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针对不同亚型涎腺癌的靶向治疗、化疗、免疫治疗和新型治疗方案
1 德国埃尔朗根-纽伦堡弗里德里希·亚历山大大学（FAU）耳鼻咽喉科、头颈外科系，91054 埃尔朗根；heinrich.iro@uk-erlangen.de（HI）；Konstantinos.Mantsopoulos@uk-erlangen.de（KM）2 德国耳鼻咽喉科学会、头颈外科唾液腺和甲状腺工作组，53113 波恩，德国 3 德国埃尔朗根-纽伦堡弗里德里希·亚历山大大学（FAU）综合癌症中心、跨学科肿瘤诊所，91054 埃尔朗根；marlen.haderlein@uk-erlangen.de（MH）；sebastian.lettmaier@uk-erlangen.de（SL）；markus.hecht@uk-erlangen.de（MH）； rainer.fietkau@uk-erlangen.de (RF) 4 埃尔兰根-纽伦堡弗里德里希-亚历山大大学 (FAU) 放射肿瘤学系，91054 埃尔兰根，德国 5 埃尔兰根-纽伦堡弗里德里希-亚历山大大学 (FAU) 病理学系，91054 埃尔兰根，德国； abbas.agaimy@uk-erlangen.de (AA)； florian.haller@uk-erlangen.de (FH) * 通讯：sarina.mueller@uk-erlangen.de † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。
果蝇 p53 亚型在生殖系基因组完整性和卵母细胞质量控制方面具有重叠和不同的功能
摘要 人类和其他生物体中的 p53 基因家族成员编码大量蛋白质亚型，其功能大部分尚不明确。以果蝇为模型，我们发现 p53B 亚型主要在生殖细胞中表达，并与 p53A 共定位到亚核体中。然而，只有 p53A 介导生殖细胞和胞体中对电离辐射的凋亡反应。相反，p53A 和 p53B 都是减数分裂 DNA 断裂正常修复所必需的，当减数分裂重组有缺陷时，这种活性更为重要。我们发现在具有持续性 DNA 断裂的卵母细胞中，p53A 也是激活减数分裂粗线期检查点所必需的。我们的研究结果表明，果蝇 p53 亚型具有 DNA 损伤和细胞类型特异性功能，与哺乳动物 p53 家族成员在基因毒性应激反应和卵母细胞质量控制中的作用相似。
初始激素受体/HER2 亚型是晚期乳腺癌亚型不一致的主要决定因素：SONABRE 登记研究
摘要 目的 激素受体 (HR) 和人表皮生长因子受体 2 (HER2) 是指导乳腺癌全身治疗选择的主要参数，但会在疾病过程中发生变化。本研究旨在评估晚期乳腺癌 (ABC) 患者的活检率和受体亚型不一致率。方法 从荷兰东南部晚期乳腺癌 (SONABRE) 登记处选取 2007 年至 2018 年 7 家医院确诊为 ABC 的患者。进行多变量逻辑回归分析以确定影响活检和不一致率的因素。结果 总体而言，2854 名患者中有 60% 在诊断时进行了转移部位的活检。与活检率降低相关的因素之一是 HR + /HER2 + 原发性肿瘤亚型（与 HR + /HER2- 亚型相比：OR = 0.68；95% CI：0.51–0.90）。在 748 名接受原发性肿瘤和转移部位活检的患者中，总受体不一致率为 18%。其中 HR + /HER2 + 原发性肿瘤亚型的不一致率最高，为 55%。在 624 名异时性转移患者中，HR + /HER2 + 亚型仍然是与较高不一致率显著相关的唯一预测因素，无论先前的（新）辅助治疗如何（OR = 7.49；95% CI：3.69-15.20）。结论 HR + /HER2 + 亚型的不一致率最高，但活检率在所有四种受体亚型中最低。先前的全身治疗与亚型不一致没有独立相关性。这项研究强调了获取转移性疾病活检的重要性，尤其是 HR + /HER2 + 亚型，以确定最佳治疗策略。
