XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System介导
抑制无义介导的 mRNA 衰变可降低...
无义介导的 mRNA 衰变 (NMD) 是一种真核 RNA 衰变途径，在细胞应激反应、分化和病毒防御中发挥作用。它在基因表达的质量控制和转录后调控中发挥作用。NMD 也已成为癌症进展的调节剂，尽管现有证据支持其既是肿瘤抑制因子又是促肿瘤发生因子，具体取决于模型。为了进一步研究 NMD 在癌症中的作用，我们在 HT1080 人纤维肌瘤细胞系中敲除了 NMD 因子 SMG7，从而抑制了 NMD 功能。然后，我们比较了亲本细胞系、SMG7 敲除细胞系和我们重新引入 SMG7 两种亚型的拯救细胞系的致癌特性。我们还测试了一种抑制 NMD 因子 SMG1 的药物的效果，以区分 NMD 依赖性效应和假定的 NMD 非依赖性 SMG7 功能。使用基于细胞的分析和小鼠异种移植肿瘤模型，我们发现抑制 NMD 功能会严重损害致癌表型。分子通路分析表明，抑制 NMD 会大大降低基质金属蛋白酶 9 (MMP9) 的表达，而 MMP9 的重新表达会部分挽救致癌表型。由于 MMP9 促进癌细胞迁移和侵袭、转移和血管生成，其下调可能有助于降低 NMD 抑制细胞的致瘤性。总之，我们的结果凸显了 NMD 抑制作为一种治疗方法的潜在价值。
社论：农杆菌介导的果树作物转化的新进展，第二卷
三十多年来，农杆菌介导的转化技术一直用于树果作物的基因工程。尽管在草本植物和一年生植物的水平上利用这项技术仍然存在许多障碍，但该领域已经取得了很大进展（Song 等人，2019 年）。在本研究主题的第二卷中，有论文描述了不同研究小组正在采取的方法，以促进难处理的树种的遗传转化，并在更基本的层面上了解 T-DNA 插入宿主细胞基因组的机制。在一项优雅的研究中，Gelvin 等人研究了 T 环的形成作为理解 T-DNA 整合的代理。在这项工作中，从转基因植物本氏烟或拟南芥中形成的 T 环中详细描述了与 LB-RB 连接相关的区域。结果表明，T 环中的 RB-LB 连接类似于 T-DNA 和发生整合的植物 DNA 之间的连接。相似之处包括：与 RB 相比，LB 处的缺失频率更高且序列变化更为广泛；连接位点存在微同源性；存在来自农杆菌或植物基因组的填充 DNA；多个 T-DNA 拷贝的多联体组织，其中 RB-RB 和 LB-LB 连接比 RB-LB 连接更常见。此外，作者还表明，T 环的形成即使在农杆菌 VirD2 基因中没有 Ku80 和 w 突变的情况下也能进行，其影响与对 T-DNA 整合的影响相似。根据他们的数据，作者提出 T 环的形成可用于研究 T-DNA 整合到宿主基因组的所有方面。大多数关于柑橘转化的已发表研究都仅使用了少数相对容易转化的品种的材料（Song 等人，2021 年）。 TAMU 的 Mandadi 团队（Dominguez 等人）开发了一种方法，可以促进 14 种柑橘品种的转化。他们通过在转化方案中使用的培养基中添加亚精胺和硫辛酸等补充剂，并使用含有额外 VirG 和 VirE 基因拷贝的辅助质粒 pCH32 来实现这一点。
微粒介导的 CRISPR DNA 递送用于杨树基因组编辑
目前，CRISPR/Cas9 的使用是植物（包括生物量作物杨树）精确基因组工程的首选方法。在杨树中传递 CRISPR/Cas9 及其成分的最常用方法是通过农杆菌介导的转化，除了所需的基因编辑事件外，还会导致稳定的 T-DNA 整合。在这里，我们探索了通过 DNA 包被的微粒轰击将基因编辑试剂传递到模型树 Populus tremula x P. alba 中，以评估其开发无转基因、基因编辑树的潜力，以及其在特定靶位整合供体 DNA 的潜力。使用优化的转化方法，有利于再生暂时表达所传递供体 DNA 上基因的植物，我们再生了不含 Cas9 和抗生素抗性编码转基因的基因编辑植物。此外，我们报告了供体 DNA 片段在 Cas9 诱导的双链断裂处频繁整合，为靶向基因插入提供了机会。
