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定量性状基因座映射鉴定的候选基因涉及植物高度调节水稻的
摘要：水稻植物的高度是一种与生物量，住宿耐受性和产量密切相关的农业特征。识别与植物高度调节和制定筛查潜在候选基因的策略有关的定量性状基因座（QTL）区域可以改善水稻的农业特征。在这项研究中，使用了跨越“ Cheongcheong”和“ Nagdong”个体的双单倍体种群（CNDH），并使用了222个单序重复标记构建遗传图。在RM3482-RM212区域中，染色体1，QPH1，QPH1-1，QPH1-3，QPH1-5和QPH1-6的区域连续五年识别。表型方差解释的范围为9.3％至13.1％，LOD评分在3.6至17.6之间。Osphq1是一种与植物高度调节有关的候选基因，在RM3482-RM212中进行了筛选。Osphq1是吉布雷素20氧化酶2的直系同源物，其单倍型以9个SNP区分。根据其高度将植物分为两组，并根据Osphq1的表达水平区分高植物并聚集。QTL和候选基因，因此，筛选了生物量调节，但是调节的分子机制仍然鲜为人知。本研究获得的信息将有助于开发通过水稻植物高度控制的标记辅助选择和繁殖的分子标记。
甲基化定量性状基因座和GWAS的整合分析确定了三种精神分裂症风险变体
该作者接受的手稿是未经编辑的同行评审手稿的PDF文件，该文件已被接受以供出版，但尚未被复制或更正。期刊上发布的官方记录的官方版本是最新的，因此可能与此版本有所不同。
鉴定儿童血液中常染色体CIS表达定量性状甲基化（顺式EQTMS）
1 Respucation of ResjudmentBioMédicen Red de Enfermedes Raras（Ciberer），西班牙巴塞罗那； 2大学庞贝·法布拉大学（UPF），西班牙巴塞罗那； 3西班牙巴塞罗那科学技术研究所（Bisti）基因组调节中心（CNAG-CRG）的Centro NacionaldeAnálisisGenómica（CNAG-CRG）； 4 Isglobal，西班牙巴塞罗那； 5西班牙巴塞罗那巴塞罗那科学技术学院基因组监管中心（CRG）； 6 CiberEpidemiologíay SaludPública（Ciberesp），西班牙巴塞罗那； 7医学基因组学集团，圣地亚哥大学，西班牙圣地亚哥·德·孔波斯特拉； 8英国布拉德福德的布拉德福德教学医院NHS基金会信托基金Bradford健康研究所； 9大学格勒诺布尔（Grenoble Alpes），Inserm，CNRS，环境流行病学团队，用于繁殖和呼吸遗产，法国格勒诺布尔； 10日环境科学系，立陶宛Kaunas Vytautas Magnus University； 11挪威挪威公共卫生学院环境卫生部；挪威； 12社会医学系，克里特岛克里特大学，希腊克里特岛； 13美国南加州大学凯克医学院预防医学系，美国洛杉矶，美国； 14 Medicine Genomics Group，Ciberer，Santiago de Compostela大学，西班牙圣地亚哥De Costela； 15加利西亚州基因组医学基金会，西班牙圣地亚哥·德·波多拉（Santiago de Costela）； 16定量基因组医学实验室（QGENOMICS），西班牙巴塞罗那的埃斯普尔·德尔·洛布雷加； 17 Departoment de Biomedicine，DeNeurociències，巴塞罗那大学，巴塞罗那大学，西班牙
使用ddrad-seq的高密度SNP遗传图构建和芝麻胶囊粉碎特征的映射