2022; 18(1): 426-440。doi: 10.7150/ijbs.64640 研究论文 抗多种自然杀伤亚型的人类间充质干细胞工程
具有治疗前景的间充质干细胞 (MSC) 通常会被宿主的先天免疫细胞（包括自然杀伤 (NK) 细胞）迅速清除。人们已努力生成免疫逃逸的人类胚胎干细胞 (hESC)，其中通过缺陷的 β -2-微球蛋白 (B2M)（人类白细胞抗原 (HLA) I 类的共同单位）逃避 T 细胞免疫，并通过 HLA-E 或 -G 的异位表达抑制 NK 细胞。然而，NK 亚型在接受者之间甚至在不同的病理状态下都不同。有必要剖析和优化免疫逃逸细胞对 NK 亚型的功效。在这里，我们首先生成 B2M 敲除 hESC 并将其分化为 MSC（EMSC），并发现仅当通过可诱导慢病毒系统以剂量依赖性方式转导时，表达 HLA-E 和 -G 的 B2M -/- EMSC 才会出现 NK 抗性，而当它们插入安全港时则不会出现。在转导的 EMSC 中同时高水平表达的 HLA-E 和 -G 抑制了三种主要 NK 亚型，包括 NKG2A + / LILRB1 + 、NKG2A + / LILRB1 - 和 NKG2A - / LILRB1 + ，并且 IFN- γ 启动进一步增强了这种抑制作用。因此，这项研究设计了对多种 NK 亚型具有抗性的 MSC，并强调当转基因用于赋予宿主细胞新效应时，剂量很重要，尤其是对于治疗细胞逃避免疫排斥而言。
基于深度学习的乳腺癌亚型分类模型
摘要。乳腺癌长期以来一直是女性死亡的主要原因。由于能够记录基因表达数据的 RNA 测序工具的出现，现在诊断、治疗和预后已成为可能。分子亚型与制定临床策略和预后密切相关，本文重点介绍如何使用基因表达数据将乳腺癌分为四种亚型，即 Basal、Her2、LumA 和 LumB。在第 1 阶段，我们提出了一种基于深度学习的模型，该模型使用自动编码器来降低维数。通过使用自动编码器，特征集的大小从 20,530 个基因表达值减少到 500 个。该编码表示被传递到第二阶段的深度神经网络，以将患者分为四种乳腺癌分子亚型。通过部署第 1 阶段和第 2 阶段的组合网络，我们已经能够在 TCGA 乳腺癌数据集上获得 0.907 的平均 10 倍测试准确率。所提出的框架在 10 次不同的运行中都相当稳健，如分类准确度的箱线图所示。与文献中报道的相关工作相比，我们取得了有竞争力的结果。总之，所提出的基于两阶段深度学习的模型能够准确地对四种乳腺癌亚型进行分类，突出了自动编码器推断紧凑表示的能力和神经网络分类器正确标记乳腺癌患者的能力。
胰腺癌分子亚型的临床影响
胰腺导管腺癌是一种高度致命的恶性肿瘤，目前已成为全球第七大癌症死亡原因，死亡率在欧洲和北美最高。在过去 30 年中，5 年生存率有所提高（从 2.5% 上升到 10%），但与所有其他常见癌症类型相比，这一水平仍然非常低。基于可操作突变的晚期胰腺癌靶向疗法令人失望，只有 3-5% 的患者显示出哪怕是短暂的临床益处。然而，除了负责产生经典信号通路的基因突变之外，还存在分子多样性。胰腺癌几乎是唯一一种促进基质其他成分过量产生的癌症，从而形成复杂的肿瘤微环境，有助于肿瘤的发展、进展和对治疗的反应。还描述了各种转录亚型。最值得注意的是，Moffit、Collinson、Bailey、Puleo 和 Chan-Seng-Yue 的经典/胰腺祖细胞和准间充质/基底样/鳞状亚型特征之间存在很强的一致性，这些特征具有潜在的临床影响。通过激光捕获显微镜结合单细胞 RNA 测序对富集的上皮细胞群进行测序，揭示了胰腺癌的潜在基因组进化是同一肿瘤内混合基底样和经典细胞群的基因表达连续性的结果，与突变型 KRAS 中的等位基因失衡有关，转移性肿瘤的拷贝数不稳定程度低于原发性肿瘤。与经典亚型相比，基底样亚型似乎更具化学抗性，生存率较低。化疗和/或放化疗也会丰富基底样亚型。与经典程序相比，鳞状/基底样程序促进免疫浸润。与基底和经典类型细胞相关的免疫浸润是不同的，可能为差异化策略打开大门。单细胞和空间转录组学现在将允许对肿瘤和驻留细胞进行单细胞分析
