摘要:在宏基因组学时代,从人类口腔的各个角落(从唾液到牙菌斑再到舌头表面)中鉴定出的病毒多样性加速增长。这种快速扩展表明我们对口腔病毒多样性的理解并不完整,只有少数研究结合了被动口水收集和宏基因组测序方法。在这项先导研究中,我们从杜克狐猴中心(美国北卡罗来纳州达勒姆)的健康工作人员那里获得了 14 个样本,以确定可在人类被动口水样本中鉴定出的病毒多样性。本研究使用高通量测序和病毒宏基因组工作流程鉴定了 3 种指环病毒、9 种 cressdnaviruses、4 种 Caudoviricetes 大噬菌体、29 种微病毒和 19 种 inoviruses 的完整基因组。这里介绍的结果扩展了我们对北卡罗来纳州(美国)人类口腔病毒组的脊椎动物感染和微生物感染病毒多样性的理解。
肠病毒属于picornaviridae家族,智人是肠道病毒的天然宿主,已知会引起各种疾病[1,2]。在当前的分类系统中,肠病毒是基于表型和网格的相似性依次编号的,并被分类为四个不同的物种:polioviruses,polioviruses,coxsackievievieviruses,echovieviruses,echovoviruses,echoviruses,以及新鉴定的诸如EV69,EV70,EV70,EV70,EV70,EV71和EV71和EV71和4] [3,4] [3,4]。虽然呼应病毒会影响上呼吸道和中枢神经系统[5],但Coxsack- Ievirus会影响心血管,胃肠道,内分泌,神经肌肉和皮肤系统[6-10]。coxsackievievievieviepirus根据其器官的性质,器官损伤和抗原反应分类为A组(CVA)和Coxsackievirus B组(CVB)[11,12]。尽管CVA通常与手,脚和口腔疾病的病因有关[13],但CVB可以诱导多种疾病。CVB于1947年第一次在美国纽约的哈德逊河镇库克萨奇镇分离出来[14]。CVB的六种血清型(CVB1至CVB6)已被鉴定,并且与与心脏,胰腺,脑,脑和胃肠道有关的几种疾病有关[15-18]。CVB1主要与1型糖尿病(T1D)相关,也可能引起胸膜炎,无菌性脑膜炎和新生儿败血症[15,19]。同样,CVB4也与T1D发育有关[16],而CVB5与诸如手,脚和口腔疾病,无菌性脑膜炎,病毒性脑炎,急性肺炎瘫痪,心肌炎,心肌炎和T1D等疾病有关[25-27]。虽然已从急性心肌炎,无菌性脑膜炎和急性脑膜脑炎的患者中分离出CVB2 [20-22],这会导致多器官衰竭和心脏源性休克[17],但CVB3感染与心肌炎有关,导致心肌疗法(DCM)和心脏病(DCM)和心脏失败[23,23,24]。然而,有关CVB6感染患病率的孤立报告,但据报道,急性发热性疾病,皮疹,严重急性呼吸道疾病,脑膜炎,心肌炎和/或心包炎的患者已有与CVB5共同感染[27]。尽管所有这些感染都是可以预防的,但目前尚无针对它们的疫苗,部分原因是开发血清型特异性疫苗是不切实际的。
载体传播的黄病毒和人畜共患病的冠状病毒是重要的人类病原体,对全球公共卫生构成了严重威胁。黄病毒,在那里它们被节肢动物载体传播,每年引起数百万个感染。虽然大多数感染是轻度或无症状的,但登革热和黄热病病毒(如黄热病病毒)可能会引起潜在的致命性出血热和休克综合征。神经性黄病毒,例如西尼罗河,日本脑炎和tick虫脑炎(TBEV)会导致具有长期症状的脑膜脑炎。冠状病毒,尤其是SARS(2003)和MERS(2012)(2012年)(2012年)的人畜共患病毒,如2000年代初期一直在定期出现。最新的例子是SARS-COV-2,它在中国城市武汉引起了一系列感染后,遍布全世界,目前造成超过690万人死亡。尽管在SARS-COV-2的情况下,疫苗对于预防感染或严重疾病和住院是至关重要的,但抗病毒药是一种非常有价值的工具,可用于治疗和预防当前和未来的黄病毒和冠状病毒感染。在本文中提出的工作中,我们使用了硅和体外技术的组合来识别和测试病毒蛋白酶潜在抑制剂的活性。