预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年1月28日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.24.632989 doi:Biorxiv Preprint
胰腺导管腺癌(PDAC)中的摘要尚未发现复发转移特异性突变,这表明表观遗传机制(例如DNA甲基化)是晚期疾病进展的主要贡献者。在这里,我们在小鼠和人类PDAC类器官模型上进行了第一个全基因组纤维纤维测序(WGB),以鉴定特异性和分子亚型特异性DNA甲基化特征。使用这种方法,我们识别了数千种差异化甲基化的(DMR),它们可以区分PDAC的阶段和分子亚型。阶段特定的DMR与与神经系统发育和细胞粘附相关的基因相关,并富含启动子和二价增强子。亚型特异性DMR显示出鳞状亚型中的GATA6前胚层转录网络的过度甲基化和祖细胞亚型中EMT转录网络的过度甲基化。这些结果表明,异常的DNA甲基化构成有助于PDAC的进展和亚型分化,从而产生了具有诊断和预后潜力的显着和重复的DNA甲基化模式。
乳腺癌是女性最常见的肿瘤,也是发病率和死亡率的重要原因。仅在美国,2021 年预计就会有 284,000 例乳腺癌病例,导致超过 44,000 人死亡[ 1 ]。乳腺癌约占女性确诊癌症总数的 30%。尽管最近由于对分子发病机制的了解不断加深,乳腺癌治疗取得了进展,但转移性乳腺癌仍然难以治疗。目前已明确,乳腺癌并不是一种单一的实体,而是存在几种亚型,对预后和治疗具有重要意义[ 2 ]。最常见的亚型是雌激素受体 (ER) 阳性,表皮生长因子受体 (EGFR) 家族受体 2 阴性,称为人类 EGFR 受体 2 (HER2),并且进一步分为与基因组管腔 A 亚型相对应的更惰性的疾病和与基因组管腔 B 分类一致的更具侵袭性、雌激素依赖性较低的疾病[ 3 ]。另一种乳腺癌亚型对 HER2 受体呈阳性,而三阴性亚型对 ER 和 HER2 均呈阴性,以及对孕酮受体 PR 呈阴性,在大多数 ER 阳性病例中呈阳性。每种亚型的治疗方法已发展到显著不同,乳腺癌的治疗决策取决于亚型。例如,HER2 阳性癌症可用针对 HER2 的单克隆抗体、小分子激酶抑制剂和抗体药物偶联物治疗[ 4 ]。
摘要中枢神经系统相关的恶性肿瘤,胶质母细胞瘤(GBM)是最常见的,死亡率最高。GBM细胞类型的高异质性和复杂的肿瘤微环境经常导致替莫唑胺治疗的患者的肿瘤复发和突然复发。在精确医学中,对GBM治疗的研究越来越集中于分子亚型,以精确表征细胞和分子异质性,以及GBM对治疗的难治性。对GBM亚型不同分子表达模式的深刻理解至关重要。研究人员最近提出了用于检测GBM分子亚型的四方分数或三方方法。GBM的各种分子亚型在基因表达模式和生物学行为上显示出显着差异。这些亚型在调节途径,癌基因表达,肿瘤微环境改变以及对标准疗法的差异反应中也表现出很高的可塑性。在此,我们总结了GBM的当前分子分型方案以及每个亚型的主要分子/遗传特征。此外,我们在各种调节剂下回顾了GBM的间充质转变机制。关键词胶质母细胞瘤;分子表型;分类;特征;间充质转变
摘要中枢神经系统相关的恶性肿瘤,胶质母细胞瘤(GBM)是最常见的,死亡率最高。GBM细胞类型的高异质性和复杂的肿瘤微环境经常导致替莫唑胺治疗的患者的肿瘤复发和突然复发。在精确医学中,对GBM治疗的研究越来越集中于分子亚型,以精确表征细胞和分子异质性,以及GBM对治疗的难治性。对GBM亚型不同分子表达模式的深刻理解至关重要。研究人员最近提出了用于检测GBM分子亚型的四方分数或三方方法。GBM的各种分子亚型在基因表达模式和生物学行为上显示出显着差异。这些亚型在调节途径,癌基因表达,肿瘤微环境改变以及对标准疗法的差异反应中也表现出很高的可塑性。在此,我们总结了GBM的当前分子分型方案以及每个亚型的主要分子/遗传特征。此外,我们在各种调节剂下回顾了GBM的间充质转变机制。关键词胶质母细胞瘤;分子表型;分类;特征;间充质转变
1 CNR,Inserm,Chu Lille,Lelle Pasteors,U1019 – UMR 9017 – Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-Ciil-感染与免疫和免疫,Lille大学,Lille大学,Lille大学,Lille,F-5900 Lille,F-5900 Lille,法国,法国;处理者。); nauscase.insautis@pasteor.fro(n.g。); sermony.dearly-leilla.fr(J.D.); bedmienneepdvos@gmail.com(D.P.D.); Warehouses.chabe@unival.fro(M.C。); gabriela.certy@pasteor-line.fr(G.C.)