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MRP1 作为新型胎儿血红蛋白调节剂和镰状细胞病潜在治疗靶点的基因组发现和功能验证
* 这些作者对这项工作做出了同等贡献。附属机构 1) 免疫学和炎症，赛诺菲，美国马萨诸塞州剑桥 2) 罕见血液病，赛诺菲，美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 3) 英国心脏基金会心血管流行病学部，剑桥大学公共卫生和初级保健系，英国剑桥 4) Tidal Therapeutics 蛋白质科学，赛诺菲，美国马萨诸塞州剑桥 5) 转化生物学研发，Biogen，美国马萨诸塞州剑桥 6) 波士顿大学阿拉姆 V. 乔巴尼安和爱德华·阿维迪西安医学院血液学/肿瘤学科；波士顿医学中心；镰状细胞病卓越中心，美国马萨诸塞州波士顿 7) 英国心脏基金会研究卓越中心，剑桥大学，英国剑桥 8) 国家血红蛋白病参考实验室，血液学系，四楼，约翰·拉德克利夫医院，英国牛津。 9）英国剑桥大学生物医学园区 NHS 血液与移植中心。 10) 英国剑桥大学国家健康与护理研究所血液与移植捐献者健康与行为研究组，英国剑桥 11) 英国国家医疗服务体系血液与移植-牛津中心，约翰拉德克里夫医院 2 楼，英国牛津 12) 英国牛津大学 BRC 血液学主题和拉德克里夫医学系，约翰拉德克里夫医院，英国牛津 13) 英国剑桥健康数据研究中心，威康基因组园区和剑桥大学，英国剑桥 14) 健康数据科学研究中心，人类科技城，意大利米兰 20157 15) 英国剑桥大学心肺研究所，英国剑桥 16) 英国威康桑格研究所人类遗传学系，欣克斯顿 17) 英国剑桥大学 MRC 生物统计学组，英国剑桥 18) 英国国家医疗服务体系血液与移植中心，朗路，剑桥，英国 19) 赛诺菲精准医学与计算生物学，美国马萨诸塞州剑桥联系人：Adam S. Butterworth 教授（asb38@medschl.cam.ac.uk）
对千人基因组计划样本进行高覆盖率纳米孔测序，建立人类遗传变异的综合目录
1 华盛顿大学儿科系遗传医学分部，美国华盛顿州西雅图 98195；2 华盛顿大学分子与细胞生物学项目，美国华盛顿州西雅图 98195；3 华盛顿大学基因组科学系、4 实验室医学与病理学系，美国华盛顿州西雅图 98195；5 华盛顿大学公共卫生遗传学研究所，美国华盛顿州西雅图 98195；6 南非约翰内斯堡 2193 威特沃特斯兰德大学健康科学学院悉尼布伦纳分子生物科学研究所；7 太平洋西北研究所，美国华盛顿州西雅图 98122；8 纽约大学生物系，美国纽约州纽约 10003；9 Alamya Health，美国路易斯安那州巴吞鲁日 70806； 10 应用和转化神经基因组学组，VIB 分子神经病学中心，VIB，安特卫普 2650，比利时；11 安特卫普大学生物医学科学系，安特卫普 2000，比利时；12 美国国家标准与技术研究所材料测量实验室，马里兰州盖瑟斯堡 20899，美国；13 田纳西大学健康科学中心遗传学、基因组学和信息学系，田纳西州孟菲斯 38163，美国；14 人类科技城，意大利米兰 20157；15 约翰霍普金斯大学计算机科学系，马里兰州巴尔的摩 21218，美国；16 墨西哥国立自治大学国际人类基因组研究实验室，人类基因组国际研究实验室，墨西哥城 76230，墨西哥； 17 纽约基因组中心，纽约，纽约州 10013，美国；18 Outlier Informatics Inc.，萨斯喀彻温省萨斯卡通 S7H 1L4，加拿大；19 西雅图儿童医院实验室部，华盛顿州西雅图 98195，美国；20 冷泉港实验室，纽约冷泉港 11724，美国；21 斯坦福大学遗传学系，22 计算机科学系，加利福尼亚州斯坦福 94305，美国；23 贝勒医学院人类基因组测序中心，德克萨斯州休斯顿 77030，美国；24 贝勒医学院分子和人类遗传学系，德克萨斯州休斯顿 77030，美国；25 莱斯大学计算机科学系，德克萨斯州休斯顿 77251，美国； 26 美国国立卫生研究院国家癌症研究所癌症数据科学实验室，马里兰州贝塞斯达 20892，美国；
植物育种和生物技术工作
