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strpsearch：快速检测结构化串联重复蛋白
动机：结构化串联重复蛋白质（Strps）构成以重复性结构基序为特征的串联重复的子类。这些蛋白质表现出不同的二级结构，形成了重复的第三级排列，通常会导致大分子组件。尽管序列高度可变，但STP可以执行重要和多样的生物学功能，并保持一致的结构，并具有可变数量的重复单元。随着蛋白质结构预测方法的出现，现已公开可用的数百万个蛋白质的3D模型。但是，由于缺乏准确性和较长的执行时间，因此使用当前的最新工具对Strp的自动检测仍然具有挑战性，从而阻碍了他们在大型数据集上的应用。在大多数情况下，手动策展仍然是检测和分类strp的最准确的方法，使其对注释数百万个结构不切实际。
通过超高性能液相色谱与串联质谱法
抽象的姜黄素化合物是生姜中重要的生物活性化合物，但它们的分析受到低浓度的限制。在当前的研究中，使用超高绩效液相色谱和串联质谱法（UHPLC-MS/MS）建立了一种高度敏感和可靠的方法，用于同时定量检测三种姜黄素化合物。通过单个因子实验优化了提取溶剂，提取溶剂的量，超声处理时间和振荡时间。方法验证结果表明，回归系数高于0.9990，线性度令人满意。矩阵效应可忽略不计，值为94.6％–98.8％。三个峰值水平的回收率在81.7％至100.0％之间，精度小于5.4％。该方法可用于确定姜样品中的姜黄素成分，因为结果表明它易于使用，可行，可重复和准确。
如何平衡串联生物电化学系统中的电压
如今，多个生物电化学系统 (BES) 模块的堆叠配置被认为是成功扩大该技术规模的最佳选择，无论是发电微生物燃料电池 (MFC) 还是耗电微生物电解或电合成电池 (MEC 或 MES)。虽然并联电连接允许独立操作堆叠中的每个 BES 而不会出现重大问题，但从能量转换的角度来看，串联堆叠的 BES 更具吸引力，因为它们的能量损失较低，并且可以在更高的电压下操作它们。然而，在串联连接的 MEC/MES 电池的情况下，高性能生物阳极可以将堆叠中性能较差的电池推到其“工作区”之外，导致不利的电位、不受控制的电压下降以及电活性生物膜的暂时或永久损坏。过去提出了一些电池平衡系统 (CBS)，但需要电力电子方面的专业知识。在这项研究中，提出了一种基于商用二极管的简单、被动且低成本的 CBS。采用三台双室 MEC。进行了第一组实验，以表征电池并了解串联电池堆中电压不平衡的原因。然后，采用并验证了 CBS。
具有串联双线性的节能 delta-sigma ADC ...
Delta-sigma (ΔΣ) ADC 广泛用于信号采集和处理应用。因此，这种类型的 ADC 被用作编解码器和助听器，这些设备需要信号路径具有较大的动态范围 [1-4]。与奈奎斯特速率转换器相比，ΔΣ ADC 更易于设计，因为它们不需要具有严格参数的模拟组件。过采样转换器对输入信号带宽进行采样，因此无需使用抗混叠滤波器。通过中等过采样率和增加的采样率，可以设计高分辨率 ADC。这可以有效降低整个功耗，同时保持所需的分辨率 [5]。电压缩放适用于数字电路设计，以降低散热量，同时牺牲速度。已报道了几种解决该问题的技术，例如体驱动电路、SAR 操作、亚阈值操作 [6-9] 和过零电路 [10, 11]，但这些电路的性能非常低。delta-sigma ADC 是一种非常高效的结构，具有过采样和噪声整形特性。连续 ΔΣADC 的工艺缩放因子和带宽得到了改善。高性能模拟电路包括无运算放大器流水线 ADC [12, 13]、节能逐次逼近寄存器 (SAR) ADC [14, 15] 和数字校准技术 [16, 17]。为了在时域中处理信号，压控振荡器 (VCO) 起着重要作用 [18-24]。当触发器同步时，VCO 输出会在 VCO 中引入量化误差。
Cheetah-MS：使用串联交联质谱数据
摘要：蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）在许多生物过程中都是核心，但很难表征，尤其是在复杂的，未分离的样品中。化学交联结合质谱（MS）和计算建模正在成为蛋白质相互作用研究中可行的工具。在这里，我们介绍了Cheetah-MS，这是一种用于预测样品复杂混合物中PPI的Web服务器。它结合了MS与蛋白质 - 蛋白质对接的功率和分辨率分析复杂样品的能力和敏感性。它通过分析串联MS/MS数据（也称为MS2）来产生感兴趣的PPI的第四纪结构。将MS分析和建模结合起来提高了灵敏度，重要的是，促进了结果的解释。可用性和实现：Cheetah-MS可以作为Web服务器免费获得，网址为https://www.txms.org。联系人：hamed.khakzad@ens-cachan.fr或lars.malmsstrom@med.lu.se
