7。职位描述:医学博士Cantas Alev教授的实验室在京都大学的人类生物学高级研究研究所(ASHBI),对人类和其他物种的早期胚胎发育的体外重建和分析感兴趣。我们的实验室正在利用经典胚胎学和基于多能干细胞的体外模型系统的组合。我们对中胚层形成和图案的体外概括特别感兴趣(即体外胃胃),中胚层器官发生和中胚型驱动的形态发生过程,包括人类和非人类多能干细胞(ESC/IPSC)的内胚和外胚层器官发生以及组织形成。与ASHBI的其他科学家合作,我们的实验室旨在在体外器官发生和“合成胚胎学”领域建立新颖的科学概念和破坏性技术,总体目标是提高我们对人类发展,疾病和进化的理解仍然有限。我们正在寻找具有积极进取和才华横溢的新成员,他们在“合成生物学”和体外器官发生方面分享了我们实验室的兴趣。我们特别寻找具有经验的候选人高含量3D/4D成像,单细胞RNA/ATAC-SEQ(和其他 - 组类型),AI-ML驱动的数据分析。在干细胞生物学和“器官”技术,基于CRISPR/CAS9的基因组编辑技术,包括光遗传学,微能力,生物材料在内的生物工程方法,基于CRISPR/CAS9的基因组编辑技术,基于CRISPR/CAS9的基因组编辑技术,生物工程方法的候选者。候选者。这是为快速新兴领域的建立和发展做出贡献的绝佳机会,同时解决了人类和其他物种的发展,疾病和进化的基本问题。如果您想成为我们动态,多样和包容性的国际研究团队的一部分,请申请。
干细胞生物学以及再生医学的相关领域涉及在包括骨髓和脂肪组织在内的多种组织中存在的多能干细胞。研究表明,1克脂肪组织产生约5 x 10 3的干细胞,其比1克骨髓中的间充质干细胞数量高出500倍。[1]干细胞由于其多能性和无限能力的自我更新能力,为组织工程和重建程序的进步提供了希望。脂肪组织尤其代表了脂肪衍生的干细胞(ADSC)的丰富且易于接近的来源,该来源可以沿多个中胚层谱系区分。[1] ADSC可以允许从另一个部位转移后改善移植物存活和新的脂肪组织的产生。
当雄性精子细胞与雌性卵细胞结合时,这会产生受精卵细胞,也称为合子。在这种结合后立即开始,随着2个细胞变为4,并向前开始,细胞繁殖的快速过程开始,直到产生了称为胚泡的空心细胞球(请参见下面的图形)。出现胃,就像一个空心的马蹄形结构一样,具有三个不同的细胞层的开始。最后,有三个主要的细菌层所在的胚胎(也称为蛋黄囊)的形成。发育的胚胎阶段始于受试者受精后的大约两周,一直持续到妊娠的第八周。人类是占地去的,这意味着它们具有从三个胚胎细胞层衍生的物体,即三个胚胎层。这三层称为内胚层,中胚层和外胚层。
Yogesh Sontakke博士;人类胚胎学教科书,临床病例和3D插图; CBS Publishers&Distributors Pvt Ltd,新德里。Ghimire S,Mantziou V,Moris N,Martinez Arias A.人类胃结构:胚胎及其模型。Dev Biol。 (2021)474:100–8。 doi:10.1016/j。 ydbio.2021.01.006。 Luckett WP。 蛋黄囊的起源和分化,以及前象中胚层和恒河猴猴子胚胎中的中胚层。 am j anat。 (1978)152(1):59–97。 doi: 10.1002/aja.1001520106 Pechriggl E, Blumer M, Tubbs RS, Olewnik Ł, Konschake M, Fortélny R, Stofferin H, Honis HR, Quinones S, Maranillo E and Sanudo J (2022) Embryology of the Abdominal Wall and Associated Malformations— A Review. 正面。 外科。 9:891896。 doi:10.3389/fsurg.2022.891896。 Zahouani T,Mendez MD。 圆环。 statpearls。 宝藏岛(FL)(2021)。 Karaman A,Aydin H,Goksu K.与三体术相关的同时的圆环,Ancephaly和关节炎。 基因群岛。 (2015)26(1):77–9。 PMID:26043511。 Chuaire Noack L.了解胃刺的新线索。 