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卡巴培南耐药的基因组表征
摘要 COVID-19 已严重影响医院感染预防和控制 (IPC) 实践，尤其是在重症监护病房 (ICU)。这经常导致多重耐药菌 (MDRO) 的传播，包括耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 (CRAB)。本文，我们报告了意大利一家大型 ICU COVID-19 中心医院的 CRAB 疫情管理情况，并通过全基因组测序 (WGS) 进行了回顾性基因型分析。通过 WGS 分析了 2020 年 10 月至 2021 年 5 月期间被诊断为 CRAB 感染或定植的重症 COVID-19 机械通气患者身上获得的细菌菌株，以评估抗菌素耐药性和毒力基因以及可移动遗传元素。结合流行病学数据，系统发育分析用于识别推定的传播链。 40 例中 14 例 (35%) 被诊断为 CRAB 感染，40 例中 26 例 (65%) 被诊断为定植，7 例 (17.5%) 在入院后 48 小时内分离出 CRAB。所有 CRAB 菌株均属于巴斯德序列 2 型 (ST2) 和 5 种不同的牛津 ST，并呈现携带 bla OXA-23 基因的 Tn 2006 转座子。系统发育分析显示，ICU 内部和ICU 之间存在四条传播链，主要在 11 月至 2021 年 1 月期间传播。量身定制的 IPC 策略由 5 点捆绑组成，包括 ICU 模块临时转换为 CRAB-ICU 和动态重新开放，对 ICU 入院率的影响有限。实施后，未检测到 CRAB 传播链。我们的研究强调了将经典流行病学研究与基因组研究相结合以确定疫情期间的传播途径的潜力，这可能是确保 IPC 策略和防止 MDRO 传播的有力工具。
挑战糖的税收政策
对未来的愿景原始预防WG的分析表明，社会健康决定因素（SDH）在整个RHD连续体中发挥了重要作用。成员列举了对各种地方性环境和低资源环境中各种干预措施进行实际评估的必要性。该评估是基于历史数据建立的，在历史数据中，急性风湿热（ARF）/RHD发病率的明显减少，随后改善了生活条件和影响力SDH的措施。13此外，原始预防WG检查了气体疫苗景观，并迫切需要加速候选疫苗从发现阶段到临床评估，然后再进行许可和实施。跨学科部分伙伴关系被确定为不可或缺的，以支持开发疫苗，这些疫苗广泛有效，能够，安全，最重要的是，最有风险的人可以使用。17主要预防WG讨论的重点是与社区和政府伴侣合作的ARF后遗症之前的气体感染和治疗，以实现可行策略的代码，以改善获得可用的基于证据的中间途径的访问权限。15二级预防WG解决了与已建立RHD患者的诊断和管理有关的问题，以防止疾病进展，包括长期的青霉素预防。在WGS中，人们认识到需要筛查或积极的病例发现以识别风险人群并支持有效的基于社区的干预措施的代码。16最后，第三级护理WG成员评估了与RHD并发症的诊断和管理有关的主题，包括手术和姑息治疗，强调了多层次努力（卫生系统，提供者，社区）的重要性，以改善可用的基于证据的交流，同时支持新型新型易行干预措施的发展。14所有WG都强调需要提高LMIC和地方性环境的研究能力
工作组“NGS 和生物信息学”领域的组成部分 - Sigu
缩写：下一代测序 (NGS)、第三代测序 (TGS)、人类白细胞抗原 (HLA)、纯合区域 (ROH)、B 等位基因频率测序 (BAF)、全外显子组测序 (WES)、全基因组测序 (WGS)、质量控制 (QC)、插入和缺失 (InDels)、结构变异 (SV)、拷贝数变异 (CNV)、聚合酶链式反应 (PCR)、变异调用格式 (VCF)、基因组 (G)VCF、整合基因组学查看器 (IGV)、平衡染色体重排 (BCR)、碱基对 (bp)、兆碱基 (Mb)、读取深度 (RD)、分割/剪辑读取 (SR)、读取对 (RP)、基于组装 (AB)、单核苷酸多态性 (SNP)、单分子实时测序 (SMRT)、零模波导 (ZMW)、差异甲基化探针（DMP）、差异甲基化区域（DMR）
1 2024 年运营计划 | 治理良好的最高审计机关工作流 1
WGS 组合支持最高审计机关开展各种类型的绩效评估，从广泛而全面的最高审计机关绩效管理框架到专门深入审查人力资源 (HR) 管理或信息和通信技术 (ICT) 实践。SPMR 随后与最高审计机关合作，评估、规划和管理最高审计机关的整体绩效，而一些专门的举措则针对具体的最高审计机关组织需求。这些需求包括人员管理、数字治理以及应对风险和危机。为了加强这些努力，我们的工作重点是领导力和利益相关者的参与。各种举措和活动共同旨在全面响应最高审计机关的需求。它们致力于支持最高审计机关的机构和组织设置，并提高其形象以及与外部环境互动和影响外部环境的能力。