<潜水> 2所大学是两门班级课程,CNR,CNR,University Lille,UMR 8187,Log,Oce Labor是类似的及其口概ET,F-62930 Wimereux,Francis; lens.li.livate-littory.fro(l.-l.l.l.l.); sebastin.monchy@unival.fro(S.M.)3 3 3个Bilogs在Desarroll,CSIC,公共Pablo,西班牙41013,西班牙41013; steal.d93@gmail.com 4 Biotech-护理,F-59000 Lelle,Frank; g.wgenesdiffssion.com(g.e。); c.aude@genesdiffusion.com(c.a.)5 PEGASE-BISOSCIENCES(经验平台上有诺克斯的应用IS Sciences exp是重生),Leille研究所,F-5900 LELLE 6 D是诊所6 D是诊所,是诊所覆盖范围,集团十足,十h f-59000 Liles,F-59000 Liles,Francis * sosementers * sosements
开发一种通用流感疫苗,该疫苗赋予了广泛而耐用的保护,以防止各种循环和新兴的河流病毒病毒,这是公共卫生和大流行准备的长期目标。1,2流感病毒是人畜共患病毒,可感染多ple动物物种,并有可能从动物储层中溢出并引起人类大流行病。传统流感病毒疫苗引起的保护性抗体反应的主要靶标是hemaglutinin(HA),hemaglutinin(HA)是一种表面糖蛋白,对于将病毒附着至呼吸性上皮附着至关重要。然而,有18种已知的流感A亚型(H1至H18)和两个流感B HA亚型。开发一种疫苗,可预防所有20种HA亚型构成强大的技术,免疫性和监管挑战。在上下文中,常规的季节性灭活流感毒素包括三个(三价)或四个(四元素)HA亚型,并引起对疫苗中包括的HA亚型的菌株特异性免疫反应。不幸的是,季节性疫苗几乎没有免受新的流感亚型的保护,因此不适合大流行的准备。1,2
记忆诊所患者是代表各种病理衰老的各种病因的异质种群。尚不清楚如先前在阿尔茨海默氏病患者中所描述的那样,在这组老年人中,脑萎缩的时空进展模式是否普遍且具有临床意义。为了揭示不同的萎缩亚型,我们将亚型和阶段推理(持续)算法应用于来自Delcode队列的813名参与者(平均值±标准偏差,年龄= 70.67±6.07岁,女性,52%女性)的基线结构MRI数据(平均值±标准偏差)。参与者的认知能力下降(n = 342),轻度认知障碍(n = 118)或阿尔茨海默氏症类型的痴呆症(n = 68)的认知认知下降(n = 342),轻度认知障碍(n = 118)或痴呆症(n = 68)。萎缩亚型。PACC-5在长达240周内进行了PACC-5轨迹。测试基线萎缩亚型和阶段是否在明显的认知障碍前预测了临床trajec por,我们分析了PACC-5轨迹和轻度认知障碍者的认知障碍参与者和主观认知能力下降的人。边缘 - 优势和海马育萎缩亚型。边缘 - 主导萎缩造成了内侧颞叶的影响,其次是进一步的颞区,最后是其余的皮质区域。海马比萎缩最初发生在基线时,该亚型与年龄更大,阿尔茨海默氏病生物标志物水平,APOE ϵ4 Carrihersip和宽松的认知障碍有关。
记忆诊所患者是代表各种病理衰老的各种病因的异质种群。尚不清楚如先前在阿尔茨海默氏病患者中所描述的那样,在这组老年人中,脑萎缩的时空进展模式是否普遍且具有临床意义。为了揭示不同的萎缩亚型,我们将亚型和阶段推断(sovera)算法应用于来自Delcode队列中813名参与者的基线结构MRI数据(平均值±标准偏差,年龄,年龄= 70.67±6.07年,52%女性)。参与者的认知能力下降(n = 342),轻度认知障碍(n = 118)或阿尔茨海默氏症类型的痴呆症(n = 68)的认知认知下降(n = 342),轻度认知障碍(n = 118)或痴呆症(n = 68)。萎缩亚型。PACC-5在长达240周内进行了PACC-5轨迹。测试基线萎缩亚型和阶段是否在明显的认知障碍之前预测了临床创伤,我们分析了PACC-5轨迹和轻度认知障碍的认知障碍率的认知障碍率和主观认知能力下降的人。边缘 - 优势和海马育萎缩亚型。边缘 - 主导萎缩无处不在影响内侧颞叶,其次是进一步的颞区,最后是其余的皮质区域。海马比萎缩最初发生在基线时,该亚型与年龄更大,阿尔茨海默氏病生物标志物水平,APOE ϵ4 Carrihersip和宽松的认知障碍有关。
(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 11 月 21 日发布。;https://doi.org/10.1101/2023.11.20.567919 doi:bioRxiv preprint