1 乌普萨拉大学免疫学、遗传学和病理学系,瑞典乌普萨拉 751 85 2 肿瘤治疗学研究中心,化学和应用生物医学科学研究院,托木斯克国立研究型理工大学,托木斯克 634050,俄罗斯 3 俄罗斯科学院 Shemyakin-Ovchinnikov 生物有机化学研究所分子免疫学实验室,莫斯科 117997,俄罗斯 4 乌普萨拉大学药物化学系,瑞典乌普萨拉 751 23 5 乌普萨拉大学生命科学实验室,瑞典乌普萨拉 751 23 6 生物纳米光子实验室,生物医学工程物理研究所 (PhysBio),国立研究核大学‘MEPhI’,莫斯科 115409,俄罗斯 7 谢切诺夫大学生物医学工程中心,莫斯科 119991,俄罗斯 * 通讯作者: anzhelika.vorobyeva@igp.uu.se
毒素 - 抗毒素(TA)系统是细菌用来调节噬菌体防御等细菌过程的普遍存在的两基因基因座。在这里,我们演示了一种新型III型TA系统AVCID的机制,并激活了对噬菌体感染的抵抗力。系统的毒素(AVCD)是一种脱氧胞苷脱氨酶,将脱氧胞苷(DC)转化为脱氧尿苷(DU),而RNA抗毒素(AVCI)抑制AVCD活性。我们已经表明,AVCD在噬菌体感染时脱氨基核苷酸脱氨基核苷酸,但是激活AVCD的分子机械词是未知的。在这里我们表明,AVCD的激活是由噬菌体诱导的宿主转录抑制,导致不稳定AVCI的降解。AVCD激活和核苷酸耗竭不仅减少噬菌体复制,而且还增加了缺陷的噬菌体形成。令人惊讶的是,AVCID不抑制的T7等噬菌体的感染也导致AVCI RNA抗毒素降解和AVCD激活,这表明AVCI的耗竭不足以赋予对某些噬菌体的保护。相反,我们的结果支持像T5这样较长复制周期的噬菌体对AVCID介导的保护敏感,而像T7这样的复制周期较短的噬菌体具有抗性。
摘要:先前已使用基于CRISPR的诱变方法获得了厌氧甲基菌质细菌中的靶向突变。在这项研究中,将来自Callanderi的RELB家庭毒素放置在甲型苯乙烯敏感启动子的控制之下,形成可诱导的反选择系统。该诱导系统与非复制性整合诱变载体相结合,以在limosum b2的Eubacterium B2中创建精确的基因缺失。这项研究中针对的基因是编码组氨酸生物合成基因HISI,甲醇甲醇转移酶和类cor我蛋白MTAA和MTAC的基因,以及编码MTTB-氨基甲基转移酶的MTCB,先前显示出MTTB-FAMILY甲基转移酶。HISI内的有针对性的缺失带来了预期的组氨酸成可营养,MTAA和MTAC的缺失都废除了甲醇的自养生长。MTCB的缺失被证明是消除了Limosum在L-肉碱上的生长。 在隔离转化菌落的初始选择步骤之后,仅需要一个单个诱导步骤才能获得所需靶标的突变菌落。 可诱导的反选择标记和非复制综合质粒的组合可以快速地编辑大肠杆菌。MTCB的缺失被证明是消除了Limosum在L-肉碱上的生长。在隔离转化菌落的初始选择步骤之后,仅需要一个单个诱导步骤才能获得所需靶标的突变菌落。可诱导的反选择标记和非复制综合质粒的组合可以快速地编辑大肠杆菌。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年2月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2022.08.08.503143 doi:Biorxiv Preprint
结果:CDI组的RTCA测量功能和毒梭状芽胞杆菌毒素B(TCDB)浓度(302.58±119.15 ng/ml)明显高于CDC组(18.15±11.81 ng/ml)(P = 0.0008)的CDC组(18.15±11.81 ng)。相反,ELISA结果显示CDC(26.21±3.57 ng/ml)和CDI组(17.07±3.10 ng/ml)之间的TCDB浓度没有显着差异(P = 0.064)。PCR结果表明,CDC(774.54±357.89副本/μL)和CDI组(4,667.69±3,069.87副本/μL)之间的TCDB基因拷贝没有显着差异(p = 0.407)。另外,通过RTCA测量了从艰难梭菌分离株分泌的功能和毒性TCDB浓度。CDC(490.00±133.29 ng/ ml)和CDI组(439.82±114.66 ng/ ml)的结果没有显着差异(p = 0.448)。值得注意的是,当与合并的CDC样品上清液混合时,RTCA测量的功能和毒性TCDB浓度显着降低(P = 0.030)。
