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靶向 HDAC6 的双分子通过肺癌细胞上的 MHC-II 上调导致肿瘤内 CD4+ 细胞毒性淋巴细胞募集
摘要 背景 尽管目前的治疗方法包括手术、化疗、放疗以及最近的免疫疗法，但肺癌的死亡率仍然很高。对于肺癌，改变细胞周期、血管生成和程序性癌细胞死亡的表观遗传修饰是与免疫疗法相结合以提高治疗成功率的治疗目标。在最近的一项研究中，我们发现一种叫做 QAPHA（(E)-3-(5-((2-氰基喹啉-4-基)(甲基)氨基)-2-甲氧基苯基)-N-羟基丙烯酰胺）的分子具有微管蛋白聚合和 HDAC 抑制剂的双重功能。在这里，我们研究了这种新型双重抑制剂对肺癌免疫反应的影响。方法 为了阐明 QAPHA 的作用机制，我们进行了化学蛋白质组学分析。使用肺癌体内小鼠模型（TC-1 肿瘤细胞），我们评估了 QAPHA 对肿瘤消退的影响。通过流式细胞术对肿瘤浸润免疫细胞进行表征。结果 在本研究中，我们首次通过蛋白质组学分析发现 QAPHA 可有效抑制组蛋白去乙酰化酶 6，从而导致 HSP90、细胞色素 C 和 caspases 上调。我们证实 QAPHA 通过在体外细胞表面表达钙网蛋白来诱导免疫原性细胞死亡 (ICD)，并证明了其作为体内疫苗的有效性。值得注意的是，即使在低浓度 (0.5 mg/kg) 下，QAPHA 也能在接受肿瘤内治疗的小鼠中实现肿瘤完全消退，从而建立持久的抗癌免疫反应。此外，QAPHA 治疗促进了接受治疗的小鼠中 M1 极化巨噬细胞的浸润，表明在肿瘤内诱导了促炎环境。非常有趣的是，我们的研究结果还表明，QAPHA 在体外和体内均上调了 TC-1 肿瘤细胞中主要组织相容性复合体 II 类 (MHC-II) 的表达，从而促进了表达 CD4+、NKG2D+、CRTAM+ 和 Perforin+ 的细胞毒性 CD4+T 细胞 (CD4+CTL) 的募集。最后，我们表明肿瘤消退与肿瘤细胞和 CD4 + CTL 浸润中的 MHC-II 表达水平密切相关。结论总的来说，我们的研究结果有助于发现一种能够诱导 TC-1 肿瘤细胞中 ICD 和 MHC-II 上调的新型多靶点抑制剂。这些
丙氨酸补充剂通过上调CNS2和CNS3基因表达水平
虫草军事（Militaris）是典型的虫草代表[1]。它主要在南亚，欧洲和北美[2]发现，并且很长一段时间以来一直用作中草的可食用蘑菇[3]。更重要的是，它被认为是一些有价值的组成部分中最早的来源[4]。到目前为止，在军事念珠菌的人工文化中已经取得了很大的进步[5 E 7]。进一步的研究表明，军事梭菌可以产生具有功能特性[8]的多种生物活性相结合，例如治疗疲劳，肾功能障碍和呼吸道疾病[9]。此外，它的抗氧化，抗光灯和抗色素沉着性能在医疗行业引起了很多关注。例如，在C. mil-itaris中发现的生物活性化合物用于天然抗癌药物[10]和面膜化妆品[11 E 13]，而其质量生产的副产品主要用于动物饲料。
通过 pemigatinib 靶向 FGFR 可诱导 G1 期细胞周期停滞、细胞应激和肿瘤抑制 miRNA 的上调
miRNA 调节介导。miRNA 是细胞生物学的重要调节剂，在癌症中经常发生改变。事实上，在我们研究的癌症环境中，许多 miRNA 已被描述为肿瘤抑制因子 [38–40]。已证明 miR-186 和 miR-195 可抑制 NSCLC 癌细胞系和组织样本中的增殖、迁移和侵袭 [41–47]。此外，与 I-II 期 NSCLC 患者相比，肿瘤分级较高且转移较多的 NSCLC 患者的血清 miR-186 水平较高。miR-133b 通常在胃癌中下调，其抑制与更具侵袭性的表型相关 [48–51]。在膀胱癌中，miR-186 和 miR-139 均被描述为相关的肿瘤抑制因子，其下调与侵袭和转移有关 [52, 53]。
通过 pemigatinib 靶向 FGFR 可诱导 G1 期细胞周期停滞、细胞应激和肿瘤抑制因子 microRNA 的上调
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甲状腺疾病的机器学习：评论