OTUB1介导的泛素化抑制
膀胱癌是尿液系统中最常见的恶性疾病之一，对生活的寿命和生活质量显着影响（1）。肌肉侵入性膀胱癌（MIBC）由于其对转移的侵略性和倾向而构成了实质性的困难（2）。目前，MIBC的标准处理（T2-T4AN0M0）涉及至少三个铂基化的新辅助化疗（NAC），然后进行自由基膀胱切除术（RC）（3，4）。尽管采用了这种密集的治疗策略（NAC + RC），但超过40％的MIBC患者在3年内复发或死亡率（3，4）。这强调了对创新的手术前治疗策略的关键需求，以增强患者的预后。免疫检查点抑制剂（ICI），包括针对程序性细胞死亡蛋白-1（PD-1）和程序性死亡配体1（PD-L1）的药物，最近证明了患有局部晚期和转移性膀胱癌患者的生存益处有希望的生存益处（5，6）。我们先前的研究表明，将吉西他滨和顺铂（GC）方案与免疫疗法相结合，显着提高了病理完整反应率（PCRR）和病理下降率（PDR），同时保持有利的安全性促进（1）。人表皮生长因子受体2（HER2）的过表达与膀胱肿瘤的发育和进展密切相关（7）。因此，HER2靶向疗法，尤其是抗体 - 药物缀合物（ADC），例如disitamab vedotin（RC48），在治疗局部晚期或转移性膀胱癌（8-10）方面表现出了效率和安全性，引起了人们的注意（8-10）。最近的研究表明，将RC48与免疫疗法相结合可以增强治疗结果（11，12）。我们假设，由于涉及的特定作用机制，RC48与PD-1抑制剂的组合将优于传统的GC方案。rc48，作为一种抗体 - 药物结合物，特定靶向表达HER2的癌细胞，提供更有定向的治疗方法并最大程度地减少脱靶效应，这可能会导致更高的效率和改善的安全性（9）。此外，与PD-1抑制剂的组合可以通过促进更强的免疫介导的反应来进一步增强抗肿瘤活性（12）。但是，
长期在小鼠成纤维细胞植入物中逆转录病毒介导的基因转移的体内表达
当前的基因治疗模型涉及逆转录病毒介导的遗传材料转移到源自各种体细胞组织的细胞中，包括造血系统的细胞，成纤维细胞，肝细胞，内皮细胞和成肌细胞（1、2）。我们先前已经描述了一种通过小鼠皮肤成纤维细胞逆转录病毒感染的基因产物传递方法（3）。我们先前在成纤维细胞研究中使用的转导基因是人和狗因子IX cDNA（3，4）。尽管在组织培养中可以实现高水平的持续性，而当在啮齿动物的同种异体移植中移植时，这些成纤维细胞仅在短时间内就产生了大量因子IX（3，5）。从理论上讲，体内表达的短期可能归因于不同的因素：（i）宿主对外源性因子IX的免疫反应； （ii）移植后外国细胞的破坏； （IIM）一旦将转导细胞移植到动物的转移基因的转录基因转录的特异性下降。已经表明（3，5），植入改良的成纤维细胞后，对人类因子IX的抗体存在，这至少可以解释，部分原因是第IX因子的短期。在这项工作中，使用不同的启动子来控制8-半乳糖苷酶的表达，我们证明，在组织培养中，长期表达可以轻松获得，但指导感兴趣基因转录的启动子的类型可能是决定体内长期表达的关键因素之一。
通过CRISPR-CAS9-介导的Hibit标记
许多蛋白质家族由多种高度同源蛋白组成，无论它们是由不同基因编码还是来自相同基因组位置的编码。某些同工型的优势与各种病理状况（例如癌症）有关。研究中蛋白质同工型的检测和相对定量通常是通过免疫印迹，免疫组织化学或免疫荧光来完成的，其中使用针对特定家族成员的同工型特异性表位的抗体。但是，同工型特异性抗体并非总是可用的，因此无法破译同工型特异性蛋白表达模式。在这里，我们描述了多功能11氨基酸标签的插入到感兴趣蛋白质的基因组位置中。此标签是开发的，由Promega（美国威斯康星州Fitchburg）发行。本协议描述了高度同源蛋白的精确蛋白质表达分析，通过hibit标签的表达，当缺失特定抗体时，可以实现蛋白质表达定量。可以通过传统方法（例如蛋白质印迹或免疫荧光）以及在荧光素酶二元报道器系统中分析蛋白质表达，从而可以使用板读取器进行可靠且快速的相对表达定量。
以及由Adeno介导的原发性和培养的肿瘤细胞...