图1。N末端区域在K2免疫力中的重要性。 a)16个删除构建体的概述,每个删除构建体缺少K2 ORF内的区域(14-27密码子)(不绘制为刻度)。 将切除的段替换为编码Pro-Ala-Gly的框架内SBFI限制性位点,并将其放置在PRS423型载体上的GAL1半乳糖诱导启动子后面。 酵母转化后,在诱导含有1%半乳糖的培养基中培养了三种转化体,然后转移到补充10 A.U.的新鲜诱导培养基中。 K2毒素。 b)在24小时的过程中,在板块读取器中记录了毒素中的OD 600。 条形表示生物学三份的最终OD 600值的平均值,误差线表示±1标准偏差。 单个重复值显示为点。 wt:野生型K2,控制:空矢量。 c)该表提供了有关系统删除构建体的修改区域的第一个也是最后一个删除的密码子的信息。 请注意,第一个构造还省略了位置1的起始密码子。N末端区域在K2免疫力中的重要性。a)16个删除构建体的概述,每个删除构建体缺少K2 ORF内的区域(14-27密码子)(不绘制为刻度)。将切除的段替换为编码Pro-Ala-Gly的框架内SBFI限制性位点,并将其放置在PRS423型载体上的GAL1半乳糖诱导启动子后面。酵母转化后,在诱导含有1%半乳糖的培养基中培养了三种转化体,然后转移到补充10 A.U.的新鲜诱导培养基中。K2毒素。 b)在24小时的过程中,在板块读取器中记录了毒素中的OD 600。 条形表示生物学三份的最终OD 600值的平均值,误差线表示±1标准偏差。 单个重复值显示为点。 wt:野生型K2,控制:空矢量。 c)该表提供了有关系统删除构建体的修改区域的第一个也是最后一个删除的密码子的信息。 请注意,第一个构造还省略了位置1的起始密码子。K2毒素。b)在24小时的过程中,在板块读取器中记录了毒素中的OD 600。条形表示生物学三份的最终OD 600值的平均值,误差线表示±1标准偏差。单个重复值显示为点。wt:野生型K2,控制:空矢量。c)该表提供了有关系统删除构建体的修改区域的第一个也是最后一个删除的密码子的信息。请注意,第一个构造还省略了位置1的起始密码子。
实验室质量培养物。minimus,A。fortilissima,P。uncinatum和S.细长。通过监测浊度,叶绿素浓度和蛋白质含量来评估这些培养物的生长。经过18天的接种期,观察到纯培养物的最大生长。使用离心浓缩的发育良好的培养物并随后冻干以将其保存为粉状形式。DNA提取在冻干的培养物上进行,从而在井下导致透明的DNA带。由A260/280比率确定的提取的DNA的质量范围为1.6至1.8。Mcyabde基因在铜绿节和O. Laetevirens var中成功扩增。minimus,而A. fortilissima和P. uncinatum分别显示了McYabd和McYabe基因的扩增。在弹性链球菌中未观察到放大。使用半定量ELISA技术,仅在微囊孢子虫中检测到显着浓度的微囊藻蛋白,水平为0.5 ppb,而其他培养物的痕量量低于0.5 ppb。
摘要:新数据表明,错误折叠的天然蛋白的聚集启动并驱动导致阿尔茨海默氏病(AD)和其他与年龄相关的神经退行性疾病的致病性级联反应。我们提出了一种统一的脑神经变性单一毒素理论,该理论识别了新的靶标和方法改善疾病的治疗方法。广泛的遗传证据表明,在AD发病机理中,β-淀粉样蛋白(Aβ)的可溶骨料是主要神经毒素。来自流体生物标志物,成像和临床研究的新见解为有毒Aβ物种在AD的启动和进展中的决定性影响提供了进一步的证据。了解可溶性和不溶性淀粉样蛋白在AD发病机理上的独特作用一直是阿尔茨海默氏症难题的关键部分。来自具有抗淀粉样剂的临床试验的数据以及AD诊断的最新进展表明,生物定义的AD的损害是可溶性Aβ聚集体的神经毒性,而不是相对易于依赖的无体性成熟的成熟的纤维纤维,而不是相对易于依赖的β聚集体。淀粉样蛋白低聚物似乎是引起突触障碍,神经元应激,tau病理的扩散和最终导致AD痴呆临床综合征的细胞死亡的主要因素。在AD中观察到的所有其他生化效应和大脑中的神经退行性变化是对低聚物的最初有毒侮辱的反应或下游效应。这些聚集体然后通过大脑扩散并引起疾病特异性的神经退行性。其他神经退行性疾病遵循类似的发病机理模式,其中具有重要生物学功能的正常脑蛋白因清除率受损而被困在衰老的大脑中,然后错误地折叠并汇总到表现出类似prike行为的神经毒性物种中。通过阻止健康蛋白质的错误折叠和聚集来抑制神经退行性的第一步,有可能减慢或阻止疾病的进展,并且如果在AD和其他神经退行性疾病的早期进行治疗,它可能会延迟或阻止临床症状的发作。
