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超短激光诱导电子空穴纳米等离子体的双流体等离子体模型
超短激光脉冲是诱导材料改性的有力工具 1–4。特别是在透明电介质中，超短激光脉冲可用于局部修改材料块内的化学结构、折射率、色心密度，光聚合，产生纳米光栅、表面纳米结构或内部空隙。大量应用领域受益于基础性进步：外科和生物医学应用、光子学、微流体学、高速激光制造 2,5–7。将这些应用推进到纳米结构需要数值建模的支持 8。在激光诱导的强场下，束缚电子从价带跃迁到导带 1,9,10，在价带中留下一个空穴。电子-空穴等离子体的粒子在激光场中被加速，通过碰撞电离导致自由载流子密度倍增，并可能产生致密的电子-空穴等离子体。最后，在远大于几皮秒的时间尺度上，材料内部发生热和结构事件 1 。我们的模型侧重于等离子体密度的积累，时间尺度可达几皮秒。已经开发了大量不同的模型来研究超短激光脉冲（约 100 fs）在高强度范围内（约 10 14 W/cm 2 ）在介电体中的传播以及随后的电离。这些模型可分为两类。第一类是几种
BW315_00_961e_MB 信息表 ATMP、其他产品（噬菌体等）和程序临床试验期间的不良反应强制性报告
▪ 捐献期间或捐献准备期间发生的严重事件（包括与为即将进行的捐献而给予患者药品的管理有关的事件）； ▪ ATMP 疑似受到病毒、细菌或其他污染； ▪ ATMP 管理期间发生的严重事件（例如，在需要使用移植产品的手术或注射期间）； ▪ 可能与 ATMP 或其成分（防腐剂、培养基、病毒载体等）或作为产品组成部分的医疗器械或基质的质量缺陷有关的严重事件； ▪ ATMP“不合格” (OOS) 批次的异常放行（《先进治疗药物良好生产规范指南》作为 EudraLex 第 4 卷新的第 IV 部分）。 ▪ 由转基因生物 (GMO) 组成或含有 GMO 的药品释放到环境中、传播给其他人或动物。
工程性动物模型的多余jak2 v617f突变体等位基因负担
多性疾病Vera（PV）是一种慢性骨髓增生性新血浆（MPN），其特征是红细胞过量。超过95％的PV患者疾病是由JAK2 V617F突变驱动的。虽然JAK2 V617F突变小鼠模型为PV生物学提供了机械见解，但这些模型中的大多数呈现出比在PV患者中发现的JAK2 V617F的变体等位基因频率（VAF）高得多的突变细胞负担。因此，当前的PV小鼠模型对PV DE Velopment的最早阶段的了解有限，包括疾病表现所需的最小突变细胞负担是什么。为了避免这些局限性，我们开发了一种使用CRISPR/CAS9同源指导修复（HDR）的PV的工程模型，以使JAK2 V6717F突变突变到人类CD34 +细胞的内源性基因座。Xenograftage靶向细胞进入NSGS小鼠，在体内概括了人类PV病理。我们使用此工具来解决两个问题：（i）生成PV病理所需的最小突变体VAF是什么，并且（ii）起源细胞的发育环境会影响MPN的疾病轨迹。该模型提供了一种有价值的临床前工具，可以在体内测试新的PV疗法，并在主要患者样品受到限制或不可用时研究PV的开发和进展。脊髓增生性肿瘤（MPN）是由造血干细胞和祖细胞（HSPC）中获得的体细胞突变驱动的，其特征是一个或多个髓样谱系的异常增殖。JAK2 V617F突变是MPN的反复驱动器。1,2 MPN可以作为多性心血症垂直（PV；过量的红细胞），必需的血小板细胞（ET；多余的血小板）或骨髓纤维化（MF；骨髓纤维化）。3-5然而，JAK2 V617F突变细胞的负担在患者中差异很大，并且可以诱导VAF非常低的临床表型。6,7在PV中，超过95％的患者将JAK2 V617F作为驱动致病性突变，但在某些患者中，突变负担可能低于3％VAF。 8尚不清楚这种低突变细胞负担如何产生MPN病理。 当前的JAK2 V617F小鼠建模策略利用复古病毒转导，9,10个转基因等位基因，11或遗传敲入（KI）模型。 12,13然而，这些模型中的大多数产生了高JAK2 V617F突变频率，这些突变频率不能准确反映PV患者的克隆轨迹。 为了超越小鼠模型的局限性，我们最近开发了从MPN患者移植CD34 +细胞的方法，以产生患者衍生的异种移植物（PDX）。 在MF的情况下，对患者衍生的CD34 +细胞的异型范围能够传播基因型，表型和关键患者病理，例如PDX中的网状纤维化。 14然而，尝试从PV患者产生PDX的尝试不太成功，植入率很差和可获得的CD34 +细胞数量有限6,7在PV中，超过95％的患者将JAK2 V617F作为驱动致病性突变，但在某些患者中，突变负担可能低于3％VAF。8尚不清楚这种低突变细胞负担如何产生MPN病理。当前的JAK2 V617F小鼠建模策略利用复古病毒转导，9,10个转基因等位基因，11或遗传敲入（KI）模型。12,13然而，这些模型中的大多数产生了高JAK2 V617F突变频率，这些突变频率不能准确反映PV患者的克隆轨迹。为了超越小鼠模型的局限性，我们最近开发了从MPN患者移植CD34 +细胞的方法，以产生患者衍生的异种移植物（PDX）。在MF的情况下，对患者衍生的CD34 +细胞的异型范围能够传播基因型，表型和关键患者病理，例如PDX中的网状纤维化。14然而，尝试从PV患者产生PDX的尝试不太成功，植入率很差和可获得的CD34 +细胞数量有限
