如何区分有益与微生物的有害相互作用?生物体使用多种方式来了解它们何时被感染。一个人不依赖于直接检测病原体,而是依赖于感染的后果。果蝇有一个惊人的例子,当真菌蛋白酶通过裂解内源性固定前体Spaetzle(2)来激活Toll信号通路(2)。此类检测系统是多种多样的。在秀丽隐杆线虫中,例如,顶端细胞外基质的破坏或核糖体,线粒体或核仁功能的扰动会通过或多或少理解的机制导致防御基因的表达(3,4)。并行,生物具有不同的模式识别受体(PRR),直接识别非自我。例如,在哺乳动物中,这可以通过类似收费的受体(TLR)。这些结合了一系列原型微生物部分,包括革兰氏阴性细菌的LPS。肽聚糖,另一种细菌细胞壁成分,由昆虫和点头样受体中的PGRP受体和哺乳动物中的TLR2检测到。奇怪的是,除了检测病毒双链RNA外,尽管进行了激烈的研究,但在秀丽隐杆线虫中仍缺乏直接病原体识别的例子(3)。Peterson等人的论文。在本期免疫力中,部分填充了该空隙,因为它描述了秀丽隐杆线虫中的新型PRR,秀丽隐杆线虫是一种检测特定有毒细菌代谢物的核激素受体(NHR)。
抽象背景超出观察到的细胞结构和线粒体的改变,将罕见的遗传突变与受脱敏突变影响的患者的心力衰竭发展联系在一起的机制尚不清楚,这是由于缺乏相关的人类心肌细胞模型。阐明线粒体在这些机制中的作用的方法,我们研究了源自人类诱导的多能干细胞的心肌细胞,这些干细胞带有杂合的DES E439K突变,这些干细胞是从患者中分离出来的,或者是由基因编辑产生的。为了提高生理相关性,在各向异性的微图案表面上培养心肌细胞以获得伸长和比对的心肌细胞,或者作为心脏球体,以创建微生物。在适用的情况下,通过突然死于携带DES E439K突变的家族的患者的心脏活检证实了心肌细胞的结果,并从五个对照健康的供体中验尸中的心脏样本。结果杂合DES E439K突变导致心肌细胞的总体细胞结构的巨大变化,包括细胞大小和形态。最重要的是,突变的心肌细胞显示出改变的线粒体结构,线粒体呼吸能力和代谢活性,让人联想到患者心脏组织中观察到的缺陷。最后,为了挑战病理机制,我们将正常的线粒体转移到突变体心肌细胞内,并证明这种治疗方法能够恢复心肌细胞的线粒体和收缩功能。结论这项工作突出了DES E439K突变的有害作用,证明了Mito-软骨异常在与Desmin相关心肌病的病理生理学中的关键作用,并为这种疾病打开了新的潜在治疗观点。
摘要。量子计算机的威胁是真实的,将需要经典系统和应用程序的显着资源和时间,以准备针对威胁的补救措施。在算法级别,这是两个最受欢迎的公钥加密系统RSA和ECC,使用Shor's算法易于量化加密分析,而Grover的Algorithm的algorithm却削弱了对称键和基于哈希的密码系统。在实施层中了解了较少的知识,在这种情况下,企业,运行和其他考虑因素,例如时间,资源,专有技术和成本可以影响受威胁的申请的速度,安全性和可用性。,我们对20种众所周知的威胁建模方法进行了景观研究,并在与攻击树和大步互补时识别面食,作为评估现有系统量子计算威胁的最合适方法。然后,我们在通用的网络物理系统(CPS)上进行意大利面威胁建模练习,以证明其效率并报告我们的发现。我们还包括在威胁建模练习中确定的缓解策略,以供CPS所有者采用。
代谢工程和合成生物学方法已经繁荣了生物技术领域,其中主要重点是大肠杆菌和酿酒酵母作为微生物的工作试验。在近年来,作为生产宿主的革兰氏阳性细菌乳酸菌和枯草芽孢杆菌的注意力越来越多。本评论将证明这些细菌可以设计的不同水平及其各种应用可能性。例如,工程化的乳酸乳杆菌菌株对生物医学应用显示出巨大的希望。此外,我们还提供了最新的合成生物学工具的概述,这些工具促进了这两种微生物的使用。
