XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System代谢的
一个多尺度时空模型，包括从有氧运动到厌氧代谢的转换，可再现早期婴儿肠道微生物群的继任
摘要人类肠道菌群在出生后立即形成，对宿主的健康很重要。在第一个日子里，师生的细菌种类通常占主导地位，例如肠杆菌科。这些由严格的厌氧物种（尤其是双杆菌种类）继承。早期过渡到双杆菌物种与健康益处有关；例如，双杆菌物种抑制病原竞争者的生长并调节免疫反应。替代多杆菌被认为是由于辅助厌氧菌（包括肠杆菌科）在新生儿中存在于新生儿中的氧氧氧气所致。为了研究过渡到双杆菌物种的氧气耗竭，我们在这里引入了一个多尺度数学模型，该模型考虑了代谢，空间细菌种群动力学和交叉进食。使用Agora Collection的公开代谢网络数据，该模型从头开始模拟了严格和某些厌氧物种在肠道和氧气影响下的肠道状环境中的竞争。该模型预测，新生婴儿的殖民地内氧的个体差异可以解释观察到的与厌氧物种，尤其是双杆菌物种的术中观察到的个体变异。双杆菌种类通过使用双杆分流器在模型中变为模型，这使双杆菌可以切换为次优屈服代谢，并在高乳糖浓度下快速生长，如此处使用液压平衡分析。因此，计算模型使我们能够检验婴儿结肠中细菌定植和继承的假设的内部合理性。
癌症治疗对脂质代谢的影响
动脉粥样硬化性心血管疾病对癌症患者构成越来越大的威胁。毫不奇怪，癌症靶向疗法与代谢失调有关，包括局部和全身脂质代谢的变化。因此，肿瘤发展和癌症治疗与胆固醇代谢密切相关，可能是导致该人群心血管发病率和死亡率增加的原因。化疗药物通过多种机制影响脂质代谢。在这篇综述中，我们重点介绍了将常用细胞毒性疗法与胆固醇代谢联系起来的机制和临床证据，以及限制该患者群体动脉粥样硬化风险的潜在机会。更好地了解动脉粥样硬化、癌症治疗和胆固醇代谢之间的联系可能会为癌症患者提供最佳的脂质治疗，并减轻心血管疾病负担。
通过CPI-613的联合治疗和乳酸代谢的抑制剂靶向胰腺癌
胰腺癌是癌症死亡的第四个主要原因，5年生存率为10％。过去几十年中停滞的高死亡率突出了对创新治疗方法的需求。胰腺肿瘤追求改变的新陈代谢，以在低营养涌入和低氧条件下进行能量产生。因此，针对这些代谢策略可能是胰腺癌的合理治疗方法。一种有前途的药物是CPI-613，这是三盒ylic酸周期的两个酶的有效抑制剂。本研究评估了CPI-613在甲状腺素，乳酸脱氢酶抑制剂或α-Cyano-4-4-羟基霉素的抗癌性疗效，一种单核酸转运蛋白的抑制剂。两种组合疗法的功效在一个人和两种鼠胰腺癌细胞系和原位胰腺癌模型中的体外进行了测试。通过MRI和18 F-FDG PET-CT评估肿瘤进展。 两种组合治疗均在体外表现出对胰腺癌细胞增殖和细胞死亡诱导的显着抑制作用。 在体外结果中，两种组合疗法均未显着降低体内肿瘤的生长。 体外结果表明，对不同代谢途径的综合抑制可能是癌症治疗的一种有希望的方法。 但是，体内实验表明，施用较高的剂量或使用针对这些代谢途径的其他药物可能更有希望。肿瘤进展。两种组合治疗均在体外表现出对胰腺癌细胞增殖和细胞死亡诱导的显着抑制作用。在体外结果中，两种组合疗法均未显着降低体内肿瘤的生长。体外结果表明，对不同代谢途径的综合抑制可能是癌症治疗的一种有希望的方法。但是，体内实验表明，施用较高的剂量或使用针对这些代谢途径的其他药物可能更有希望。
增加谷物摄入量和减少咖啡摄入量可增加大脑体积：共同的遗传决定因素及其对认知和新陈代谢的影响