在我们的第一项研究(论文1)中,我们意外地鉴定出具有对ZIKV NS2B-NS3蛋白酶的体外活性的HIV蛋白酶抑制剂。Covid-19爆发后,我们将注意力转移到SARS-COV-2上。通过虚拟筛选已知蛋白酶抑制剂的库来鉴定抑制剂,该抑制剂通过分子动力学模拟评估,并最终使用基于FRET的酶促测定法对重组ZIKV蛋白酶进行了测试。还使用了分子对接和分子动力学模拟的相同组合来正确预测已知的泛氟韦蛋白酶抑制剂对TBEV蛋白酶的活性(论文2)。结果,我们是第一个报告基于肽的化合物,具有对TBEV的体外活性。我们首先测试了广谱抗病毒一氧化氮(NO)的抑制作用,并发现无释放的化合物快照对基于细胞的测定中的SARS-COV-2复制具有剂量依赖性抑制作用(论文3)。我们推测SNAP可以通过对SARS-COV-2主要蛋白酶的催化Cys145的反硝化来抑制SARS-COV-2蛋白酶,并发现SNAP对体外酶试验中的重组SARS-COV-2 MPRO蛋白酶具有剂量依赖性抑制作用。在我们的最后一项研究(论文4)中,我们通过对含有42亿种化合物的DNA编码的化学文库的亲和力筛选来确定一类新的有效SARS-COV-2蛋白酶抑制剂。所鉴定的化合物抑制了IC50低至25 nm的重组SARS-COV-2蛋白酶,并且在感染的CALU-3和CACO-2细胞系中低微摩尔范围内的剂量依赖性抗病毒作用。
摘要最近,COVID-19大流行对世界各地的个人和社会产生了极大的影响。这项研究旨在描述瑞典中学(10-12岁)学生对细菌和病毒的理解,从而说明了大流行在学校和社会中的影响。数据是通过半结构化的各个视图和要求学生绘制图像的。使用了访谈成绩单的主题编码和学生注释图纸的内容分析。图纸上微生物的形态通常是“电晕”的,具有圆形和突出的部分。病毒被认为比细菌大,但有时也相似。细菌和病毒之间的相互关系用上等微生物表达。学生将微生物像细胞一样,从不将它们描绘成动物或具有拟人化特征。病毒被认为比细菌引起更严重的疾病。学生很少将特定病毒束缚在特定的传染病上,并经常将(病毒和疾病)称为“电晕”。然而,当它们确实建立连接时,病毒被认为会引起流感和covid-19,细菌会引起感冒和鼠疫。通常,这些结果表明,病毒在COVID-19的后果中在小学生的脑海中获得了微型iSM的更为明显的位置。
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四个家族的四个家族的节肢动物特异性,大型DSDNA病毒(核节肢动物大型DNA病毒或NALDVS)具有编码涉及Baculovirus原发性感染机制的保守成分的基因的同源物。存在编码每个OS感染因子(PIF基因)的这种同源物,以及它们不存在其他病毒和其他共同特征的发生,这表明这些家族病毒的共同起源。因此,最近建立了纳尔达维维特级,适合这四个家庭。此外,在该类别中,ICTV批准了其中三个家族的命令左旋病毒的创建,其成员携带杆状病毒基因的同源物,这些基因代码为病毒RNA聚合酶的成分进行编码,这是造成晚期基因表达的。根据ICTV在2019年的决定朝着所有病毒物种迈向标准化命名法的决定,我们进一步建立了一个以左旋病毒命令对所有病毒物种进行二项式命名的系统。左叶叶命令成员的二项式物种名称由该物种所属的属的名称(例如,α杆状病毒)的名称组成,然后是一个单个上皮,它是指与该病毒最初与之隔离的宿主物种。病毒的通用名称及其缩写不会改变,因为病毒名称的格式位于ICTV的份额之外。
Malacoherpesviridae的家族目前仅由两种感染软体动物的病毒,Ostreid疱疹病毒1(OSHV-1)和卤素疱疹病毒1(HAHV-1)表示,既导致了水产养殖物种的有害感染。还通过在两栖类药物(分支群瘤物种)和Annelid Worm(Capitella teleta)中的基因组测序项目(Capitella teleta)中检测到类似麦芽菌病毒的序列,这表明水生动物中有隐藏的马拉科植物病毒的多样性存在。