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用户友好的门户网站链接分子和临床数据以增强代谢性疾病研究
努力的关键部分是由Jiawei Zhong博士领导的。学生和Karolinska Institutet博士后研究员Danae Zareifi。他们确保可以通过标准化术语比较来自不同来源的数据。鉴于几乎没有蛋白质组学数据，它们还生成了新的蛋白质分析数据集，从而提高了门户网站验证基因活性发现的能力。
2025; 21（6）：2396-2414。 doi：10.7150/ijbs.99275研究论文PPARG脂肪酸代谢的激活使H
HER2阳性乳腺癌约占所有乳腺癌的15-20％，其特征是其侵略性复发，转移和生存降低。 尽管抗HER2疗法进展，但许多患者最初或在初始阳性反应后仍会面临治疗性抗药性，从而导致复发或疾病进展。 这项研究的主要重点是确定过氧化物酶体增殖物激活的受体伽马（PPARG）是通过建立HER2阳性乳腺癌的抗HER2药物耐药细胞系来降低药物敏感性的因素。 我们发现PPARG促进脂肪酸代谢并激活PI3K/AKT/MTOR信号通路。 PPARG过表达后抑制脂肪酸合成（FASN），有效阻止PI3K/AKT/MTOR途径的激活并增强细胞抗HER2药物敏感性。 PPARG抑制剂GW9662的共同给药已成为增强抗HER2疗法疗效的有前途的策略，从而为临床应用提供了潜力。HER2阳性乳腺癌约占所有乳腺癌的15-20％，其特征是其侵略性复发，转移和生存降低。尽管抗HER2疗法进展，但许多患者最初或在初始阳性反应后仍会面临治疗性抗药性，从而导致复发或疾病进展。这项研究的主要重点是确定过氧化物酶体增殖物激活的受体伽马（PPARG）是通过建立HER2阳性乳腺癌的抗HER2药物耐药细胞系来降低药物敏感性的因素。我们发现PPARG促进脂肪酸代谢并激活PI3K/AKT/MTOR信号通路。PPARG过表达后抑制脂肪酸合成（FASN），有效阻止PI3K/AKT/MTOR途径的激活并增强细胞抗HER2药物敏感性。PPARG抑制剂GW9662的共同给药已成为增强抗HER2疗法疗效的有前途的策略，从而为临床应用提供了潜力。
微生物代谢物控制人宫颈干细胞的自我更新和癌前进展
宫颈癌是第四大常见的女性癌症，子宫骨髓癌是最常见的部位。然而，宫颈干细胞，分化和调节的理解仍然很差。在这里，我们报告了富含人宫颈干细胞及其调节机制的人群的分离。使用单细胞RNA测序，我们表征了人类外部的细胞异质性，并识别簇特异性细胞表面标记。通过建立正常和癌前的宫颈类器官和插内移植系统，我们表明ITGB4和CD24可以富集人和鼠类外宫内干细胞。我们发现，乳酸杆菌衍生的乳酸通过PI3K-AKT途径和YAP1调节宫颈干细胞的自我更新和早期肿瘤发生。最后，我们表明D乳酸会抑制正常和癌前器官的生长，而L-乳酸却没有。我们的发现揭示了人类宫颈干细胞和微生物代谢产物在宫颈健康和疾病中的作用。
社论：癌症的代谢重编程
在过去的几十年中，技术进步已经揭示了肿瘤的多样性和适应性，阐明了支持肿瘤生长的关键遗传畸变和代谢途径。特别是癌细胞改变其代谢途径，以满足增强的能量和基础需求，同时管理其增殖和生存至关重要的氧化应激（Nong等，2023）。通过这些代谢途径的漏斗，癌症代谢可塑性的潜在，受到癌症驱动器突变和环境营养的可用性的控制。肿瘤微环境（TME）通常在特异性营养素中表现出来，迫使癌细胞通过诱导机制清除营养和维持其增殖来适应癌细胞。越来越多地认识到，TME中非癌细胞类型的代谢，例如内皮细胞，细胞细胞和免疫细胞，会影响肿瘤的进展（Xia等，2021）。特定的，代谢重编程对于维持各种类型免疫细胞的自我和身体稳态也至关重要。最近的研究表明，免疫细胞在效应功能的增殖，分化和执行过程中进行代谢重编程，这对于调节抗肿瘤免疫反应至关重要（Hu等，2024）。通过释放代谢物及其对免疫分子表达的影响来实现这种影响。此外，利用癌症遗传分析对患者进行分层和设计饮食干预措施以及靶向代谢疗法的设计有了新的兴趣。考虑到转移是与癌症相关的死亡的重要原因，因此持续的努力集中在理解转移细胞的代谢如何使用，尤其是在诸如肺和胰腺癌等侵袭性肿瘤类型中（Comandatore等人（Comandatore等）（Comandatore等，2022222））。本研究主题包括12篇原始和评论论文，涉及肿瘤中代谢重编程的不同特征，并在转化的角度提供了有关此主题的新知识。在他们的评论文章Chen等人中。总结了肿瘤中代谢重编程的主要特征，解决了不同方面，包括增加的糖酵解代谢，脂质合成，氨基酸的改变以及代谢改变和免疫反应之间的关系。然后，他们将论文集中在代谢适应机制在肾癌预后和进展中所扮演的作用，讨论了肾脏诊断和治疗的最新进展