鉴定明显的和年龄依赖性的P16高小胶质细胞亚型
缩写：AD，阿尔茨海默氏病； CAM，中枢神经系统相关的巨噬细胞； CDK，细胞周期蛋白依赖性激酶； CDP，中央动物设施；中枢神经系统，中枢神经系统；大坝，疾病相关的小胶质细胞； 12月，动物护理和使用委员会； GRP，神经胶质限制的祖细胞； HOM，稳态小胶质细胞； HSV，单纯疱疹病毒； HVG，高度可变的功能； IFN，干扰素小胶质细胞； logfc，日志折叠更改； MRFP，单体红荧光蛋白； MS，多发性硬化症； OPC，少突胶质细胞祖细胞； PCA，主成分分析； PD，帕金森氏病； QRT-PCR，定量实时聚链反应； SASP，衰老相关的分泌表型； TTK，胸苷激酶；嗯，小胶质细胞； UMAP，均匀的歧管近似和投影； WGCNA，称重的基因相关网络分析。
对乳腺癌和分子亚型的脑转移空间分布的定量表征
心脏内脑机构界面（BCIS）可以通过允许用户控制带有记录在大脑中的信号的效应器或辅助设备来恢复受重大瘫痪的人的功能。近年来，运动皮层中的心脏内植入物已用于灵长类动物和人类参与者的BCI控制（Ajiboye等人。2017; Bouton等。2016; Collinger等。2013; Hochberg等。2006; Santhanam等。 2006; Velliste等。 2008; Wodlinger等。 2014）。 最近，通过在体感皮质中刺激电极来添加体感觉反馈（Armenta Salas等人。 2018; Fifer等。 2020; Flesher等。 2016; Flesher等。 2019; Flesher等。 2021;休斯等人。 2020;休斯等人。 2020）。 鉴于心脏内BCI需要手术植入，因此必须在临床上可行多年才能稳定。 在人类和灵长类动物中都研究了这个问题，表明可以从汽车皮层中的电极可靠地记录信号，但设备没有失败，尽管有相当大的受试者间可变性，并且信号随着时间的流逝通常会降低（Bullard等人（Bullard等人） 2020; Chestek等。 2011;唐尼等。 2018;休斯等人。 2020;詹姆斯等人。 2013; Simeral等。 2011; Suner等。 2005）。2006; Santhanam等。2006; Velliste等。 2008; Wodlinger等。 2014）。 最近，通过在体感皮质中刺激电极来添加体感觉反馈（Armenta Salas等人。 2018; Fifer等。 2020; Flesher等。 2016; Flesher等。 2019; Flesher等。 2021;休斯等人。 2020;休斯等人。 2020）。 鉴于心脏内BCI需要手术植入，因此必须在临床上可行多年才能稳定。 在人类和灵长类动物中都研究了这个问题，表明可以从汽车皮层中的电极可靠地记录信号，但设备没有失败，尽管有相当大的受试者间可变性，并且信号随着时间的流逝通常会降低（Bullard等人（Bullard等人） 2020; Chestek等。 2011;唐尼等。 2018;休斯等人。 2020;詹姆斯等人。 2013; Simeral等。 2011; Suner等。 2005）。2006; Velliste等。