在这里,为了扩展有关Malacoherpesvirus多样性的知识,我们在基因组,转录组和元基因组数据集中搜索了Malacoherpesvirus亲戚的存在,包括来自Tara Oceans探险队,并报告了4个新颖的Malacoherpesvirus类基因组(Malacoike Genomes(Malacohemes)(Malacohemes(malacohv1-4))。基因组分析建议腹足动物和双壳类作为这些新的马拉科佩病毒的最可能的宿主。基于家族B DNA聚合酶的系统发育分析分别将新型的MalacoHV1和MalacOHV3作为OSHV-1和HAHV-1的姐妹谱系,而MalacoHV2和MalacOHV4表现出更高的差异。发现与两栖动物相关的病毒基因组与malacohv4相关,形成了Mollusc和Annelid malacoherpesviruse的姊妹进化枝,这表明这两种病毒组合的早期分歧。总而言之,尽管在可用序列数据库中相对较少,但先前未描述的马拉科佩病毒Malacohv1-4在水生生态系统中循环,并且在不断变化的环境条件下应被视为可能是新兴病毒。
摘要:我们的研究目的是:(1)评估表型正常的犬类结膜和轨道组织和组织中的犬叶状轨道轨道腺瘤(Cloas),以便存在病毒基因组材料,并且(2)将检测到的DNA病毒分类以确定DNA病毒是否与Cloas相关。在本研究中包括31种植物固定的粘膜嵌入蛋白蛋白蛋白乳蛋白组织样品,4个乳头状瘤或sarcoid,以及10种新的临床正常结膜组织。基因组DNA,并制备了测序文库。库是分子索引并合并的,并通过使用virocap捕获的靶向序列捕获病毒DNA。库是在Illumina Hiseq平台上测序的,并将其与已知的病毒DNA参考基因组进行了比较,以鉴定病毒DNA。分别在6.4%和20%的克洛阿组织和正常的结膜样品中鉴定出食肉动物细节病毒。这项研究表明,来自健康狗和颈毛的结膜组织却罕见地携带了DNA病毒,并且没有与这些肿瘤有关的DNA病毒。需要进一步的研究来评估披针对的病因。
在细菌和其他微生物中繁殖,并在特殊条件下引起裂解。在1917年F.D'RPILL中首先观察到他检测到从同一患者的粪便标本中获得的滤液中从痢疾患者获得的病原体的裂解。d'eRLELL会得出结论,引起裂解的因子是一种病毒,可以通过细菌过滤器,称为该病毒为噬菌体(«饮食细菌»)和现象 - 作为细菌噬菌体。噬菌体大小与其他病毒相似,在20-800 nm之间变化。它们具有线,立方体和精子等形态。e.coli噬菌体已经(t噬菌体)进行了很好的研究。t(键入)组噬菌体由7个成员表示,其中4个成员(T1,T3,T5,T7)和配对3(T2,T4,T6)。配对的T噬菌体,尤其是T2具有复杂的结构。由于与细菌手机噬菌体相互作用的特征,分为有毒和温带。
靶向细胞代谢的抽象抗病毒化合物是控制病毒感染的疗法的一部分,无论是唯一的治疗还是与直接作用抗病毒药物(DAA)或疫苗的结合。在这里,我们描述了其中两个,Lauryl Gallate(LG)和丙戊酸(VPA)的作用均表现出广泛的抗病毒光谱,以应对HCOV-229E,HCOV-OC43和SARS-COV-2等冠状病毒感染。在每种抗病毒的存在下观察到了病毒产率的2至4个decrease酶,LG的平均IC 50值为1.6 m m,VPA为7.2 mm。在吸附前1小时,感染时或感染后2小时添加药物时,观察到相似的侵害水平,支持病毒后的作用机理。相对于其他相关综合体(例如食道酸(G)和epicatechin Gallate(ECG),LG对SARS-COV-2的抗病毒作用的特定效果也被预测是根据Silico研究中更好的抑制作用。LG,VPA和REMDESIVIR(RDV)的联合添加是一种对人冠状病毒具有证明作用的DAA,从而在LG和VPA之间产生了强大的协同作用,并且在其他药物组合之间的程度较小。这些发现增强了这些广泛的抗病毒谱宿主靶向化合物的兴趣,作为针对病毒疾病的第一条防御线,或作为疫苗补充,以最大程度地减少抗体介导的疫苗的间隙,在SARS-COV-2中引起疫苗的疫苗保护,或者在SARS-COV-2的情况下,或者在其他可能的可能的emersing病毒下。