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2021; 12（12）：3741-3753。 doi：10.7150/jca.52103研究论文KIF11在结直肠癌中上调，沉默损害肿瘤的生长和
1。基因组学研究中心（肠道微生物群的关键实验室和海伦吉安根省的药物基因组学，中国生物医学 - 药剂师的国家主要实验室），哈尔林医科大学，哈尔滨医科大学，哈尔宾，150081，中国。2。冰冻区心血管疾病（NKLFZCD）的国家主要实验室，哈尔滨医科大学，哈尔滨，150081，中国。3。Harbin医科大学 - 卡尔加里·卡明学院医学中心感染与基因组学中心，哈尔滨医科大学，哈尔滨，150081年，中国。 4。 加拿大卡尔加里大学生物化学与分子生物学系，加拿大T2N 4N1。 5。 加拿大卡尔加里大学，卡尔加里大学免疫学和传染病系微生物学系，加拿大T2N 4N1。 6。 抗肿瘤药理学司，上海医学学院，中国科学院上海医学研究所，上海，上海，201203年，中国中国科学学院。Harbin医科大学 - 卡尔加里·卡明学院医学中心感染与基因组学中心，哈尔滨医科大学，哈尔滨，150081年，中国。4。加拿大卡尔加里大学生物化学与分子生物学系，加拿大T2N 4N1。5。加拿大卡尔加里大学，卡尔加里大学免疫学和传染病系微生物学系，加拿大T2N 4N1。6。抗肿瘤药理学司，上海医学学院，中国科学院上海医学研究所，上海，上海，201203年，中国中国科学学院。
自组装GN头铁蛋白纳米颗粒疫苗可完全保护Dabie Bandavirus的致命挑战 使用有效的无克隆CRISPR/CAS9系统在锥虫质质量 一种多尺度的数字双胞胎，用于人类肥胖驱动的胰岛素耐药性：饮食和药物效应 用惩罚回归技术测量线性多元过程中的连通性 ki-67在DNA复制过程中是必要的，用于叉子保护和 胃结构后人类胚胎的时空转录组图 直接和间接神经发生产生不同谷氨酸能6 的镶嵌物 发现和表征丝氨酸 - 硫代激酶细胞周期蛋白依赖激酶样5（CDKL5）的特异性抑制剂（CDKL5）在海马CA1生理中表现出作用 转录免疫抑制和双链DNA损伤的上调 基于细胞的DATP输送作为慢性心力衰竭的疗法 使用化学和基因描述基于基于化学和基因描述的生物医学文献的采矿药物 - 目标相互作用 从复杂的神经流形的行为简单解码 空间限制调节微孔退火粒子（MAP）支架中的巨噬细胞反应 cas12a目标歧视 oarfish
。cc-by-nc 4.0国际许可证未获得同行评审的认证）是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是制作
159 -KLF5上调是胆管癌的常见事件，充当癌基因，构成不良的预后因素
结果：与正常肝组织相比，来自5个不同患者同类的人类CCA组织中KLF5的表达上调。高KLF5水平与淋巴结侵袭和总体生存率较差有关。 与正常的人胆管细胞相比，在人CCA细胞中发现了体外，KLF5蛋白和mRNA水平。 KLF5 - / - CCA细胞的蛋白质组学分析表明，大多数改变的途径与细胞周期，增殖，生存和迁移的调节有关。 一致，与CCA对照细胞相比，klf5 - / - CCA细胞表现出降低的细胞增殖，菌落形成和迁移，同时在G1/s处促进细胞周期停滞，并在体外凋亡。 