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World File Search System丝状
丝状真菌中生物合成基因簇的转录激活
丝状真菌是高产的细胞工厂，其中许多是酶、有机酸和次级代谢物的工业生产者。越来越多的真菌基因组测序揭示了转录沉默的次级代谢物生物合成基因簇 (BGC) 形式的巨大且未开发的生物合成潜力。人们已经采取了各种策略来探索和挖掘这种尚未开发的生物活性分子来源，随着合成生物学的出现，已经为丝状真菌开发了新的应用和工具。在这里，我们总结了旨在表达内源或外源天然产物 BGC 的方法，包括合成转录因子、人工转录单元的组装、基因簇重构、真菌穿梭载体和平台菌株。
丝状病原体效应物通过内吞作用进入植物细胞
(RxLR) 基序，这是易位所必需的 [2,5]。RxLR 效应物递送到宿主细胞中的方式存在争议；关于 RxLR 基序与宿主质膜脂质结合和细胞自主摄取的说法受到了质疑 [4]。有证据表明 RxLR 基序是蛋白水解加工的位点，在分泌过程中被切割和去除 [5]。与卵菌效应物相比，真菌细胞质效应物缺乏与易位相关的明显氨基酸基序。然而，卵菌和真菌效应物中保守的结构折叠被认为有助于效应物递送 [4]。有趣的是，真菌病原体稻瘟病菌 [ 6 ] 和卵菌晚疫病菌 [ 7 ] 的细胞质效应物都是通过非常规蛋白分泌 (UPS) 途径从这些病原体中输出的，也就是说，尽管它们具有分泌信号肽，但它们的输出对抑制剂布雷菲德菌素 A 不敏感，因为抑制剂布雷菲德菌素 A 会阻断细胞内囊泡运动，从而阻止通过内质网 (ER) 和高尔基体的常规分泌。分泌途径可能是决定这些病原体向宿主输送的关键步骤。事实上，有证据表明，通过 UPS 途径从丝状病原体中输出细胞质效应物的情况非常普遍 [ 4 ]。除了了解细胞质效应物的分泌之外，一个关键问题是：它们如何进入植物细胞？
DNA修复途径对丝状病原体基因组编辑和进化的贡献
DNA 双链断裂需要修复，否则可能会破坏生命语言。为了确保基因组的完整性和可行性，多种 DNA 双链断裂修复途径在真核生物中发挥作用。两种这样的修复途径，即典型的非同源末端连接和同源重组，已经得到了广泛的研究，而其他途径，如微同源介导的末端连接和单链退火，曾经被认为是后备途径，现在似乎在 DNA 修复中发挥着根本作用。在这里，我们回顾了这四种 DNA 修复途径的分子细节和层次结构，并在可能的情况下，比较了动物和真菌模型之间的已知情况。我们讨论了导致断裂修复途径选择的因素，并旨在探索我们对丝状病原体机制和调控的理解和知识差距。我们还讨论了 DNA 双链断裂修复途径如何影响基因组工程结果，包括意外突变结果。最后，我们回顾了丝状病原体中基因组进化偏向的概念，并提出了一种称为“偏向变异”的模型，该模型将 DNA 双链断裂修复途径与基因组进化的特性联系起来。尽管我们对这一普遍过程有着广泛的了解，但仍有许多未解问题，这些问题的答案可能会改善基因组工程和我们对基因组进化的理解。
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识别 - 北氧 - 毫米 - 丝状尿素 - 弗洛（Flow）...
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隔离和鉴定具有人畜共患的丝状真菌和酵母菌
构成鸟类正常微生物的不同微生物可以存在于不同底物中，例如土壤和构成栖息地的其他元素。在牛肠，由于部分迁移习惯，肠道菌群可能会改变。因此，这项研究旨在隔离和鉴定出从墨西哥东部经济区Tulancingo的牛群（bubulcus ibis）粪便粪便中获得的真菌和酵母。牛群粪便进行分析，共240个池样品，这些样品分布在Sabouraud琼脂上，并在25.00-37.00°C下孵育2至3天。丝状真菌和酵母是通过形态学和乳酚蓝染色或中国墨水染色鉴定的。丝状真菌属粘液属。（42.35％），根茎属。（26.71％）;青霉属。（13.35％）; Paecilomyces spp。（11.40％）; Scedosporium spp。（1.95％）;并且，来自诸如加密赛属的酵母。（2.29％）; Rhodotorula spp。（1.95％）被鉴定出来。在这项工作中，从牛肠粪便中分离出具有人畜共患势的丝状真菌属和酵母菌的存在。当存在免疫抑制或结合不同的倾向因子时，可能会发生真菌感染的临床表现。鸟类的存在及其在人为活性中的下降并不是在免疫学胜任人类中表现出疾病的诱人因素。
基因组编辑技术及其在工业丝状真菌曲霉中的应用潜力
