XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System代谢
应用于大肠杆菌核心代谢
摘要：基本通量模式（EFM）为系统地表征稳态，细胞表型以及代谢网络鲁棒性和脆弱性提供了严格的基础。但是，EFM的数量通常随代谢网络的大小而成倍增长，导致过度的计算需求，不幸的是，由于系统限制，这些EFM的很大一部分在生物学上是不可行的。这种组合爆炸通常阻止对基因组规模代谢模型的完整分析。传统上，EFM是通过Double Description方法计算的，这是一种基于矩阵计算的有效算法；但是，只能将少数几个约束集成到该计算中。他们必须对辅助的设定包含是单调的；否则，必须在后处理中对其进行处理，因此不能节省计算时间。我们提出ASPEFM，这是一种基于答案集编程（ASP）和线性编程（LP）的混合计算工具，允许在实施许多不同类型的约束时进行EFM的计算。我们将方法应用于包含226×10 6 EFM的大肠杆菌核心模型。在考虑转录和环境调节，热力学约束和资源使用方面的考虑时，解决方案空间被降低至可直接使用ASPEFM计算的1118 EFM。使用后处理和Pareto前部分析，可以将完全有氧厌氧的O大肠杆菌生长到O的2个完全有氧厌氧的O 2梯度上的大肠杆菌生长。
本月代谢组学
我们还要感谢我们即将离任的EMN成员在EMN委员会任职的两年：Millena Barros Santos（Bordeaux代谢代谢 - Metabolome- Metabohub，Inrae Bordeaux Nouvelle-Aquitaine），Domenica Berrardi（Domenica Berrardi） （日本大阪大学）和Anza Ramabulana（南非约翰内斯堡大学）！EMN网络研讨会EMN将再次感谢Alan Pilon博士的丰富和引人入胜的演示，题为“通过LC-MS分子网络解密的质量碎片途径”。他建设性地解释并共享有关分子网络如何帮助识别和注释具有相似结构的分子的提示。网络研讨会录制将很快在METSOC的网站上提供。不要错过10月的下一次EMN网络研讨会会议，并跟踪我们的社交媒体平台以进行更新！
精确药物和代谢综合征
抽象代谢综合征（MetS）是世界上最重要的健康问题之一，也是2型糖尿病（T2DM）和心血管疾病的主要危险因素。MetS的病因是由遗传因素和环境因素之间的相互作用决定的。有效的预防和治疗MetS明显降低了其并发症的风险，例如糖尿病，肥胖，高血压和血脂异常。根据最近全基因组关联研究，多个基因参与了MetS的发病率和发展。存在负责肥胖和脂质代谢的特定基因，影响胰岛素敏感性和血压以及与炎症相关的基因，可以增加大都能蛋白的风险。这些分子标记物以及蛋白质组学，代谢组，药代动力学和其他方法的临床数据和发现将阐明MetS的病因和病理生理学，并促进发展Mets管理的个性化方法。基于确定的基因组的个性化药物的应用将有助于医生建议更健康的生活方式和开药，以改善Mets患者的健康各个方面。近年来，通过基因检测的个性化医学帮助医生确定了对大都会的遗传易感性，通过行为，与生活方式相关或治疗干预措施预防疾病，并检测，诊断，治疗和管理疾病。它还消除了膨胀医疗费用并破坏患者护理的反复试验效率低下。在临床上，个性化医学正在通过降低药物临床试验的时间，成本和失败率来提供有效的Met和治疗策略。关键字：代谢综合征；个性化医学；基因组学；蛋白质组学；代谢组学
代谢相关脂肪肝病和...
