摘要:信息提取(IE)是自然语言处理(NLP)和计算机视觉的基本任务,旨在自动从非结构化数据源(例如文本,图像和视频)中提取结构化信息。本文对各种IE技术进行了全面的调查,重点介绍了指定的实体识别(NER),关系提取(RE)和意见分类。我们讨论了基于规则的,无监督,监督和深度学习方法,以突出其优势和局限性。此外,我们还探讨了IE在不同应用中的作用,包括学术文献数据库,商业智能,医疗保健,专利分析和客户服务。此外,我们研究了应用于图像和视频的IE方法,涵盖了视觉关系检测,光学特征识别(OCR)和自动视频摘要。本文还解决了诸如域适应,模棱两可,数据隐私和计算效率之类的挑战。最后,我们概述了未来的研究方向,强调了多模式IE的整合,深度学习的进步和实时处理。关键字:信息提取(IE),命名实体识别(NER),关系提取(RE),意见分类,基于特征的监督学习,IE深度学习,文本挖掘,光学角色识别(OCR)和自然语言处理(NLP)。I.简介信息提取(IE)是从非结构化或半结构化数据源(例如文本文档,图像和视频)中自动识别,提取和构造相关信息的过程。它涉及将原始数据转换为有意义的结构化表示形式的技术,从而促进了下游任务,例如知识图构造,问题答案和信息检索[1]。IE主要着重于提取特定类型的信息,包括:
在将其用于关键应用程序之前,请始终验证使用文档信息提取服务提取的信息。当我们争取最高的准确性和质量时,请注意,提供的提取结果可能并非完全没有错误。此限制适用于标准和自定义文档类型。它也适用于所有可用的提取方法 - 换句话说,该服务的机器学习模型,生成AI和模板。
该方案描述了从多种不同物种的多个不同组织样品中手动提取HMW DNA,不包括植物和真菌,用于使用Qiagen MagAttract HMW DNA提取试剂盒进行长阅读测序。此过程对于生命之树计划所涵盖的各种分类群体都是有效的。该方案对于组织可用性有限的样品特别有用,因为它始终从这些较小的样品中产生的DNA比等效的自动化方法更多。The output of this protocol is HMW DNA, which depending upon yield and the genome size of the species, can be directed towards HMW DNA Pooling, HMW DNA Fragmentation: Diagenode Megaruptor® 3 for LI HiFi, HMW DNA Fragmentation: Diagenode Megaruptor® 3 for LI PacBio or HMW DNA Fragmentation: g-Tube for ULI PacBio.
摘要 - 开放式学习从使用符号方法来实现目标表示,因为它们提供了为有效且可转移的学习构建知识的方法。但是,依赖符号推理的现有层次增强学习(HRL)方法通常受到手动目标表示,因此通常受到限制。自主发现符号目标表示的挑战是它必须保留关键信息,例如环境动态。在本文中,我们提出了一种通过紧急表示(即组在一起)在任务中具有相似作用的环境状态集的新兴表示的发展机制。我们引入了一种封建HRL算法,该算法同时了解目标表示和层次结构政策。该算法使用神经网络工作的符号可及性分析来近似状态集之间的过渡关系并确定目标表示。我们在复杂的导航任务上评估了我们的方法,表明学习的表示形式可解释,可转移,并导致数据有效学习。
6如果菌株产生会干扰相分离的表面活性剂,请加入0.1体积3 M乙酸钠和1体积冷的异丙醇,混合并在冰上孵育20分钟。在5000 rpm处离心10分钟,并倒在上清液中。然后重悬于400μl的10和550μl十*中,然后转移到微分管中。
要通过分子方法研究海洋环境中的微生物群落,重要的是要以足够的量和纯度提取DNA。样品中抑制剂的存在可能导致虚假的阴性结果或信息丢失,但可以通过实验中的过程控制来突出显示。我们比较了海洋样品上的七种细菌DNA提取方法:鱼皮,g和胆量,软体动物肉,浮游植物和浮游动物。在一半的样品中添加了一个过程控制(单核细胞增生李斯特菌)。比较了DNA提取方法的性能,以产生针对细菌TUF基因和过程控制Hlya基因的QPCR扩增的更纯和浓缩的DNA。通过分光光度法测定测定DNA的纯度和浓度。结果表明,使用PowerBiofilm和Purelink微生物组试剂盒获得了最高纯度和浓度DNA。QPCR数据证实了这些试剂盒以更高的扩增效率产生了更好的细菌DNA纯度和浓度。在某些样品中,通过靶向Hlya基因的QPCR检测到抑制剂的存在,表明样品是被抑制剂污染的异质性。DNA提取物适用于海洋环境中的遗传下游应用。
与研磨过程。我通常更喜欢类似于水稻颗粒的沉淀尺寸,无论是冷冻的还是新鲜的。我去除了多余的液体,因为它使磨石变得困难(藻类倾向于漂浮!)。我检查了显微镜下的样品,以评估磨削的进展,并观察CTAB溶液的绿色。通常,我将每个样品磨碎大约一分钟。•或者,您可以使用自动涡流适配器(例如Mobio)同时处理多个样本。沉淀后,将二氧化硅砂和细胞与CTAB放在管中。让其在架子上站立5分钟,然后将其转移到热块20分钟。如果CTAB缓冲区在此步骤之后没有变成绿色,请重复涡旋过程。一般规则,尤其是在仅氯仿提取物中,添加更多的组织可以产生更多的DNA到一定点,但它还增加了样品中污垢或杂质的量。DNA中的残基可以氧化样品,从而导致降解,并且可能会干扰下游应用中使用的酶。因此,必须在所用的组织量与提取的DNA质量之间找到适当的平衡,以确保在进一步的实验中获得可靠的结果。
a 哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院,哈尔滨,中国 b LINEACT CESI,里昂 69100,法国 c 埃法特大学电气与计算机工程系,吉达 22332,沙特阿拉伯 d Persistent Systems Limited,那格浦尔,印度 e AGH 科技大学生物控制论与生物医学工程系,克拉科夫,波兰 f 克拉科夫理工大学计算机科学与电信学院计算机科学系,华沙 24,31-155,克拉科夫,波兰 g 波兰科学院理论与应用信息学研究所,Ba ł tycka 5,44-100,格利维采,波兰 h EIAS 数据科学实验室,苏丹王子大学计算机与信息科学学院,利雅得 11586,沙特阿拉伯 i 梅努菲亚大学理学院数学与计算机科学系,32511,埃及j 埃及梅努菲亚大学计算机与信息学院信息技术系
添加到1.5毫升管中。血液:在13,000rpm处离心血液样本约1分钟(到颗粒样品)。用牙签从乙醇中取出样品,然后将其印迹到组织中。几乎干燥后,将牙签转移到1.5ml管中,然后摇晃以脱落血液。取出牙签并放入消毒剂中。拭子:乙醇干燥并放入1.5毫升管中。从交换的末端扣下来,以便盖子可以关闭。羽毛:将1-3羽羽毛的鱿鱼切成小块,在无菌玻璃板上用无菌剃刀刀片切成小块,然后再添加到管中。如果羽毛很小并且尖端上存在血斑,则可以添加羽毛。
AurélienMaillet,AgnèsBouju-Albert,Steven Roblin,PaulineVaissié,SébastienLeuillet等。dna提取方法和采样方法对细菌群落的采样方法和采样方法,受16s rdna Metabarcoding在冷salmokeped salmon and Processing salmon and Processing surfaces中监测的细菌群落。食品微生物学,2021,95,pp.1-10。10.1016/j.fm.2020.103705。hal-03492706