肺癌是死亡率最高的恶性肿瘤,而肺腺癌(LUAD)占所有肺癌的40%(1)。在亚洲,表皮生长因子受体(EGFR)是LUAD最常见的驱动突变,发生率为55%(2-4),其中EGFR激活突变在全球占17.4%,在中国占37.3%(5)。表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)目前是EGFR突变LUAD患者的标准一线治疗方案(6)。尽管使用EGFR-TKI已为晚期EGFR突变型NSCLC患者带来显著的临床获益和前所未有的生存率提高(7-10),但不可避免地会产生获得性耐药。继发性EGFR突变,包括EGFR-T790M突变和EGFR结构域内的其他突变、MAPK、PI3K和细胞周期基因的突变以及EGFR或其他致癌基因如MET的扩增,导致LUAD细胞获得性EGFR-TKI耐药(11-13)。但有些患者在缺乏已知耐药机制的情况下获得了EGFR-TKI耐药。因此,内在性EGFR-TKI耐药是临床上的一个挑战。据报道,大约20%-30%的EGFR突变型LUAD对EGFR-TKI具有内在性耐药(14)。因此,如何克服这些获得性和内在性的EGFR-TKI耐药一直是临床关注的焦点。
唾液酸是九种碳糖,经常在脊椎动物细胞中的细胞表面以及某些类型的无脊椎动物和细菌的细胞中限制胶囊。唾液酸的九个碳主链可以在自然界中进行广泛的酶促修饰,并在C-4/7/8/9处尤其是在C-4/7/8/9处进行O-乙酰化。近年来,o-乙酰化的唾液酸的检测和分析已经采用了乳酸特异性(SOATS)和O-乙酰基酯酶(SIAES),分别鉴定并在哺乳动物细胞中添加和表征盐酸 - 乙酰基酯酶(SOATS)和O-乙酰酯酶(SIAES)(SIAES)(SIAES)(SIAES)(SIAES)(siaES),分别鉴定出和去除O-乙酰基组。这些进步现在使我们能够更完整地了解多样的O-乙酰化唾液酸的生物合成途径,以驱动遗传和生物化学模型细胞系和生物体的产生,并具有o-乙酰化的唾液酸表达的表达,以改变其角色,以使其在孔隙蛋白中脱离孔隙蛋白的良好性,并伴随着孔隙蛋白的良好性,并具有良好的发现,并具有良好的发现,并具有良好的发现,并具有良好的发现,并逐渐识别。此外,越来越多的研究将唾液酸O-乙酰化与癌症,自身免疫性和感染相关联,这为开发选择性探针和Soats and Siaes的抑制剂提供了理由。在这里,我们讨论了O-乙酰化唾液酸的生物合成和生物学功能的当前见解,并回顾了将这种修饰与疾病联系起来的证据。此外,我们讨论了针对不自然的O-乙酰化唾液酸的设计,合成和潜在应用的新兴策略,以及肥皂和SIAES的抑制剂,这些策略可能可以实现这种多功能唾液酸的治疗靶向。
摘要:微管蛋白去乙酰化酶 sirtuin 2 (Sirt2) 和组蛋白去乙酰化酶 6 (HDAC6) 的失调与癌症和神经退行性疾病的发病机制有关,因此这两种酶是药物干预的有希望的靶点。在此,我们报告了首创的双重 Sirt2/ HDAC6 抑制剂的设计、合成和生物学表征,作为双重抑制微管蛋白去乙酰化的分子工具。使用生化体外测定和基于细胞的靶标参与方法,我们确定 Mz325 ( 33 ) 是两种靶标酶的强效选择性抑制剂。Sirt2 和 HDAC6 与 33 的构造块复合物的 X 射线晶体结构进一步证实了对两个靶标的抑制。在卵巢癌细胞中,与单独或联合使用未结合的 Sirt2 和 HDAC6 抑制剂相比, 33 对细胞活力的影响增强。因此,我们的双重 Sirt2/HDAC6 抑制剂是研究微管蛋白去乙酰化双重抑制的后果和治疗潜力的重要新工具。■ 简介
组蛋白去乙酰化酶抑制剂已被研究作为癌症和其他疾病的潜在治疗剂。已知 HDI 可促进组蛋白乙酰化,从而导致开放染色质构象并通常增加基因表达。在之前的研究中,我们报告了一组基因,特别是那些由超级增强子调控的基因,可以被 HDAC 抑制剂拉格唑抑制。为了阐明拉格唑抑制基因的分子机制,我们进行了转座酶可及染色质测序、ChIP-seq 和 RNA-seq 研究。我们的研究结果表明,虽然拉格唑治疗通常会增强染色质的可及性,但它会选择性地降低一组超级增强子区域的可及性。这些基因组区域在拉格唑存在下表现出最显著的变化,富含 SP1、BRD4、CTCF 和 YY1 的转录因子结合基序。 ChIP-seq 分析证实 BRD4 和 SP1 在染色质上各自位点的结合减少,特别是在调节基因(如 ID1、c-Myc 和 MCM)的超级增强子上。拉格唑通过抑制 DNA 复制、RNA 加工和细胞周期进程发挥作用,部分是通过抑制 SP1 表达来实现的。shRNA 消耗 SP1 可模拟拉格唑的几种关键生物学效应并增加细胞对该药物的敏感性。针对细胞周期调控,我们证明拉格唑通过干扰中期染色体排列来破坏 G/M 转换,这种表型在 SP1 消耗时也观察到。我们的结果表明,拉格唑通过抑制超级增强子上的 BRD4 和 SP1 发挥其生长抑制作用,导致细胞抑制反应和有丝分裂功能障碍。