胚胎学,发病机理和流行病学。 colomb Med(Cali)。 (2021)52(3):E4004227。 doi:10.25100/cm.v52i3.4227。 Keshtgar A,Griffiths M.儿童脐疝的监禁:趋势是否在增加? 欧洲小儿手术杂志。 (2003)13(01):40–3。DOI:10.1055/S-2003-38299。Dev Biol。(2021)474:100–8。doi:10.1016/j。ydbio.2021.01.006。Luckett WP。蛋黄囊的起源和分化,以及前象中胚层和恒河猴猴子胚胎中的中胚层。am j anat。(1978)152(1):59–97。doi: 10.1002/aja.1001520106 Pechriggl E, Blumer M, Tubbs RS, Olewnik Ł, Konschake M, Fortélny R, Stofferin H, Honis HR, Quinones S, Maranillo E and Sanudo J (2022) Embryology of the Abdominal Wall and Associated Malformations— A Review.正面。外科。 9:891896。 doi:10.3389/fsurg.2022.891896。 Zahouani T,Mendez MD。 圆环。 statpearls。 宝藏岛(FL)(2021)。 Karaman A,Aydin H,Goksu K.与三体术相关的同时的圆环,Ancephaly和关节炎。 基因群岛。 (2015)26(1):77–9。 PMID:26043511。 Chuaire Noack L.了解胃刺的新线索。 胚胎学,发病机理和流行病学。 colomb Med(Cali)。 (2021)52(3):E4004227。 doi:10.25100/cm.v52i3.4227。 Keshtgar A,Griffiths M.儿童脐疝的监禁:趋势是否在增加? 欧洲小儿手术杂志。 (2003)13(01):40–3。DOI:10.1055/S-2003-38299。外科。9:891896。 doi:10.3389/fsurg.2022.891896。Zahouani T,Mendez MD。圆环。statpearls。宝藏岛(FL)(2021)。Karaman A,Aydin H,Goksu K.与三体术相关的同时的圆环,Ancephaly和关节炎。 基因群岛。 (2015)26(1):77–9。 PMID:26043511。 Chuaire Noack L.了解胃刺的新线索。 胚胎学,发病机理和流行病学。 colomb Med(Cali)。 (2021)52(3):E4004227。 doi:10.25100/cm.v52i3.4227。 Keshtgar A,Griffiths M.儿童脐疝的监禁:趋势是否在增加? 欧洲小儿手术杂志。 (2003)13(01):40–3。DOI:10.1055/S-2003-38299。Karaman A,Aydin H,Goksu K.与三体术相关的同时的圆环,Ancephaly和关节炎。基因群岛。(2015)26(1):77–9。PMID:26043511。Chuaire Noack L.了解胃刺的新线索。胚胎学,发病机理和流行病学。colomb Med(Cali)。(2021)52(3):E4004227。doi:10.25100/cm.v52i3.4227。Keshtgar A,Griffiths M.儿童脐疝的监禁:趋势是否在增加?欧洲小儿手术杂志。(2003)13(01):40–3。DOI:10.1055/S-2003-38299。(2003)13(01):40–3。DOI:10.1055/S-2003-38299。
我们在 CPM 中生成了 Chd7 的条件性 KO,并使用转录组和表观基因组分析、体内表达分析和与现有数据集的生物信息学比较分析了心脏祖细胞。我们表明 CHD7 是正确表达几种基因所必需的,这些基因已确定为心脏发育的主要参与者,尤其是在第二心脏领域 (SHF) 中。我们在心脏祖细胞中确定了 CHD7 结合位点,并发现与组蛋白标记有很强的关联,这表明在 mESC 分化的中胚层到心脏祖细胞转变过程中存在动态调节的增强子。此外,CHD7 与心脏源性基因调控网络中的先驱转录因子 ISL1 共享其靶位子集,包括一个调节 SHF 祖细胞与分化心肌细胞中 Fgf10 表达的增强子。