大豆中 CRISPR/Cas9 介导诱变产生的 Kunitz 胰蛋白酶抑制剂突变体等位基因的分子标记开发
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 8 月 23 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.08.22.504807 doi：bioRxiv preprint
千的波兰基因组 - 波兰变体等位基因频率的数据库
1 MNM Bioscience Inc.，美国马萨诸塞州剑桥市02142，美国； elzbieta.kaja@gmail.com（e.k. ）; 26adrian.l@gmail.com（A.L. ）; dawid.sielski@mnm.bio（D.S. ）; mateusz.sypniewski@mnm.bio（M.S. ）; wojtaszewska@gmail.com（M.W。 ）; mmaria.stepien@gmail.com（M.S. ）; karolina.lisiak@mnm.bio（K.L.-T。）; fip.wolbach@mnm.bio（F.W. ）; daria.kolodziejska96@gmail.com（D.K. ）; katarzyna.ferdyn@gmail.com（k.f. ）; maciej.dabrowski@mnm.bio（M.D. ）; alicja.wozna@mnm.bio（A.W。 ）; paula.dobosz@gmail.com（p.d. ）; kasia@mnm.bio（K.Z. ）; pawel.zawadzki@mnm.bio（P.Z.） 2华沙内政和行政部中央临床医院，波兰华沙02-507； zbigniew.krol@cskmswia.pl（Z.J.K. ）; artur.zaczynski@cskmswia.pl（a.z. ）; agnieszka.pawlak@cskmswia.pl（A.P. ）; robert.gil@cskmswia.pl（R.G. ）; waldemar.wierzba@cskmswia.pl（W.W.）3医学化学与实验室医学系，波兹南医学科学大学，60-101 Poznan，波兰，波兰4 4遗传学和动物育种系，Pozna´n Life Sciences of Pozna´n Life Sciences of Life Sciences，60-637 Poznan，Poland 5波兰； tgambin@gmail.com 6医学遗传学系，母亲和儿童研究所，波兰华沙01-211； Mateusz.dawidziuk@imid.mid.pl 7 Biostatistics Group，Wrocław环境与生命科学大学，波兰弗罗茨瓦夫51-631； tomasz.suchocki@gmail.com（T.S. ）; jszyda@gmail.com（J.S。） ）; anna.bodora@gmail.com（A.B.-T。）; welikowski@wp.pl（W.E.）1 MNM Bioscience Inc.，美国马萨诸塞州剑桥市02142，美国； elzbieta.kaja@gmail.com（e.k.）; 26adrian.l@gmail.com（A.L.）; dawid.sielski@mnm.bio（D.S.）; mateusz.sypniewski@mnm.bio（M.S.）; wojtaszewska@gmail.com（M.W。）; mmaria.stepien@gmail.com（M.S.）; karolina.lisiak@mnm.bio（K.L.-T。）; fip.wolbach@mnm.bio（F.W.）; daria.kolodziejska96@gmail.com（D.K.）; katarzyna.ferdyn@gmail.com（k.f.）; maciej.dabrowski@mnm.bio（M.D.）; alicja.wozna@mnm.bio（A.W。）