对粪便样品的代谢组筛查是对婴儿过敏的牛奶蛋白过敏的临床试验的替代方法
牛奶蛋白过敏（CMPA）是食物过敏的最复发性儿科疾病之一，这是幼儿时期发生的。诊断并不容易，需要口服食物挑战测试（OFC）。在寻找可以用作CMPA的生物标志物的可能的肠道代谢产物时，评估了来自怀疑CMPA的婴儿的粪便样品的24个代谢组谱。儿童先前被诊断出患有OFC。粪便样品，并使用FT-Orbitrap质谱仪直接通过超高分辨率质谱（HRMS）直接分析。代谢组谱，该分析在区分样品以提出诊断方面并不有效。然后，在负面分析模式下获得的特定M/Z范围的代谢组谱成功地经受了正交部分最小二乘判别分析（OPLS-DA），该分析在没有CMPA的情况下将两组分开。模型拟合为R²= 0.88，在测试中具有Q²= 0.52的预测能力，其置换为2000排列，显着性p值<0.05。在这项初步研究中，使用代谢组谱获得的模型显示出显着的验证值，这表明有可能区分两组感兴趣的验证值，这表明其用作CMPA患者的可能诊断工具。
枳果梗多糖调节谷氨酸代谢和紧密连接蛋白表达改善酒精 ...
摘 要 ： 目的：本研究旨在明确枳椇果梗多糖（ HDPs ）对酒精暴露所致的小鼠神经行为异常的改善效果，并探究谷 氨酸代谢和紧密连接蛋白表达在其中的作用。方法：雄性 C57BL/6 小鼠按 114 μL/20 g 剂量连续酒精灌胃 14 d ，建 立酒精暴露模型，同时设置干预组进行 HDPs 干预（ 114 μL/20 g 酒精 +100 mg/kg HDPs ）。应用行为学实验（旷场 实验、高架十字迷宫实验）评估神经行为学变化，采用气相色谱法测定小鼠血液中乙醇浓度， γ -H2AX 荧光检测小 鼠脑海马组织 DNA 损伤，免疫组化分析检测小鼠脑组织中紧密连接蛋白 Claudin-1 和 ZO-1 的表达，并通过超高 效液相色谱 - 四级杆飞行时间质谱法（ UPLC-Q-TOF-MS ）代谢组学技术对小鼠脑组织代谢物进行分析。结果： HDPs 可有效降低酒精暴露小鼠血液乙醇浓度，由 4.69±0.29 g/L 降至 1.64±0.104 g/L ；改善酒精暴露所致的小鼠神 经行为异常，旷场实验中，与酒精组相比， HDPs 干预组总路程显着提升至 27340±3304 cm （ P <0.05 ），平均速度 显着提升至 67.4±13.4 cm/s （ P <0.05 ），不动时间缩短 29% （ P <0.05 ）；高架十字迷宫实验中，与酒精组相比， HDPs 干预组闭臂停留时间显着减少至 195.6±10.3 s （ P <0.05 ），开放臂进入次数显着增加 26% （ P <0.05 ））；还 可降低酒精诱导的脑组织氧化应激与 DNA 损伤水平， ROS 、 MDA 分别降低 5.4% 、 29.5% （ P <0.05 ）， T-AOC 提 高 10.9% ，上调脑海马组织中 Claudin-1 （ 2.2 倍）和 ZO-1 （ 0.1 倍）蛋白的表达；并调节脑组织谷氨酸代谢通路， 提高甘氨酸（ 19.7% ）、谷光甘肽（ 25% ）、琥珀酸（ 22.6% ）等代谢物水平。结论： HDPs 可有效改善酒精对小鼠 神经行为的影响，其机制或可能通过抗氧化、保护紧密连接蛋白和调节谷氨酸代谢通路发挥作用，研究结果可为 扩展枳椇资源在食品领域中的应用提供理论依据。
将网络药理学，代谢组学和肠道菌群分析整合到
Lihao Xiao b,c,# , Tingyu Zhang a,# , Yun Liu a , Chayanis Sutcharitchan a , Qingyuan Liu a ,
o r i g i n a l r e s a r c h剖析免疫细胞，血浆代谢产物和冠状动脉粥样硬化之间的因果关系：Mendelian Rando