2008; Wodlinger等。 2014）。 最近，通过在体感皮质中刺激电极来添加体感觉反馈（Armenta Salas等人。 2018; Fifer等。 2020; Flesher等。 2016; Flesher等。 2019; Flesher等。 2021;休斯等人。 2020;休斯等人。 2020）。 鉴于心脏内BCI需要手术植入，因此必须在临床上可行多年才能稳定。 在人类和灵长类动物中都研究了这个问题，表明可以从汽车皮层中的电极可靠地记录信号，但设备没有失败，尽管有相当大的受试者间可变性，并且信号随着时间的流逝通常会降低（Bullard等人（Bullard等人） 2020; Chestek等。 2011;唐尼等。 2018;休斯等人。 2020;詹姆斯等人。 2013; Simeral等。 2011; Suner等。 2005）。2008; Wodlinger等。2014）。最近，通过在体感皮质中刺激电极来添加体感觉反馈（Armenta Salas等人。2018; Fifer等。2020; Flesher等。2016; Flesher等。2019; Flesher等。2021;休斯等人。2020;休斯等人。2020）。鉴于心脏内BCI需要手术植入，因此必须在临床上可行多年才能稳定。在人类和灵长类动物中都研究了这个问题，表明可以从汽车皮层中的电极可靠地记录信号，但设备没有失败，尽管有相当大的受试者间可变性，并且信号随着时间的流逝通常会降低（Bullard等人（Bullard等人）2020; Chestek等。2011;唐尼等。2018;休斯等人。2020;詹姆斯等人。2013; Simeral等。2011; Suner等。2005）。2005）。
尽管疫苗接种了疫苗，但 div> delta变体很普遍 - 威斯康星州，2021年7月，威斯康星州 对乳腺癌和分子亚型的脑转移空间分布的定量表征 植入人类皮质中的犹他州电极阵列的外植物分析
SARS-COV-2 DELTA变体及其sublineages（B.1.617.2，ay.1，Ay.2，Ay.3; [1]）可以引起高病毒载荷，高度可传播，并且包含赋予部分免疫逃生的突变[2,3]。使用来自单个大型合同实验室的PCR阈值周期（CT）数据，我们表明美国威斯康星州的个人在鼻拭子中具有类似的病毒载荷，无论疫苗状态如何，在较高且越来越多的Delta变体患病率的时期。感染性SARS-COV-2，来自接种疫苗和未接种疫苗的人的CT <25，这表明大多数CT值在此范围内具有CT值（Wilson 95％CI 83％-97％），损坏了感染性病毒。值得注意的是，尽管接种疫苗接种测试阳性，但有68％的人在测试时至少有8名无症状的人，其中包括至少8个。我们的数据证实了感染三角洲变体的接种个体可能有可能向他人传输SARS-COV-2的想法。接种疫苗的人应继续在室内和聚集环境中佩戴脸部覆盖物，同时，如果暴露或经历类似于共证的症状，也应对SARS-COV-2进行测试。
小细胞肺癌亚型的分子特征
小细胞肺癌 (SCLC；约占所有肺癌的 13% - 15%) 是一种极其致命的恶性肿瘤，其特征是倍增时间快、易于转移。与其他类型肺癌的日益个性化治疗相比，SCLC 仍然被视为同质性疾病，SCLC 患者的预后仍然不佳。然而，最近我们对 SCLC 生物学的认识取得了实质性进展。基因组学的进展和新的临床前模型的开发促进了对该疾病的肿瘤内异质性和特定基因改变的深入了解。全球范围内对 SCLC 研究的复苏最终导致了新的亚型特异性分类的发展，这些分类主要基于 SCLC 的神经内分泌特征和独特的分子特征。重要的是，这些生物学上不同的亚型可能决定了独特的治疗弱点。在此，我们总结了目前关于 SCLC 亚型分子特征的知识，重点关注其潜在的临床意义。