; paula.dobosz@gmail.com（p.d.）; kasia@mnm.bio（K.Z.）; pawel.zawadzki@mnm.bio（P.Z.）2华沙内政和行政部中央临床医院，波兰华沙02-507； zbigniew.krol@cskmswia.pl（Z.J.K.）; artur.zaczynski@cskmswia.pl（a.z.）; agnieszka.pawlak@cskmswia.pl（A.P.）; robert.gil@cskmswia.pl（R.G.）; waldemar.wierzba@cskmswia.pl（W.W.）3医学化学与实验室医学系，波兹南医学科学大学，60-101 Poznan，波兰，波兰4 4遗传学和动物育种系，Pozna´n Life Sciences of Pozna´n Life Sciences of Life Sciences，60-637 Poznan，Poland 5波兰； tgambin@gmail.com 6医学遗传学系，母亲和儿童研究所，波兰华沙01-211； Mateusz.dawidziuk@imid.mid.pl 7 Biostatistics Group，Wrocław环境与生命科学大学，波兰弗罗茨瓦夫51-631； tomasz.suchocki@gmail.com（T.S.）; jszyda@gmail.com（J.S。））; anna.bodora@gmail.com（A.B.-T。）; welikowski@wp.pl（W.E.）8波兰国家动物生产研究所，32-083 BALICE 9遗传学与生物技术研究所，华沙大学生物学学院，波兰02-106； p.golik@uw.edu.pl 10弗雷德里克·肖邦省专业医院血液学系，波兰35-055rzeszóW，11. m.mroczek888@gmail.com 12 Department of Infectious Diseases, Medical University of Lublin, 20-059 Lublin, Poland 13 Department of Sports Medicine, Medical University of Lublin, 20-059 Lublin, Poland 14 Medical and Science Sp. z o.o., 08-455 Podebłocie, Poland 15 Institute of Human Genetics Polish Academy of Sciences, 60-479 Poznan, Poland 16 Faculty of Physics, Adam Mickiewicz University, 61-614 Poznan, Poland 17 Department of Internal Medicine, J ó zef Stru´s Multidisciplinary Municipal Hospital, 61-285 Poznan,波兰； marcin.zytkiewicz@gmail.com（M。Z. 18波兰科学学院Mossakowski医学研究中心，波兰华沙02-106，191-091华沙大学临床中心血液学，移植和内科，波兰，波兰 *通信 *通信：Pawel.sztromwasser@mnm.mm.bio†这些授权撰稿人。8波兰国家动物生产研究所，32-083 BALICE 9遗传学与生物技术研究所，华沙大学生物学学院，波兰02-106； p.golik@uw.edu.pl 10弗雷德里克·肖邦省专业医院血液学系，波兰35-055rzeszóW，11. m.mroczek888@gmail.com 12 Department of Infectious Diseases, Medical University of Lublin, 20-059 Lublin, Poland 13 Department of Sports Medicine, Medical University of Lublin, 20-059 Lublin, Poland 14 Medical and Science Sp.z o.o., 08-455 Podebłocie, Poland 15 Institute of Human Genetics Polish Academy of Sciences, 60-479 Poznan, Poland 16 Faculty of Physics, Adam Mickiewicz University, 61-614 Poznan, Poland 17 Department of Internal Medicine, J ó zef Stru´s Multidisciplinary Municipal Hospital, 61-285 Poznan,波兰； marcin.zytkiewicz@gmail.com（M。Z.18波兰科学学院Mossakowski医学研究中心，波兰华沙02-106，191-091华沙大学临床中心血液学，移植和内科，波兰，波兰 *通信 *通信：Pawel.sztromwasser@mnm.mm.bio†这些授权撰稿人。