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晚期软组织肉瘤的分子分析
背景：软组织肉瘤 (STS) 是一组异质性罕见肿瘤，包括 70 多种不同的组织学亚型。高通量分子分析（下一代测序外显子组 [NGS]）是识别驱动突变的独特机会，这些突变可以将通常的“一刀切”治疗模式转变为以患者为主导的治疗策略。MULTISARC 试验的主要目标是评估是否可以在合理的时间内为大部分转移性 STS 参与者进行 NGS，其次是确定 NGS 指导的治疗策略是否可以改善参与者的结果。方法：这是一项随机、多中心、II/III 期试验，其灵感来自伞状和生物标志物驱动试验的设计。该设置计划在法国各地设立多达 17 个研究中心并招募 960 名参与者。参与者年龄至少 18 岁，患有法国肉瘤病理参考网络确认的无法切除的局部晚期和/或转移性 STS，按照 1:1 的分配比例随机分配到实验组“ NGS ”和标准“无 NGS ”之间。如果 (i) NGS 结果可用且可解释，并且 (ii) 在生物病理平台上收到样本后 7 周内向研究者提供包含多学科肿瘤委员会临床建议的外显子组测序报告，则将 NGS 视为可行。可行性率预计超过 70%（零假设：70% vs 备择假设：80%）。在护理方面，随机分配到“无 NGS ”组且治疗失败的参与者将能够根据研究者的要求转换到 NGS 组。讨论：MULTISARC 试验是一项前瞻性研究，旨在提供高级别证据支持在晚期 STS 参与者的常规临床实践中大规模实施 NGS。试验注册：clinicaltrial.gov NCT03784014。
![[18F]2FNQ1P 作为大鼠、猪、非人类灵长类动物和人类脑组织中 5-HT6 受体特异性 PET 放射性示踪剂的临床前验证](/simg/9/9e4bc0056c0b1c85127ea895e33afa5c22b37f78.webp)
[18F]2FNQ1P 作为大鼠、猪、非人类灵长类动物和人类脑组织中 5-HT6 受体特异性 PET 放射性示踪剂的临床前验证
Stéphane Emery、Sylvain Fieux、Benjamin Vidal、Pierre Courault、Sandrine Bouvard 等人。[18F]2FNQ1P 作为大鼠、猪、非人类灵长类动物和人类脑组织中 5-HT6 受体特异性 PET 放射性示踪剂的临床前验证。核医学与生物学，2020 年，82-83，第 57-63 页。�10.1016/j.nucmedbio.2020.01.006�。�hal-03035781�
周细胞是器官特异性的组织调节器......
血管提供了一种多功能且适应性强的运输系统，但最近的研究已经证实，构成血管网络最内层的内皮细胞也是控制周围组织中其他细胞类型行为的分子信号来源。周细胞是血管壁的另一个重要组成部分，但人们对它们在器官生长和模式形成过程中与其他细胞群的信号相互作用知之甚少。在这里，我们使用组织特异性和可诱导小鼠遗传学、高分辨率成像、单细胞 RNA 测序和细胞培养实验来解决三种周细胞衍生的生长因子在两种模型器官（即肺和脑）的出生后发育中的作用。我们发现 Pdgfrb-CreERT2 控制的肝细胞生长因子 (HGF) 基因失活不会导致出生后大脑发生明显改变，但由于与 AT2 上皮细胞的相互作用缺陷，会损害肺泡形成。同样，周细胞表达脑源性神经营养因子 (BDNF) 不是出生后大脑所必需的，但通过与肺内皮细胞中的受体酪氨酸激酶 TrkB 相互作用来控制肺部发育。相反，周细胞表达 TGFβ 家族生长因子 Nodal 不是肺形态形成所必需的，但调节出生后大脑的血管生长和屏障功能，我们将其归因于与内皮细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞的信号相互作用。总之，我们的研究结果表明，周细胞是血管分泌信号的重要来源，这些信号以器官特异性方式控制形态形成过程。
神经元细胞外囊泡的分子分析揭示了脑组织特异性信号
神经元 (nEV) 释放的细胞外囊泡 (EV) 为测量周围循环的脑生物标志物提供了机会。目前还没有研究直接比较脑组织中的分子货物与人类循环中发现的 nEV。我们比较了 microRNA 和环境化学物质的水平，因为 microRNA 是研究最多的 nEV 货物之一，具有作为生物标志物的巨大潜力，而 nEV 中的环境化学负荷研究不足，可以揭示大脑中的化学物质水平。为此，我们利用匹配的脑组织和血清组，并分离血清总 EV 和血清 nEV。我们还生成并比较了不同匹配血清、血清总 EV 和血清 nEV 中的代谢组学谱，因为 nEV 中的代谢物货物也研究不足，但可以提供潜在的生物标志物。高表达的脑组织 miRNA 与 nEV 的相关性比血清或总 EV 更强。我们在 nEV 中检测到了几种环境化学污染物类别。 nEV 中的化学污染物浓度与脑组织水平的相关性比脑组织与血清或总 EV 之间的相关性更强。我们还在 nEV 中检测到了几种内源性代谢物。与血清和总 EV 相比，具有已知信号传导作用的代谢物有所丰富，例如胆汁酸、油酸、磷脂酰丝氨酸和类异戊二烯。我们提供的证据表明 nEV 货物与脑组织内容密切相关，进一步支持了它们作为脑液体活检的实用性。
