抽象背景肿瘤抗原NY-ESO-1已被证明是转基因产物细胞疗法(ACT)的有效靶标,用于治疗肉瘤和黑色素瘤。然而,尽管经常产生早期临床反应,但许多患者最终发展为进行性疾病。了解耐药性的基本机制对于改善未来的ACT方案至关重要。在这里,我们描述了一种新型的肉瘤治疗耐药性机理,涉及涉及NY-ESO-1的表达丧失,以响应树突状细胞(DC)疫苗(DC)疫苗和程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)阻滞。Methods A HLA-A*02:01-positive patient with an NY- ESO-1-positive undifferentiated pleomorphic sarcoma was treated with autologous NY-ESO-1-specific T-cell receptor (TCR) transgenic lymphocytes, NY-ESO-1 peptide-pulsed DC vaccination, and nivolumab-mediated PD-1 blockade.结果在ACT后2周内与NY-ESO-1-特异性T细胞进行外周血重建,表明体内迅速膨胀。有初始的肿瘤回归,并且周围转基因T细胞的免疫表型随着时间的推移显示出主要的效应记忆表型。通过基于TCR测序的基于TCR测序和基于RNA测序的免疫重建,在治疗活检中证明了转基因T细胞对肿瘤部位的跟踪,并在肿瘤部位证实了转基因T细胞上的Nivolumab与PD-1的结合。在疾病进展时,发现NY-ESO-1的启动子区域被广泛甲基化,并且通过RNA测序和免疫组织化学测量,肿瘤NY-ESO-1表达完全丢失。通过直流疫苗接种和抗PD-1治疗给出的NY-ESO-1转基因T细胞的结论ACT导致瞬时抗肿瘤活性。ny-eso-1表达在纽约ESO-1启动子区域的广泛甲基化的情况下,在治疗后样品中丢失。生物/临床洞察力抗原损失代表了肉瘤中免疫逃生的新机制,并且是细胞疗法方法的新点。试用注册号NCT02775292。
图 1 P. discolor 基因组的改进基因注释。UCSC 基因组浏览器截图展示了具有各种改进的基因座示例,包括注释 (A) 先前注释中缺失的基因;CNTNAP2 ,(B) 新外显子;FOXP2 ,(C) 改进的 UTR;THSD1 ,和 (D) 替代异构体;GABRP 。在每个面板中,顶部轨道(浅蓝色)表示 Jebb 等人 2020 年报告的先前注释,第二条轨道(黑色)报告当前研究的更新注释。蓝色和红色的附加轨道表示支持当前注释的实验证据。水平线表示预测或观察到的基因座。垂直线或粗矩形表示通过预测或功能数据识别的外显子。较细的矩形表示从第一个外显子(5'UTR)或最后一个外显子(3'UTR)延伸出来的非翻译区(UTR)。箭头表示编码区(外显子)之间的非编码序列(内含子)和基因组中的编码方向。每个基因下方标有以千碱基 (kb) 为单位的比例尺。
摘要:生物限制因素包括病原真菌、病毒细菌、食草昆虫以及寄生线虫等,造成作物产量损失和品质下降,常规管理措施对这些生物限制因素的效果有限。转基因技术的进步为改良作物的生物抗性提供了直接而有方向性的途径。目前,通过异源表达外源基因和RNAi技术,已培育出上百个抗食草昆虫、病原病毒和真菌的转基因事件和数百个抗性品种,并获准种植和上市,显著减少了产量损失和品质下降。然而,通过过量表达内源基因和RNAi技术进行抗细菌和线虫的转基因改良的探索尚处于试验阶段。 RNAi 和 CRISPR/Cas 技术的最新进展为提高作物对病原细菌和植物寄生线虫以及其他生物限制的抵抗力开辟了可能性。
Charles J. Bieberich(221,235),病毒学系,Jerome H. Holland实验室,美国红十字会,马里兰州罗克维尔市20855年,霍华德Y. Chen(279),默克,夏普和Dohme研究实验室,新泽西州铁路,新泽西州07065 C. Cioffi(279) Doetschman(115),辛辛那提分子遗传学,生物化学和微生物学系,辛辛那提大学医学院,俄亥俄州辛辛那提市45267 Harold W. Hawk(339)马里兰州贝尔茨维尔,20705 Jan K. Heideman(265),转基因动物设施,威斯康星大学,威斯康星州麦迪逊大学,威斯康星州53706吉尔伯特·杰伊(Gilbert Jay)(221,235),病毒学系,杰罗姆·霍兰德(Jerome H. 45701 Michael J. Martin(315),DNX Corporation,新泽西州普林斯顿,08540 Glenn M. Monastersky(177),查尔斯·河实验室,威尔明顿,马萨诸塞州威尔明顿01887和TRANSGENIC ALLIANCE,TRENSGENIC ALLIANCE,St. Germain Sur sur sur L'Arbresle,France Liengo(235)马里兰州罗克维尔的克罗斯20855 Paul A. Overbeek(69),细胞生物学系兼分子遗传学研究所,德克萨斯州休斯敦贝勒医学院77030