近年来的报告提供了有关小脑功能形态的结构和存在的令人信服的证据。但是，其中大多数都集中在小脑的运动功能上。最近的研究表明，小脑后叶与神经性和认知障碍的背景下有关。这些疾病的病理生理学尚未充分理解，最近的研究表明，这也可能影响小脑的其他子区域。与神经成像结合的解剖学和临床研究提供了有关小脑组织和功能的新思维方式。本综述总结了小脑的地形和功能的知识，并着重于其对神经疾病发展的解剖学和功能贡献。（Folia Morphol 2024; 83，3：497–508）
先天性代谢缺陷 (IEM) 人工智能代谢计算器应用程序的开发与试用
研究使用人工智能驱动的交互式计算器聊天机器人应用程序（Met Bot App）的可行性，供患有先天性代谢错误（IEM）的儿童的看护者监测其孩子的蛋白质和/或氨基酸、能量和特殊代谢产物的摄入量，以便他们可以持续监测和调整饮食
色氨酸代谢决定结核性脑膜炎的结果：有针对性的代谢组学分析
1. 印度尼西亚万隆帕查达兰大学传染病护理与控制研究中心 14 2. 荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心内科系和拉德堡德传染病中心 (RCI) 15 3. 美国马萨诸塞州剑桥麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所 17 4. 越南胡志明市牛津大学临床研究中心； 18 5. 印度尼西亚万隆帕查兰大学医学院哈桑萨迪金医院内科部 20 6. 印度尼西亚万隆帕查兰大学医学院哈桑萨迪金医院神经内科部 22 7. 印度尼西亚大学医学院 Cipto Mangunkusumo 医院神经内科部 23 8. 英国牛津大学纳菲尔德医学院热带医学与全球健康中心 24 9. 英国伦敦吉佩尔街伦敦卫生与热带医学院 25 10. 荷兰阿姆斯特丹大学医学中心医学微生物学与感染预防系 26 11. 越南胡志明市第五区热带病医院 27 12. 越南胡志明市第五区范玉石结核病与肺病医院5，胡志明市，越南 30 13. 印度尼西亚万隆巴查达兰大学医学院生物医学科学系 31 14. 个性化感染医学计算生物学系，个性化感染医学中心 (CiiM) 和 TWINCORE，亥姆霍兹感染研究中心 (HZI) 与汉诺威医学院 (MHH) 的合资企业，33 汉诺威，30625，德国 34 15. 印度尼西亚牛津大学临床研究中心，印度尼西亚大学医学院 35
糖尿病、内分泌和代谢疾病
在 1 型糖尿病中，免疫系统会攻击并破坏胰腺中产生胰岛素的 β 细胞，因此研究人员正在研究阻止这种攻击的方法。正如本章所述和这幅艺术作品中所描绘的那样，科学家们发现，一种抗体药物（中间的紫色和灰色叉骨形分子）可以与一种名为锌转运蛋白 8（ZnT8，左下角和右下角的浅蓝色分子）的蛋白质结合，这种蛋白质存在于 β 细胞的表面（底部以黄色/橙色表示）。与 ZnT8 结合的抗体可保护 β 细胞免受破坏性免疫细胞（图像顶部的粉红色细胞）的攻击，并在小鼠模型中预防 1 型糖尿病。由于 ZnT8 是人类 1 型糖尿病自身免疫攻击的主要靶点，因此这种治疗方法有望转化为人类。
针对胰腺癌的氧化还原代谢
摘要：癌细胞的细胞代谢被重新编程，以满足其高生物能量和生物合成需求。这种代谢重编程伴随着氧化还原代谢的改变，其特征是活性氧 (ROS) 的积累。ROS 的产生增加（主要是由线粒体呼吸引起）被抗氧化防御（主要是谷胱甘肽和抗氧化酶）的增加所抵消。癌细胞适应高浓度的 ROS，这会导致肿瘤发生、转移形成、治疗耐药性和复发。在胰腺导管腺癌 (PDAC) 中观察到的频繁基因改变会影响 KRAS 和 p53 蛋白，它们分别在 ROS 的产生和控制中发挥作用。这些观察结果导致人们提出使用抗氧化剂来预防 PDAC 的发展和复发。在这篇综述中，我们重点介绍了进一步提高 ROS 水平以诱导 PDAC 细胞死亡的治疗策略。促进ROS产生与抑制抗氧化能力相结合是临床治疗胰腺癌的一种有希望的途径。