目前尚不清楚不同的饮食如何影响人类大脑发育，以及遗传和环境因素是否发挥作用。我们调查了英国生物库 18,879 名健康成年人的饮食效应，发现咖啡和谷物摄入量之间存在反相关的全脑灰质体积 (GMV) 关联模式，这与它们的反相关遗传结构一致。孟德尔随机化方法进一步表明，较高的咖啡摄入量对总 GMV 减少存在因果关系，这可能是通过调节负责大脑突触发育的基因表达来实现的。已确定的遗传因素可能通过谷物/咖啡摄入的介导进一步影响人们的生活习惯和身体/血脂水平，而 CPLX3 基因的全脑表达模式可能是咖啡/谷物摄入量和认知功能之间共享的 GMV 关联模式的基础。CPLX3 是调节皮质发育和可塑性的亚板神经元的专用标记。所有主要发现都已成功复制。因此，我们的研究结果表明，高谷物和低咖啡饮食具有相似的大脑和遗传结构，从而对认知、体重指数 (BMI) 和其他代谢指标具有长期有益的关联。鉴于 BMI 较高的 COVID-19 患者的预后较差，这项研究对公共卫生具有重要意义，尤其是在疫情期间。
整合生理相关的光合能流入光驱动代谢的整个基因组模型
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2021年11月4日发布。 https://doi.org/10.1101/2021.11.11.04.467239 doi：Biorxiv Preprint
增加谷物摄入量和减少咖啡摄入量可增加大脑体积：共同的遗传决定因素及其对认知和新陈代谢的影响
作者：康菊娇 MSc 1,2,3†、贾天野博士 2,3,4†*、焦泽宇 MSc 1,2,3、沉春博士 2,3、谢超 MSc 2,3、Wei Cheng 博士 2,3、Barbara J Sahakian DSc 2,3,5,6*、David Waxman 博士 2,3、冯剑峰 博士1,2,3,7,8* 5
一碳代谢的影响 -
1医学创新与转化研究中心，大阪大学医学院医学数据科学系，伊萨卡伊萨卡，山道卡2-2，大阪565-0871，日本； takey8729@gmail.com（y.t。）; rchijimatsu@cfs.med.osaka-u.ac.jp（r.c.）; t.arai@unitech-op.com（T.A.）; toru@kyowakai.com（T.K.）; oof21443@ideacon.co.jp（k.o.）; yabumoto.masami@gmail.com（M.Y。）; hirotsu@hbio.jp（t.h.）2日本大阪大学医学院研究生院胃肠道手术系565-0871； heguchi@gesurg.med.osaka-u.ac.jp（H.E.）; ydoki@gesurg.med.osaka-u.ac.jp（y.d。）3罗马大学“ Sapienza”临床和分子医学系，Santo Andrea医院，Di Grottarossa，意大利罗马1035-00189； Andrea.vecchione@uniroma1.it 4 Unitech Co.，Ltd.，Kashiwa 277-0005，日本5 Kyowa-Kai医学公司，大阪540-0008，日本6食品和生命科学实验室，Prophoenix Division，Idea Consegants，Indeaka 559-85519-KINSHU，Prophoenix divist 558-0041，日本8 Hirotsu Bio Science Inc.，东京107-0062，日本 *信件：hishii@gesurg.med.osaka-u.ac.ac.jp;电话。 ： +81-（0）6-6210-8406（Ext。 