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World File Search System乙酰化
研究文章组蛋白去乙酰化酶 1 的表达和...
背景与目的 .组蛋白去乙酰化酶1（HDAC1）编码的蛋白质是组蛋白去乙酰化酶复合物的组成部分。HDAC1的异常表达与细胞增殖、分化、转录和翻译密切相关。通过不断筛选与肺腺癌（LUAD）变化相关的基因，形成基因网络，探索肿瘤发病机制和新的治疗靶点。方法 .利用相关网站和数据库（TCGA和GEO数据库）评估HDAC1基因生存分析及其在LUAD的表达。通过数据挖掘，确定HDAC1突变的频率和类型，获得基因相互作用网络的相关热图，完成基因本体和功能富集分析，了解HDAC1的药剂学。结果 .发现HDAC1的表达与LUAD患者的预后有关。基因表达分析中，HDAC1在LUAD中高表达，HDAC1相互作用基因网络（MARCKSL、eIF3I）与细胞基因表达密切相关。功能网络分析显示HDAC1的表达与细胞周期G1-S期的监控点及Notch信号通路（CSL转录因子）的激活有关，参与细胞增殖分化过程及基因表达与新的治疗靶点相关。结论本研究数据挖掘揭示了LUAD中HDAC1的表达及潜在调控因素，为研究LUAD中HDAC1的发生、发展及治疗奠定了基础。
赖氨酸的乙酰化82通过破坏其核进口
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2024年9月7日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.09.04.611121 doi：Biorxiv Preprint
乙酰化在肥胖引起的心脏代谢改变
肥胖是一个日益增长的公共卫生问题，其流行率在过去的五十年中已经增加了两倍。已经表明，肥胖与心脏能量代谢的改变有关，这反过来又在心力衰竭发育中起着重要作用。在肥胖期间，心脏高度依赖于脂肪酸氧化作为其主要能源（ATP），而葡萄糖氧化的贡献显着降低。这种代谢不足与降低心脏效率和收缩功能障碍有关。尽管众所周知，肥胖期间心脏能量代谢的改变与心力衰竭发育的风险有关，但控制这些代谢变化的分子机制尚不完全了解。最近，已证明代谢酶的翻译后蛋白质修饰在肥胖症中观察到的心脏能量代谢变化中起着至关重要的作用。了解这些新型机制对于开发新的治疗选择以治疗或预防肥胖个体的心脏代谢改变和功能障碍很重要。本综述讨论了肥胖期间翻译后的乙酰化变化及其在肥胖期间介导心脏能量代谢扰动及其治疗潜力中的作用。
针对组蛋白去乙酰化酶在心脏疾病中的应用
组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 催化组蛋白和非组蛋白上乙酰化修饰的去除，从而调节基因表达和其他细胞过程。HDAC 抑制剂 (HDACi) 是一种已获批准的抗癌药物，有望成为治疗心脏病的新疗法。在许多心脏病临床前动物模型中都观察到了 HDACi 的心脏保护作用。已经开发了遗传小鼠模型来了解每种 HDAC 在心脏功能中的作用。一些发现是有争议的。在这里，我们概述了 HDACi 和 HDAC 在生理或病理条件下如何影响心脏功能。我们重点关注锌依赖性经典 HDAC 的体内研究，强调涉及心脏肥大、心肌梗死 (MI)、缺血性再灌注 (I/R) 损伤和心力衰竭的疾病状况。特别是，我们回顾了无偏组学研究如何帮助我们理解 HDACi 和 HDAC 对心脏影响的潜在机制。
组蛋白去乙酰化酶抑制剂（伏立诺他）
• 方法 2（亲和纯化） 1. 洗涤 4 o C（冰上）用洗涤缓冲液洗涤珠子 3 次。 2. 添加样品溶液 将 1000ul HeLa 细胞提取物添加到珠子中。 3. 反应 4 o C 孵育 240 分钟。 4. 洗涤 除去样品溶液。4 o C（冰上）用洗涤缓冲液洗涤珠子 3 次。 5. 洗脱 伏立诺他洗脱： - 添加 40ul 洗脱缓冲液并重新悬浮珠子。在 98 o C 下煮沸 5 分钟并除去珠子。 伏立诺他洗脱： + 在洗涤缓冲液中加入 30ul 25mM 伏立诺他并重新悬浮珠子。将管放在冰上一小时，通过间歇轻拍使结合的蛋白质洗脱。旋转后，磁性分离。将上清液转移到新的干净管中98 o C 煮沸 5 分钟。 6. 通过 SDS-PAGE 和银染分析样品
伏特甲基甲基苯胺及其N-乙酰化衍生物与DNA
铁在人体中具有重要作用，并影响各种生理过程。一些研究表明，铁水平的失调与包括精神分裂症在内的不同精神疾病的发展之间存在联系。在精神分裂症患者中，已经观察到了大脑特定区域中铁的异常水平。铁水平可能有助于精神分裂症与其他遗传，环境和饮食因素结合使用。铁还可以有助于精神分裂症患者的认知功能更好，并且由于这组患者的频繁营养不良和营养不足，至关重要的是要考虑到常规血液学检查以及确定必要的营养缺乏症。