芝麻的含种子胶囊在收获时破碎。这种野性的特征使该作物不适合机械化收获，并通过限制无法获得低成本劳动的国家的耕种来限制其商业潜力。因此，为了开发可持续的芝麻农业的机械化品种，囊囊破碎特征的基本遗传基础非常重要。在本研究中，我们产生了芝麻F 2种群，这些种群源自胶囊粉碎品种（Muganli-57）和非惊人突变体（PI 599446）之间的交叉，该杂种用于基于基于双重数量的限制性站点 - 相关的DNA测序的遗传图。所得的高密度遗传图包含782个单核苷酸多态性（SNP），并跨度为697.3厘米，平均标记间隔为0.89 cm。基于参考基因组，将囊破碎特性映射到SNP标记物S8_5062843（78.9厘米）附近LG8（染色体8）附近。为了揭示可能控制破碎特征的基因，检查了标记区域（S8_5062843），并确定了包括六个CDSS的候选基因。注释表明，该基因编码具有440个氨基酸的蛋白质，与转录抑制剂KAN1共享约99％的同源性。与胶囊粉碎等位基因相比，SNP在S8_5062843的空气区域中发生变化和改变的剪接，导致mRNA中的移码突变，从而导致突变父母中该基因的功能丧失，从而导致在不受破坏的囊囊和叶片卷曲中。使用基因组数据，开发了Indel和CAPS标记，以区分标记辅助选择研究中的破碎和非惊人的胶囊基因型。在研究中获得的结果在育种计划中可能是有益的，以提高破碎的性状并提高芝麻的生产力。
玉米中与耳朵相关性状的定量性状基因座和候选基因的热点区域：文献综述
摘要：在这项研究中，热点区域，QTL簇和候选基因具有八个与耳朵相关的玉米特征（耳长，耳长，耳道，内核行号，每行的内核数，内核长度，内核宽度，内核宽度，内核厚度和100个内核重量），并总结了三个十二次。本评论的目的是（1）全面总结和分析与这八个与耳朵相关性状相关的QTL的研究，并确定位于玉米染色体上的热点式bin区域以及与耳朵相关性状相关的关键候选基因，以及与QTL和稳定的QTL和QTL clusers和QTL clusers相关的杂物和QTL clusique和QTL clusequique and Migapppers的信息，并兴起。用于高收益和高质量玉米的映射，基因克隆和育种。先前的研究表明，与耳朵相关性状的QTL分布在玉米中的所有十种染色体上，而表型变异的解释为单个QTL范围为0.40％至36.76％。总共确定了所有十种染色体的耳朵相关性状的23个QTL热点箱。最突出的热点区域是4号染色体上的bin 4.08，其中15个QTL与八个与耳朵相关性状有关。此外，本研究确定了与耳朵相关性状相关的48个候选基因。在这些研究中，有五个被克隆和验证，而QTL热点中的二十8个候选基因是由本研究定义的。本评论对QTL映射的进步以及与八个与耳朵相关特征相关的关键候选者的识别提供了更深入的了解。这些见解无疑将帮助玉米育种者制定策略来开发高产玉米品种，从而有助于全球粮食安全。
秀丽隐杆线虫中伊维菌素反应的转录组学：整合淡蛋白的定量性状基因座并与伊维菌素暴露的DA1316菌株进行比较
寄生线虫对人类和动物的健康构成了重大威胁，并在农业部门造成经济损失。使用驱虫药物（例如伊维菌素（IVM））来控制这些寄生虫的使用导致了广泛的耐药性。识别寄生线虫中抗药性的遗传标记可能具有挑战性，但是秀丽隐杆线虫的自由生活的Nema-Tode Caenorhabditis提供了合适的模型。在这项研究中，我们旨在分析成人c的转录组。秀丽隐杆线虫蠕虫暴露于驱虫药伊维菌素（IVM）的N2菌株，并将其与抗性菌株DA1316和最近确定的杀伤蛋白定量性状基因座（QTL）进行比较。 RNA并在Illumina NovaseQ6000平台上对其进行了排序。使用内部管道确定差异表达的基因（DEG）。将DEG与先前关于IVM抗性c的微阵列研究的基因进行了比较。秀丽隐杆线虫和Abamectin-QTL。我们的结果显示，N2 c中不同基因家族的615摄氏度（183个上调和432个下调基因）。秀丽隐杆线伤。31与DA1316菌株的IVM成年蠕虫的基因重叠。我们确定了19个基因，包括叶酸转运蛋白（Folt-2）和跨膜转运蛋白（T22F3。11），在N2和DA1316菌株中表现出相反的表达，被认为是潜在的候选物。此外，我们编制了进一步研究的潜在候选列表，包括T型钙通道（CCA-1），氯化钾共转运蛋白（KCC-2），以及其他映射到Abamectin-QTL的基因，例如谷氨酸门控通道（GLC-1）。
法国根据条约第 13(3) 条提交的年度报告...
