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男性不育的肠道，尿液和精液的功能和分类性营养不良
背景：关于泌尿生殖器和胃肠道菌群在男性不育症发病机理中的作用知之甚少。目的：比较肠道，精液和尿液微生物的分类和功能性填充物。设计，设置和参与者：我们前瞻性地招募了25名具有特发育原发性不孕症的男性和12名健康的父亲，我们收集了直肠拭子，精液样本，中游尿液样本和实验控制。结果测量和统计分析：我们对定量高分辨率分类法进行了全面的精液分析，16S rRNA测序以及shot弹枪元基因组学，中位数为1.4亿个样品，用于功能代谢途径。结果和局限性：我们确定了与尿液微生物组相似的多种精液微生物组。不育男性藏有增加的a -di -dectity和独特的B多样性，精确的空气菌和直肠呼吸菌的减少。prevotella的丰度与精子浓度成反比，假单胞菌与总运动精子数直接相关。输精管切除术似乎改变了精液微生物组，表明睾丸或附睾的贡献。厌氧菌在具有静脉曲张的不育男性精液中高度代表性，但是氧化应激和白细胞植物植物仅与微妙的差异有关。结论：这项试验研究代表了对男性不育症中微生物组的第一次全面研究。宏基因组学数据鉴定出S-ade-Nosyl-L-甲硫代周期中的显着改变，该循环可能在通过DNA甲基化，氧化应激，/或多胺合成中在不孕症的发病机构中起多方面的作用。这些发现为未来的研究提供了基础，以探索因果关系，并为患有这种复杂且情绪上破坏性疾病的男性确定基于微生物组的新型诊断和治疗疗法。
尿miRNA签名作为Hirschsprung病的潜在非侵入性诊断生物标志物
hirschsprung疾病（HSCR）的特征是胃肠道中没有神经节细胞的先天性缺失，从而导致排便，便秘和肠梗阻受损。当前的HSCR诊断是基于直肠吸力活检（RSB），这在新生儿中可能很复杂。有时会延迟诊断会增加临床并发症的风险。因此，有新的非侵入性诊断方法是客观的，更可行的，并且为潜在的手术干预提供了更早的基础。近年来，MicroRNA（miRNA）已成为相关的早期标志物的重点，该标志物可以提供对疾病的病因和进展的更多见解。因此，在寻找非侵入性HSCR生物标志物时，我们分析了HSCR患者尿液样品中的miRNA表达。使用微阵列的5例HSCR患者的结果显示，HSA-MIR-378 H，HSA-MIR-210-5P，HSA-MIR-6876-3P，HSA-MIR-634和HSA-MIR-634和HSA-MIR-6883-3P是最上升的miRNA；而HSA-MIR-4443，HSA-MIR-22-3P，HSA-MIR-4732-5P，HSA-MIR-3187-5P和HSA-MIR-371B-5P最下调的miRNA。在mirnawalk和mirdb数据库中进一步搜索表明，这些失调的miRNA肯定鉴定出靶标HSCR相关基因，例如RET，GDNF，BDNF，BDNF，EDN3，EDNRB，ERBB，ERBB，NRG1，NRG1，SOX10；以及神经元迁移和神经发生中暗示的其他基因。最后，我们还可以通过RT-QPCR验证HSCR尿中的一些miRNA变化。总的来说，我们的分析的HSCR队列表现出失调的miRNA表达表达，可以在尿液中检测到。我们的发现为将来使用特定的尿液miRNA特征作为非侵入性HSCR诊断方法开辟了可能性。
使用 HRAM 质谱仪对尿液中的药物进行针对性的法医筛查和半定量分析
毒理学实验室面临许多挑战，包括复杂基质中极大量的样品以及设计药物的泛滥。实验室必须快速且低成本地进行筛选和量化。虽然这些挑战可以单独解决，但用一种分析方法解决所有挑战要困难得多。在这里，我们提出了一种新颖的工作流程，它结合了液相色谱和高分辨率精确质量 (HRAM) 质谱法，可以在一次运行中筛选和量化大面板，同时保留回顾性查询分析数据以寻找新化合物或意外化合物的能力。此外，我们证明了在一种质谱仪型号上开发的方法可以在较新的仪器型号上成功运行。
利用三重四极杆质谱法定量测定尿液中的 106 种滥用药物