摘要目的:元编码和元基因组测序使高度多样化的环境社区的表征能够表征。估计这些社区执行的代谢功能的挑战导致了几种最新方法的发展,其中大多数方法是根据特定基因标记量身定制的。但是,测序技术进步所产生的方法的增加,驱动了能够处理异质微生物社区数据的方法。预测通常取决于其内部分析管道,并受到基础数据库的影响,这些数据库将标记基因与特定功能注释联系起来。这限制了用户通过追踪内部数据和流程来评估预测质量的能力。最后,用户受这些方法提供的特定注释的约束(例如ec数),限制了他们根据中间结果进行进一步专业分析的能力。方法:ESMECATA预测分类学官员的共识蛋白质组及其相关功能。Esmecata的关键特征是其解释性和功能。为了支持异质测序数据的灵活整合,Esmecata利用了通过分析不同测序数据集的分析获得的分类学官方。为了深入了解每种分类学的知识并解释预测功能的相关性,Esmecata确定了在UNIPROT数据库中有记录的蛋白质组织能够辅助代表的给定官能中的分类学等级。根据阈值,将Uniprot蛋白质组的蛋白聚类并过滤,以创建共识蛋白质组。这些共有的蛋白质组会自动用功能信息(例如,EC数字,GO术语)注释,但它们也被设计为用于进一步的自定义注释工作流。功能注释在功能表中报道,该功能表可以充满分类的丰度,以产生全面的功能性文件。结果:ESMECATA预测已使用多个数据集验证,并将其与最新方法进行了比较。此外,它被应用于甲烷剂反应器的新型元编码数据集,表征了微生物群落和沼气在不同的时间点和进气条件上的产生。我们的结果证明了沼气之间的联系
摘要:前列腺癌(PCA)经常变得耐药,对有效的管理提出了重要的挑战。尽管对雄激素剥夺治疗的初始治疗可以控制晚期PCA,但随后的耐药机制允许肿瘤细胞继续生长,需要采取替代方法。这项研究深入研究了不同PCA亚型的特定代谢依赖性,并探讨了结合雄激素受体(AR)抑制(ARN具有线粒体复合物I抑制(IACS))的潜在协同作用。我们检查了正常前列腺上皮细胞(PNT1A),雄激素敏感细胞(LNCAP和C4-2)的代谢行为以及与雄激素独立的细胞(PC-3)使用ARN,IACS或组合时。结果发现了跨PCA亚型的不同线粒体活性,雄激素依赖性细胞表现出增强的氧化磷酸化(OXPHOS)。在多个PCA细胞系中,ARN和IACS辅助细胞增殖的结合。细胞生物能分析表明,IACS减少了OXPHOS,而ARN阻碍了某些PCA细胞中的糖酵解。另外,送乳糖补充破坏了代谢重编程引起的补偿性糖酵解机制。值得注意的是,葡萄糖抑制条件提高了PCA细胞对线粒体抑制的敏感性,尤其是在抗性PC-3细胞中。总体而言,这项研究阐明了PCA中AR信号传导,代谢适应性和治疗耐药性之间的复杂相互作用。这些发现提供了对亚型特异性代谢纤维文件的有价值的见解,并提出了一种有前途的策略,通过利用其代谢脆弱性来靶向PCA细胞。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2025年3月5日。 https://doi.org/10.1101/2025.03.03.03.641170 doi:Biorxiv Preprint
摘要目的:用脑部计算机界面系统对运动皮层激活进行神经反馈训练可以增强中风患者的恢复。在这里,我们提出了一种新方法,该方法训练与运动性能相关的静止状态功能连接,而不是与运动相关的激活。方法:使用神经反馈和源功能连通性分析和视觉反馈,将十个健康受试者和一名中风患者在其手运动区域和其他大脑之间受过训练的α波段连贯性。结果:十分之一的健康受试者中有7个能够在一次疗程中增加手运动皮层和其他大脑其他大脑之间的α波段连贯性。慢性中风的患者学会了增强其受影响的原发性运动皮层的α波段连贯性,该病神经皮层在一个月内应用了一个月。连贯性在靶向运动皮层和α频率中特别增加。这种增加与中风后运动功能的临床有意义且持久的改善有关。