本研究回顾了甲状腺疾病早期诊断的机器学习的最新进展。基于本综述的结果，不同类型的甲状腺疾病诊断的不同类型的数据将适合于甲状腺疾病的不同类型的数据：（1）在数字数据的情况下，随机森林和梯度提升；（2）基因组数据中的随机森林；（3）随机森林和Radiomic Data;（4）森林中的随机森林；其性能度量在64.3–99.5范围内有所不同，灵敏度为66.8–90.1，特异性为61.8-85.5，在接收器操作特征曲线下的区域为64.0–96.9。According to the findings of this review, indeed, the following attributes would be important variables for the early diagnosis of thyroid disease: clinical stage, marital status, histological type, age, nerve injury symptom, economic income, surgery type [the quality of life 3 months after thyroid cancer surgery]; tumor diameter, symptoms, extrathyroidal extension [the local recurrence of differentiated thyroid carcinoma]; RNA feasures including ADD3-AS1 (downregulation), MIR100HG (downregulation), FAM95C (downregulation), MORC2-AS1 (downregulation), LINC00506 (downregulation), ST7-AS1 (downregulation), LOC339059 (downregulation), MIR181A2HG (upregulation), FAM181A-AS1 (downregulation), LBX2-AS1 (upregulation), BLACAT1 (upregula- tion), hsa-miR-9-5p (downregulation), hsa-miR-146b-3p (upregulation), hsa-miR-199b-5p (downregulation), hsa-miR-4709-3p (upreg- ulation), hsa-miR-34a-5p (upregulation), hsa-miR-214-3p (downregulation) [papillary thyroid carcinoma]; gut microbiota RNA features such as veillonella, paraprevotella, neisseria, rheinheimera [hypothyroidism]; and ultrasound features, i.e., wreath-shaped feature, micro- calcification, strain ratio [the malignancy of thyroid nodules].
2025; 16（6）：1958-1970。 doi：10.7150/jca.108895研究论文EIF4A3通过人类乳腺癌细胞中的CDC5L上调促进细胞增殖
乳腺癌是影响女性健康的最常见疾病之一。近年来对乳腺癌的研究取得了进展，但仍然是一个主要的健康问题。研究表明，翻译起始因子EIF4A3与肿瘤的发生和发育密切相关，但特定机制尚不清楚。在这项研究中，我们旨在探索EIF4A3的特定分子机制，以促进体内和体外乳腺癌的恶性过程。我们的结果表明，在乳腺癌中，EIF4A3的表达显着上调，EIF4A3的过表达可以加速乳腺癌细胞的生长。RIP-SEQ和RIP-RT-QPCR分析表明，EIF4A3可以与CDC5L的mRNA结合并影响其表达。 从catrapid中，我们预测EIF4A3-蛋白可以与Cdc5l-MRNA的5705-5954区域结合Cdc5l。 CDC5L是EIF4A3的下游效应子。 这些结果表明EIF4A3-CDC5L轴促进了乳腺癌细胞的增殖。 这项研究为理解EIF4A3在乳腺癌的恶性过程中的作用提供了理论基础。RIP-SEQ和RIP-RT-QPCR分析表明，EIF4A3可以与CDC5L的mRNA结合并影响其表达。从catrapid中，我们预测EIF4A3-蛋白可以与Cdc5l-MRNA的5705-5954区域结合Cdc5l。CDC5L是EIF4A3的下游效应子。这些结果表明EIF4A3-CDC5L轴促进了乳腺癌细胞的增殖。这项研究为理解EIF4A3在乳腺癌的恶性过程中的作用提供了理论基础。
