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NLRP3炎性体/IL-6途径与
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。（未经同行评审证明）是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以永久显示预印本。此预印本版的版权持有人于2023年5月5日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.05.03.23289436 doi：medrxiv preprint
鉴定引起数量性状变异的基因组变异：综述
摘要：牲畜的许多重要性状都是复杂或数量性状，受个体动物 DNA 序列中数千种变异和环境因素控制。识别这些因果变异有利于基因组预测、了解重要性状的生理和进化以及基因组编辑。然而，很难识别这些因果变异，因为它们的影响很小，而且与其他 DNA 变异处于连锁不平衡状态。尽管如此，只要我们用较大的样本量来弥补较小的效应量，就应该能够识别复杂性状的可能因果变异，就像我们识别简单性状一样。在这篇综述中，我们考虑了识别因果变异所需的八种证据。大量且多样化的动物样本、准确的基因型、多种表型、基因组位点注释、跨物种比较、跨基因组比较、候选基因的生理作用以及候选基因组位点的实验突变。
在多个自主组织中使用对象感知过程变体
由于自我管理的权利，各种德国市政当局使用了同一业务流程的数字化变体略有不同[1]。现有的管理过程变体的方法专注于控制流，而不是实现级别，即在过程模型中，可以添加，移动或删除片段[2]，并且可能受到限制（例如AN或网关可能仅限于AN和网关）[3]。为了降低开发类似的软件产品时的成本，出现了软件产品线（SPL）工程学科[4]。一个SPL包括一组通用核心软件人工制品，可以从中得出单个软件产品，即。在我们以前的工作[1]中，我们将SPL工程的概念应用于以活动为中心的过程管理，以从优势中受益（例如降低的成本），因为可以通过为该过程模型的活动选择不同的实现，从一组软件伪像，包括过程模型，包括过程模型。因此，可以通过不同的活动实现来得出各种流程感知信息系统。通常，在以活动为中心的过程管理中，数据对象的指定不足。此外，以活动为中心的过程管理缺乏灵活性，因为用户不得以不同的序列进行活动。对象感知过程管理方法[8]相比之下，以数据为中心的过程管理[7]是指定非结构化或半结构化过程的范式，其中数据和过程紧密耦合，并且过程的进度由数据驱动。
CCN2中的双重变体是常染色体隐性脊椎运动不良发育不良
遗传学系，医学与健康科学学院，苏丹Qaboos大学马斯喀特，阿曼和医学遗传学系，卡斯塔尔巴医学院，马尼帕尔，马尼帕尔高等教育学院，马尼帕尔，马尼帕尔，卡纳塔克邦，卡纳塔克邦，印度卡纳塔克邦，印度卡纳塔克邦g.kumar@squ.edu.om遗传学系，医学与健康科学学院，苏丹Qaboos大学马斯喀特，阿曼和医学遗传学系，卡斯塔尔巴医学院，马尼帕尔，马尼帕尔高等教育学院，马尼帕尔，马尼帕尔，卡纳塔克邦，卡纳塔克邦，印度卡纳塔克邦，印度卡纳塔克邦g.kumar@squ.edu.om
qSanger：通过桑格测序对细菌培养物中的遗传变异进行量化
所有培养生物体中都会自发出现突变和重组等遗传变异。虽然可以通过选择或反选择来识别非中性突变，但在异质群体中识别中性突变通常需要昂贵且耗时的方法，例如定量或液滴聚合酶链反应和高通量测序。在不断变化的环境条件下，中性突变甚至可能成为主导，从而强制进行暂时选择或反选择。我们提出了一种新方法，我们称之为 qSanger，使用来自混合 Sanger 测序读数的对齐电泳图峰的振幅比来量化 DNA。表达增强型绿色荧光蛋白和 mCherry 荧光标记的质粒用于通过定量聚合酶链反应和荧光定量在体外和共转化大肠杆菌中验证 qSanger。我们表明，qSanger 允许从混合 Sanger 测序读数中量化遗传变异，包括单碱基天然多态性或从头突变，与标准方法相比，大大减少了劳动力和成本。
