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World File Search System代谢物
抗菌化合物来自肌细菌的细胞内和细胞外次生代谢物INACC A759
摘要世界卫生组织（WHO）确定了由于抵抗问题而需要开发新抗菌剂的病原体清单；这些包括铜绿假单胞菌，大肠杆菌和金黄色葡萄球菌。此外，分枝杆菌已用于抗菌发现，以解决结核病的增加。在这项研究中，对抗菌活性，继发代谢产物分析和菌株鉴定的优化是在INACC A759上进行的。INACC A759的细胞内和细胞外提取物具有不同的抗菌活性。提取物的最小抑制浓度（MIC）值分别抑制Smegmatis，大肠杆菌和铜绿假单胞菌的生长，分别为50、25和100 µg/ml（细胞内），以及25、25、25、25和100 µg/ml（细胞外）。但是，提取物都不能抑制金黄色葡萄球菌的生长。使用高分辨率 - 质量光谱法（HR -MS）的代谢物分析导致肌动杆菌A759的两种提取物之间的主要化合物差异，即N-乙酰基酰胺（C 10 H 13 NO 2 /179.0945）（2 /179.0945）（24.24％）（24.24％）（24.24％）（24.24％）（24.24％）（24.24％）（palmiteicaliral酸） /273.27034）（86.92％）（细胞外）。基于16S rRNA基因的分子分析，静脉细菌INACC A759与Forh46链霉菌菌株相同。先前尚未报道过抗菌活性和二级代谢物谱。
饮食多酚的肠道微生物代谢物及其在人类健康和疾病中的潜在作用
抽象的多酚在所有植物化学物质中都是最大的化合物组之一。饮食多酚的常见来源是蔬菜，水果，浆果，谷物，全谷物等。由于其原始形式，它们很难被吸收。进行肠道微生物代谢后的饮食多酚形成了可访问和有效的代谢物。多酚和衍生的代谢物都是一组多样化的化合物，这些化合物表现出针对心血管，癌症，氧化应激，炎症和细菌疾病的药理活性。形成的代谢产物有时比母亲多酚更具生物利用和有效性。饮食多酚的肠道微生物代谢的研究引入了以补充饮食形式使用富含多酚食品的新方法。本综述提供了有关各个方面的见解，包括多酚的分类，多酚的肠道微生物介导的代谢，多酚代谢的化学以及多酚肠道微生物代谢物的药理作用。它还表明使用来自海洋来源的多酚用于微生物代谢研究。迄今为止，与海洋多酚相比，对陆生源多酚的肠道微生物代谢进行了广泛的研究。海洋生态系统是一个深刻但部分探索的植物成分来源。其中，食用海藻含有高浓度的多酚，尤其是菲洛丁蛋白。因此，对海藻的微生物代谢研究可以揭示海洋多酚衍生代谢产物的药理潜力。
小檗碱及其代谢物的药理学，它是自然界的奥泽米克还是伊马替尼？
背景：小檗碱是一种天然存在的生物碱，被广泛用于多种健康益处，包括体重管理和代谢紊乱。据报道，小檗碱的主要药理作用是通过激活 AMP 活化蛋白激酶，而其其他临床结果缺乏明确的作用机制。因此，本研究使用成熟的 Insilco 工具评估了小檗碱及其两种主要代谢物（小檗红碱和药根碱）在人体中的详细药理学。材料和方法：在 SwissTargetPrediction 服务器中确定了小檗碱及其代谢物的靶标，并使用 AutoDock vina 1.2.0 评估了它们的亲和力。使用 PrankWeb：配体结合位点预测工具评估了最高配体受体组合的结合位点。结果：激酶、酶和 A 家族 GPCR 被确定为小檗碱及其代谢物的三大靶标类别。观察到 ROCK2、PIK3CD、KCNMA1、CSF1R 和 KIT 是小檗碱及其代谢物的高亲和力靶点，亲和力值 <4 uM。小檗碱及其代谢物对所有 AMPK 和脂质/葡萄糖调节靶点（LDLR、DDP4 和 PCSK9）的亲和力均为 >10 uM。小檗碱及其代谢物对 ROCK2 的 IC50 值最小（<1 uM），而其其他高亲和力靶点（PIK3CD、KCNMA1、CSF1R 和 KIT）的 IC50 值 <5 uM。结论：多种多样的蛋白质靶点和观察到的新的亲和力靶点（ROCK2、PIK3CD、KCNMA1、CSF1R 和 KIT）为小檗碱及其代谢物在各种疾病条件下的潜在作用机制和治疗效果提供了有价值的见解，值得在合适的功效分析研究中进行验证。
在啮齿动物脑脊液中优化甲状腺激素和极性代谢物的质谱检测