背景：循环免疫细胞和代谢产物与冠状动脉粥样硬化有关，但是特定的因果关系以及代谢物作为介质的作用仍不清楚。方法：来自免疫细胞GWAS数据集的摘要统计数据（n = 3,757），循环代谢物（n = 8,299）和冠状动脉粥样硬化（病例n = 51,589;对照n = 343,079）使用BiDirectirectional Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Mendelal Ryneral分析。两步和多元孟德尔随机化被用来识别介导的代谢产物，并以逆差异加权（IVW）为主要方法。结果：我们确定了九种免疫细胞表型，包括特定的T细胞和单核细胞种群，与冠状动脉粥样硬化有显着的因果关系。此外，鉴定出41个跨四个代谢途径的血浆代谢产物，包括3-羟基-2-乙基丙酸和反式2-己烯酰甘氨酸甘氨酸甘氨酸。调解分析表明，3-羟基-2-乙基丙酸酯介导了IgD+ CD24+ B细胞对冠状动脉粥样硬化的影响（介导效应：0.961; 95％CI：95％CI：0.955-0.967），而Trans-2-Hexenoylglycine调节+ CD24+ b-b-b-cellsiors+ b-b-b-cellsiors+ b-b-cellsiiors， （中介效应：0.983; 95％CI：0.981–0.986）。结论：关键的免疫细胞表型和血浆代谢产物与冠状动脉粥样硬化有关。3-羟基-2-乙基丙酸和反式2-己烯酰基甘氨酸甘氨酸在调节B细胞功能中的作用表明了预防和治疗的潜在治疗靶标。关键字：免疫细胞，冠状动脉粥样硬化，血浆代谢产物，孟德尔随机化，B细胞功能
acot1 eqtl：参与脂质代谢的基因...
介绍：表达定量性状基因座（EQTL）和勃起功能障碍（ED）之间的因果关系尚未得到充分兴奋。这项研究应用了孟德尔随机分析（MR）分析来研究ED的新敏感性基因与其不体定式机制之间的潜在因果关系。材料和方法：采用两样本的MR分析来检查EQTL，代谢产物和ED进展之间的因果关系。此外，还使用基于摘要数据的MR（SMR）分析来验证顺式EQTL和ED之间的因果关系。还建立了cast割的大鼠模型，以通过定量的实时聚合酶链反应（QRT-PCR）验证基因表达。结果：结果提供了新的证据，表明ACOT1 EQTL促进了ED的进展。SMR分析证实了ACOT1顺式EQTL和ED进展之间的因果关系（P <0.05）。 关于ACOT1在ED中的潜在作用，该研究表明，ACOT1 EQTL可能对Docosadieate（C22-DC）和八烷基二烯丙基钙氨酸（C18-DC）进行负面调节，这两种均抑制了EDSTRESSION。 在SD大鼠中，cast割导致钙内压（ICP）与平均动脉压（MAP）的比率降低，并降低平滑肌对胶原蛋白的降低，并伴随着cast抗的α -SMA表达增加。 这些发现证实了成功建立了cast割的模型。 此外，ACOT1表达的进一步分析显示cast割组的上调显着上调（p <0.05）。 这些见解为ED提供了潜在的新治疗靶标。SMR分析证实了ACOT1顺式EQTL和ED进展之间的因果关系（P <0.05）。关于ACOT1在ED中的潜在作用，该研究表明，ACOT1 EQTL可能对Docosadieate（C22-DC）和八烷基二烯丙基钙氨酸（C18-DC）进行负面调节，这两种均抑制了EDSTRESSION。在SD大鼠中，cast割导致钙内压（ICP）与平均动脉压（MAP）的比率降低，并降低平滑肌对胶原蛋白的降低，并伴随着cast抗的α -SMA表达增加。这些发现证实了成功建立了cast割的模型。此外，ACOT1表达的进一步分析显示cast割组的上调显着上调（p <0.05）。这些见解为ED提供了潜在的新治疗靶标。结论：这项研究首次阐明了ACOT1作为一种新型EQTL介导的ED易感基因的机制，通过负调节docosadioate（C22-DC）的水平来加速ED的进展，并加速了ED的进展。
ANSES正在招募质谱法和代谢组学的后界研究人员
进行文献综述。在实验室进行体外和体内代谢研究。准备使用质谱技术进行分析的样品使用LC-HRMS鉴定新的化学和生物学标记的分析方法。使用专用软件进行单变量和多变量统计的数据处理。生产与项目相关的报告。通过科学文章和口头介绍发布研究结果。根据NF EN ISO 17025国际标准工作。确保维护蚂蚁的设备适当运作确保适当应用卫生和安全法规。您所需的个人资料教育和经验：