由 TadA 变体生成的改进的胞嘧啶碱基编辑器
胞嘧啶碱基编辑器 (CBE) 可实现可编程的基因组 C·G 到 T·A 转换突变，通常包含经过修饰的 CRISPR-Cas 酶、天然存在的胞嘧啶脱氨酶和尿嘧啶修复抑制剂。先前的研究表明，利用天然存在的胞嘧啶脱氨酶的 CBE 可能导致无引导的全基因组胞嘧啶脱氨。尽管随后报道了可减少随机全基因组脱靶的改进型 CBE，但这些编辑器的靶向性能可能不理想。本文，我们报告了使用 TadA 的工程变体 (CBE-T) 的 CBE 的生成和表征，这些变体可在序列多样的基因组位点上实现高靶向 C·G 到 T·A，在原代细胞中表现出强大的活性，并且不会导致全基因组突变的可检测升高。此外，我们报道了胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑器 (CABE)，它们可催化 A 到 I 和 C 到 U 编辑 (CABE-T)。与 ABE 一起，CBE-T 和 CABE-T 可使用实验室进化的 TadA 变体对所有转换突变进行可编程安装，与之前报道的 CBE 相比，这些变体具有更好的特性。
使用碱基编辑器筛选对人类变异进行大规模并行评估
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基准对囊性纤维化变体的字母固定致病性预测
对囊性纤维化变体的字母敏感性致病性预测Eli Fritz McDonald 1,2，Kathryn E. Oliver 3,4，Jonathan P. Schlebach 5，Jens Meiler 1,2,6,7**生物学，范德比尔特大学，纳什维尔，田纳西州37240，美国3美国埃默里大学医学院儿科学系，亚特兰大，佐治亚州30322，美国4囊性纤维化和航空疾病中心，亚特兰大和埃默里大学的儿童医疗保健，亚特兰大大学，亚特兰大，亚特兰大，加利福尼亚州30322，美国5个部门。范德比尔特大学药理学，纳什维尔，田纳西州纳什维尔37240，美国7莱比锡大学药物发现研究所，莱比锡大学，莱比锡，萨克斯04103，德国8号，8 8日，纳什维尔大学生物科学系，纳什维尔，田纳西州37235，美国37235作者：JM（jens@meilerlab.org），lp（lars.plate@vanderbilt.edu）囊性纤维化跨膜电导调节剂基因（CFTR）中的摘要变体导致囊性纤维化 - 一种致死性自身骨膜衰减障碍。在CFTR蛋白中改变单个氨基酸的错义变体是最常见的囊性纤维化变体之一，但是迄今为止，用于准确预测错义变体的分子后果的工具已限制为迄今为止。字母启示（AM）是一项新技术，可预测基于双重学识料蛋白质结构和进化特征的错义变体的致病性。在这里，我们评估了AM预测CFTR错义变种的致病性的能力。AM预测总体CFTR残基的致病性很高，从而在CFTR2.org数据库的CF变体上产生了高的假阳性率和公平分类性能。AM致病性评分与CF患者的致病性指标适度相关，包括汗液氯化物水平，胰腺功能不全率和铜绿假单胞菌感染率。相关性也与CFTR运输和体外折叠能力相关。相比之下，AM分数与CFTR通道功能在体外良好相关 - 尽管在训练过程中缺乏此类数据，但表明双重结构和进化训练方法学习了重要的功能信息。跨指标表明AM的不同性能可能会确定CFTR中的多态性是否是隐性CF变体，但无法区分机理效应或病理生理学的性质。最后，AM预测提供了有限的实用性，以告知CF变体的药理响应，即Theratype。开发新方法以区分CFTR变体的生化和药理学特性，仍然需要完善新兴精度CF治疗剂的靶向。
神经：一种多模式的方法，用于生成硅中的新蛋白质变体
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本于2024年3月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.03.12.584504 doi：Biorxiv Preprint