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World File Search System上消化道
对瑞典男性和男性瑞典患者的微生物组，血脂谱和IL-6的长期变化，以响应减肥犬胃旁路
摘要：脂质代谢失调是导致肥胖症的关键因素。为了抵消与肥胖相关的疾病，减肥手术被作为一种非常有效的方法实施。然而，诸如roux-en-y胃旁路（RYGB）之类的手术是不可逆的，导致消化道的终身变化。本研究的目的是阐明RYGB之前和之后与血脂谱和促炎性IL-6有关的粪便菌群的变化。在这里，我们研究了RYGB手术后长达六年的长期效果，对15例患者的肠道微生物组及其手术后的幸福感，强调了患者的生物学性别。结果表明，手术后患者的健康状况有所改善，这与体重减轻和脂质代谢改善相吻合。健康变化与炎症减少和肠道微生物组的显着变化有关，在女性和男性之间有所不同。女性的静脉细菌门降低，男性增加。prevotella，Paraprevotella，gemella，链球菌和Veillonella_A的总体增加，以及Bacteroides_H，Anaerostipes，lachnoclostridium_b，hydrogeniiclostridium，Lawsonibacter，Lawsonibacter，Lawsonibacter，lawsonibacter，paludicola and Rothia and paludicola and Rothia sasve。总而言之，我们的发现表明，RYGB后肠道微生物群发生了长期变化，并且微生物分类群的转移似乎取决于性别，这应该在更大的队列中进一步研究。
生物信息学分析将Dync1i1确定为肝肝细胞癌
肝肝细胞癌（LIHC）是消化道最常见的恶性肿瘤之一。在全球范围内，LIHC的发病率在恶性肿瘤发病率和死亡率中排名第四[1]。lihc严重影响人们的生活和健康。目前，LIHC的总体预后不令人满意。主要原因包括内部疾病，高度恶性肿瘤，复发和转移[2]。因此，鉴定LIHC特异性生物标志物可以帮助预测和监测疾病的进展，更重要的是，通过实施早期干预，可以减少可能发展为侵略性疾病的病例[3]。癌症基因组图集项目（TCGA）由国家癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所（NHGRI）共同推出。TCGA数据库包含33个肿瘤项目的基因组数据，并向所有研究人员提供原始测序数据[4]。TCGA发布了许多LIHC癌患者的mRNA测序数据。本研究旨在通过分析从TCGA数据库下载的高吞吐量mRNA数据来确定LIHC样品和正常相邻样品之间的mRNA表达差异。我们使用蛋白质相互作用[5]和Cyto-Hubba [6]来找到轮毂基因-Dync1i1。此外，我们评估了Dync1i1的前进价值，并分析了Dync1i1的可能生物学功能，这些生物学功能有望为LIHC的基本分子机制提供新的见解。
在...
Maria Julia de Assis 1 Debora Mariana da Silva Marioto 2抽象肠道炎症性疾病（DII），包括克罗恩病，其特征是慢性和复发性炎症，可能影响消化道的不同部分。证据表明，由于致病细菌和有益细菌之间的关系改变，肠道菌群组成的不平衡可能与这些疾病有关。益生菌给药，例如saccharomyces boulardii，已被提议作为恢复肠道屏障完整性并改善肠道健康的策略。这项工作的目的是分析Boulardii用作DII患者的微生物替代方法的影响。描述符“克罗恩病”，“ Microbiota”和“ Saccharomyces boulardii”用于建立搜索策略，使用布尔操作员和OR将这些术语结合在葡萄牙语和英语中。选定的信息来源包括PubMed和Scielo，具有10年的时间剪切，涵盖了2013年至2023年的期间。体内和体外研究表明，链球菌可以降低肠道通透性，稳定肠壁并帮助组织修复，从而有助于恢复肠道菌群并缓解与炎性肠道疾病有关的症状。关键词：克罗恩病；营养不良；微生物群； S.Boulardii。
对结肠靶向药物输送系统的全面回顾，
摘要 药物给药可在结肠局部或全身进行。结肠药物输送变得越来越重要，不仅用于输送治疗结肠局部疾病（如克罗恩病、溃疡性结肠炎等）的药物，还用于全身输送治疗性肽、蛋白质、抗糖尿病、抗哮喘和抗高血压药物。必须保护药物以免其在上消化道变质、释放和吸收，才能成功靶向结肠。还必须保证药物在近端结肠中快速释放或受控释放。与压力控制结肠输送胶囊、CODESTM 和渗透控制药物输送 (ORDS-CT) 等较新的结肠靶向药物输送系统 (CTDDS) 方法相比，它们在实现体内位点特异性和制造工艺可行性方面具有独特性。本综述主要比较了结肠靶向药物输送系统 (CTDDS) 的主要方法，即前体药物、pH 和时间依赖系统以及微生物触发系统。这些方法取得的成功有限，并且存在局限性。如果可以将药物直接输送到结肠，治疗可能会更成功。本文还介绍了针对结肠部位给药的各种策略和评估的优缺点。关键词：结肠、靶向药物输送系统、pH、生物聚合物、微生物群落、新策略。
