结直肠癌(CRC)是全球最致命,通常被诊断出的肿瘤之一。几个基因参与其发展和进展。最常见的突变涉及APC,KRAS,SMAD4和TP53基因,这表明CRC依赖于相关途径的伴随改变。但是,使用经典的分子方法,同时分析这些途径之间的互连并不容易。为了克服这一局限性,最近这些途径已包括在一个巨大的化学反应网络(CRN)中,描述了健康的结直肠细胞处理如何通过生长因子从环境中感知的信息。从此CRN开始,我们提出了一个计算模型,该模型模拟了全局信号网络对单个或多个并发突变引起的效果。该模型已在三种情况下进行了测试。首先,我们通过APC,KRAS,SMAD4或TP53中的突变量化了网络蛋白浓度所引起的变化。第二,我们计算了由多达两个影响网络上游蛋白的并发突变引起的p53浓度的变化。第三,我们考虑了受KRAS功能增长影响的突变细胞,并模拟了Dabrafenib的作用,表明该模型可用于确定将最有效的药物传递到细胞中。通常,所提出的方法显示出几个优点,因为它允许量化由单个或多个给定突变引起的蛋白质浓度的变化。此外,可以使用CRC全局信号网络的模拟来识别新的治疗靶标,或者披露所涉及途径之间的意外相互作用。
化学疗法或内源性醛。ICL的形成触发FA核心综合以定位于DNA病变,然后募集其他含FA蛋白质的复合物和ICL修复酶(4)。FA基因中的不活性突变导致无法修复ICL,从而导致杂种不稳定性。 FA造血干细胞和祖细胞(HSPC)中的DNA损伤会激活MYC和遗传毒性应激/TP53途径,并诱导炎症的炎性细胞因子信号传导(1,5,6)。 通过先前未定义的下流事件,这些变化驱动了FA中的HSPC损失和/或血液系统恶性肿瘤。 在JCI的这个问题中,Casado等。 通过识别免疫介导的机制来提供这种缺失的下游链接,通过该机制激活DNA损伤途径会导致BMF(7)(图1)。FA基因中的不活性突变导致无法修复ICL,从而导致杂种不稳定性。FA造血干细胞和祖细胞(HSPC)中的DNA损伤会激活MYC和遗传毒性应激/TP53途径,并诱导炎症的炎性细胞因子信号传导(1,5,6)。通过先前未定义的下流事件,这些变化驱动了FA中的HSPC损失和/或血液系统恶性肿瘤。在JCI的这个问题中,Casado等。通过识别免疫介导的机制来提供这种缺失的下游链接,通过该机制激活DNA损伤途径会导致BMF(7)(图1)。
• 之前接受过治疗的华氏巨球蛋白血症患者,如果接受治疗,下一步将接受苯达莫司汀联合利妥昔单抗治疗。患者必须未接受过布鲁顿激酶抑制剂治疗,除非患者通过早期使用计划接受了赞布替尼治疗之前接受过治疗的华氏巨球蛋白血症,或之前开始使用伊布替尼治疗之前接受过治疗的华氏巨球蛋白血症,但停药仅是因为剂量限制性毒性,且疾病明显没有进展。• 之前未接受过治疗的慢性淋巴白血病 (CLL) 或小淋巴细胞淋巴瘤 (SLL),存在 17p 缺失和/或 TP53 突变。患者先前必须未接受过 CLL/SLL 的全身治疗,除非先前通过百济神州早期使用计划开始使用一线 zanubrutinib,或者由于剂量限制性毒性并且明显没有病情进展而必须停止使用一线 acalabrutinib 或一线 ibrutinib。• 先前未接受过治疗的慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 或小淋巴细胞淋巴瘤 (SLL),没有 17p 缺失或 TP53 突变,这些患者原本被认为不适合使用氟达拉滨、环磷酰胺和利妥昔单抗 (FCR) 联合治疗或苯达莫司汀和利妥昔单抗 (BR) 联合治疗。患者既往未接受过任何针对 CLL/SLL 的全身治疗,除非之前通过 BeiGene 早期使用计划开始使用一线 zanubrutinib,或一线 acalabrutinib 仅因剂量限制性毒性且在明显无疾病进展的情况下必须停用。• 先前接受过治疗的慢性淋巴细胞白血病 (CLL),无论是否存在 17p 缺失和/或 TP53 突变。患者必须是未接受过布鲁顿激酶抑制剂治疗的患者,或患者之前已开始使用伊布替尼或阿卡替尼单药治疗先前接受过治疗的 CLL/SLL,并且仅因剂量限制性毒性且在明显无疾病进展的情况下必须停用伊布替尼或阿卡替尼,或患者之前曾接受过伊布替尼加维奈克拉的一线组合治疗,并且在完成治疗时仍有反应,但此后复发。 • 曾接受过至少 1 种抗 CD20 疗法治疗的边缘区淋巴瘤 (MZL)。患者必须未接受过布鲁顿激酶抑制剂治疗,或已通过公司准入计划接受过 zanubrutinib 治疗。治疗意向