抗糖尿病，抗炎，抗氧化剂，抗癌，抗菌，抗菌和组织工程在微型和纳米成型中的应用：Mini-Review
genipin作为虹膜单二烯和出色的自然交联链，可以从Genipa Americana中提取。与化学交联剂（如戊二醛和甲醛）相比，该代谢物具有合适的生物相容性，已用于交叉链接水凝胶和纳米复合材料，由胶原蛋白，壳聚糖，蛋白质，蛋白质和胶质素组成。此外，已经报道了该单苯甲酸酯的治疗活性，包括抗炎，抗氧化剂，抗癌和抗菌活性。几种生物医学局限性涉及几乎没有可用来源，提取困难以及Genipin的高成本。在这种微型审查中，已经讨论了这种草药代谢物在微型和纳米形式中的抗糖尿病，抗炎，抗氧化剂，抗癌，抗菌和组织工程的应用。
鼠伤寒沙门氏菌感染对文昌鸡肠道菌群及肠组织花生四烯酸代谢的影响
沙门氏菌感染可导致禽类肠道炎症与代谢紊乱，但花生四烯酸（ARA）代谢是否参与沙门氏菌引起的肠道炎症尚不明确。本试验利用16s rDNA测序和靶向代谢组学技术研究了感染鼠伤寒沙门氏菌的海南文昌鸡盲肠菌群和ARA代谢的变化。研究结果表明，文昌鸡感染鼠伤寒沙门氏菌后盲肠组织中ARA代谢产物含量升高，包括前列腺素E2（PGE 2 ）、前列腺素F2α（PGF 2 α）、脂氧素A4（LXA4）、±8（9）-EET、±11（12）-EET和±8,9-DiHETrE。感染沙门氏菌后，鸡盲肠组织中ARA生成和代谢的关键酶（磷脂酶A2 PLA2和环氧合酶-2 COX-2）含量增加。感染后炎症因子的相对mRNA水平也增加，包括干扰素-γ（IFN-γ）、转化生长因子-β1（TGF-β1）、白细胞介素-4（IL-4）和白细胞介素-6（IL-6）。在HD11细胞中，使用环氧合酶（COX）抑制剂可降低沙门氏菌感染引起的COX-2和PGF 2α水平升高，并有效降低炎症反应。此外，文昌鸡感染鼠伤寒沙门氏菌后，盲肠中有益菌属（如双歧杆菌、乳酸杆菌、臭杆菌）的数量显著减少。本研究揭示了鼠伤寒沙门氏菌感染文昌鸡盲肠菌群的结构。此外，本研究还证实了鼠伤寒沙门氏菌激活ARA环氧合酶代谢途径，进而介导文昌鸡肠道炎症的发生。研究结果可为禽科沙门氏菌病的防控提供数据支持和理论支撑。
聚乙烯乙二醇：抗菌和抗癌剂的组织工程和载体中的新应用
聚合物是各种生物材料，通常应用于抗癌和抗菌剂的组织工程和载体中。有多种化学，生物学，医学和工业应用，用于聚乙烯乙二醇（PEG），一种水溶性聚醚。由PEG组成的聚合药物输送系统由于免疫原性，生物降解性，活性药物靶向和可持续的药物释放特征而具有许多优势。此外，该聚合物已成功地用于为各个身体部位的组织工程制备三维（3D）支架。是增加生物相容性和全身循环时间的关键步骤。此外，刺激性反应性和两亲性药物结合物基于PEG作为自组装的配方，例如胶束增强了细胞内药物的释放。在这篇综述中，我们试图提出并讨论与PEG在抗菌药物携带者和组织工程中的新应用相关的最新进展和挑战。
组织和液体活检样本中的敏感变异分析
根据 Illumina 无细胞 DNA 富集制备用户指南中的详细说明，从碎片化的 FFPE DNA 或 cfDNA 制备 Illumina 无细胞 DNA 富集制备文库。对于 FFPE DNA，超声处理后，将 45 μl 碎片 DNA（~40 ng）转移到 96 孔 PCR 板中以进行最终修复反应。对于 ctDNA 样本，将 20 ng DNA 输入文库制备中。对“浓缩索引文库”步骤进行了更改，按质量而不是体积进行汇集，以适应在本研究期间测试的单个文库制备中的 1 重、4 重和 12 重文库汇集。使用 Qubit dsDNA BR 检测（Thermo Fisher Scientific，目录号 Q32853）对文库进行量化。为了适应更大的体积，每个文库汇集了 250 ng，并对协议进行了一些修改。富集是使用定制的 79 基因探针面板进行的，如 Illumina 无细胞 DNA 富集准备用户指南中所述。
通过组织表达限制将基因编辑的脱靶效应降至最低
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2025 年 1 月 21 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.21.634017 doi：bioRxiv preprint