最高职位HT-意大利人类米兰人类：合作进行重要的项目，以隔离和与环境相互作用进行遗传特征。协助...（发布1天，截止日期为3月16日）顶级职位MPP-瑞士的药物专利池：为产品开发和验证活动提供技术专业知识，包括分析开发，过程规模扩大和表征。（12天前发布，截止日期为2月19日）最高职位HT-意大利人类米兰人：开发和监督世界一流的翻译流行病学研究计划。有助于促进科学改进的倡议。（20天前发布，截止日期为3月28日）顶级职位SLU-瑞典农业科学大学Alnarp，瑞典：在该学科领域内进行高质量的研究，从而有助于与系主任的科学发展。（27天前发布，3月17日截止日期） - 瑞典农业科学大学Uppsala，瑞典：除其他组件外，要在各个层面上教动物分子遗传学。（61天前发布，截止日期为4月28日）CEMM-奥地利奥地利科学学院分子医学研究中心：奥地利维也纳：领导湿实验室设施，包括NGS服务提供，分析开发和对客户的支持。（4天前发布，3月31日截止日期）Max F. Perutz实验室，奥地利维也纳：研究基因组之间移动遗传元素的分子机制，探索了它们对基因组重塑的影响。验证突变效应。关注从干细胞衍生的神经细胞和神经胶质细胞。文档搜索策略。2。（未指定的截止日期）UVA-荷兰阿姆斯特丹阿姆斯特丹大学：使用CRISPR/CAS9技术创建在E-2-己烯感知或己烯酸异构酶活动中受损的突变马铃薯植物。（6天前发布，截止日期为3月13日）Embl -Ebi-英国的欧洲生物信息学研究所：监督重要的生物信息学资源，确保其在不断变化的科学环境中的持续影响和相关性。（发表于8天前，截止日期为3月16日）乌普萨拉大学 - 瑞典免疫学，遗传学和病理学系：使用各种生物学和干细胞来源开发3D打印的组织器官。（15天前发布，截止日期2月21日）ESHRE-欧洲人类繁殖与胚胎学会，布鲁塞尔，比利时：进行逐步文献搜索以确定相关证据，确保采用系统的方法来采购数据。（未指定截止日期）法国巴黎巴斯德学院：1。在KAUST可用的位置研究昆虫和哺乳动物发育中的动态过程。成功的候选人将在生物反应器设计和燃料生产中进行合作。在法国Inrae的职位发布，重点是细菌细胞外囊泡介导的细胞间通信。3。在巴黎的INRAE角色，涉及从实验室到商业规模的发酵过程的规模扩大。4。在意大利EMBL的位置，制定一个独立的研究计划，以解决环境反应的分子机制。 5。 在瑞典SLU的职位发布，重点是微生物生物技术和厌氧微生物。 6。 7。 1。在意大利EMBL的位置，制定一个独立的研究计划，以解决环境反应的分子机制。5。在瑞典SLU的职位发布，重点是微生物生物技术和厌氧微生物。6。7。1。使用尖端技术的发展生物学，计算科学和儿科心脏病学探索了巴黎研究所的项目。荷兰UVA的研究助理职位，重点是分析化学和分子寄生虫学。博士后项目负责人SLU-瑞典农业科学大学发表了7天前截止日期3月14日。生物生产KTH-皇家理工学院发表8天前截止日期3月5日。助理教授职位职位 - 免疫学cinbio-纳米材料和生物医学研究中心，维戈大学的纳米材料和生物医学中心发表了12天前的截止日期，2月28日2月28日，研究系的重点是植物育种，生物技术和产品质量。他们使用多种技术等技术来研究农作物。该团队还为苹果和土豆开展公共育种计划。作为其活动不可或缺的一部分，他们拥有著名组织的国际赠款。他们的学科领域以植物生物技术为中心，专注于使用工具和技术在北欧的适应和繁殖作物。这可能涉及在植物代谢，生物化学和基因组学等领域的研究。教授的职责包括加强部门的研究和教育环境，管理团队，确保资金，发布研究成果，教学，监督学生以及与行业和组织合作。SLU的[主题]部门以卓越的声誉而闻名。为了与大学的愿景和目标保持一致，我们希望所有员工都遵守我们的核心价值观。虽然英语主要用于我们的学术活动，但预计将在四年内获得瑞典语或斯堪的纳维亚语言的能力。这将使教授能够与同事有效沟通并促进我们的语言多样性。关键资格： *在相关领域任职博士学位或展示等效的科学专业知识 *具有出色的研究技能，包括获得外部资金并领导成功的研究小组 *展示了一个可靠的良好影响力的研究论文的记录，以发表高影响力的研究论文，并与行业利益相关者合作 *通过教学，监督和学生进行培训。优先考虑科学和教学技能。我们根据他们的研究专业知识来评估候选人，包括他们启动创新项目，确保外部资金并展示明确的科学愿景的能力。