相反，在CCA异种移植动物模型中皮下或原位注射后，没有明显的肿瘤发育迹象。 同样，高KLF5水平与淋巴结侵袭和总体生存率较差有关。与正常的人胆管细胞相比，在人CCA细胞中发现了体外，KLF5蛋白和mRNA水平。KLF5 - / - CCA细胞的蛋白质组学分析表明，大多数改变的途径与细胞周期，增殖，生存和迁移的调节有关。一致，与CCA对照细胞相比，klf5 - / - CCA细胞表现出降低的细胞增殖，菌落形成和迁移，同时在G1/s处促进细胞周期停滞，并在体外凋亡。相反，在CCA异种移植动物模型中皮下或原位注射后，没有明显的肿瘤发育迹象。同样，
红色foxtail小米上调体外和体内脑衍生的神经营养因子水平
大脑中脑衍生的神经营养因子（BDNF）的上调可以帮助预防和治疗抑郁症。 bdnf在各种周围组织以及大脑中合成，可以通过血脑屏障到达大脑。 因此，上调上调的食物可能有助于抑郁管理。 我们先前使用人肾脏腺癌ACHN细胞系具有白色foxtail小米（WFM）的BDNF-UP调节作用，该细胞系能够产生和分泌BDNF。 但是，尚不清楚其他foxtail小米品种是否也可以上调BDNF。 在此，我们检查了红色Foxtail小米（RFM）对体外和体内BDNF生产的影响。 RFM甲醇提取物在ACHN细胞的培养基中显着提高了BDNF水平，并且水平高于WFM处理的水平。 喂养含有20％RFM的标准饮食的大鼠的血清BDNF浓度明显高于对照中的饮食。 此外，RFM甲醇提取物的丁醇部分显着提高了ACHN细胞培养基中的BDNF水平，并在ACHN细胞中上调BDNF mRNA表达。 我们的结果表明，RFM具有具有BDNF诱导活性的食物材料。大脑中脑衍生的神经营养因子（BDNF）的上调可以帮助预防和治疗抑郁症。bdnf在各种周围组织以及大脑中合成，可以通过血脑屏障到达大脑。因此，上调上调的食物可能有助于抑郁管理。我们先前使用人肾脏腺癌ACHN细胞系具有白色foxtail小米（WFM）的BDNF-UP调节作用，该细胞系能够产生和分泌BDNF。但是，尚不清楚其他foxtail小米品种是否也可以上调BDNF。在此，我们检查了红色Foxtail小米（RFM）对体外和体内BDNF生产的影响。RFM甲醇提取物在ACHN细胞的培养基中显着提高了BDNF水平，并且水平高于WFM处理的水平。喂养含有20％RFM的标准饮食的大鼠的血清BDNF浓度明显高于对照中的饮食。此外，RFM甲醇提取物的丁醇部分显着提高了ACHN细胞培养基中的BDNF水平，并在ACHN细胞中上调BDNF mRNA表达。我们的结果表明，RFM具有具有BDNF诱导活性的食物材料。
熟练不匹配修复结直肠癌的患者的新辅助肿瘤内流感疫苗治疗导致CD8+ T细胞的肿瘤浸润增加，PD-L1的上调：一项1/2期临床试验
结直肠癌的抽象背景，免疫检查点抑制剂的作用主要限于缺乏不匹配修复肿瘤的患者，其特征是CD8+T细胞的高级浸润。缺乏熟练的不匹配修复肿瘤中增加肿瘤内CD8+T细胞浸润的干预措施。方法我们进行了概念验证阶段1/2临床试验证明，该试验患有非近去sigmoid或直肠癌的患者，该患者计划接受治疗性手术的治疗，并用内窥镜内镜内施用的新辅助疫苗疫苗进行治疗。血液和肿瘤样品。主要结果是干预的安全性。评估病理肿瘤退化等级，免疫组织化学，血液流式细胞仪，组织批量转录分析以及肿瘤区域的空间蛋白质分析都是次要结果。