*频率,响应率和结果度量应通过风险类别进行报告,如果有足够的数量可用,则应通过指示的特定遗传病变。†主要基于在经过跨治疗的患者中观察到的结果。根据可测量残留疾病分析的结果,在治疗过程中可能会发生变化。•并发套件和/或FLT3基因突变不会改变风险分类。§AML被归类为不良风险。||仅影响Cebpa基本亮氨酸拉链的框内突变,无论它们是否以单相关还是双重突变的形式出现,都与有利的结果有关。¶(t (9; 11)的存在P21.3; Q23.3)优先于罕见的,并发的不良风险基因突变。#Eccluding KMT2A部分串联复制(PTD)。**复合核型:在没有其他类别定义的重复遗传异常的情况下,$ 3无关的染色体异常;不包括三个或三个或多个三分之一的高二倍体核型(或多个多核),没有结构异常。††单粒核型:存在两个或更多不同的单色((不包括X或Y(Y(Y(Y(Y))),或一个单个常染色体单子弹结合使用,与至少一个结构性染色体异常相结合,不包括核心结合因子AML)。‡‡目前,如果这些标记与有利的风险AML亚型共发生,则不应将这些标记用作不良预后标记。从参考文献6ATP53在变异等位基因部分至少为10%处的ATP53突变,与TP53等位基因状态(单或双重突变无关; TP53突变与AML与复合和单核核型显着相关。
慢性淋巴细胞性白血病(CLL)是老年人的一种疾病,诊断为70岁。疾病的自然病程差异很大,非培养和无症状白血病的患者不接受治疗。,但是高级和进行性CLL确实需要治疗。近年来,CLL治疗的结果显着改善,主要是由于引入了新的和更有效的药物,包括B细胞受体抑制剂和B细胞淋巴瘤2(BCL2)抑制剂。这些新药被连续用作单一疗法,或在指定期间的征服方案中。venetoclax与抗CD20抗体结合使用了24(利妥昔单抗)或12(obinutuzumab)月,而用ibrutinib和venetoclax进行治疗持续15个月。治疗方案的选择应在很大程度上取决于对17p缺失/ TP53突变的评估,并且在第二处理线Im-munoglobulin可变重链(IGVH)突变状态中,这与免疫化学疗法的反应相关。免疫化学疗法的作用最近显着降低了。在没有17p缺失/ TP53突变的患者中,它仍然是一种选择,具有编码IGVH的突变基因且性能良好。然而,最近的研究结果表明,这些患者也可能从无化学治疗方案中获得重大益处。在第一批和随后的治疗线中,其余的患者应接受新的靶向疗法,该疗法目前可根据药物计划在波兰可用。在本文中,我们介绍了CLL诊断和治疗指南的更新,包括治疗自身免疫并发症以及
ALK (4) NRAS (2) ARID1A (1) NRG1 (2) ATM (2) NTRK (6) ATR (1) P53 (1) BRAF (15) PALB (1) BRCA (2) PDGFR (2) CCND (1) PIK3 (5) CDK4/6 (1) POLD1 (2) CDKN2 (1) POLE (2) ctDNA (3) PRKC (2) CTNNB1 (1) PTCH1 (2) DDR (5) RAF (2) EGFR (10) RAS (2) ERK (2) RET (4) EWSR1 (1) ROS1 (5) EZH2 (1) SMO (1) FBXW7 (1) STK11 (1) FGFR (4) TAF15 (1) GNAQ/11 (2) TMB (4) HRD (7) TP53 (1) IDH (2) TSC (1) KIT (2) UGT1A1 (1) KRAS (24) CCNE1 (1) MDM2 (1) CLDN (3) MEK (3) FET (1) MET (5) FRa (1) MMR (2) FUS (1) MRD (2) HER2 (12) MSI-H (1) MAGE (2) MTAP (4) MUC (1) MYC (1) PD-L1 (12) Nectin-4 (2) PRAME (1) NF1 (6)