对于教学专业知识，我们考虑了课程计划，实施，考试和评估等因素，以及所有教育水平的监督和检查。我们还重视将研究和科学方法整合到教学工作中的能力。其他考虑因素包括领导才能，与外部利益相关者的合作以及有关研发工作的沟通。虽然不是强制性的，但如果申请人可以记录其使用和开发现代植物生物技术方法来改善与北欧相关的作物的能力，则认为这是一个优点。理想的候选人将记录与各种农作物合作的经验，并与行业合作伙伴紧密合作。加入SLU，成为一个动态团队的一部分，该团队促进了部门内的增长和积极性。作为SLU员工，您将沉浸在思想蓬勃发展的协作研究环境中。您还可以享受诸如瑞典家庭医疗保健，慷慨的休假政策等的巨大收益。瑞典以其高质量的教育系统，美丽的学龄前结构和丰富的文化遗产而闻名。SLU的Alnarp校园坐落在隆德，马尔默和哥本哈根附近，使其成为学者和文化爱好者的理想场所。现在应用成为这个充满活力的社区的一部分！
全基因组关联分析和门德尔随机化蛋白质组学确定心力衰竭的药物靶标
Genome-wide association analysis and Mendelian randomization proteomics identify drug targets for heart failure Authors: Danielle Rasooly, PhD* 1,2 , Gina M Peloso, PhD* 2,3 , Alexandre C Pereira, MD, PhD 4,5 , Hesam Dashti, PhD 1,6 , Claudia Giambartolomei, PhD 7,8 , Eleanor Wheeler, PhD 9 , Nay Aung, MD, PhD 10,11 , Brian R Ferolito, MS 2 , Maik Pietzner, PhD 9,12,13 , Eric H Farber-Eger, BS 14 , Quinn Stanton Wells, MD 15 , Nicole M Kosik, MPH 2 , Liam Gaziano, MPhil, PhD 2,16 , Daniel C Posner, PhD 2 , A Patrícia Bento,博士学位17，Qin Hui，PhD 18，19，Chang Liu，MPH 18，Krishna Aragam，MD 2,6,20，Zeyuan Wang，MPH 18，Brian Charest MS，MPH 2，MPH 2，Jennifer E Huffman，Jennifer E Huffman，Phd 2，Peter W.F.，Peter W.F.威尔逊，医学博士19，21，劳伦斯·菲利普斯（Lawrence S Phillips），医学博士19，22，约翰·惠特克（John Whittaker） Gaziano，医学博士，MPH 1,2，VA百万退伍军人计划27，Claudia Langenberg，MD，PhD 9，12，13†，Yan V Sun，Phd，MS，MS，18，19，19，28†，Jacob Joseph，Joseph，Mbbs，Mbbs，Md 29†，Juan P Casas，Md casas，Md，Md，Md，Phd 1,2 1,2 agnorty for equalty for equalty for equalty progutty for equalty progutty for equalty progutty for equalty progutty这些著作。†这些作者共同监督这项工作。机构：1年老化师，杨百翰和妇女医院，哈佛医学院，美国马萨诸塞州波士顿75号，美国马萨诸塞州02130。2马萨诸塞州退伍军人流行病学研究与信息中心（Maveric），VA波士顿医疗保健系统，150。S. Huntington Ave，波士顿，马萨诸塞州02130，美国。 3马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州801 Ave Crosstown中心的波士顿大学公共卫生学院生物统计学系，美国马萨诸塞州，美国马萨诸塞州02118。S. Huntington Ave，波士顿，马萨诸塞州02130，美国。3马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州801 Ave Crosstown中心的波士顿大学公共卫生学院生物统计学系，美国马萨诸塞州，美国马萨诸塞州02118。4。02142，美国意大利。意大利，意大利，意大利。剑桥研究所。。Bartholomew的Barthol心脏中心，Bartholomew，比恩。