摘要 乙酰胆碱 (ACh) 是周围神经系统 (PNS) 和中枢神经系统 (CNS) 的重要神经递质,它通过烟碱型乙酰胆碱受体 (nAChR) 和毒蕈碱型乙酰胆碱受体 (mAChR) 发出信号。在这里,我们探讨了三个 nAChR 亚基 chrna3 、 chrnb4 和 chrna5 的表达模式,它们位于进化保守的簇中。在多种脊椎动物中,这种紧密的基因组定位可能表明共同功能和/或共同表达。通过新型转基因斑马鱼系,我们观察到 PNS 和 CNS 内广泛表达。在 PNS 中,我们观察到 chrna3 tdTomato 、chrnb4 eGFP 和 chrna5 tdTomato 在肠道神经系统中的表达; chrna5 tdTomato 和 chrnb4 eGFP 位于侧线的感觉神经节中;而 chrnb4 eGFP 位于耳朵中。在中枢神经系统中,chrnb4 eGFP 和 chrna5 tdTomato 的表达出现在视网膜中,这三种基因均在大脑的不同区域表达,其中一部分 chrna3 tdTomato 和 chrnb4 eGFP 细胞被发现是投射到侧线的抑制性传出神经元。在脊髓内,我们在运动网络内识别出表达 chrna3 tdTomato、chrnb4 eGFP 和 chrna5 tdTomato 的不同神经元群,包括表达 dmrt3a 的中间神经元和表达 mnx1 的运动神经元。值得注意的是,每个半节段的三到四个初级运动神经元均被 chrna3 tdTomato 和 chrnb4 eGFP 标记。有趣的是,我们在每个半节段中发现了一个 sl 型次级运动神经元,该神经元强烈表达 chrna5 tdTomato 并同时表达 chrnb4 eGFP。这些转基因系为 nAChRs 在运动网络中的潜在作用提供了见解,并为探索它们在整个神经系统一系列组织中尼古丁暴露和成瘾的作用开辟了途径。
外源基因的异源表达、内源基因的过度表达和抑制不良基因的表达是转基因技术改良作物的三种策略。截至 2020 年,全球批准商业化推广的作物单个转基因事件(265 个)中,大多数(227 个)都是通过第一种策略开发的。其中 38 个是通过转录反义或双链 RNA 的合成序列转化的,3 个是通过抑制不良基因表达的突变拷贝转化的(第三种策略)。通过第一种和第三种策略,已经开发并批准商业化推广了数百个转基因事件和数千个品种,这些品种对除草剂和杀虫剂的抗性以及营养品质都有显著提高。它们的应用大大减少了合成农药的使用和作物生产成本,提高了作物的产量和农民的收益。然而,除一个育性恢复事件和另一个提高除草剂耐受性的事件外,几乎所有的内源基因过度表达事件都停留在测试阶段。在组成型启动子的控制下异源表达的外源基因所赋予的新功能通常在受体作物中是不存在的或通过不同的途径实现。然而,过量表达的内源基因编码的内源蛋白质受到复杂的网络调控,具有功能冗余和可替换的途径,难以显著地赋予理想的表型。结论是,对于作物的转基因改良而言,外源基因的异源表达和通过 RNA 干扰和成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR/Cas) 抑制不良基因的表达优于内源基因的过量表达。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2024年6月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.13.598801 doi:biorxiv Preprint
ACIAR Projects 8419(1985-1988)和8834(1989-1991)在印度尼西亚花生生产的主要限制中确定了花生条纹病毒(PSTV)。与ICRISAT合作,在世界上有1000多个Arachis Hypogaea种质收集中,没有发现对该病毒的抵抗来源。经典的繁殖方法融合了来自野生阿拉奇亲属的宿主抗性基因,这是由于遗传不兼容而没有成功的。因此,随后的两个ACIAR项目,9017(1992-1995)和9439(1996-1999),通过不关注从病毒本身中得出的转基因抗性基因来解决商业花生系中针对PSTV的保护。引入,表达或沉默转基因的先决条件是将新型基因引入花生组织的可靠和有效手段,并随后再生的转化植物的再生,这些植物善于稳定地继承了新的抗性特征。在9017和9439项目期间,尝试了几种基因输送的方法,花生外植体的类型和不同的植物园再生途径,这些方法已在项目的年度报告和利文斯通和Birch(1995,1999)中总结了。此处描述的详细花生转化方案的开发构成了D. Malcolm Livingstone和Tanya Newton和D.M.的BSC荣誉论文的基础。利文斯通的博士学位论文(昆士兰大学植物学系),
我们报告了通过体细胞核移植 (SCNT) 和胚胎碱基编辑克隆了一只 12 岁的转基因绿色荧光蛋白 (GFP) 猴,同时对腺嘌呤碱基编辑器 (ABE) 进行了安全性评估。我们首先展示了 ABEmax 通过在 293T 细胞中对 GFP 序列进行 A 到 G 编辑来沉默 GFP 的能力。随后,使用表达 GFP 的猴子的供体细胞,我们成功生成了 207 个 ABEmax 编辑 (SCNT-ABE) 和 87 个野生型 (SCNT) 胚胎,用于胚胎移植、基因分型以及基因组和转录组分析。使用一种名为 OA-SCNT 的新方法,对 SCNT-ABE 和 SCNT 胚胎进行比较以进行脱靶分析,而无需遗传变异的干扰。在编辑的猴胚胎中,ABEmax 不会诱导明显的脱靶 DNA 突变,但会诱导广泛的脱靶 RNA 突变,其中 35% 是外显子。研究结果为ABE的临床应用提供了重要参考。