摘要：Aspergillus oryzae是一种浮雕的真菌，已用于传统的日本酿酒行业，例如清酒，酱油和味o味生产。此外，绿曲霉已被用于异源蛋白质的产生中，并且该真菌由于能够通过引入外国生物合成基因而产生大量异源天然产物，因此该真菌最近被用于生物合成研究。遗传操作在绿曲霉的功能发展中很重要，主要限于野生应变rib40，这是一种适用于实验室分析的基因组参考。但是，有许多具有各种专业特征的A. oryzae的工业酿造菌株，并且根据各种目的所需的特性选择性地使用它们，例如清酒，酱油和味o的生产。自2000年代初以来，已经开发了基因组编辑技术；在这些技术中，转录激活效应效应子核酸酶（Talens）和定期插入的短期短质体重复序列/CRISPR-相关蛋白9（CRISPR/CAS9）已应用于A. oryzae的基因修饰。值得注意的是，CRISPR/CAS9系统已经显着提高了A. oryzae工业菌株基因修饰的效率。在这篇综述中，总结了基因组编辑技术及其在A. Oryzae中的应用潜力的发展。
CRISPR/CAS9在丝状真菌中的二级代谢物合成中的应用
背景：医学教育是一个苛刻的终身学习过程，其中包括三个紧密联系的阶段：大学教育，研究生教育和持续教育。居住是大学教育后的第一年，这是一个合格的医生发展的关键时期。此外，居民是从事医院大部分临床工作的主要力量。因此，通过对居民医生（STRP）的标准化培训来确保和提高居民的临床技能和能力很重要。但是，与省省的其他医院相比，近年来，我们医院居民的STR评估结果并不令人满意。因此，这项研究的目的是找出导致性能不令人满意的问题，并确定“计划检查”（PDCA）计划在为将来培训提供宝贵框架方面的作用。
高度对齐的组织工程构造的丝状光 (FLight) 生物制造
基于光的投影技术越来越多地用于制造仿生组织。[1–3] 最近，通过激光光束的断层投影，已经可以快速生物制造复杂的细胞结构。[4–6] 然而，在制造肌肉和肌腱等各向异性组织时，大多数光导组织制造策略在有效细胞排列方面的潜力有限[7,8]，因为大多数方法都侧重于宏观特征（> 100 μ m），而这些特征缺乏这些组织中高度排列的细胞和细胞外组织所必需的地形线索。对于可以实现细胞级（< 30 μ m）分辨率的双光子聚合和超高分辨率数字光处理等技术，非相干光源将光聚合限制在小范围（< mm）内发生，而这需要逐层策略才能实现大型组织工程结构的制造。 [1,9,10] 速度和可扩展性的折衷限制了这些方法的转化潜力。指导性线索（如纤维成分以及纤维和挤压式生物打印的组合）已被广泛研究，因为它们具有促进细胞排列和排列组织工程结构成熟的潜力，如肌肉、肌腱、神经和软骨组织。[7,11–14] 研究表明，长宽比增大的拓扑线索会影响基底内/上细胞的生物活性。例如，通过微流体或软光刻制备的棒状微凝胶（长宽比为 10）能够增加细胞取向，与微球相比，高长宽比微棒之间的空隙可以更好地实现细胞取向。[15,16] 通过微图案化技术创建的具有超高长宽比（> 20:1）的拓扑特征可以有效诱导细胞粘附和排列。 [17,18] 尤其是当限制的尺寸接近细胞核的尺度（<10μm）时，这些纵向限制导致的核变形变得明显。细胞核的细长形状可以影响细胞分化、基因表达和再生，后者通过染色体重组和激活 DNA 修复机制来实现；[19,20]
基于AMA1的下一代质粒，用于增强丝状真菌的异源表达
图1使用下一代AMA1质粒增强了麦克利荧光蛋白的表达。A。分析了MCHERRY表达的AMA1质粒的示意图，其选择标记物具有不同的变体。b荧光曲霉曲霉菌落的荧光照片显示，用Ubi-M-Pyrg和Ubi-Y-Y-Pyrg质粒转化的菌落中荧光增加。来自转化菌落的孢子中麦克利荧光的流式细胞仪分析表明，使用UBI-Y-Y-PYRG质粒实现了最均匀和最高的麦克利信号。在图S1a中，来自不同转化菌落的重复之间的平均荧光和重复的直方图。在液体培养中生长的菌丝体的共聚焦显微镜图像显示，在含有UBI-M-PYRG和UBI-Y-PYRG质粒的菌丝体中的表达增加。ImageJ火灾校准栏代表不同级别的MCHERRY信号。在图中重复S2。e。对等差质粒浓度下不同质粒的转化效率的评估显示，质质质质量降低的质粒的转化效率降低了，将pyRG融合到降解标签。字母表示由ANOVA确定的，并在Tukey后的测试中确定了显着不同的组。F.在选定和非选择条件下固体培养基上菌落生长速率的比较表明，在选择性条件下，携带UBI-M-PYRG和UBI-Y-Y-PYRG质粒的菌株的生长较慢。星号代表pADJ <0.05 <0.05，韦尔奇的t检验表示选择性和非选择性培养基之间的直径差异，用于携带每种质粒的菌株。