8405）;传真： +81-（0）6-6210-84073罗马大学“ Sapienza”临床和分子医学系，Santo Andrea医院，Di Grottarossa，意大利罗马1035-00189； Andrea.vecchione@uniroma1.it 4 Unitech Co.，Ltd.，Kashiwa 277-0005，日本5 Kyowa-Kai医学公司，大阪540-0008，日本6食品和生命科学实验室，Prophoenix Division，Idea Consegants，Indeaka 559-85519-KINSHU，Prophoenix divist 558-0041，日本8 Hirotsu Bio Science Inc.，东京107-0062，日本 *信件：hishii@gesurg.med.osaka-u.ac.ac.jp;电话。： +81-（0）6-6210-8406（Ext。8405）;传真： +81-（0）6-6210-8407
多种筛查方法显示HDAC6是三阴性乳腺癌中糖酵解代谢的新型调节剂
三阴性乳腺癌（TNBC）是乳腺癌的亚型，没有靶向治疗。不幸的是，多达70％的TNBC患者会产生对治疗的抗药性。对化学抗性的已知贡献者是线粒体凋亡信号传导功能失调。我们设置了一个表型小分子筛选，以揭示与线粒体凋亡无关的TNBC细胞中的脆弱能力。使用功能遗传方法，我们确定了“命中”化合物BAS-2具有与组蛋白脱乙酰基酶抑制剂（HDAC）的潜在相似作用机理。一种体外HDAC抑制剂测定法证实了该化合物选择性抑制HDAC6。使用最新的乙酰基团质谱法，我们确定了TNBC细胞中HDAC6的糖酵解底物。我们证实，HDAC6的抑制作用或敲除体外和体内都会降低糖酵解代谢。通过一系列公正的筛选方法，我们确定了HDAC6在调节糖酵解代谢中的先前未鉴定的作用。
PDK1-4对肿瘤能量代谢的影响，...
从氧化磷酸化（OXPHOS）到糖酵解的代谢转移（称为Warburg效应）是许多癌症的特征。它使癌细胞在低氧肿瘤微环境中具有生存优势，并保护它们免受氧化损伤和凋亡的细胞毒性作用。这种代谢转移的主要调节剂是丙酮酸脱氢酶复合物和丙酮酸脱氢酶激酶激酶（PDK）同工型1-4。已知PDK在几种癌症中过表达，并且与不良的预后和耐药性有关。虽然PDK1 - 3的表达是组织特定的，但PDK4表达取决于整个生物体的能量状态。与其他PDK同工型相比，不仅是致癌性，而且还报道了PDK4的肿瘤抑制功能。在肿瘤中拟合高的肿瘤和高脂肪酸合成，PDK4可以具有保护作用。前列腺癌是男性最常见的癌症的情况，使PDK4成为有趣的治疗靶点。大多数工作都集中在具有高糖酵解活性的肿瘤中的PDK上，但很少研究PDK4具有保护性并且非常需要的情况。
致癌机制和白血病和淋巴瘤中代谢的治疗靶向
白血病和淋巴瘤获得了不受约束的细胞生长和增殖的能力，并结合对促进终端分化的分子程序的反应能力的丧失。恶性细胞通过增加从环境中获得营养的获取以及重编程的中介代谢，从而产生快速细胞分裂所需的构件，以使这些分子分解为产生蛋白质，脂质和核酸，这些蛋白质，脂质和核酸含有细胞生物量。这些加速的代谢过程需要以ATP的形式进行能量，并以NADPH的形式降低等效物，而NADPH的形式是生物合成反应和代谢活性癌细胞遇到的缓冲氧化应激。与癌症相关的代谢改变还可以促进直接调节细胞命运和功能的特定代谢产物的积累或塑造，从而将代谢重编程耦合到去分化和茎。本综述将重点介绍白血病和淋巴瘤细胞再现细胞代谢以支持的机制：（1）生物能源，（2）生物量积累，（3）氧化还原平衡和（4）分化阻滞。我们将进一步强调白血病和淋巴瘤代谢的特定途径如何赋予可以抑制生长或促进分化的治疗脆弱性的例子。