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SARS-COV-2的列表，关注的变体，感兴趣的变体和用于监视的变体
•影响峰值蛋白S1/S2连接结构域的S1部分的突变（残基613-705）已添加到每个变体的兴趣突变列表中。感兴趣的突变现在包括对峰值蛋白残基319-541和613-705的变化，以及该变体特有的任何其他异常变化。•从零星/爆发到社区的欧盟/EEA的传输变更。•增加了英格兰公共卫生技术简报11的参考，证明了B.1.617.2的可传播性增加的证据。•增加了对印刷品出版物的参考，以证明对b.1.617.1的免疫力影响。•添加了B.1.1.519（在墨西哥首次检测到）和AV.1（在英国首次检测到）。
鉴定种系种群变异的识别为癌症相关的体细胞变异
在临床变异解释数据库的背景下，一个潜在的问题是，当它们实际上是种系（与患者的祖先人群相关的）时，将变体的分类错误（与癌症相关）。这可能取决于所使用的参考基因组，如果错误分类的变体与诊断，治疗或预后直接相关，则可能在临床上有问题（13）。换句话说，当这种变体可能不是癌症特异性时，可以用作潜在治疗的指示，或者在诊断过程中肿瘤学家可能会意外使用的是提供不准确的预后信息或分子病理学家。错误分类的变体对于在癌症研究的背景下也要意识到。人类变体起源（无论是种系还是躯体）通常是转化肿瘤学研究中的必要规范，从药物机理到临床试验的纳入标准（14，15）。
值得关注的 SARS-CoV-2 变异株和
本报告中分析的数据截止时间为 2021 年 12 月 29 日。目前，英格兰通过测序或基因分型确诊的 Omicron VOC-21NOV-01 (B.1.1.529)（以下简称 Omicron）病例为 198,348 例，通过 S 基因靶标失败 (SGTF) 确诊的疑似病例为 451,194 例。这并不代表 Omicron 感染或病例的总数（大约 30% 的社区 PCR 检测是使用可以检测 SGTF 的检测方法进行的）；SGTF 占 12 月 29 日 S 基因检测病例的 93%，这是可归类为 Omicron 进行比较分析的病例数。截至 12 月 29 日，英格兰共有 815 名经实验室确诊（测序、基因分型或 SGTF）的 Omicron 患者从急诊室入院或转院。
Grin1，Grin2a和...
电子邮件：tereza.smejkalova@fgu.cas.cz简介由Grin Genes编码的N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDARS）是离子型谷氨酸受体，它们是中枢神经系统中几乎所有兴奋性突触的离子谷氨酸受体。经典的NMDAR具有特征性的生物物理特征，需要两种激动剂（谷氨酸和甘氨酸/ D-丝氨酸）的结合，在静息膜电位上，Mg 2+的强阻滞，高Ca 2+渗透性，相对较慢的激活和减速性动力学Kinetics [1]。这些特性使NMDAR可以作为突触前谷氨酸释放和突触后去极化的巧合探测器，从而去除Mg 2+块。所得的NMDAR介导的Ca 2+流入是一个关键信号，该信号调节了突触强度的活动依赖性变化[2]，它是神经回路及其
大脑钙化和PCDH12变体
最近在亲戚家族中报道了一种纯合废话PCDH12变体，该杂志中受影响的儿童患有先天性小头畸形，癫痫病和严重的全球发育障碍。1胎儿MRI和USG在中脑 - 高层丘脑 - 光学区域和过度教育性perithalamic Foci中显示出发育不良的伸长肿块。PCDH12概述了一种与膜物理稳定性，粘附和脉管系统维持相关的原粘蛋白，并最近被指出为原发性家族性脑钙化（PFBC）的候选基因。pFBC的特征是在没有次要原因的情况下，存在主要影响基底神经节的钙化。2临床表现包括运动障碍，认知障碍，精神障碍和头痛，在成年期间最常开始。在4个基因中鉴定出多达50％的家族的常染色体显性pfbc的2,3杂合变体在4个基因中鉴定出：SLC20A2，PDGFRB，PDGFB和XPR1。4 - 8我们先前搜索具有类似于PFBC Major