1田纳西州纳什维尔大学范德比尔特大学分子生理与生物物理学系。11 2肌肉能量实验室，NHLBI，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。12 3宾夕法尼亚州立学院宾夕法尼亚州立大学生物化学与分子生物学系，宾夕法尼亚州立大学13号宾夕法尼亚州立大学生命科学研究所，14 4 4 4 4美国爱荷华州爱荷华大学，爱荷华州，爱荷华州，爱荷华州52242，美国52242。15 5美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学系。 16 6加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学。 17 7田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心病理学系，美国37232。 18 8约翰·霍普金斯大学医学院病理学系，美国马里兰州巴尔的摩199 9 9儿科部门。 ，美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学医学中心，圣路易斯大学医学院，密苏里州圣路易斯，密苏里州圣20204，密苏里州，圣路易斯大学医学院。 22 11医学系，范德比尔特大学传染病科，纳什维尔，23 tn，37232，美国。 24 12美国俄勒冈州立大学综合生物学系，俄勒冈州科瓦利斯，俄勒冈州97331，美国。 25 13中央显微镜研究机构，爱荷华州，爱荷华州52242，美国26 14 NIAMS，NIH，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。 27 2815 5美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学系。16 6加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学。17 7田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心病理学系，美国37232。18 8约翰·霍普金斯大学医学院病理学系，美国马里兰州巴尔的摩199 9 9儿科部门。，美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学医学中心，圣路易斯大学医学院，密苏里州圣路易斯，密苏里州圣20204，密苏里州，圣路易斯大学医学院。 22 11医学系，范德比尔特大学传染病科，纳什维尔，23 tn，37232，美国。 24 12美国俄勒冈州立大学综合生物学系，俄勒冈州科瓦利斯，俄勒冈州97331，美国。 25 13中央显微镜研究机构，爱荷华州，爱荷华州52242，美国26 14 NIAMS，NIH，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。 27 28，美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学医学中心，圣路易斯大学医学院，密苏里州圣路易斯，密苏里州圣20204，密苏里州，圣路易斯大学医学院。22 11医学系，范德比尔特大学传染病科，纳什维尔，23 tn，37232，美国。24 12美国俄勒冈州立大学综合生物学系，俄勒冈州科瓦利斯，俄勒冈州97331，美国。25 13中央显微镜研究机构，爱荷华州，爱荷华州52242，美国26 14 NIAMS，NIH，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。27 28
创伤性脑损伤患者的循环代谢物谱和磁共振成像指标的综合分析
1 厄勒布鲁大学医学院，702 81 厄勒布鲁，瑞典；ilias.thomas@oru.se 2 图尔库大学和奥博学术大学图尔库生物科学中心，FI-20520 图尔库，芬兰；alex.dickens@utu.fi 3 图尔库大学医院临床神经科学部、神经外科和康复及脑外伤科，FI-20520 图尔库，芬兰；jussi.posti@utu.fi 4 图尔库大学医院图尔库脑损伤中心，FI-20520 图尔库，芬兰；mehmoh@utu.fi(MM)；riikka.takala@gmail.com (RSKT)； Olli.Tenovuo@tyks.fi(OT) 5 图尔库大学临床神经科学系，FI-20520 图尔库，芬兰 6 伦敦帝国理工学院计算系，伦敦 SW7 2AZ，英国；ledig.christian@gmail.com 7 图尔库大学医院和图尔库大学围手术期服务、重症监护医学和疼痛管理，FI-20520 图尔库，芬兰 8 厄勒布鲁大学化学系，702 81 厄勒布鲁，瑞典；tuulia.hyotylainen@oru.se * 通讯地址：matej.oresic@oru.se；电话：+ 46-76-9464459
