。
抽象的遗传密码扩展(GCE)已通过实现非经典氨基酸(NCAA)的位点掺入到蛋白质中,已成为生物学的关键工具。GCE的中心是正交氨基酰基-TRNA合成酶(AARS)/tRNA对的开发,其中工程的AARS识别所选的NCAA并将其充电到解码空白密码子的TRNA(例如,琥珀终止密码子)。许多正交的AARS/tRNA对涵盖了广泛的NCAA,这是通过定向进化产生的,但是标准策略通过标准策略的新AARS/TRNA对的演变仍然是一个劳动密集型的过程,通常会产生AARS/TRNA对,并产生副最好的NCAA NCAA INCAA Incorpiesies。在这项研究中,我们提出了一种发展AARS的策略,该策略利用Orthorep来推动其在酵母中的连续超女。我们在8个独立的AARS进化运动中展示了我们的战略,从4个不同的AARS/tRNA父母开始,针对7个不同的NCAA。我们观察到了多种新型AARS的快速演变,能够将13个NCAA的整体范围纳入响应于琥珀色密码子的蛋白质中。一些进化的系统达到了琥珀色密码子指定的NCAA依赖性翻译的效率,可与酵母中有义务密码子指定的天然氨基酸翻译相当。此外,我们发现了一个令人惊讶的AAR,它演变为自我调节自己的表达,以更大程度地依赖NCAA进行翻译。这些发现证明了由Orthorep驱动的AARS进化平台支持GCE技术持续增长的潜力。