结果总共包括10名患者。中位患者年龄为70岁（54-78岁），女性为30％。所有患者均具有国际癌症控制阶段I – III肿瘤的熟练不匹配修复结合。没有发生内窥镜安全事件，所有患者正按计划进行治疗手术（干预后9天）。在接种疫苗接种后，CD8+T细胞肿瘤的浸润增加（中位数为73 vs 315细胞/mm 2，p <0.05），以及与中性粒细胞相关的Messenger RNA基因表达的显着下调以及编码细胞毒性功能的转录物相关的上调。空间蛋白质分析显示，程序性死亡凸式1（PD-L1）（调整后的P值<0.05）和FOXP3下调（调整后的P值<0.05）的局部上调显着上调。
转录免疫抑制和双链DNA损伤的上调
图2。corex基因（a，b）验证验证核心基因预测值的验证。精度表示真正是eCDNA（+）的预测样品的比例。召回是指正确预测的eCDNA（+）样品的比例。对于具有相似精度的多个点，绘制了最大召回率。（a）核心基因和核心基因的曲线重叠，表明相似的预测能力。（b）Corex基因具有较高的预测率，并且基于对数折叠的折叠变化（TOP-| LFC |基因）的643个差异表达基因。（c）Corex基因在肿瘤类型的ECDNA（+）样品中始终在肿瘤样品中持续上调，但SARC除外。（d）的643 top- | lfc |基因，240个上调，而403个在ECDNA（+）样品中下调。325上调，而318个下调。top- | lfc |的绝对LFC值基因集明显大于核心基因的基因（p值1.83E -158）。（e）Corex基因的归一化基因表达值显着高于Top-| LFC |的基因表达值。基因集（p -Value <2E -308）。*** p -Value <0.001。
o r i g i n a l r e s a r c h上调通过ddit4介导的自噬途径抑制低氧 - 异化脑损伤
简介：低氧 - 缺血（HI）仍然是婴儿脑瘫和长期神经后遗症的主要原因。尽管进行了深入的研究和许多治疗方法，但针对HI侮辱的神经保护策略有限。在此，我们报告了HI损伤在新生儿小鼠的同侧皮层中显着下调的MicroRNA-9-5P（miR-9-5p）水平。方法：通过QRT-PCR，蛋白质印迹分析，免疫荧光和免疫组织化学评估缺血性半球蛋白质的生物学功能和表达模式。开放现场测试和Y迷宫测试用于检测运动活动，探索性行为和工作记忆。结果：miR-9-5p的过表达有效地减轻了HI侮辱后的脑损伤并改善了神经系统行为，并伴随着抑制神经炎症和凋亡。miR-9-5p直接与DNA损伤诱导转录物4（DDIT4）的3'未翻译区域结合，并对其表达负面调节。此外，miR-9-5p模拟处理下调节的轻链3 II/轻链3 I（LC3 II/LC3 I）比率和Beclin-1表达，并降低了同侧皮层中LC3B的积累。进一步的分析表明，DDIT4敲低明显抑制了HI-UP调节的LC3 II/ LC3 I比和Beclin-1表达，与脑损伤相关。结论：研究表明，miR-9-5p介导的HI损伤受DDIT4介导的自噬途径调节，而miR-9-5p水平的上调节可能会对HI脑损伤产生潜在的治疗作用。关键字：缺氧 - 疾病，HI，miR-9-5p，DNA损伤诱导的转录本4，（DDIT4），自噬
FHD-286 暴露上调髓系成熟...