内容:在胚胎发生,组织再生和癌变期间,有一些关键的调节元件有助于EMT以及干细胞特性的诱导和维持。在这里,我们探讨了EMT在胚胎发生和组织发育的不同阶段的含义。我们特别强调了中胚层形成和神经rest细胞中EMT的必要性。通过EMT,这些细胞获得上皮 - 间质可塑性(EMP)。随着这种过渡,损伤后通过转移性级联反应以及组织再生发生了至关重要的形态变化。干细胞(包括癌症干细胞)是由EMT产生的,在此过程中,会上调干细胞维持所需的因素。因此,重要的是要了解允许癌症干细胞觉醒的关键调节剂,从而提高了可塑性并促进治疗耐药性,以制定针对该细胞群体的策略并改善患者的结果。
抽象间充质干细胞(MSC)是CD34和CD45阴性,非造血干/祖细胞,这些细胞源自骨髓的基质分数。与其他茎/祖细胞亚群一样,确切的表型仍然有争议。但是,它们的特征是遵守组织培养塑料,而无需专业底物。此外,存在多种表面抗原,例如粘附分子或整联蛋白,它们已多种归因于MSC的分数,并导致其描述中进一步的异质性。出现了一种操作定义,该定义将MSC定义为具有分化能力的多能细胞,并保留多个中胚层谱系。临床前研究表明,在心肌损伤模型中自体和同种异体移植的益处。最近报道的一项临床研究表明,急性心肌梗塞患者同种异体细胞的早期安全性。
慢性肾脏疾病(CKD)代表了一个重要的全球健康问题,与我们的医疗保健系统的高经济成本有关。ckd是肾脏对肾脏的不可逆转损害逐渐丧失肾脏功能的条件,肾脏影响了全球约10%的成年人口。分化人类胚胎(ES)和诱导多能茎(IPS)细胞成功能性肾脏组织的能力为开发新疗法的新工具提供了新的工具,以减缓肾脏疾病的进展。此外,发现肾脏器官的发现是自组织的3D结构,这些结构包含类似于体内对应物的某些方面的功能性肾细胞类型,克服了对常见单层培养系统中细胞相互作用的极限建模的限制。肾脏类器官为特定于患者的肾脏疾病,研究肾脏发育和进行肾毒性化合物筛查提供了新的机会。近年来,几个小组通过逐步引导人多能干细胞(HPSC)通过晚期原始条纹,中间中胚层和中胚层的阶段引起人类多能干细胞(HPSC)来建立直接分化方案,从而引起了胎儿聚集体,然后引起肾小球,然后导致最终形成的肾脏肾小管(图1)。但是,许多方案要求分化培养物分解为单细胞悬浮液,并在分化过程中重新聚集,这可能导致效率下降,肾脏器官较低的产量和较高的实验变异性。To standardize the generation of kidney organoids, we developed STEMdiff™ Kidney Organoid Kit, containing a specialized serum-free medium formulation that enables highly efficient and reproducible differentiation of hPSCs into kidney organoids that model the developing nephron—composed of podocytes, proximal and distal tubules, and its associated endothelium.此外,我们使用简单的两阶段分化系统最大程度地减少了细胞培养操作,这与96和384孔板中的表型高通量筛选兼容。
在脊椎动物发育过程中,心脏主要来自中胚层,其心脏神经rest细胞的至关重要的贡献迁移到心脏并形成各种心血管衍生物。在此,通过将大量和单细胞RNA-seq与ATAC-Seq整合在一起,我们确定了由关键转录因子EGR1,SOX9A,TFAP2A和ETS1组成的迁移性心脏rest细胞的基因调节亚电路。值得注意的是,我们表明表达经典神经Crest基因SOX10的细胞对于成年斑马鱼的适当心脏再生至关重要。此外,在伤口边缘受伤后重新激活了迁移心脏rest基因亚电路的所有转录因子的表达。一起,我们的结果揭示了一个发展对于心脏神经克雷斯特命运确定至关重要的发育基因调节网络,在再生过程中重新激活了关键因素。