基因组基础模型具有精确医学,药物发现和理解复杂生物系统的变革潜力。然而,现有模型通常效率低下,受到次优的令牌化和建筑设计的约束,并偏向参考基因组,限制了它们在稀有生物圈中对低丰度,未培养的微生物的表示。为了应对这些挑战,我们开发了Genomeocean,这是一个40亿参数的基因组基础模型,该模型对超过600 GBP的高质量重叠群进行了训练,这些基础是从地球生态系统中各种栖息地收集的220 TB元基因组数据集的高质量重叠群。基因瘤的一项关键创新是直接对元基因组样品的大规模共组合进行培训,从而增强了稀有微生物物种的表示,并提高了以基因组为中心方法的概括性。我们实施了基因组序列产生的字节对编码(BPE)代币化策略,以及建筑优化,实现高达150倍的更快序列产生,同时保持高生物学保真度。Genomeocean在代表微生物物种和产生受进化原理约束的蛋白质编码基因方面表现出色。此外,其微调模型还展示了在天然基因组中发现新型生物合成基因簇(BGC)的能力,并执行生物化学上完全合理的完整BGC的零拍合成。Genomeocean为元基因组研究,自然产品发现和合成生物学设定了一个新的基准,为这些领域提供了强大的基础。
抽象的客观遗传主动脉疾病(HADS)增加了主动脉解剖和破裂的风险。最近,我们建立了一种客观的方法来测量鼠主动脉的破裂力,从而解释了临床研究的结果并评估了血管ehlers中认可的药物的附加值 - Danlos综合征(VEDS)。在这里,我们将方法应用于另外鼠标具有模型的另外鼠标。材料和方法,我们使用了Marfan综合征(MFS)的两种鼠标模型(FBN1 C1041G和FBN1 MGR),以及一个EFEMP2的平滑肌肉敲除(SMKO)和三种CRISPR/CAS9工程型敲门模型(LTBP1,MFAP1,MFAP4和TIMP1)。对两个MFS模型之一进行了为期4周的莱萨坦治疗。每只小鼠,制备三个胸主动脉的环,安装在组织拉拔器上,并单轴伸展直至破裂。结果与野生型小鼠相比,SMKO和两个MFS模型的主动脉破裂力显着降低,但在两个MFS模型中,高于对VEDS建模的小鼠模型。相比之下,LTBP1,MFAP4和TIMP1敲入模型没有主动脉完整性受损。正如预期的那样,氯沙坦治疗降低了动脉瘤的形式,但令人惊讶的是对我们MFS小鼠的主动脉破裂力没有影响。
结果:VIP/MONICA 队列中前瞻性收集了 96,196 名受试者的数据,其中 236 名 AAA 患者(181 名男性和 55 名女性)和 935 名匹配对照,168 名 TAA 患者(115 名男性和 53 名女性)和 662 名对照。AAA 病例和对照的基线检查平均年龄为 57.0 ± 5.7 岁,TAA 病例和对照的基线检查平均年龄为 52.1 ± 8.8 岁。AAA/TAA 基线检查和诊断之间的平均时间分别为 12.1 年和 11.7 年。AAA 和 TAA 之间的风险因素谱存在明显差异。吸烟、高血压和冠状动脉疾病与 AAA 的后期诊断有显著相关性,吸烟史的 aOR 最高(aOR,10.3;95% 置信区间 [CI],6.3-16.8)。对于 TAA,高血压是唯一的阳性风险因素(aOR,1.7;95% CI,1.1-2.7),而吸烟则无关。糖尿病与 AAA 或 TAA 均无关;自我报告的体力活动也无关。
摘要本研究旨在确定非洲叶乙醇提取物对降低糖尿病2型糖尿病的小鼠总胆固醇水平和主动脉组织学的影响。本研究使用了一个完整的随机设计,具有阴性对照组(标准纯化的饲料),一个阳性对照组(HFD + Alloxan一水合物),一个辛伐他汀组和用乙醇提取物,以75、100和125 mg/kgbb的剂量用乙醇提取物,具有四个重复和治疗时间为7天。在高脂饮食之前,在第0天(HFD之后)和第8天之前测量了总胆固醇水平。通过100倍和400倍宏伟的光显微镜检查大鼠主动脉的组织学。总胆固醇水平和变化的数据进行了方差分析和邓肯测试。使用Welch的ANOVA测试分析了主动脉腔直径的数据。使用Kruskal-Wallis和Mann-Whitney测试分析了动脉粥样硬化评分。分析的结果表明,以不同剂量降低总胆固醇水平和动脉粥样硬化评分的非洲叶乙醇提取物的给药。总而言之,非洲叶乙醇提取物的剂量会影响糖尿病2型糖尿病的小鼠的总胆固醇水平和主动脉组织学,剂量125 mg/kgbb是最佳剂量,是可以降低胆固醇水平的最佳剂量,并可以降低总胆固醇水平,并修复糖尿病型糖尿病的主动脉组织学剂量。关键字:动脉粥样硬化;高脂饮食;高胆固醇血症
作者完整列表: Piri, Reza;奥登斯大学医院,核医学系;南丹麦大学,临床研究 Edenbrandt, Lars;哥德堡大学,分子与临床医学系,医学研究所,萨尔格伦斯卡学院 Larsson, Måns;Eigenvision AB Enqvist, Olof;Eigenvision AB;查尔姆斯理工大学,电气工程系 Nøddeskou-Fink , Amalie;奥登斯大学医院,核医学系 Gerke, Oke;奥登斯大学医院,系。核医学;南丹麦大学,系。临床研究 Høilund-Carlsen, Poul;奥登斯大学医院,核医学系