CALIPERS：用于表型分析实验和再生研究的细胞周期感知活体成像
1. 意大利帕维亚大学合成生理学实验室 2. 意大利米兰人类科技城 3. 意大利都灵大学“Guido Tarone”分子生物技术中心 * 通讯作者：francesco.pasqualini@unipv.it；moises.disante@unipv.it 摘要 在活细胞成像中测量细胞结构和功能以及细胞周期进程一直很有挑战性，因为荧光泛素细胞周期指示剂 (FUCCI) 和大多数表型传感器都使用绿色 (GFP) 和红色 (RFP) 荧光蛋白。我们介绍了 CALIPERS，一种用于表型分析实验和再生研究的细胞周期感知活细胞成像方法。CALIPERS 使用一种名为 FUCCIplex 的定制 FUCCI 传感器，该传感器与基于 GFP 和 RFP 的传感器进行光谱多路复用。为了证明 CALIPERS 的广泛应用范围，我们用上皮和人类诱导性多能干细胞多色报告基因系在增殖、迁移、心脏药物检测和再生医学研究中对其进行了验证。正文组学和成像技术的融合为基础科学 1,2 、药物检测 3 和再生医学 4 中的细胞表型的高级评估提供了动力。此外，参考人类诱导性多能干细胞 (hiPSC) 和多谱系分化的强大协议（例如心肌细胞、hiPSC-CM）增强了可重复性 5 ，并将表型分析工作扩展到类器官 6,7 和器官芯片 8,9。然而，细胞周期 (CC) 可能会混淆这些研究，因为随着细胞在分裂后生长（G1 期）、复制其 DNA（S）、在随后的分裂前生长（G2）或分裂（M）10 ，基因表达、形态和行为会发生变化。这在分子表型分析中得到了很好的解决，因为由于同时测量许多 CC 基因/蛋白质 11 ，大多数组学研究都具有 CC 感知能力。然而，基于成像的 CC 感知表型分析具有挑战性。通过对 G1/S/G2/M 标记物进行特定染色，可以使化学固定样品的结构表型分析具有 CC 感知能力 12 。然而，功能表型分析只有通过活细胞成像 13,14 才有可能，目前很难使用标准荧光显微镜同时评估 CC 以及细胞结构和功能。事实上，绿色和红色荧光蛋白 (GFP、RFP) 为荧光泛素细胞周期指标 (FUCCI) 10 和大多数表型传感器 15 提供动力。在这里，我们引入了一个可复用的 FUCCI 传感器 FUCCIplex，并展示了 CC 感知实时成像，用于人类上皮细胞（HaCaT，图 1）和 hiPSC（图 2）中的表型分析实验和再生研究（CALIPERS）。为了创建 FUCCIplex，我们将 fastFUCCI 传感器 16 中的 GFP 和 RFP 替换为 miRFP670（iRFP）和 mTurquoise2（CFP）。因此，FUCCIplex 细胞的细胞核在 G1 中包含 CFP，在 G1-S 过渡期包含 CPF 和 iRFP，在 S/G2/M 期仅包含 iRFP（图 1a）。为了展示 CALIPERS，我们在 HaCaT 细胞中共表达了 FUCCIplex 和肌动蛋白结合肽 RFP-LifeAct 17，并使用 40 小时以上的活细胞荧光成像来追踪细胞在每个 CC 期所花费的时间（图 1b 和补充视频 1 和 2）。我们证实 HaCaT 细胞约 40% 的时间处于 G1 期，其余时间处于 S/G2/M 期，这与使用 FUCCIplex 或 DNA 标记在静态图像和流式细胞术实验中测得的 CC 期占有率一致（图 1c-d 和扩展图 1）。此外，我们开发了一个开源插件，可将 CFP 和 iRFP 强度转换为 FUCCIphase 信号，该信号可追踪 CC 完成百分比并实现 CC 感知的形态和运动分析（图 1e、补充视频 3 和扩展图 2）。
对来自...的样本进行高覆盖率纳米孔测序
