循环肿瘤DNA(CTDNA)敏感性仍然是膀胱癌患者分子残留疾病(MRD)检测的敏感性。为了解决这个问题,我们专注于最靠近该疾病,尿液和分析的尿液肿瘤DNA的生物流体。我们通过深层测序(UCAPP-SEQ)将超低通的整个基因组测序(ULP-WGS)与尿癌个性化的亲填充(ULP-WGS)整合在一起,以实现敏感的MRD检测并预测总体存活。变体等位基因频率,推断的肿瘤突变负担和无尿细胞DNA(CFDNA)的拷贝数衍生肿瘤分数水平的明显预测的病理完全反应状态,远胜于血浆CTDNA的能力。将这些尿液CFDNA衍生的因子具有带有一口输出的交叉验证的随机森林模型,对于预测有关金标准手术病理学的残留疾病的敏感性为87%。Kaplan - Meier分析该模型的患者具有MRD,这是通过COX回归分析证实的。对肌肉侵入性,新辅助化疗和持有验证亚组进行的其他生存分析证实了这些发现。总而言之,我们促进了来自74例局部膀胱癌患者的尿液样本,并使用尿液CFDNA多词敏感地检测MRD并准确预测生存率。
背景:一种非侵入性子宫内膜癌检测工具,可以准确地有症状的女性进行定义测试,这将改善患者护理。尿液是一种吸引人的生物流体,用于癌症检测,因为它的简单性和易于收集性。这项研究的目的是确定可以区分子宫内膜癌患者与症状对照的基于尿液的蛋白质组学特征。方法:这是一个前瞻性案例 - 对症状的绝经后妇女的控制研究(50个癌症,54例对照)。无效的自我收集的尿液样品进行质谱法处理,并使用所有理论质谱(Swath-MS)的顺序窗口采集进行运行。机器学习技术用于识别重要的歧视性蛋白质,随后使用逻辑回归将其合并在多标记面板中。结果:用于子宫内膜癌症检测的最高歧视性蛋白单独表现出适度的准确性(AUC> 0.70)。但是,结合最歧视性蛋白的算法在AUC> 0.90中表现良好。表现最好的诊断模型是一个10标记的面板,将SPRR1B,CRNN,CALML3,TXN,FABP5,C1RL,MMP9,ECM1,S100A7和CFI结合在一起,并预测子宫内膜癌的AUC为0.92(0.96 - 0.96 - 0.97)。基于尿液的蛋白质特征显示出早期癌症检测的良好精度(AUC 0.92(0.86 - 0.9))。结论:一种患者友好的,基于尿液的测试可以在有症状的女性中提供非侵入性子宫内膜癌检测工具。有必要在较大的独立队列中进行验证。
使用人尿作为农作物肥料,由于其潜在的好处引起了兴趣,但其应用对尿液如何影响土壤功能和微生物群落有所了解。本研究旨在阐明土壤细菌群落对用人尿液施肥的反应。为此,菠菜作物被2种不同剂量的分离和储存的人类尿液(170 kg n ha-1 + 8.5 kg p ha-1和510 kg n ha-1 + 25.5 kg p ha-1),并与合成受肥(170 kg n ha-h ha-8.5 ka + p ha-5 k p ha-5 k p ha-1)相比根据随机块方案,在温室条件下在四个土壤罐中进行了实验。我们在开始时和土壤和植物特性的开始时评估了尿液和土壤细菌组成的地位,以了解细菌组成变化中的驱动因素。储存12个月后,尿液具有耗尽的微生物组,但仍然含有很少的尿液或粪便菌株。总体而言,土壤细菌群落对尿液施肥有抵抗力,只有3%的分类单元受到影响。然而,与合成肥料相比,尿液受精的硝化和反硝化基团的相对丰度,这意味着在用尿液施肥时可能会发出更多的n 2 o,而无需发出。尿液的高盐浓度对BAC群落几乎没有明显的影响。在更广泛的背景下,该实验提供了证据表明,一年储存的尿液可以应用于植物土壤系统,而不会在短期内对土壤细菌群落产生负面影响。
摘要:超极化的核磁共振(NMR)提供了一组方法,可以显着解决NMR的灵敏度问题。溶解动态核极化(D-DNP)提供了一种独特而通用的方法,可检测13 C NMR信号,其灵敏度通过几个数量级增强。D-DNP的扩展应用范围现在涵盖了自然13 C丰度时对复杂混合物的分析。但是,在该区域中,它仅限于代谢物提取物。在这里,我们报告了自然丰度时生物氟-urine-的第一个DNP增强的13 C NMR分析,为这种具有挑战性的样本提供了前所未有的分辨率和敏感性。我们还表明,可以通过标准添加程序检索有关多个靶向代谢物的准确定量信息。
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的,他已授予MedRxiv的许可证,以永久显示预印本。(未通过同行评审认证)
1肝脏外科和移植系,肝癌研究所,中国福丹大学,上海200032,中国肝癌医院。 2癌变和癌症入侵的关键实验室(Fudan University),教育部,上海200032,中国。 3中国医学学院的肝癌复发和转移的肝癌复发和转移单元,中国北京100010。 4肝癌研究所,肝癌研究所,中山医院,福丹大学,上海200032,中国。 5林克西亚人民医院,林克斯市731100,普通外科部,中国。 6 Fudan University,Fudan University,上海200032,中国。 7基因工程的国家主要实验室,福丹大学,上海200032,中国。 8上海福丹大学中心医院重症监护室,200032年,中国。 #作者同样贡献。1肝脏外科和移植系,肝癌研究所,中国福丹大学,上海200032,中国肝癌医院。2癌变和癌症入侵的关键实验室(Fudan University),教育部,上海200032,中国。3中国医学学院的肝癌复发和转移的肝癌复发和转移单元,中国北京100010。4肝癌研究所,肝癌研究所,中山医院,福丹大学,上海200032,中国。 5林克西亚人民医院,林克斯市731100,普通外科部,中国。 6 Fudan University,Fudan University,上海200032,中国。 