1.1。禁止原则适用于每年更新的边界。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 22 1.2。政府的责任。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 23 1.3。对许可证申请进行逐案审查。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 23 1.4。出口转移的特殊情况。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 24 1.5。国际和国家层面的透明度。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 26
识别静息态神经振荡功率与特质焦虑之间具有最大关联的空间模式
摘要 焦虑影响着全球大约 5-10% 的成年人口，给卫生系统带来了沉重的负担。尽管焦虑无处不在，并且对身心健康产生影响，但大多数受焦虑影响的人都没有得到适当的治疗。精神病学领域的当前研究强调需要识别和验证与这种疾病相关的生物标记。神经生理学临床前研究是一种确定大脑节律的主要方法，可以作为焦虑主要特征的可靠标记。然而，虽然神经影像学研究一致表明前额叶皮层和皮层下结构（如杏仁核和海马）与焦虑有关，但对于导致这种疾病的潜在神经生理过程仍缺乏共识。允许非侵入性记录和评估皮质处理的方法可能有助于识别可用作干预目标的焦虑特征。在本研究中，我们将源功率共调节 (SPoC) 应用于具有不同程度焦虑特质的参与者样本的脑电图 (EEG) 记录。 SPoC 的开发是为了寻找空间滤波器和模式，这些滤波器和模式的功率与个体参与者的外部变量共同调节。所获得的模式可以从神经生理学角度进行解释。在这里，我们将 SPoC 的使用扩展到多受试者环境，并使用具有真实头部模型的模拟数据测试其有效性。接下来，我们将 SPoC 框架应用于 43 名人类参与者的静息状态脑电图，这些参与者的特质焦虑评分可用。SPoC 对窄频带数据的受试者间分析揭示了具有神经生理学意义的 θ 波段（4-7 Hz）空间模式，这些模式与焦虑呈负相关。结果特定于 θ 波段，在 alpha（8-12 Hz）或 beta（13-30 Hz）频率范围内未观察到。θ 波段空间模式主要位于额上回。我们讨论了我们的空间模式结果对于寻找焦虑生物标志物的相关性及其在神经反馈研究中的应用。
识别静息态神经振荡功率与特质焦虑之间具有最大关联的空间模式
摘要 焦虑影响着全球大约 5-10% 的成年人口，给卫生系统带来了沉重的负担。尽管焦虑无处不在，并且对身心健康产生影响，但大多数受焦虑影响的人都没有得到适当的治疗。精神病学领域的当前研究强调需要识别和验证与这种疾病相关的生物标记。神经生理学临床前研究是一种确定大脑节律的主要方法，可以作为焦虑主要特征的可靠标记。然而，虽然神经影像学研究一致表明前额叶皮层和皮层下结构（如杏仁核和海马）与焦虑有关，但对于导致这种疾病的潜在神经生理过程仍缺乏共识。允许非侵入性记录和评估皮质处理的方法可能有助于识别可用作干预目标的焦虑特征。在本研究中，我们将源功率共调节 (SPoC) 应用于具有不同程度焦虑特质的参与者样本的脑电图 (EEG) 记录。 SPoC 的开发是为了寻找空间滤波器和模式，这些滤波器和模式的功率与个体参与者的外部变量共同调节。所获得的模式可以从神经生理学角度进行解释。在这里，我们将 SPoC 的使用扩展到多受试者环境，并使用具有真实头部模型的模拟数据测试其有效性。接下来，我们将 SPoC 框架应用于 43 名人类参与者的静息状态脑电图，这些参与者的特质焦虑评分可用。SPoC 对窄频带数据的受试者间分析揭示了具有神经生理学意义的 θ 波段（4-7 Hz）空间模式，这些模式与焦虑呈负相关。结果特定于 θ 波段，在 alpha（8-12 Hz）或 beta（13-30 Hz）频率范围内未观察到。θ 波段空间模式主要位于额上回。我们讨论了我们的空间模式结果对于寻找焦虑生物标志物的相关性及其在神经反馈研究中的应用。
一种新型的定量特质基因座暗示了MSH3在小鼠全基因组短串联重复膨胀
1医学系2，美国加利福尼亚州加利福尼亚州加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚州加利福尼亚州92093的计算机科学与工程系； 3加利福尼亚州加利福尼亚大学加利福尼亚州加利福尼亚州加利福尼亚州加利福尼亚州92093，加利福尼亚大学圣地亚哥分校生物信息学和系统生物学计划； 4田纳西大学健康科学中心，田纳西州田纳西州38163，田纳西大学健康科学中心遗传学，基因组学和信息学系； 5意大利的那不勒斯80111国家研究委员会遗传与生物物理学研究所； 6美国加利福尼亚州圣地亚哥分校电气与计算机工程系，美国加利福尼亚州92093，美国； 7美国斯坦福大学斯坦福大学的生物学系8遗传学系94305； 9美国加利福尼亚州加州圣地亚哥分校基因组医学研究所，美国加利福尼亚州92093，美国； 10精神病学系，11个生物医学信息学系医学系，加利福尼亚州圣地亚哥分校，加利福尼亚州，加利福尼亚州92093，美国1医学系2，美国加利福尼亚州加利福尼亚州加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚州加利福尼亚州92093的计算机科学与工程系； 3加利福尼亚州加利福尼亚大学加利福尼亚州加利福尼亚州加利福尼亚州加利福尼亚州92093，加利福尼亚大学圣地亚哥分校生物信息学和系统生物学计划； 4田纳西大学健康科学中心，田纳西州田纳西州38163，田纳西大学健康科学中心遗传学，基因组学和信息学系； 5意大利的那不勒斯80111国家研究委员会遗传与生物物理学研究所； 6美国加利福尼亚州圣地亚哥分校电气与计算机工程系，美国加利福尼亚州92093，美国； 7美国斯坦福大学斯坦福大学的生物学系8遗传学系94305； 9美国加利福尼亚州加州圣地亚哥分校基因组医学研究所，美国加利福尼亚州92093，美国； 10精神病学系，11个生物医学信息学系医学系，加利福尼亚州圣地亚哥分校，加利福尼亚州，加利福尼亚州92093，美国