作为手术风险评分高估死亡率,严重主动脉狭窄(AS)接受经导管主动脉瓣植入(TAVI)的患者的风险预测仍然是一个尚未解决的问题。因此,我们研究了新型生物标志物中肾上腺素甲素(MR-PRODM)和生长分化因子15(GDF-15)是否可以为风险评估增加价值。收集了92例患者的血清水平,并通过生存分层。不仅出示了在随访期间死亡的患者较高的生物标志物水平((MR-PRODM(幸存者:0.922 nmol/L(0.706-1.202)与死者:1,347 nmol/l(1,038-1,678),1,038-1,678),1,038-1,678),P = 0.0003),P = 0.0003);(GDF-15)(GDF-15(GDF-15)167.67.675.M.25(M.25)PRE:25; 2524.4)与死者:2770.0 pg/ml(2401.0-3701.0),p = 0.0006)))),但是通过使用kaplan-meyer分析,结合了youden index,我们能够确定一个特定的临界值,我们能够确定一个良好的差异(MR-P-P-peckivival forection forectional)。 0.85),p = 0.002);将提出的生物标志物纳入二进制逻辑回归进一步提高了经典风险预测因子的预后价值(AUC = 0.811(标准误差0.05; 95%CI(0.693; 0.899))。此外,TAVI后幸存的患者的血清促ADM水平显着降低。因此,新型的生物标志物具有通过提供个性化和客观信息的TAVI患者的风险分层的潜力。
颈部周长(NC)是诊断代谢综合征(MS)的预测度量。本研究的目的是基于根据IDF和NCEP-ATP III标准,基于MS组成部分建立NC的截止点,以作为MS在巴西农村工人中的存在的预测指标。这是一项与巴西Espı´rito Santo州圣玛丽亚·德·jetiba市的农村工人进行的横断面研究。计算了ROC曲线,并使用确定MS的不同标准方法,从NC中识别出NC的截止点,并从NC中识别出NC。灵敏度,特异性,正和阴性预测值以及Youden指数。所采用的显着性水平为5%。根据IDF标准,男性的截止点不同,根据NCEP-ATP III c症状,导致39.550 cm(AUC 0.832)和39.125 cm(AUC 0.888)。对于女性,截止值相似,导致单个截止值为34.725 cm(NCEP-ATP III的AUC 0.862,IDF为0.849)。针对NC的男性和女性定义的截止点显示出良好的灵敏度和特异性,可预测研究人群中的MS。NC的测量被证明是评估巴西农村工人中这种发病率的简单,低成本和准确的措施。
腹主动脉瘤(AAA)定义为直径超过3.0 cm的腹主动脉扩张[1,2]。尽管AAA的发病率和患病率通常很低,但AAA破裂的死亡率很高。破裂后紧急手术的死亡率超过40%,只有10-25%的人可能能够生存直到出院[1,2]。AAA中的增长率和破裂风险与直径成比例增加,随着时间的推移会增加。因此,根据ANEU-ry-Rysm大小[3,4],建议每6个月至3年进行初次筛查的患者每6个月至3年进行定期监视。这是因为定期监视和及时干预对于AAA高危患者的生存至关重要。肺癌是全球最常见的癌症之一,死亡率高于其他癌症。取决于局部NSCLC的5年生存率为57%,而所有肺癌所有阶段的总5年生存率仅为5%[5-7]。使用低剂量计算机断层扫描(LDCT)筛查的早期诊断,早期肺癌的患者人数增加了[8]。因此,可切除肺癌患者的比例增加了,肺癌的预后也有所改善[9]。AAA的几个危险因素,包括吸烟,男性,年龄较大,高血压,血脂症,冠状动脉阻塞性疾病(CAOD)和慢性阻塞性肺部疾病(COPD),也是肺癌的危险因素[10-12]。和,Wiles B等。发现肺癌患者患AAA的患病率很高。因此,我们旨在检查有资格切除的早期肺癌患者中AAA及其特征的患病率。尽管癌症阶段的分配存在不确定性,但先前的肺癌和AAA患者的生存分析,中位随访期为6。13年(四分位数范围:3.05-6.54),显示AAA患有肺癌的AAA患者的总体死亡率风险更高。众所周知,高级NSCLC具有5年生存率(<5%,<5%,IIIB阶段和IV阶段<2%)[5-7]。此外,还知道AAA的破裂非常致命(大约59-83%的AAA破裂患者死亡之前死亡之前,他们可以被送往医院),但是直径少于5 cm的AAA的RUPTURE率并不常见(根据直径为0-6%/年,根据直径为0-6%/年)[1,2,2,2,2,4]。考虑到小型AAA患者的上述晚期NSCLC的预后不良和不常见的破裂率,可以推断,即先进阶段NSCLC患者的寿命将主要取决于肺癌的预后,而不是肺癌的风险。由于监视旨在减少AAA破裂的潜在风险,并且一生中需要大量精力,因此只有早期NSCLC患者才能从AAA监视中受益。因此,考虑到AAA监视的成本效益,我们只包括可切除的NSCLC患者,具有能力预期寿命的患者足以从AAA监视中受益,以进行分析。