认知表观遗传启动：利用组蛋白乙酰化记忆改善
多次研究发现，通过组蛋白脱乙酰基酶抑制剂（HDACI）治疗增加组蛋白乙酰化可以减轻记忆和挽救认知障碍，但其作用方式尚未完全理解。尤其是尚不清楚HDACIS在系统上应用和缺乏基因组靶标的选择将如何专门改善与内存相关的分子过程。这种特殊的山丘的一种理论称为认知表观遗传启动（CEP），根据该理论，HDACIS通过促进通过学习自身刺激的神经可塑性相关基因的表达来促进记忆。在这篇综述中，我们总结了支持CEP的实验证据，描述了HDACIS的新发现的靶向效应，并突出了药物诱导的CEP和自然发生的CEP之间的相似性。理解CEP的基本机制鉴于HDACIS作为认知增强剂的临床前前提很重要。
αkg介导的肉碱合成可通过组蛋白乙酰化促进同源重组
GSK864（IDH1I）和DNA破坏特工Olaparib（OLAP）或顺铂（CIS）单独或合并。％，并将其标准化为对照。d）在谷氨酰胺饥饿的条件下培养了指定的CCNE1-低（橙色）和 - 高（紫色）同源细胞，并单独或单独或单独或合并用DNA损害剂Olaparib（OLAP）或顺铂（Cisplatin（Cis）处理。％的细胞，并将其标准化为媒介物对照。e）将IP基因细胞注射到免疫功能低下的雌性小鼠（n = 8/组）中。表达空载体（ev）=橙色的单元格；表达CCNE1（CCNE1）=紫色的细胞。单独或组合使用媒介物，IDH1抑制剂GSK864（IDH1I）和Olaparib（OLAP）处理小鼠。在端点，通过计算腹膜肿瘤结节来计算肿瘤负担。f）仅用IDH1抑制剂GSK864（IDH1I）处理指示的CCNE1高细胞，单独使用DNA破坏药物Olaparib（OLAP）或顺铂（CIS）（CIS）（cis）（黄色）（黄色）（黄色）（黄色），并与细胞渗透性的A kg（绿色）或柠檬酸盐（蓝色）结合使用。％，并将其标准化为对照。g）在谷氨酰胺饥饿条件下培养了指定的CCNE1高细胞，并用DNA损伤剂Olaparib（OLAP）或顺铂（CIS）（CIS）（CIS）（黄色）和可渗透的细胞渗透kg（绿色）处理。％的细胞，并将其标准化为媒介物对照。h）依赖性二氧酶CRISPR KO屏幕的示意图。i）CRISPR KO屏幕的分析。所有图表示平均值±SD。显示为Log2折叠分数（CCNE1 + Olaparib vs. CCNE1）与（EV + Olaparib vs.EV）中的负分数的变化。J）在两个CCNE1高细胞系中5个负富集基因的Venn图。k）用SHGFP（Shcont-紫色）或两个靶向TMLHE的独立shRNA（SHTMLHE＃1-浅蓝色，浅蓝色，SHTMLHE＃2-深蓝色）转导指示的CCNE1高细胞，并用DNA损害剂Olaparib（Olap）用Cell-Cell-clip-carn的dna损害剂处理（la）或l-CARNIT（l-CARNIT）。％的细胞，并将其标准化为媒介物对照。l）单独使用肉碱合成抑制剂（Mildro）或单独使用DNA损伤剂Olaparib（OLAP）（紫色）和组合（黄色）处理指示的CCNE1高细胞。组合处理的细胞用可渗透的细胞A kg（绿色）或L- carnitine（L-Carn; Maroon）补充。％的细胞，并将其标准化为媒介物对照。m）用IDH1抑制剂GSK864（IDH1I）和单独的DNA损伤剂Olaparib（OLAP）（紫色）和组合（黄色）处理指示的CCNE1高细胞。组合处理的细胞用L-肉碱（L-Carn; Maroon）补充。％的细胞，并将其标准化为媒介物对照。n）在谷氨酰胺饥饿条件下（紫色）培养指示的CCNE1-高细胞，并单独用DNA损伤剂Olaparib（OLAP）（黄色）或补充L-Carnitine（L-Carn; Ma-Roon）。％，并将其标准化为对照。**** p <0.005，ns =不显着o）kg是tmlhe和carnitine上游的示意图。（A-D，F）显示的是来自每个等源性细胞系对中至少3个独立实验的代表性数据。（G，K-N）是来自每个等源性细胞系对中2个独立实验的代表性数据。
组蛋白乙酰化位点在心脏肥大和心力衰竭中的作用
心力衰竭是由导致心脏肥大的各种生理和病理刺激引起的。这种病理过程常见于多种心血管疾病，并最终导致心力衰竭。心脏肥大和心力衰竭的发展涉及基因表达的重编程，这一过程高度依赖于表观遗传调控。组蛋白乙酰化受心脏应激的动态调节。组蛋白乙酰转移酶在心脏肥大和心力衰竭的表观遗传重塑中起重要作用。组蛋白乙酰转移酶的调控是信号转导和下游基因重编程之间的桥梁。研究心脏肥大和心力衰竭中组蛋白乙酰转移酶和组蛋白修饰位点的变化将为治疗这些疾病提供新的治疗策略。本综述总结了组蛋白乙酰化位点和组蛋白乙酰化酶与心脏肥大和心力衰竭的关联，重点介绍了组蛋白乙酰化位点。