具有全面等离子体和细胞的代谢组学工作流程的极性代谢物的定量分析
将定量分析与Hilic Polar代谢组学工作流程中的新第4代6495 LC/TQ结合在一起。靶向代谢组学方法提供了具有较大动态范围的代谢物的敏感而精确的测量。先前描述的是使用带有细胞或等离子体的Bravo样品制备平台的Hilic Polar代谢物工作流程，1290个Infinity II Bio LC，用于改善金属敏感分析物的性能，以及6495 LC/TQ质谱仪，具有〜500极性代谢物的数据库和保留时间（图1）。1 6495 LC/TQ的速度允许在同一注射中精确地分析以正离子模式和负离子模式的数百个分析物。此工作流程和数据库可以通过多种方式部署，从代谢物途径发现（分析）到样本中数百个分析物的半定量分析，或者使用同位素标记的内部标准品进行绝对定量。
二级代谢物具有由高海拔热液系统嗜热细菌产生的抗菌活性
嗜热微生物具有多种适应性在高温下繁殖的适应性，这反映为蛋白质和可热稳定分子的生物合成，隔离和培养代表了巨大的挑战，因此，高吞吐量测序可以使整个细菌基因组的筛查能够筛选出功能潜力，从而为识别和成本化的培养物进行识别，以识别鉴定和成本化的培养物。在这项研究中，我们从Atacama沙漠中的微生物垫中分离了两个与芽孢杆菌LB7和链霉菌LB8相对应的嗜热细菌菌株。通过结合基因组挖掘，靶向培养物和生化特征，我们旨在确定其与抗菌特性合成生物活性化合物的能力。此外，我们确定了在受控的体外测定下产生生物活性化合物的能力，并通过通过薄层色谱/质谱法（TLC/MS）确定其质量来检测。总体而言，这两种分离株都可以产生抗菌剂（例如，粘胺C副产物）和抗氧化剂（例如二羟基丙氨酸，酰胺生物素和黄酮副产物）化合物。Bacillus LB7菌株具有更多样化的曲目，其中51.95％的总代谢产物无与伦比，而链霉菌LB8主要偏爱抗氧化剂，但未分类的化合物中有70％以上，突显了研究和阐明新颖化合物结构的必要性。基于这些结果，我们假设未经文化或
免疫细胞与结直肠癌风险之间的因果关系及代谢物介质：孟德尔随机化研究
1 重庆医科大学附属第一医院临床分子医学检测中心，重庆，2 重庆医科大学附属第一医院重庆市分子肿瘤学与表观遗传学重点实验室，重庆，3 重庆医科大学脑科学与疾病研究所，重大脑疾病与衰老研究教育部重点实验室，重庆，4 重庆医科大学附属永川医院肿瘤科，重庆，5 高州市人民医院乳腺外科，高州，6 德国慕尼黑路德维希·马克西米利安大学普通外科、内脏外科和移植外科，7 重庆医科大学附属第一医院生物库中心，重庆，
五旬节途径形成所有必需代谢物的能力为代谢的起源提供了线索
在所有生命系统中的代谢网络的显着保护表明，代谢的基本结构是在地球上最早的生命阶段建立的，至少在40亿年前出现。在现代生物体中，代谢网络跨越了数百种具有数千种不同代谢物的酶[1]。在该网络中，“分解代谢”和“合成代谢”反应，即累积或分解代谢产物的反应是相互交织的，这意味着早期的代谢含有两种异植物的特征（即，胞外代谢物）和自身植物（即自我自我sysysysessiss）的特征（即对细胞外代谢物）和自身植物的消耗。在关于这种保守的基本结构的起源的竞争假设中，人们越来越多地认为，该网络来自非酶反应序列，至少部分由铁（Fe（II））和其他金属离子催化剂驱动[2-4]。在该模型中，早期酶已经是基于氨基酸的，并且是通过加速和增加非酶反应的特异性来选择的[5-8]。一个模型将非偶氮反应序列放置在代谢网络的根部也克服了“最终产品问题”，它描述了多步骤，酶促反应序列需要一个前体才能进化：形成Intermediate的酶不能直接选择Darwinian进化，因为它们不提供任何优势，因为它们不提供底层步骤，因此选择了9个功能，因此可以选择 - 因此，它可以选择 - 并选择了''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''的确，关于金属离子在代谢进化中作用的证据正在增长。即使在没有酶的情况下，金属离子也会通过互转换反应（例如参与糖酵解的互转换反应，五旬节磷酸盐途径（PPP））以及氧化和还原性的KREBS循环[2，3]。最近的研究表明，大约90％的代谢途径取决于现代生物中的金属离子[10]，该铁被回收为最多的