BAF（BRM/BRG1 相关因子）复合物（也称为 mSWI/SNF）是基因组染色质景观的关键调节器。通过控制染色质的可及性，BAF 调节谱系特异性转录程序，包括对 AML 母细胞生长和存活至关重要的程序。FHD-286 是 BAF 催化亚基 BRM 和 BRG1（SMARCA2/4）的强效抑制剂，正在开发用于治疗复发/难治性 AML 和 MDS。FHD-286 已证明在体外治疗来自不同遗传背景的 AML 患者样本中具有广泛的疗效，包括那些具有难以治疗的突变特征的样本，例如 mtNPM1、FLT3 ITD 和 EVI1 过表达的 Inv(3)。有趣的是，虽然较高浓度（≥90 nM）的 FHD-286 主要诱导细胞减少，但较低浓度（≤30 nM）诱导分化样反应。为了研究这种分化效应，我们在长期暴露于 FHD-286 后对细胞系和原发性 AML 样本进行了免疫表型分析。使用药理学相关浓度（5-20 nM）的 FHD-286 进行长期治疗（7 天以上）导致髓系成熟标志物 CD11b 的时间和剂量依赖性上调。CD11b+ 细胞表达较低水平的增殖和存活蛋白 Ki67 和 BCL2，以及 BRG1 蛋白，这意味着未成熟母细胞以高水平的 BRG1 为特征。这些结果表明 BAF 可驱动维持 AML 细胞处于未分化状态所需的转录程序，并且 FHD-286 可能通过克服这种分化阻滞来抑制 AML 细胞生长。我们还证明了在体外多种 AML 细胞系中与标准治疗细胞毒性药物联合使用具有益处，并且在体内具有显著的生存益处。总之，这些发现表明 FHD-286 能够靶向高度依赖 BRM/BRG1 的原始祖细胞群，并且与标准治疗药物联合使用可以在 AML 中实现显著的、突变不可知的抗肿瘤活性。
伏立诺他通过上调 PTEN 诱导乳腺癌细胞 G2/M 细胞周期停滞
摘要。– 目的：乳腺癌 (BC) 是全世界女性中最常见的癌症类型。人们提出了各种方法来治疗这种疾病，但没有一种单一的药物被证明是有效的。因此，了解不同药物的分子机制变得势在必行。本研究旨在评估厄洛替尼 (ERL) 和伏立诺他 (SAHA) 在诱导乳腺癌细胞凋亡中的作用。还根据一些癌症相关基因的表达谱评估了这些药物的作用；PTEN、P21、TGF 和 CDH1。材料和方法：在本研究中，乳腺癌细胞 (MCF-7) 和 MDA-MB-231 以及人羊膜细胞 (WISH) 用两种浓度 (50 和 100 µM) 的厄洛替尼 (ERL) 和伏立诺他 (又名 SAHA) 处理 24 小时。收获细胞用于下游分析。通过流式细胞仪分析DNA含量和细胞凋亡，并进行qPCR以评估不同癌症相关基因的表达。结果：结果表明，与正常细胞和对照相比，ERL和SAHA在24小时后将两种乳腺癌细胞都抑制在G2/M期。对于细胞凋亡，随着两种所用药物的浓度增加，BC细胞显示出升高的总细胞凋亡水平（早期和晚期），在24小时处理中，ERL的最有效浓度为100µM。在对照细胞中，SAHA被证明是在100µM浓度下最有效的药物，在24小时处理中细胞凋亡百分比范围为1.7-12％。在所使用的两种乳腺癌细胞系中，坏死也呈剂量依赖性。我们进一步评估了 PTEN 、 P21 、 TGF- β 和 CDH1 的表达谱。在 MCF-7 中，数据表明对于 TGF- β 、 PTEN 和 P21 ，最有效的治疗是浓度为 100 µM 的 SAHA，而对于 CDH1 ，最有效的浓度是 100 µM 的 ERL。在 MDA-MB-232 中也观察到了类似的情况，其中对于 TGF- β 、 PTEN 和 P21 ，最有效的治疗是浓度为 100 µM 的 SAHA，而对于 CDH1 ，最有效的浓度是 50 µM 的 SAHA。结论：我们的结果揭示了 ERL 和 SAHA 在调节癌症相关基因表达中的作用，尽管这些数据需要进一步研究。
2型中长的非编码RNA MEG3和miR-181b的上调
几项研究表明，长的非编码RNA（LNCRNA）和microRNA（miRNA）分子与糖尿病（DM）及其并发症的发病机理密切相关。这项研究旨在探讨LncRNA母体表达的基因3（MEG3）和miR-181b与缺血性脑卒中（CS）的发展作为2型DM的并发症的可能关系。该研究涉及20名糖尿病患者（DM），20名CS糖尿病患者（DM+CS），17名CS患者和10名显然健康的受试者。使用实时PCR在血清样品中分析了MEG3和miR-181b的表达水平。与DM或对照组相比，DM+CS组和CS组的MEG3的表达显着更高。此外，与对照组相比，在DM+CS和CS中，miR-181b显着上调。总而言之，这项研究表明，MEG3和miR-181b可能在糖尿病患者的CS进展中起作用。