*除 1-(3-氯苯基)哌嗪、25I-NBOMe 和 N-去甲基-他喷他多外，每种目标分析物均使用其自己的标记内标，这三种分析物分别使用内标去甲氯胺酮-d4、氯氮卓-d5 和唑吡坦-COOH-d4。
利用新兴生物活性技术和材料分析尿液游离 DNA 以诊断膀胱癌
尿液游离 DNA (UcfDNA) 正逐渐成为诊断膀胱癌的重要生物标志物。UcfDNA 含有肿瘤来源的 DNA 序列，使其成为膀胱癌非侵入性早期检测、诊断和监测的可行候选物。UcfDNA 的定量和定性在膀胱癌的分子表征中表现出高灵敏度和特异性。然而，精确分析 UcfDNA 以进行临床膀胱癌诊断仍然具有挑战性。本综述总结了 UcfDNA 的发现历史、其生物学特性以及对 UcfDNA 在膀胱癌患者中的临床意义和实用性的定量和定性评估，强调了 UcfDNA 在膀胱癌诊断中的关键作用。新兴的生物活性技术和材料目前为多种 UcfDNA 分析提供了有希望的工具，旨在实现更精确、更有效地捕获 UcfDNA，从而显著提高诊断准确性。本综述还强调了检测技术和基质方面的突破，这些突破可能会彻底改变临床上的膀胱癌诊断。
尿液保留与刺后的利尿后，作为急性低钠血症的潜在原因：病例报告
急性尿液保留是一种常见的泌尿科急诊室，在急诊室（ER）经常出现。标准治疗方法包括放置带有门诊泌尿科随访的尿中导管或上桥式导管。尿液保留会引起并发症，例如低钠血症和后刺后的利尿作用。适当诊断和管理这些威胁生命的并发症至关重要。在此，我们提出了尿液保留引起的低钠血症的病例。患者的尿液钠水平和渗透压与诊断不当抗利尿激素（SIADH）的综合征一致。在该患者中，钠自校正后钠的放置后开始。低渗盐水用于防止自动校正快速。这种类型的低钠血症是独一无二的，因为放置导管后发生自动校正。但是，需要监视以确保不会发生快速自动更正。潜在的快速自动纠正在这些患者中。治疗那些患有高渗性流体或正常盐水的患者会加剧快速自我校正并导致严重的并发症。在开发快速自动校正时应考虑使用低音流体给药。
ctDNA转移到尿液中的ctDNA超短状态，促进了HPV +口咽癌的无创液体活检
。此外，由于尿液可以在家中自我收集，因此这种远程标本的收集能力可以帮助达到服务不足的人群，并在人群范围内实现更有效的癌症筛查。尽管TR-CTDNA方法具有巨大的潜力，但与血液ctDNA相比，关于Tr-CTDNA检测效率的报道混杂（3-7）。对TR-CTDNA进行分析的潜在至关重要因素是知道尿液中存在的Tr-ctDNA片段的长度，因为这会影响测定设计，以在Tr-CTDNA检测中进行最佳灵敏度。迄今为止，已经有关于Tr-ctDNA片段长度的对比报告。基于PCR的TR-CTDNA研究，当使用缩短大于60 bp（4、8、9）时，在检测方面已显示出更大的成功，这是两项最近的下一代测序（NGS）研究（NGS）研究，该研究专门针对TR-CTDNA，表明中间长度的中间长度为112 bp（10）或101 bp（11）或较高的研究表明，与一项较高的comptions（相比），与一项较高的表现相结合。控件（11）。报告的NGS结果的限制是使用的特定库制备方法（例如，双链DNA [dsDNA]库制备方案，基于杂交的ctDNA片段捕获）容易偏向于恢复较短的片段，尤其是超级片段，尤其是超级片段（尤其是<50 bp）（12）（12）。为了检验这一假设，我们利用了能够捕获最小片段的单链NGS方法来开发TR-CTDNA大小的更完整的曲线。鉴于在非癌症环境中对无细胞的无细胞DNA（CFDNA）的研究（例如，孕妇尿液中的胎儿DNA或结核病患者的结核分枝杆菌DNA的胎儿DNA（13，14）（13，14）报道了跨性别的CFDNA是超消除的（<50 bp），我们可以彻底crunder（<50 bp） - 均可能是癌症。尿液。如结果所示，我们的数据表明TR-CTDNA是超短症（<50 bp），可在多种非动物癌症类型中检测到。除了单链DNA（SSDNA）NGS研究外，我们开发了一种基于液滴数字PCR（基于DDPCR）的测定法，以测量尿液中的TR-CTDNA，该测量提供了绝对的量化，更高的精度，更高的精度和更高的吞吐量。我们设计了此测定方法来研究患有HPV +口咽鳞状细胞癌（OPSCC）的患者。