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真核SMC蛋白在每个DNA处诱导-0.6的扭曲...
真核生物携带三种类型的结构性维持（SMC）蛋白复合物，冷凝蛋白，粘着素和SMC5/6，它们是ATP依赖性运动蛋白，通过DNA环挤出重塑基因组。SMCS调制DNA超螺旋，但仍未完全了解如何实现这一目标。在这里，我们提出了一个单分子磁性镊子测定法，该测定法直接测量每个回路 - 分解步骤中单个SMC诱导的扭曲程度。我们证明，所有三个SMC复合物都将相同的较大的负扭曲（即，链接数变化δk k k k占-0.6在每个回路 - 排除步骤中）中的挤压循环，与步长大小无关。使用ATP-Hydrolsyssys突变体和不可用的ATP类似物，我们发现ATP结合是ATPase循环期间的扭曲诱导事件，它与产生力的环路 - 分解步骤相吻合。所有三种真核SMC蛋白诱导相同数量的扭曲表明这些SMC复合物中常见的DNA环境解开机制这一事实。
水老化和有机碳源的质量驱动活性巴旋原核生物微生物组的小众分区
由于有机物（OM）源（1000 - 4000 m深度）的稀缺性，原核生物代谢被认为集中在源自表面的颗粒上。然而，活跃的巴旋原核生物群落的结构及其在环境梯度之间的变化如何仍未开发。结合16S rRNA基因和转录本测序，宏基因组学和底物摄取潜在测量值，我们旨在探讨水质量的衰老和OM影响的质量如何影响活性微生物组的结构，以及对社区功能的潜在影响。我们发现，在富含顽固性OM的较老的水质量中，分类群具有自由生活的生活方式对活性微生物组的相对贡献，这表明这些原核生物也可能在海洋广阔地区的沐浴型代谢中发挥作用。表现出较低的潜在代谢率，并且具有有限数量的两分量感觉系统，这表明它们具有较小的感知能力和对环境提示的反应。相比之下，与颗粒相关的原核生物携带的基因用于颗粒定植和碳水化合物利用，这些基因在具有自由生活的生活方式的原核生物中没有。一致地，我们观察到，与较高比例不稳定OM的水域相比，居住在较旧水域的原核生性群落显示出降低的颗粒能力，并具有更高的使用复杂碳源的能力。我们的结果提供了涉足贝类活性原核微生物组区域化的证据，并根据OM的质量揭示了细分市场分配。
水老化和有机碳源的质量驱动活性巴旋原核生物微生物组的小众分区
由于有机物（OM）源（1000 - 4000 m深度）的稀缺性，原核生物代谢被认为集中在源自表面的颗粒上。然而，活跃的巴旋原核生物群落的结构及其在环境梯度之间的变化如何仍未开发。结合16S rRNA基因和转录本测序，宏基因组学和底物摄取潜在测量值，我们旨在探讨水质量的衰老和OM影响的质量如何影响活性微生物组的结构，以及对社区功能的潜在影响。我们发现，在富含顽固性OM的较老的水质量中，分类群具有自由生活的生活方式对活性微生物组的相对贡献，这表明这些原核生物也可能在海洋广阔地区的沐浴型代谢中发挥作用。表现出较低的潜在代谢率，并且具有有限数量的两分量感觉系统，这表明它们具有较小的感知能力和对环境提示的反应。相比之下，与颗粒相关的原核生物携带的基因用于颗粒定植和碳水化合物利用，这些基因在具有自由生活的生活方式的原核生物中没有。一致地，我们观察到，与较高比例不稳定OM的水域相比，居住在较旧水域的原核生性群落显示出降低的颗粒能力，并具有更高的使用复杂碳源的能力。我们的结果提供了涉足贝类活性原核微生物组区域化的证据，并根据OM的质量揭示了细分市场分配。
真核ITS和rRNA扩增子的全长HIFI测序
与简短的读数相比，覆盖范围仅限于ITS1或ITS2区域，HIFI读取的读数涵盖了全真菌其区域的全长。这包含800 bp，如果包括18s和/或28S基因以跨越操纵子，则可以提供约5 kb的扩增子。以及更保守的rRNA基因，这些区域允许在物种水平上降低序列相似性和更高分辨率的分类信息（Tedersoo等，2018； Tedersoo等人，2021年，图2）。除了产生更高的分类价值外，HIFI全长扩增子测序的成本与短阅读的部分扩增子测序相当。在本申请注释中，我们提供了从复杂社区DNA样品中扩增全长真核ITS和rRNA区域的一般指导。
上下文样本：通过样本和相关元数据收集
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靶向DNA依赖性激活机制Sparta
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真核藻类中的定量元素成像
从根本上讲，所有生物都是由相同的原材料制成的，即元素表的要素。生化多样性是通过如何利用这些元素，用于什么目的以及在哪个物理位置来实现的。确定元素分布，尤其是痕量元素的元素分布，这些元素促进了本质酶活跃中心的代谢，可以确定代谢，营养状况或生物体的发育阶段的状态。光合真核生物，尤其是al-gae，是对元素分布进行定量分析的出色主题。这些微生物利用独特的代谢途径，这些途径需要各种痕量营养素的核心以实现其操作。光合微生物在养分有限或毒素污染的栖息地中也具有重要的环境作用。因此，光合真实的真核生物对生物技术剥削，碳固存和生物修复具有极大的兴趣，许多应用涉及各种痕量元素，因此影响其配额和细胞内分布。为元素成像开发了许多不同的应用，允许亚细胞分辨率，X射线荧光显微镜（XFM，XRF）处于最前沿，可以在非破坏性方法中对完整细胞的定量描述。本教程审查总结了使用XFM对真核藻类的定量单细胞元素分布分析的工作流程。
探索世界各地的人类肠道真核微生物群
总而言之，既不能确认也没有反驳全球真核核心的存在或不存在。然而，由于个体数量的异质性，已经谨慎地证明了某些特定的区域核心的存在。这证明了未来需要继续探索人类微生物组的真核比例。