Gasdermin电子介导的程序性细胞死亡
结直肠癌（CRC）是最常见的消化道癌。化学疗法药物（如奥沙利铂）经常被诊断为诊断患有晚期或转移性疾病的CRC患者。对CRC肿瘤发生的基础分子机制的深入了解和估计化学疗法敏感性的最佳生物标志物的鉴定对于治疗CRC至关重要。癌症家族的许多成员在癌症中失调，导致肿瘤发生，转移和耐药性。kif11是双极纺锤体的关键组成部分，在几种癌症类型中高度表达。我们通过Western印迹和QRT-PCR分析了KIF11在临床样品中的表达，并通过检测激酶的磷酸化特征和功能良好的功能分析，探索了其在CRC生长中的作用和机制。我们发现KIF11在CRC组织中被上调，并与晚期临床阶段和血管侵袭有关，并且KIF11的敲低导致肿瘤生长停滞，并通过增强的DNA损伤和细胞凋亡增强对Oxaliptin的敏感性。机械上，异常激活的p53信号传导或可能停用的GSK3β信号传导负责CRC细胞中的KIF11敲低介导的效应。因此，我们的数据牢固地证明了KIF11可以作为评估CRC中阿沙利铂敏感性的潜在癌基因和适当的生物标志物。
人类结肠：一个复杂的生物反应器。功能性营养链厌氧消化的概念建模
3 Université Paris XI, , France (E-mail: Beatrice.Laroche@lss.supelec.fr ) 4 INRA, UR910, Unité d'Ecologie et Physiologie du Système Digestif, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex, France (E-mail: marion.leclerc@jouy.inra.fr ) Abstract本文介绍了人类结肠中碳水化合物厌氧消化的模型结构的描述。由于厌氧消化在消化剂和动物胃肠道中类似地发生，因此提出了这些系统之间的相似之处。该过程的水力行为，反应机制和转运现象被确定为构建数学模型的关键初步步骤。在此基础上，提出了验证模型的障碍，并提出了初步方法来评估所获得的结构的充分性，该结构的构建最小的微生物群模型。数学模型将在动物模型上进一步验证，该模型由由人类大肠子接种模型微生物联盟接种的轴突啮齿动物。这种方法对于更好地理解人类消化道，作为一个复杂的系统以及微生物群在人类健康中的作用非常有用。关键字厌氧消化建模；碳营养链；人类结肠；微生物群引言人类结肠（也称为大肠）是肠内的厌氧室。它的主要功能是通过消化纤维的降解为人体带来能量（即复杂的碳水化合物）未水解并吸收在上部消化道中（MacFarlane和Cummings，1991）。除了纤维降解的代谢方面外，宿主与细菌群落之间的相互作用刚刚开始被理解。共生微生物在人类健康中起着重要作用。例如，它们参与炎症性肠道疾病现在已经有充分的文献证明（Gill等，2006）。尽管在人类健康中起了重要作用，但肠道菌群组成和功能仍然有待阐明。胃肠道研究（GIT）微生物群的主要局限性是其微生物多样性超过数百种（Eckburg等，2005），而培养的细菌数量很少，占总微生物细胞的20％（Suau等，1999）。然而，分子方法首先通过元基因组学方法靶向16sRDNA基因和功能基因，可以更好地表征细菌多样性和未培养物种的功能（Manichanh等，2006，Gloux等，2007，2007，Gill等，Gill等，2006）。在文献中，人工系统（化学稳定）或硅方法已被用来研究系统的特定方面，例如微生物竞争（Ballyk等，2001），VFA吸收（Tyagi等，2002; Minekus等，1999）和主机之间的相互作用和相互作用。但是，这些模型都没有整合大肠的生理参数，生化过程和通量以及功能性微生物多样性。由于其生物学复杂性，对人类肠道生态系统的建模确实是一个具有挑战性的主题。这也是更好地理解碳水化合物发酵的关键步骤。此外，模型开发在理解微生物群落对消化系统在健康个体和炎症性疾病发展中的稳定性方面的影响中起着重要作用。这种模型将用于研究饮食方案对人类胃肠道菌群的影响。该模型也将是体内和体外实验设计的非常有用的工具，因为医疗领域和私人公司（药品，营养，益生菌）都需要代表“健康肠道微生物群”的生物学工具。
从粪便样品中自动提取细菌DNA ...