在此类患者中，HPV DNA序列在血液循环中以CTDNA为单位，我们假设可以通过DDPCR在尿液中检测到肾脏肾小球屏障的ctDNA片段。HPV ctDNA代表了TR-CTDNA的DDPCR分析开发的理想靶标，因为（a）90％的HPV + OPSCC患者共享单个HPV亚型HPV16的序列，因此，单个HPV16 TR-CTDNA分析可以覆盖大型患者； （b）由于HPV是一个非人类序列，因此预计没有HPV +癌症患者的“背景”信号将很低； （c）HPV16可以在肿瘤基因组内的多个位点整合，从而导致每个肿瘤基因组的信号更高。因此，我们试图开发一种能够从HPV + OPSCC患者的尿液中检测到尿液中超常用的HPV16 TR-CTDNA片段的第一代DDPCR分析。值得注意的是，与HPV +宫颈癌的设置不同，可以将肿瘤DNA直接沉积到尿液中，HPV16 HPV16信号在HPV + OPSCC患者的尿液中必然是跨性别的。我们将此测定（42 bp扩增子）与常规长度测定（77 bp amplicon）进行了比较，发现靶向超短片段对于可靠的尿液TR-CTDNA检测至关重要。利用超短扩增子测定法，我们在HPV + OPSCC患者的尿液中获得了TR-CTDNA检测，这些尿液与匹配的血浆CTDNA的结果一致。此外，使用小病例系列中的纵向尿液样品，我们展示了概念证明，用于早期发现癌症复发。因此，我们的结果表明，通过靶向超短DNA片段，TR-CTDNA成为HPV + OPSCC检测的可行方法，并且有可能在治疗后进行癌症复发监测。
联邦强制尿液药物检测的阳性筛查和确认结果比较
推荐引用 推荐引用 Stuck, Mary M.. “联邦强制尿液药物检测阳性筛查结果与确认结果比较”（1996 年）。理学硕士 (MS)，论文，社区与环境健康，Old Dominion 大学，DOI：10.25777/w6h1-0j84 https://digitalcommons.odu.edu/commhealth_etds/2
对用于首次排尿样本的 Allplex HPV28 基因分型检测进行优化和分析验证
摘要尽管首次尿液 (FVU) 越来越多地被认可为一种可靠的人乳头瘤病毒 (HPV) 检测样本，但缺乏经过充分验证的检测方法，无法对 FVU 样本进行疫苗影响监测所需的完整定量基因分型。Allplex HPV28 检测能够单独检测 28 种 HPV 基因型，是一种很有前途的方法。我们旨在评估其在 FVU 样本上的基因型特异性性能，并优化 FVU 预分析。我们选择了使用 Colli-Pee 装置 (20 mL，带 UCM) 采集的 701 个 FVU 样本，这些样本基于之前使用 GP5+/6+-PCR 反向线印迹 (GP5+/6+ RLB) 和 Amicon 过滤 (AF) 后的 E7-MPG 进行的测试，以富集 HPV 阳性 (n = 630)。我们首先评估了根据不同的预分析方法 Allplex HPV28 基因型特异性阳性的可比性和一致性。随后，我们对 Allplex HPV28 与 GP5+/6+ RLB AF 和 E7-MPG AF 进行了基因型特异性比较。在比较预离心和非离心 DNA 提取时，以及在比较手动和自动 DNA 提取时，Allplex HPV28 检测的 HPV 阳性率没有显著差异。在 Allplex HPV28 和 GP5+/6+ RLB AF 之间观察到了良好的基因型特异性一致性，Allplex HPV28 对所有 28 种 HPV 基因型的敏感性略高（平均 Allplex HPV28：GP5+/6+ RLB AF 比率为 1.729）。与 E7-MPG AF 相比，Allplex HPV28 对所有 21 种重叠 HPV 基因型的灵敏度较低（平均 Allplex HPV28:E7-MPG AF 比率为 0.588）。本研究结果结合实际实施考虑，支持在自动或手动 DNA 提取后使用 Allplex HPV28 检测，无需预离心，用于基于 FVU 样本的 HPV 研究，尤其是用于疫苗对 HPV 流行率影响监测的研究。