用于指导复发和难治性套细胞淋巴瘤 (R/R MCL) 治疗决策的临床工具有限,而循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的转化潜力在很大程度上仍未得到证实。我们设计并应用了基于面板的双重测序,以揭示接受维奈克拉、来那度胺和利妥昔单抗 (Ven-R2) 治疗的 R/R MCL 患者 ctDNA 中反应和结果的分子决定因素。基因分析揭示了反应和结果的分子预测因子,这些预测因子与临床预后因素无关,SMARCA4 突变的 R/R MCL 对治疗有反应,而 TP53 突变则产生耐药性。治疗前 ctDNA 捕获了空间异质性,其浓度与临床病理疾病特征和生存期相关,与分子预测因子无关。根据当代实时定量 PCR 检测,对微小残留病的动态 ctDNA 评估补充了临床反应评估,并揭示了部分分子缓解患者的难治性。基线时克隆性造血 (CH) 的特征与治疗期间的血液学毒性和不良结果相关。治疗期间对 TP53 相关 CH 的阳性选择不会损害 ctDNA 反应分析的特异性,并且碎片特征可以区分 MCL ctDNA 和 CH。总之,我们报告了 MCL ctDNA 中的新特征,这些特征解锁了新的微创工具,有可能改变 R/R MCL 的临床决策。
leukemiutringbenmärg/blod mylood面板*(ABL1,ANKRD26,ASXL1,ATRX,BCOR,BCOR,BCORL1,BRAF,CALR,CALR,CBL,CBL,CBL,CBL,CDKN2A,CDKN2A,CEBPA,CEBPA,CEBPA,CSF3R,CSF3R,CSF3R,CUX1,DDX41,DDX41,DNMT3A fbxw7, FLT3, GATA1, GATA2, GNAS, HRAS, Idh1, Idh2, Ikzf1, jak2, jak3, kdm6a, kit, kraas, kmt2a, mpl, myd88, NF1, Notch1 (INKLUSIVE 3´UTR), NPM1, NRAS, PDGFRA, PHF6, PPM1D, Pten, Ptpn11, Rad21, Runx1, Samd9, SAMDL9, Setbp1, SF3B1, SMC1A, SMC3, SRSF2, Stag2, Stat3, Stat5B, Tet2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR2, BTK, plcg2, terc) Div>
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摘要。肾肿瘤是 10 种最常见的癌症类型之一。肾细胞癌 (RCC) 是最常见的肾癌类型,被认为是西方世界第七大最常见的癌症类型。最常见的改变基因是 VHL、PBRM1、SETD2、KDM5C、PTEN、BAP1、mTOR、TP53、TCEB1 (ELOC)、SMARCA4、ARID1A 和 PIK3CA。RCC 疗法可分为三类:单克隆抗体、酪氨酸激酶抑制剂和 mTOR 抑制剂。此外,还有针对性药物治疗 RCC。然而,患者经常出现副作用和耐药性。尽管已经报道了许多针对 RCC 的多药耐药机制,但专注于揭示新的生物标志物以及更有效且无副作用或副作用较小的抗肿瘤疗法的研究非常重要。一些研究