涉及PPAR，酰基-COA结合蛋白和GABAA受体
酰基辅酶-A结合蛋白（ACBP），也称为地西epam结合抑制剂（DBI），是食欲和脂肪生成的有效刺激剂。生物信息学分析与系统筛选结合表明，过氧化物酶体增殖物激活的受体伽马（PPARγ）是转录因子，最能解释了包括肝脏和脂肪组织在内的代谢活性器官中的ACBP/DBI上调。PPARγ激动剂罗格列酮诱导的ACBP / DBI上调以及体重增加，这可以通过小鼠中的ACBP / DBI敲除。此外，PPARG的肝脏特异性敲低阻止了高脂饮食（HFD）诱导的循环ACBP/DBI水平上调，体重增加降低。相反，ACBP / DBI的敲除阻止了HFD诱导的PPARγ上调。Notably, a single amino acid substitution (F77I) in the γ 2 subunit of gamma-aminobutyric acid A receptor (GABA A R), which abolishes ACBP/DBI binding to this receptor, prevented the HFD-induced weight gain, as well as the HFD- induced upregulation of ACBP/DBI, GABA A R γ 2, and PPAR γ .基于这些结果，我们假设依靠ACBP/DBI，GABA A R和PPARγ的肥胖前馈环的存在。在任何水平上的中断，都无法区分地减轻HFD诱导的体重增加，肝脏toposisos和高血糖。
控制CRISPR激活质粒：SC-437275
定期间隔间隔的短质体重复序列（CRISPR）和与CRISPR相关的蛋白质（CAS9）系统是ARCHEA和细菌使用的一种适应性免疫反应防御机制，用于降解前遗传材料。该机制可以用于其他功能，包括用于哺乳动物系统的基因组工程，例如基因敲除（KO）（KO）（1,2）和基因激活（3-6）。CRISPR Activation Plasmid products enable the identification and upregulation of specific genes by utilizing a D10A and N863A deactivated Cas9 (dCas9) nuclease fused to a VP64 acti- vation domain, in conjunction with sgRNA (MS2), a target-specific sgRNA engineered to bind the MS2-P65-HSF1 fusion protein (6).这种协同激活介质（SAM）转录激活系统提供了一个强大的系统，以最大程度地激活内源基因表达（6）。
Cockayne综合征患者IPSC衍生的脑器官和神经球显示与脑发育和代谢相关的生物学过程的早期转录失调
摘要Cockayne综合征是一种罕见的遗传性常染色体隐性疾病，其特征是不同的神经系统痛苦。但是，对于CS患者的大脑发育知之甚少。，我们利用Cockayne综合征B蛋白（CSB）产生了神经球和脑类器官，缺乏诱导的多能干细胞，这些干细胞来自两名患者，这些干细胞来自两名患者，具有不同严重性的CS和健康对照。使用RNA-SEQ和生物信息学分析探索了两个发育时间点的转录组，以鉴定两名CS患者常见的生物学失调，与对照相比。CSB缺陷型神经球显示了VEGFA-VEGFR2信号通路，囊泡介导的运输和头部发育的上调。CSB缺陷式脑器官表现出脑发育，神经元投射发育和突触信号的下调。我们进一步确定了对两个时间点共有的类固醇生物合成的上调，特别是胆固醇生物合成分支的上调。我们的结果提供了对CS患者神经发育失调的见解，并加强了CS的理论，即CS不仅是神经退行性的，而且是神经发育障碍。