3。生物医学科学系自身免疫和炎症实验室(LAI),第11和BK21Plus生物医学科学项目,首尔国立大学医学院医学院,12080年12月12日,大韩民国首尔。13 4。医学院生物医学科学系和BK21plus生物医学科学14韩国国立大学医学院汉城03080,大韩民国共和国。15 5。Yonsei大学医学院内科,16朝鲜共和国尤森大学。 17 6。 宽河免疫学研究所,首尔国立大学,韩国25159,共和国18号。 19 7。 肾脏科学系首尔国立大学医院肾脏科,韩国共和国2080年20月20日。 21 8。 肾脏科学系肾脏科学系22,尤斯大学医学院,首尔03722大韩民国。 23 9。 首尔国立大学医学院缺血/低氧疾病研究所;首尔24国立大学医院生物医学研究所,首尔03080,大韩民国。 25 26†这些作者对这项工作做出了同样的贡献27 28利益冲突陈述:29作者宣布不存在利益冲突。 30 31通讯32 33 Won-woo Lee D.V.M.,博士学位34 35教授,微生物学和免疫学系 /生物医学科学系36首尔国立大学医学院37 103 Daehak-ro,Jongno-Gu,韩国首尔03080,韩国。 44 Tel) +82-2-740-8545 /电子邮件)hyk0801@hotmail.com 45 46 < / div>Yonsei大学医学院内科,16朝鲜共和国尤森大学。17 6。宽河免疫学研究所,首尔国立大学,韩国25159,共和国18号。 19 7。 肾脏科学系首尔国立大学医院肾脏科,韩国共和国2080年20月20日。 21 8。 肾脏科学系肾脏科学系22,尤斯大学医学院,首尔03722大韩民国。 23 9。 首尔国立大学医学院缺血/低氧疾病研究所;首尔24国立大学医院生物医学研究所,首尔03080,大韩民国。 25 26†这些作者对这项工作做出了同样的贡献27 28利益冲突陈述:29作者宣布不存在利益冲突。 30 31通讯32 33 Won-woo Lee D.V.M.,博士学位34 35教授,微生物学和免疫学系 /生物医学科学系36首尔国立大学医学院37 103 Daehak-ro,Jongno-Gu,韩国首尔03080,韩国。 44 Tel) +82-2-740-8545 /电子邮件)hyk0801@hotmail.com 45 46 < / div>宽河免疫学研究所,首尔国立大学,韩国25159,共和国18号。19 7。肾脏科学系首尔国立大学医院肾脏科,韩国共和国2080年20月20日。21 8。肾脏科学系肾脏科学系22,尤斯大学医学院,首尔03722大韩民国。23 9。首尔国立大学医学院缺血/低氧疾病研究所;首尔24国立大学医院生物医学研究所,首尔03080,大韩民国。25 26†这些作者对这项工作做出了同样的贡献27 28利益冲突陈述:29作者宣布不存在利益冲突。30 31通讯32 33 Won-woo Lee D.V.M.,博士学位34 35教授,微生物学和免疫学系 /生物医学科学系36首尔国立大学医学院37 103 Daehak-ro,Jongno-Gu,韩国首尔03080,韩国。44 Tel) +82-2-740-8545 /电子邮件)hyk0801@hotmail.com 45 46 < / div>44 Tel) +82-2-740-8545 /电子邮件)hyk0801@hotmail.com 45 46 < / div>38 TEL) +82-2-740-8303,传真) +82-2-743-0881 /电子邮件)wonwoolee@snu.ac.kr 39 40 Hee Young Kim Ph.D. 41首尔国立大学医学院微生物学和免疫学系研究教授43 103 Daehak-Ro,Jongno-Gu,韩国首尔03080,韩国。
(NCT02575261)和使用中性脂质体小干扰 RNA 递送实体瘤的 EphA2 基因靶向(NCT01591356)。两项研究均提前终止,但迄今为止尚无数据发布。抗 EphA2 抗体 DS-8895a 在晚期或转移性 EphA2 阳性实体瘤患者中进行了研究。未达到最大耐受剂量 (MTD),安全性数据包括血小板减少、感觉减退、低血压、外周寒冷、恶心、呕吐和输液反应。17 由于肿瘤摄取不良,该抗体的进一步开发被迫停止。18 MM-310(一种含有多西紫杉醇的 EphA2 抗体靶向纳米脂质体)的研究因累积性周围神经病变而终止。 19 最后,一项关于 MEDI-547(一种由奥瑞他汀(细胞毒素)和 EphA2 单克隆抗体组成的抗体药物偶联物 (ADC))的研究因治疗相关的出血和凝血缺陷而终止。20