SARS-COV-2变体和药物敏感性
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2021年4月8日。 https://doi.org/10.1101/2021.04.06.438540 doi：biorxiv preprint
社论：新兴SARS-COV-2变体
该研究主题的重点是诸如跟踪新兴的SARS-COV-2变体，新兴变体的检测，隔离和基因组表征，传播，发病机理，变体的临床效果，评估COVID-19疫苗接种和治疗效果的效果和治疗效果的效果，对SARS-COV-2基因组合数据的比较分析，以及其他公共生命值数据，以及其他数据，以及其他数据，以及其他。该研究主题有27篇文章，介绍了Omicron变体及其在全球范围内的次级及其临床表现的出现，特定的无症状感染，与199相关的肝损伤以及相关性，以及诸如高血压，糖尿病和凝发炎等合并症。此外，一些研究报告了治疗药物在减少病毒载量和疫苗接种的显着性和对Omicron变异剂的促进剂量方面的效率。此外，关于基因组监测和进化分析的研究表明，Omicron及其亚线及其特征突变的出现。所有这些深入的研究都探索了Omicron的各种元素，从而对该变体有全面的理解。
糖尿病中OneCut1的突变和变体
对应作者：Albert-Einstein-Allee Internechance I Alexander Kleger教授，Albert-Einstein-Allee 23，89081 Ulm，德国，电话： +49-731-500-44728，传真： +49-731-731-500-444612，Alexander.klegleni-umi-ulm.dee; CécileJulier，内分泌学，代谢和糖尿病系，科钦研究所，24 Rue du Faubourg Saint-Jacques，75014法国巴黎，电话：+33.1.44.41.41.22.33＃这些作者为这项工作做出了同样的贡献。*这些作者也同样贡献。作者贡献AP，SH，IGC和VS被获取，分析和解释数据，起草和修改工作。AP对项目的人类遗传部分进行了统计，遗传和生物信息学分析。SH对RNA，ATAC-SEQ和质谱法进行了PSC和准备样品的功能研究。IGC对项目进行了并定向生物信息学分析。与糖尿病患者及其家人以及德国队列的测序和基因分型。MB，ZL和GK获得了数据并进行了数据分析。ad，pz，hn，ES，TK，MW，CB，RO，JFD，BK，CDR获得了该项目的数据。MB，RG，MHE和TS修订了手稿。具体来说，MB和AI进行了hESC和初始功能分析的基因编辑。Zl，GK和XZ进行了chip-seq，Zl，GK和MSC进行ATAC-SEQ和ZL，GK，MSC和QL RNA-SEQ生物信息信息分析。RR获得了数据并对工作进行了大量修订。MHO对患者成纤维细胞和IPSC分析进行了重编程。SL解释了数据并修改了工作。JRB生成的记者ESC线路。对WES数据进行了生物信息学分析，并在临床上描述了黎巴嫩患者及其家人的PZ。MSA解释了提供的数据，提供了材料，修改了工作。JK获得并分析了质谱数据。AW awed并提供了RG提供芯片序列数据。 kg，JC解释了遗传学数据，而GN提供了来自分化MEL1 HESC的RNA。 Bob，FO，MN，CJ和AK负责获取和分析数据的起草和修订。 此外，鲍勃（Bob）也指导了有关德国患者队列和解释遗传学数据的研究，FO表达和分析了TFS和ONECUT1变体，MN确定并临床表征了患者1及其大家庭，并解释了人类的遗传和临床数据。 