建立了由8个组蛋白乙酰化相关基因组成的STAD预后模型,根据中位风险评分将STAD患者分为高危组和低危组,高危组的预后较低危组差。两组在体细胞突变、免疫亚型、临床病理特征、肿瘤微环境、免疫细胞浸润和免疫活性、免疫治疗预测和药物敏感性等方面存在明显差异。基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果表明,两组中的差异表达基因(DEG)参与了与癌症相关的过程和途径。细胞分析表明,DCLK1是胃癌的促癌因子,可促进胃癌细胞对奥沙利铂产生耐药性。
先天免疫是抵御病毒的第一道防线,其中线粒体在诱导干扰素 (IFN) 反应中起着重要作用。BHRF1 是一种在 Epstein-Barr 病毒再激活过程中表达的多功能病毒蛋白,它会调节线粒体动力学并破坏 IFN 信号通路。线粒体是一种可移动的细胞器,借助细胞骨架,特别是微管 (MT) 网络,它可以在细胞质中移动。微管会经历各种翻译后修饰,其中包括微管蛋白乙酰化。在本研究中,我们证明 BHRF1 会诱导微管过度乙酰化以逃避先天免疫。事实上,BHRF1 的表达会诱导缩短的线粒体聚集在细胞核旁边。这种“线粒体聚集体”围绕着丝粒组织,其形成依赖于微管。我们还观察到 α-微管蛋白乙酰转移酶 ATAT1 与 BHRF1 相互作用。使用 ATAT1 敲低或不可乙酰化的 α-微管蛋白突变体,我们证明了这种高乙酰化对于线粒体聚集体的形成是必需的。在 EBV 重新激活期间也观察到了类似的结果。我们研究了导致线粒体聚集的机制,并确定了运动蛋白是线粒体聚集所需的马达。最后,我们证明了 BHRF1 需要 MT 高乙酰化来阻止 IFN 反应的诱导。此外,MT 高乙酰化的丧失会阻止自噬体定位到靠近线粒体聚集体的位置,从而阻碍 BHRF1 启动线粒体自噬,而线粒体自噬对于抑制信号通路至关重要。因此,我们的结果揭示了 MT 网络及其乙酰化水平在诱导亲病毒线粒体自噬中的作用。
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2024年9月7日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.09.04.611121 doi:Biorxiv Preprint
抽象访问DNA是调节基因转录的第一级控制,该控制对于维持DNA完整性也至关重要。细胞衰老的特征是深刻的转录重排和DNA病变的积累。在这里,我们在H2BK120乙酰化中发现了一个表观遗传学的X介于C4和HD A C4和HD A C1 / HD A C2。HD A C4 / HD A C1 / HD A C2复合物通过H2BK120的动态脱乙酰化来调整通过同源重组的DNA修复效率。HD A C4的缺乏会导致H2BK120AC的积累,BRCA1的募集受损和CTIP募集到病变部位,累积DNA和衰老。在衰老细胞中,由于HD A C4的蛋白酶体降解增加,这种复合物被拆卸。在Ras诱导的衰老的HD A C4强迫表达降低了γH2AX的基因组扩散。 它也会影响H2BK120AC LE V ELS,在RAS诱导的衰老过程中积累的DNA受损区域中增加了。 总而言之,衰老过程中HD A C4的降解会导致DNA受损的积累,并有助于由维持衰老的超级增强剂控制的转录程序的激活。在Ras诱导的衰老的HD A C4强迫表达降低了γH2AX的基因组扩散。它也会影响H2BK120AC LE V ELS,在RAS诱导的衰老过程中积累的DNA受损区域中增加了。总而言之,衰老过程中HD A C4的降解会导致DNA受损的积累,并有助于由维持衰老的超级增强剂控制的转录程序的激活。
铁在人体中具有重要作用,并影响各种生理过程。一些研究表明,铁水平的失调与包括精神分裂症在内的不同精神疾病的发展之间存在联系。在精神分裂症患者中,已经观察到了大脑特定区域中铁的异常水平。铁水平可能有助于精神分裂症与其他遗传,环境和饮食因素结合使用。铁还可以有助于精神分裂症患者的认知功能更好,并且由于这组患者的频繁营养不良和营养不足,至关重要的是要考虑到常规血液学检查以及确定必要的营养缺乏症。
肥胖是一个日益增长的公共卫生问题,其流行率在过去的五十年中已经增加了两倍。已经表明,肥胖与心脏能量代谢的改变有关,这反过来又在心力衰竭发育中起着重要作用。在肥胖期间,心脏高度依赖于脂肪酸氧化作为其主要能源(ATP),而葡萄糖氧化的贡献显着降低。这种代谢不足与降低心脏效率和收缩功能障碍有关。尽管众所周知,肥胖期间心脏能量代谢的改变与心力衰竭发育的风险有关,但控制这些代谢变化的分子机制尚不完全了解。最近,已证明代谢酶的翻译后蛋白质修饰在肥胖症中观察到的心脏能量代谢变化中起着至关重要的作用。了解这些新型机制对于开发新的治疗选择以治疗或预防肥胖个体的心脏代谢改变和功能障碍很重要。本综述讨论了肥胖期间翻译后的乙酰化变化及其在肥胖期间介导心脏能量代谢扰动及其治疗潜力中的作用。