对千人基因组计划样本进行高覆盖率纳米孔测序，以建立人类遗传变异的综合目录 作者 Jonas A. Gustafson 1,2,*, Sophia B. Gibson 1,3,*, Nikhita Damaraju 1,4,*, Miranda PG Zalusky 1 , Kendra Hoekzema 3 , David Twesigomwe 5 , Lei Yang 6 , Anthony A. Snead 7 , Phillip A. Richmond 8 , Wouter De Coster 9,10 , Nathan D. Olson 11 , Andrea Guarracino 12,13 , Qiuhui Li 14 , Angela L. Miller 1 , Joy Goffena 1 , Zachary B. Anderson 1 , Sophie HR Storz 1 , Sydney A. Ward 1 , Maisha Sinha 1 , Claudia Gonzaga-Jauregui 15 、Wayne E. Clarke 16,17 、Anna O. Basile 16 、André Corvelo 16 、Catherine Reeves 16 、Adrienne Helland 16 、Rajeeva Lochan Musunuri 16 、Mahler Revsine 14 、Karynne E. Patterson 3 、Cate R. Paschal 18,19 、Christina Zakarian 3 、Sara Goodwin 20 、Tanner D. Jensen 21 、Esther Robb 22 、1000 基因组 ONT 测序联盟、华盛顿大学罕见疾病研究中心 (UW-CRDR)、阐明罕见疾病遗传学的基因组学研究 (GREGoR) 联盟、W. Richard McCombie 20 、Fritz J. Sedlazeck 23,24,25 , Justin M. Zook 11 , Stephen B. Montgomery 21 , Erik Garrison 12 , Mikhail Kolmogorov 26 , Michael C. Schatz 14 , Richard N. McLaughlin Jr. 2,6 , Harriet Dashnow 27,28 , Michael C. Zody 16 , Matt Loose 29 , Miten Jain 30 , Evan E. Eichler 3,31,32 , Danny E. Miller 1,19,31,** 附属机构 1. 美国华盛顿州西雅图华盛顿大学儿科系遗传医学分部 2. 美国华盛顿大学西雅图分子与细胞生物学项目 3. 美国华盛顿大学基因组科学系 4. 美国华盛顿大学西雅图公共卫生遗传学研究所 5. 悉尼南非约翰内斯堡威特沃特斯兰德大学健康科学学院布伦纳分子生物科学研究所 6. 美国华盛顿州西雅图太平洋西北研究所 7. 美国纽约州纽约纽约大学生物系 8. 美国路易斯安那州巴吞鲁日阿拉米亚健康中心 9. 比利时安特卫普 VIB 分子神经病学中心应用和转化神经基因组学组 10. 比利时安特卫普大学生物医学科学系 11. 美国马里兰州盖瑟斯堡国家标准与技术研究所材料测量实验室 12. 美国田纳西州孟菲斯田纳西大学健康科学中心遗传学、基因组学和信息学系 13. 意大利米兰人类科技城 14. 美国马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯大学计算机科学系 15. 国际人类基因组研究实验室人类基因组研究，墨西哥国立自治大学 16. 纽约基因组中心，美国纽约州纽约市 17. Outlier Informatics Inc.，萨斯卡通，萨斯卡通，加拿大 18. 西雅图儿童医院实验室部，西雅图，华盛顿州，美国 19. 检验医学和病理学部，美国华盛顿大学，美国华盛顿州西雅图 20. 冷泉港实验室，美国纽约州冷泉港 21. 斯坦福大学遗传学系，美国加利福尼亚州斯坦福 22. 斯坦福大学计算机科学系，美国加利福尼亚州斯坦福 23. 贝勒医学院人类基因组测序中心，美国德克萨斯州休斯顿