7基因工程的国家主要实验室,福丹大学,上海200032,中国。 8上海福丹大学中心医院重症监护室,200032年,中国。 #作者同样贡献。4肝癌研究所,肝癌研究所,中山医院,福丹大学,上海200032,中国。5林克西亚人民医院,林克斯市731100,普通外科部,中国。 6 Fudan University,Fudan University,上海200032,中国。 7基因工程的国家主要实验室,福丹大学,上海200032,中国。 8上海福丹大学中心医院重症监护室,200032年,中国。 #作者同样贡献。5林克西亚人民医院,林克斯市731100,普通外科部,中国。6 Fudan University,Fudan University,上海200032,中国。 7基因工程的国家主要实验室,福丹大学,上海200032,中国。 8上海福丹大学中心医院重症监护室,200032年,中国。 #作者同样贡献。6 Fudan University,Fudan University,上海200032,中国。7基因工程的国家主要实验室,福丹大学,上海200032,中国。8上海福丹大学中心医院重症监护室,200032年,中国。 #作者同样贡献。8上海福丹大学中心医院重症监护室,200032年,中国。#作者同样贡献。
11218-5 LOINC Microalbumin (mass/volume) in urine by test strip 12842-1 LOINC Protein (mass/volume) in 12-hour urine 13705-9 LOINC Albumin/creatinine (mass ratio) in 24-hour urine 13801-6 LOINC Protein/creatinine (mass ratio) in 24-hour urine 14585-4 LOINC Albumin/creatinine (molar ratio)在尿液14956-7中,尿液中的24小时尿液微蛋白(质量/时间)在尿液14957-5尿液14958-3中微量微蛋白(质量/体积)中,尿液14958-3 li liinc microalbumin/crectinine/crectinine/crectinine(质量比)24 Hour尿液14959-114959-1 liein uil 14959-14959-14959- locin-micin-simin-beiins/comerin-norign-norige insminine(质量)中的含量(Intor corualion)中的含量(IRINE蛋白含量)。 urine 1754-1 LOINC Albumin (mass/volume) in urine 1755-8 LOINC Albumin (mass/time) in 24-hour urine 1757-4 LOINC Albumin renal clearance in 24 hours 18373-1 LOINC Protein (mass/time) in six-hour urine 20454-5 LOINC Protein (presence) in urine by test strip 20621-9 LOINC Albumin/creatinine (presence) in urine by test strip 21059-1 24小时尿液中的Loinc Choly(质量/体积)
样品制备和液相色谱(LC)分离通常是典型筛选LC-MS分析中最耗时的步骤。lc分离是一种有效的方法,可以将感兴趣的化合物与从样品基质中的干扰成分分开,从而减少离子抑制效应并分离出同种异体化合物。LC仍然是确保对目标和非靶向筛选进行广泛化合物分析的准确和精确的数据质量的宝贵工具。同时,保留时间也可以用作多个选择性点的一部分,以确保对样品中的药物有信心识别。为了全面筛选数百种化合物LC分离的可能性很长。已专门设计了一种集成的多重系统[MPX™-2高吞吐量系统],以增加LC-MS/MS分析的吞吐量,并作为传统筛查方法的替代方法进行评估,以提供高通量,全面的药物筛查分析。将高分辨率MS和MS/MS采集与LC分离相结合,允许基于准确的质量产物离子特异性,质谱库匹配以及质量误差,同位素谱和分子公式的发现,可以回顾性化合物识别和最高置信度。
©2016-2024 Thermo Fisher Scientific Inc.保留所有权利。除非另有说明,否则所有商标都是Thermo Fisher Scientific及其子公司的财产。eppendorf和Thermomixer是Eppendorf AG的商标。Agilent是Agilent Technologies,Inc。的商标。Taqman是Roche Molecular Systems,Inc。的商标,在许可和许可下使用。
抽象的克雷伯氏菌肺炎是全球公共卫生的关注,因为无数多种过度呼吸和多药的克隆都与高死亡率相关。基于这些顽固的K.肺炎感染的分子机制,以及如何与几乎所有当今所有临床上重要的抗菌抗菌物质的谱系的毒性与抗性的毒力结合在一起,尚不清楚。在这项研究中,我们在亚洲最常报道的地方性K2-ST375病原体的K.肺炎ECL8中进行了全基因组筛查,以定义对富含营养的实验室培养基生长至关重要的基因(Luria-bertani [LB]培养基[LB]培养基),人类尿液和精神尿液。通过转座子定向插入位点测序(传统),总共427个基因被确定为LB琼脂上生长至关重要,而11和144个基因的转座子插入分别降低了尿液或血清的适应性。这些研究不仅提供了有关该病原体遗传学的进一步知识,而且还为发现新的抗菌靶标提供了强大的动力,以改善肺炎链球菌感染的当前治疗选择。