此外，CJ和AK设计了工作，解释了数据并用所有作者的输入起草了手稿。 cj指导项目的遗传部分，并进行了人类遗传分析。 AK指导该项目的功能研究。AW awed并提供了RG提供芯片序列数据。kg，JC解释了遗传学数据，而GN提供了来自分化MEL1 HESC的RNA。Bob，FO，MN，CJ和AK负责获取和分析数据的起草和修订。此外，鲍勃（Bob）也指导了有关德国患者队列和解释遗传学数据的研究，FO表达和分析了TFS和ONECUT1变体，MN确定并临床表征了患者1及其大家庭，并解释了人类的遗传和临床数据。此外，CJ和AK设计了工作，解释了数据并用所有作者的输入起草了手稿。cj指导项目的遗传部分，并进行了人类遗传分析。AK指导该项目的功能研究。
粘多糖化类型的遗传变异
常染色体隐性粘膜性糖尿病I（MPS-I）是一种天生的代谢误差，其中硫酸乙酰肝素和硫酸乙酰肝素硫酸盐由于酶α-iduronidase（IDUA）的缺乏而在细胞中积聚在细胞中，这在直系群中更为普遍。以前，据报道α-辅助酶（IDUA）基因中的变体引起MPS-1表型。本研究的目的是确定十个无关的MPS-1的IDUA基因中的遗传变异，影响了巴基斯坦伊斯兰堡的巴基斯坦医学科学研究所（PIMS），巴基斯坦伊斯兰堡的儿童医院。收集了受影响和未受影响的家庭成员的血液样本，并进行了IDUA基因的测序。在对所有鉴定出的引起疾病变体的硅分析中进行了检查，以检查其对蛋白质结构和功能的影响。对所有MPS-1患者的临床检查均表现出粗糙的面部特征，骨骼畸形，疝气，角膜阴影，腹部延伸和肝肾上腺全球。iDUA基因的测序显示了十种错义变化和八个同义变化。在包括突变品尝器，筛分，多形和普罗普兰在内的有机工具中提出了三种变体，是引起疾病的三种变体。在疾病引起的变异中，在我们的分析家庭的80％中鉴定出了先前报道的错义变体，即c.1469t> c引起p.leu490pro。此外，这是一种新颖的14个核苷酸缺失，即C.568_581DEL AACGTCTCCATGAC引起P.ASN190HIFFS*204和单个核苷酸缺失，即C.784DELC引起P.His262thrfs*55造成了与P.His262thrfs*55造成了与MMS-spy sectize seectize。这项研究报告了80％的筛查家庭中的先前报道的错义变体，一种小说（C.568_581DEL AACGTCTCCATGAC）和先前报道的引起疾病的缺失。
功能变体破坏FOXP2
FOXP2的抽象背景杂合破坏是严重言语障碍的第一个鉴定出的分子原因：言语的儿童失尝试（CAS），但尚未报告病例，限制了对病情的了解。这里的方法我们表现出了来自17个具有致病FOXP2变种的家庭的28个个体（12个功能丧失，5个错义变体； 14名男性； 2至62岁）。健康与发展（认知，运动，社会领域）进行了检查，包括对英语和德语进行首次跨语言分析的言语和语言结果。言语障碍的结果很普遍（23/25，92％），CAS最常见（22/25，88％），在英语和德语上进行了类似的语音演讲。言语在成年中仍然受到损害，并且从未获得过某些演讲声音（例如，'th'，'r'，'ch'，'j'）。语言障碍（21/25，84％）的范围从轻度到重度。合并症包括婴儿期（10/26，38％），罚款（13/26，50％）和总（13/26，50％）运动障碍，焦虑症（5/27，19％），抑郁症（6/27，22％，22％）和睡眠障碍（10/24，42％）。物理特征是常见的（22/27，81％），但没有一致的模式。认知范围从平均到轻度障碍，与语言能力不一致。例如，七名患有严重语言障碍的参与者具有平均非语言认知。因此，我们的发现强化了FOXP2为检查言语障碍的神经生物学基础提供了一个宝贵的切入点。结论尽管我们确定了焦虑，抑郁和睡眠障碍等状况的增加，但我们证实，与其他与CAS相关的近期鉴定的单基因疾病相比，FOXP2功能障碍的后果仍然相对特异。