串联和整个基因组重复的蜘蛛soneobox基因库的演变
基因复制产生新的遗传物质，可以有助于基因调节网络和表型的演变。重复的基因可以对祖先函数和/或新功能性进行下功能化，以实现新功能。我们以前发现在芳基肺化合物的祖先，包括蜘蛛和蝎子在内的谱系中有整个基因组重复（WGD），但不包括螨虫，tick虫和收割机等其他蛛网。许多重复的同源基因（包括两个HOX簇）在蜘蛛中证明了这一WGD。然而，目前尚不清楚哪些同源副校友由WGD与诸如串联杜普尔（Tandem du Plications）等小规模事件相比。理解这是确定WGD对蛛网基因组evo lution的贡献的关键。在这里，我们表征了重复的同源基因在八个染色体级蜘蛛基因组中的分布。我们发现，蜘蛛中大多数重复的同源基因与WGD的起源一致。我们还发现了所有八种物种中的两个保守同源基因簇的副本，包括HOX，NK，HRO，IRX和正弦簇。一致地，我们观察到每个集群的一个副本是根据基因含量和组织而退化的，而另一个群体则更加完整。专注于NK群集，我们发现了与Har Vestman phalangium opilio中的单拷贝直系同源物相比，蜘蛛parasteatoda tepidariorum中重复的NK基因之间调节性亚功能的证据。我们的研究提供了对蜘蛛进化过程中多种模式对同源物基因曲目的相对贡献的新见解和NK基因的功能。
串联和整个基因组重复的蜘蛛soneobox基因库的演变
图1 - 本研究中使用的节肢动物的系统发育。整个基因组重复（WGD）的时机由红色星星指示；预先提出的谱系具有灰色线，重复的基因组具有黑色线条。基因组组装水平在物种二项式下方指示，以八个染色体级蜘蛛和三个用于同步分析的非WGD外群基因组组件的粗体。
针对哺乳动物基因组中的针对性，可编程和精确的串联重复
基因特异性DNA串联重复序列（TRS）的扩展，于1991年首次描述为人类引起疾病的突变，现在已知会引起60型表型，不仅是疾病，而不仅仅是在人类中。tr是遗传变异的一种常见形式，并在人类，狗，植物，牡蛎和酵母中观察到生物学后果，并观察到。重复疾病表现出非典型的临床特征，遗传预期以及家庭成员中多种和部分渗透的表型。发现引起疾病的重复扩张基因座通过DNA测序和综合分析中的技术进步加速。在2019年至2021年之间，报告了17种新的引起疾病的TR扩张，总共有63个TR基因座（> 69个疾病），可能发现更多的发现，以及更多的生物体。最近和历史课程表明，正确评估的临床表现，再加上遗传和生物学意识，可以指导发现引起疾病的疾病的发现。我们强调了TR突变的批判性但不足的方面。重复基序可能不存在于当前的参考基因组中，而是即将到来的无间隙长阅读参考。重复基序尺寸可以是单个核苷酸到千目标/单位。在给定的基因座，重复基序序列纯度可能会随结果而变化。致病性重复可以是非patheogenic TR中的“联系”。TRS的扩展，收缩和体长期变化可能会带来临床/生物逻辑后果。TR不稳定性发生在人类和其他生物中。TR可以表观遗传修饰和/或染色体脆弱的位点。我们讨论了与疾病相关的TR不稳定性的扩大领域，突出了前景，临床和遗传线索，工具和挑战，以进一步发现引起疾病的TR不稳定性并了解其生物学和病理学影响 - 即将扩大的远景。
工作记忆存储组件在随机串联系列中的作用
人们不配备内部随机系列发电机。当被要求产生一个随机系列时，他们只是尝试重现已知随机过程的输出。但是，这项工作通常受到其工作记忆能力的限制。在这里，我们研究了类似随机的系列生成的模型，该模型解释了工作内存的存储和处理组件的参与。在两项研究中，我们使用了现代，强大的随机性来评估人类生成的序列。在研究1中，在实验设计中，最后生成的元素作为受试者间变量的可见性，我们测试了在工作记忆上减少认知负载是否会减轻生成系列的随机性水平的衰减。此外，我们研究了人类生成系列的随机性判断与算法复杂性之间的关系。结果表明，当人们不必仅依靠其工作记忆存储成分来维持活跃的过去选择时，他们就能延长其高素质的性能。此外，能够更好地区分更复杂模式的人同时产生了更多随机系列。在研究2中，在相关设计中，我们检查了工作记忆能力与产生类似随机系列的能力之间的关系。结果表明，工作记忆能力较长的个体也将产生更复杂的系列。这些发现突出了工作记忆在生成随机序列中的重要性，并提供了对这种认知过程的基本机制的见解。