测序所需的设备和材料
PACBIO强烈建议使用汉密尔顿液体处理系统将DNA剪切至〜15 - 20 kb的片段尺寸范围，用于WGS样品制备工作流程。If a Hamilton system is unavailable, a Megaruptor 3 system, Spex SamplePrep 1600 MiniG homogenizer or MP Bio FastPrep 96 homogenizer may also be used to shear DNA samples.如果上述剪切工具都不可用，则Covaris g-tube提出了一种替代剪切方法，该方法不需要仪器以外的标准微分离散 - 参见技术注：Covaris G-Tube DNA剪切smrtbell Prep Kit 3.0（102-326-501），以获取更多信息。有关特定设备建议的更详细的指导，请参阅适当的PACBIO程序和清单。
世卫组织非洲区域结核病：2023 年进展更新
ART 抗逆转录病毒治疗 CARN-WARN 中非结核病控制网络-西非结核病控制网络 DOT 直接观察治疗 DST 药敏测试 ECSA-HC 东部、中部和南部非洲 - 卫生社区 EQA 外部质量保证 HIV/AIDS 人类免疫缺陷病毒/获得性免疫缺陷综合征 MDR-TB 耐多药结核病 NTP 国家结核病规划 NTRL 国家结核病参考实验室 QMS 质量管理体系 rGLC 地区绿灯委员会 RR-TB 耐利福平结核病 SEARN-TB 南部和东部非洲国家结核病规划 SRL 超国家参考实验室 STI 性传播感染 TB 结核病 US-CDC 美国疾病控制中心 USAID 美国国际开发署 WGS 全基因组测序
年度工作组报告表
- 今年出版：“老年高血压性心脏病：临床实践考虑”（正在接受） - 准备中：“心脏成像用于高血压心脏的鉴别诊断。实际考虑”（正在开发中） 今年组织/计划的会议： ESH 认可：是/否 参加 ESH 年会 WG 科学会议；主要计划 今年完成的科学项目：正在进行中：计划明年进行： 今年完成的教育项目：正在进行中：计划明年进行： 与其他 WG/科学协会的合作： 其他备注： 填写人（全名）：Konstantinos Tsioufis 日期：2024 年 12 月 3 日 附录：完整董事会组成。所有现任 WG 成员名单，包括全名、电子邮件和出生年份（如果有）。其他（非强制性）：WG 简史、会员标准、详细章程……
博士后资助——离子捕获芯片的开发...
这项博士后研究将是实现集成氮化硅 (SiN) 光波导 (WG) 和光栅的硅基离子捕获芯片的第一步。它将针对光学频率计量应用，并有可能对多个离子进行单独寻址。实现过程和制造理念还将使其与量子信息处理 (QIP) 和单个量子位的片上光学寻址兼容。对于用于 QIP、原子钟或其他量子传感器的坚固、紧凑甚至可移动的离子阱有着强烈的需求。在此背景下，表面电极 (SE) 离子阱是一项非常有前途的技术，它能够捕获多个离子、操纵单个离子并实现可扩展的离子穿梭。这种陷阱依赖于 2D 电极架构，可轻松与标准洁净室工艺兼容。
Illumina DNA准备化学
除了提供快速工作流程外，Illumina DNA准备化学为输入类型和输入量提供了非凡的灵活性，包括直接的新鲜血液或唾液的直接样品输入，并支持广泛的应用（表1）。Illumina DNA Prep与全基因组测序（WGS）应用兼容，包括人，小/微生物和大型复杂基因组测序。对于有针对性的DNA富集应用，包括不同尺寸的固定和自定义面板以及全外显子组测序（WES），Illumina提供具有富集的Illumina DNA Prep，其具有丰富的珠子连接的转座体（EBLTS），以提供丰富的兼容库兼容库。此外，具有富集的Illumina DNA准备与Illumina和第三方富集探针/面板兼容，从而使内容可移植性提高了灵活性。
一周结束2025年1月4日
新南威尔士州的健康不断审查用于监测新南威尔士州呼吸道病毒活动的方法。这是由于社区中包括Covid-19在内的测试，通知模式和呼吸道病毒水平的变化所致。这些变化会影响通知随着时间的推移监测病毒活动和社区传播的有用性。公共卫生，快速，急诊和综合症监测（PHREDSS）数据，COVID-19，废水监视计划，整个基因组测序（WGS）数据以及NSW Sentinel Sentinel Laboratory网络结果目前是监测COVID-19和其他在社区中重要的急诊病毒的最有价值的。新南威尔士州阳性阳性-19阳性抗原测试（大鼠）的公共注册于2023年9月30日停止。NSW Health还监视了由澳大利亚政府和新南威尔士州抗病毒处方出版的住宅老年护理设施中的Covid-19爆发。