粪便样品分析提供了一种简单的，无创的方法，用于检测多种引起疾病的微生物，生物标志物检测消化道的癌症，以分析肠道微生物组及其对生理健康和疾病的影响。对肠道微生物组的分子检查可以为细菌组成提供宝贵的见解，并可以作为预测胃肠道疾病治疗结果的早期筛查工具。但是，由于存在多酚，腐殖酸，脂质和其他抑制PCR的化合物，因此粪便是一个复杂的样品源。为了实现其巨大的临床潜力，需要从粪便中提取高质量的DNA，不含PCR抑制剂，以自动化的高通量格式提取。为了满足这一需求，Omega Bio-Tek开发了一种用多种磁珠的试剂盒，称为Mag-Bind®通用病原体96套件，用于从包括粪便在内的各种样本类型的病原体检测。在本申请说明中，我们使用Mag-Bind®通用病原体96套件在Chroma Ate的MagXtract 3200上提供了从粪便样品中提取DNA的自动工作流程。下表1中描述了Chroma Ate的MagXtract 3200系统的产品规格。申请说明还讨论了使用实时PCR的DNA产量，质量和扩增潜力的自动化工作流程的性能。
社论：肠肺轴：结核病和耐药性
肠道菌群由消化道中的微生物组成，在维持整体健康方面发挥着关键作用。研究人员发现该生态系统与不同器官和系统之间存在联系，影响免疫、代谢和功能。在这些联系中，肠肺轴是一个复杂的区域，有可能改变结核病 (TB) 和耐药性的治疗。此外，肠道菌群会影响结核病药物的代谢。结核分枝杆菌感染是一个全球性的健康问题，需要有效的控制措施，而对人类微生物群的研究起着至关重要的作用 (Wu et al., 2023)。了解肠道菌群、免疫系统和药物代谢之间的相互关系可以导致针对性治疗，解决结核病感染和耐药性的根本问题。微生物群组成的不平衡是结核分枝杆菌发病机制和药物代谢的重要因素。然而，很少有研究探讨结核分枝杆菌感染如何与肠肺轴微生物群组成相互作用。本研究主题旨在揭示这种联系，强调肠肺轴和耐药性在结核病管理策略中的重要性。重点是结核分枝杆菌，但也包括对其他分枝杆菌科菌株的研究。在这个研究主题中，已经发表了五篇文章，扩大了我们对肠肺轴在结核病感染和耐药性中的作用的理解。
狗微生物组在健康与疾病中的作用
在土壤中。Marchesi和Ravel（1）在其对微生物基因和蛋白质表达的基因和模式的定义中，在给定的环境中以及其中占据了生物和非生物条件。根据这些作者，微生物生物群包括生活在特定的小众中，例如肠。这两种债务都表明，宏观生态学的一般概念可以轻松用于微生物 - 微生物以及微生物 - 宿主。另一方面，“微生物群”一词首先是由Lederberg和McCraya（2）定义的，以强调居住在健康和疾病中人体的微生物的重要性。摩尔生物是通过摩尔 - 斑点方法鉴定的，主要由16S rRNA基因，18S rRNA基因或其他营销基因和基因组区域的分析，放大和微生物组的测试。微生物组位于身体的严格定义位置，例如在消化道，皮肤，生殖系统，呼吸道，同时以定性和定量术语区分微生物组的微生物组。它们非常适合特定年龄范围内特定物种的个体中的个体（例如新生儿，青少年，成人）。通常，微生物群微生物组执行保护功能，这要归功于一个地方的竞争以及有条件疾病的微生物（3，4）。发现，人类和动物的微生物组也会影响身体的发展和各种功能，将他的研究（5）加强为“新发现的器官”，这对健康有重大影响，通常是决定性因素
溶质转运蛋白octn1/slc22a4在实验性结肠炎中影响疾病的严重程度和对英夫利昔单抗的反应：肠道微生物群和免疫调节的作用
*免疫学，风湿病学和传染病研究领域，人类微生物组，BambinoGesù儿童医院，IRCCS，罗马，意大利，意大利†医学和外科科学系，消化道疾病中心（CEMAD），翻译研究实验室，Fondazione Policazione Policlinico Rimisitorio“ A. ”Gemelli” IRCCS, Rome, Italy ‡ Department of Medical and Surgical Sciences, UOS Inflammatory Bowel Diseases, Center for Diseases of Digestive System (CeMAD), Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, Rome, Italy § Department of Translational Medicine and Surgery, Catholic University of the Sacred Heart, Rome, Italy ¶ Department of Pathology, Fondazione意大利罗马的Policlinico Universitorio A.Gemelli Irccs'生物学与生物技术系查尔斯·达尔文（Charles Darwin）圣心天主教大学，意大利罗马，医学与老化科学系，” G。d'Annunzio” Chieti-Pescara大学，意大利Chieti§§高级研究与技术中心（CAST），” G。Gemelli” Irccs，意大利罗马d'Annunzio” Chieti-Pescara大学，意大利Chieti¶¶）和福利，60 Nakaorui-Machi，370-0033，Takasaki，Gunma，日本，日本，††††††药学学院，卡纳泽大学，Kakuma-Machi，Kanazawa，Kanazawa 920-1192，日本，日本‡‡‡‡‡‡‡微生物学和诊断单位学和诊断单位学，Microbunologic and Microbunologicy，Microbumology and Microbumology，REN REN REN，REN，REN，REN人类微生物组，BambinoGesù儿童医院，IRCC，意大利罗马，意大利§§§§§§