结论:这些结果提供了概念证明,即对α波段连贯性的神经反馈训练是可行的,并且在行为上是有用的。意义:该研究提供了证据表明α波段在运动学习中的作用,并可能导致新的康复策略。1简介大脑界面(BCI)的技术可以监测大脑活动和生成有关活动模式特定变化的实时输出。这特别显示了有关感觉运动节奏(SMR)的表明。记录的受试者会收到有关与他/她的努力相关的神经活动的反馈,因此可以学会自愿调节大脑活动(Kamiya,1969)。SMR对应于α和β频率(〜8-30 Hz)中感觉运动皮层中神经元基的活性,这被真实或想象中的运动抑制(Arroyo等,1993; Pfurtscheller等人,2006年)。人类自愿调节SMR的能力导致BCI的发展用于运动替代,即控制假体和机器人设备(Galan等,2008; McFarland等,2008)。BCI技术的最新应用包括通过反馈训练大脑模式。在神经居住中,神经反馈的兴趣主要在于它可能改善脑部病变患者恢复的潜力(Birbaumer等,2007; Daly等,2008)。运动康复的神经反馈主要旨在训练SMR调节(Buch等,2008; Broetz等,2010; Caria等,2011; Ramos-Murguiarlday等,2013),因此可以看作是对运动成像训练的支持(Mattia等人(Mattia等,2012)。
微生物组越来越被认为是健康的关键因素。肠道菌群通过一系列不同的代谢物调节17个肠道稳态。例如,饮食纤维的微生物发酵产物(SCFAS)等分子已经建立了19个分子,以反映微生物组和/或饮食转移,而SCFAS的变化已有20种与来自癌症的多种胃肠道疾病有关。尽管具有21种生物标志物的潜力,但粪便收集的技术挑战的临床翻译有限。在这里,我们22个粪便擦拭(s'wipe),这是一种使用无毛,质量23光谱兼容纤维素湿巾作为厕纸的超低成本粪便收集方法。标本保存在乙醇24中,无需冷藏,可以通过常规邮件运送。质谱分析25表明,S'Wipe捕获了具有可重现性26的挥发性和非挥发性代谢物,并且对诊断相关的分子进行了验证。我们表明,s'wipe在指导凳子收集方面的性能等效27,从而可以与28个现有研究进行可互换的使用和比较。这种方法非常适合大规模的人群研究,29次纵向跟踪和个性化医学应用。30
摘要目的:评估自身免疫性脑炎儿童(AE)儿童的临床谱,治疗和结果。研究设计:描述性研究。研究的地点和持续时间:2017年1月至2021年1月,巴基斯坦卡拉奇Aga Khan大学医院儿科学系。方法论:审查了诊断为AE的儿童的病历,以了解临床特征,治疗细节和结果。基于修改后的兰金量表(MRS)得分在3个月的随访中,将结果定义为良好(0-2)或较差(3-6)。报告性统计数据,并使用逻辑回归来评估与结果相关的预后因素。结果:使用AE鉴定33例患者。13(39.3%)是抗体阳性。抗N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDAR)抗体。行为异常(87.8%),癫痫发作(81.8%),运动障碍(66.6%),精神病症状(63.6%)和Mutism(33.3%)是突出的症状。三十(91%)患者接受了第一线免疫疗法。在14例(48.2%)患者中看到了良好的结果。单变量分析表明,绒毛膜患者的预后差的几率为2.5(95%的置置间隔[CI] 0.37-16.88,p = 0.34)。此外,脑脊液升高(CSF)蛋白的优势比(OR)为8.6(CI 0.88-84.83,p = 0.064)和阳性CSF抗体的抗体为3.7(CI 0.79-17.72,P = 0.095)。死亡率。结论:在出现行为症状和舞蹈的儿童中,需要一个非常低的阈值来诊断AE。尽管CHOREA,CSF蛋白升高和CSF阳性抗体的患者的预后不良差异较高,但P值并未显着。