我们已经使用阳离子脂质体来促进原代和培养细胞类型的腺相关病毒（AAV）质粒转染。AAV质粒DNA显示出比标准质粒的复合物高的表达水平。此外，观察到典型的脂质体介导的瞬时表达与标准质粒的转染所证明的瞬态表达不同，该基因的长期表达（> 30天）。染色体DNA的南部分析进一步证实了长期表达是由于AAV质粒转染组中的转基因而不是在标准质粒转染组中引起的。AAV质粒 - 脂质体复合物诱导的转基因表达水平与重组AAV转导相当。原发性乳房，卵巢和肺部肿瘤细胞可与AAV质粒DNA-脂质体复合物转染。转染的原发性和培养的肿瘤细胞即使在致命照射后也能够表达转基因产物。在正常人类外周血的新鲜分离的CD3+，CD4+和CD8+T细胞中也观察到了高级基因表达。转染效率范围为10％至501％，如白细胞介素2转染的细胞中细胞内白细胞介素-2水平评估。在原发性肿瘤和淋巴样细胞中表达转基因的能力可以应用于肿瘤疫苗研究和方案，最终可以对癌症和艾滋病中细胞免疫反应的高度特异性调节。
巨细胞病毒特异性细胞介导的免疫状态...
众所周知，宿主对CMV感染的免疫反应主要由细胞介导的免疫（CMI）介导，并且CMI会限制CMV感染重新激活的风险。对CMV的免疫缺陷或该生物的原发性感染或继发感染是导致先兆子痫中CMV感染的发育或重新激活的原因，目前尚不清楚。Quantiferon -CMV（QF -CMV）测试是一种识别CMV特异性CD8+ T细胞患者的体外方法。在该测定中，评估了主要由CMV抗原刺激的CD8+ T细胞产生的特定干扰素− -Gamma（IFN -γ）。[13,14]值得注意的是，此方法对CMI监测的准确性和功效已被证实。[15,16]据我们所知，这项调查是评估CMV相关的CMI和先兆子痫之间的关联的首次尝试。然而，调查调查调查CMV感染与先兆子痫之间的关系导致数据矛盾。
crispr/cas9介导的精英木米（Oryza sativa L.）中半昏昏欲睡性特征的增强：靶向SD1和WX基因的产量和
在水稻培养中，半枯萎和粘性质地的特征分别是优化产量潜力和晶粒质量的关键。Xiangdaowan（XDW）大米以其出色的芳香特性而闻名，由于其高的身材和高淀粉糖含量而面临挑战，导致住宿耐药性不佳和次优烹饪属性。为了解决这些问题，我们采用了CRISPR/CAS9技术来精确地编辑XDW大米中的SD1和WX基因，从而发展具有所需半昏迷和麸质特征的稳定的遗传纯合线。SD1-WX突变型线表现出降低的gibberellin含量，植物高度和淀粉糖含量，同时保持了几乎不会改变发芽率和其他关键的农艺性状。重要的是，我们的研究表明，外源性GA 3的应用通过补偿内源性Gibberellin的缺乏有效地促进了生长。基于此，开发了半昏昏欲睡的精英大米（Oryza sativa L.）线，对大多数农艺性状没有太大影响。此外，比较转录组分析揭示了差异表达的基因（DEG）主要与膜的锚定成分，过氧化氢分解代谢酶分解代谢酶活性，过氧化物酶活性，萜烯合酶活性和寄生虫相关。此外，将二萜类化合物的生物合成催化为gibberellins的生物合成富集并显着下调。这项全面的研究提供了一种有效的方法，可以同时提高水稻植物的身高和质量，为耐药和高质量的水稻品种的发展铺平了道路。
优化农杆菌介导的大豆毛状根体外和体外转化，以便使用可视化方法筛选转化子
体外和体外农杆菌介导的毛状根转化 (HRT) 测定是植物生物技术和功能基因组学工具包的关键组成部分。在本报告中，使用 RUBY 报告基因优化了大豆的体外和体外 HRT。评估了不同的参数，包括农杆菌菌株、细菌细胞培养物的光密度 (OD 600 )、共培养基、大豆基因型、外植体年龄以及乙酰丁香酮的添加和浓度。总体而言，就毛状根和转化根（表达 RUBY ）的诱导百分比而言，体外测定比体外测定更有效。尽管如此，体外技术被认为更快且方法更简单。在 cv 的 7 天大子叶上观察到了 RUBY 的最高转化。 Bert 用 R1000 接种 30 分钟，R1000 悬浮在 ¼ B5 培养基中，OD 为 600 (0.3)，乙酰丁香酮含量为 150 µM。该测定的参数还通过两步体外毛状根转化获得了最高百分比的 RUBY。最后，使用基于机器学习的建模，进一步确定了两种测定的最佳方案。本研究建立了适用于大豆功能研究的高效可靠的毛状根转化方案。