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hh scomation：在高级...
scomation可以鉴定单细胞数据集中的体细胞单核苷酸变体（SNV），而无需匹配的参考样品，从而提供了一种新的研究体细胞诱变方法。这种能力对于分析具有固有复杂性的细胞类型和样品特别有价值，例如分化细胞和多克隆组织表现出明显的遗传异质性，例如癌细胞。值得注意的是，与现有的管道相比，SCOMAT在单细胞数据中检测体细胞SNV时表现出了卓越的性能，从而促进了癌细胞和非癌细胞中突变过程的探索。
利用基于 CRISPR/Cas9 的转录调控系统进行细胞重编程
多年来积累的有关细胞分化机制的数据推动了细胞重编程的发展——这是生物技术的一个全新策略。将体细胞恢复到多能状态甚至将一种体细胞类型直接转换为另一种体细胞类型（转分化）的能力已成为细胞生物学的一项重要突破，因为它广泛应用于从基础研究到再生医学和遗传疾病治疗。早期的重编程技术，如体细胞核移植 (SCNT) 和细胞融合，大约 60 年前首次实施，证实了体细胞的分化状态是可以逆转的（Briggs 和 King，1952 年；Köhler 和 Milstein，1975 年）。尽管这些技术适用于多种应用（Köhler 和 Milstein，1975 年；Lee 等人，2016 年），但对于大多数现代重编程目的而言，它们仍然过于随机和不可控。重编程的下一个级别是在体细胞中外源性过度表达转录因子 (TF)。Takahashi 和 Yamanaka (2006) 在他们著名的将体细胞重编程为诱导多能干细胞 (iPSC) 的实验中使用了这种方法。TF 的过度表达仍然是改变细胞命运的最常见和最有效的方法。如今，存在多种技术可以实现这种改变。其中之一可能是 CRISPR/Cas9 — 一种基于细菌抗病毒防御系统的基因工程工具（Hsu 等人，2014 年）。该系统经过多次修改，不仅允许 DNA 编辑，还可以通过激活、抑制甚至染色质重塑等不同方式调节基因表达。
葡萄牙转移性前列腺癌患者中体乳腺癌基因（BRCA）1和2病原变异的流行
目前，多腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂用于治疗与同源重组修复缺乏有关的基因中的体细胞或种系致病变异的转移性前列腺癌（MPC）患者。因此，建议对这些变体进行测试，因为测试结果可能对系统治疗具有影响。，在临床实践中最相关的是乳腺癌基因（BRCA）1和2。尽管没有公布有关MPC葡萄牙患者种系和体细胞变异率流行的数据，但长期以来，从业人员认为这些患者的体细胞BRCA1/2变体的患病率远低于先前研究的人群。为了估计致病性BRCA1/2变体的流行率，我们拟合了贝叶斯分层模型，该模型与经过普遍测试的转移患者的数据和来自国际同伙的数据。所有42例测试的患者均为体细胞BRCA1/2病原变异。此后期估计值为3.1％（95％的可信度间隔为0.3-10.3％），我们发现不同人群的患病率之间存在很大的分散体。此估计值远低于其他已发表的队列中的估计值。我们认为，测试建议应针对特定国家特定的流行量。因此，我们将继续在研究环境中进行普遍测试，以减少估计值的不确定性，并更好地确定普遍体细胞测试在葡萄牙人群中的作用。
多莉诞生二十五年后 - 生殖杂志
一个多世纪以来，科学界一致认为，终末分化细胞的细胞核无法控制后代的发育。多莉的诞生推翻了这一理论，多莉是第一只使用成年体细胞作为核供体通过核移植产生的动物。随着这一范式转变，各种各样的动物都通过体细胞核移植被克隆出来。再加上现代基因组工程技术，体细胞核移植已成为生产转基因农场动物的首选方法。这为研究基因功能开辟了新的机会，并促成了各种人类状况和疾病的动物模型的建立，或改善了牲畜的健康。生殖 (2021) 162 F1–F10
药物行业不良药物反应报告要求的指南
2“高级治疗产品”是指以下任何用于人类使用的产品 - （a）基因治疗产品； （b）体细胞治疗产品； （c）组织工程产品。在《药学和毒药条例》第2节中列出了基因治疗产物，体细胞治疗产物和组织工程产品的定义。138。
SEMM：体细胞工程小鼠模型。一种用于基础和转化研究的体内疾病建模的新工具
尽管经过多年的临床前测试，大多数实验性肿瘤疗法在临床开发过程中都失败了。这就引出了一个问题：目前用于评估肿瘤疗法的临床前模型是否充分反映了患者的异质性和对治疗的反应。大多数临床前工作都是基于异种移植模型，其中肿瘤错误定位和缺乏免疫系统是将许多观察结果从临床前模型转化为患者的主要限制因素。基因工程小鼠模型 (GEMM) 具有更准确地重现疾病模型的巨大潜力，但其成本和复杂性阻碍了它们在发现、早期或晚期药物筛选计划中的广泛应用。由于 CRISPR/Cas9 系统的发现和开发，基因组编辑技术的最新进展为通过直接突变感兴趣的器官或组织区室中的体细胞基因组来生成与疾病相关的动物模型提供了机会。 CRISPR/Cas9 的出现不仅有助于生产传统的 GEMM，而且还使得人们能够绕过这些昂贵的菌株的构建。在这篇综述中，我们将体细胞工程小鼠模型 (SEMM) 描述为一种新的模型类别，其中特定的致癌特征被引入出生后动物的目标器官的体细胞中。此外，SEMM 代表了一种进行体内功能基因组学研究的新平台，这里将其定义为 DIVoS（直接体内筛选）。
FEP 医疗政策手册
2.04.02 - 遗传性乳腺癌/卵巢癌综合征和其他高危癌症的种系基因检测（BRCA1、BRCA2、PALB2） 2.04.08 - 林奇综合征和其他遗传性结肠癌综合征的基因检测 2.04.101 - 李-法美尼综合征的基因检测 2.04.111 - 前列腺癌管理的基因表达分析和蛋白质生物标志物 2.04.115 - 用于选择靶向癌症疗法的综合基因组分析 2.04.141 - 用于癌症管理的循环肿瘤DNA和循环肿瘤细胞（液体活检） 2.04.151 - 乳腺癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（BRCA1、BRCA2、PIK3CA、Ki- 67、RET、 2.04.157 - 免疫检查点抑制剂治疗的体细胞生物标志物检测（BRAF、MSI/MMR、PD-L1、TMB） 2.04.33 - 用于前列腺癌诊断和癌症风险评估的基因和蛋白质生物标志物 2.04.45 - 非小细胞肺癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（EGFR、ALK、BRAF、ROS1、RET、MET、KRAS） 2.04.53 - 转移性结直肠癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（KRAS、NRAS、BRAF 和 HER2） 2.04.77 - 体细胞基因检测以选择黑色素瘤或神经胶质瘤患者进行靶向治疗（BRAF） 2.04.88 - PTEN 基因检测错构瘤综合征 2.04.93 - 使用下一代测序的遗传癌症易感性面板 5.01.122- Vitgrakvi (Iarotrectinib) 5.21.134- Rozlytrek (entrectiinib)
体细胞基因编辑可改善猪和人类杜氏肌营养不良症模型中的骨骼和心肌衰竭
作者贡献 CK、EW 和 WW 设计了猪研究。MK、VZ、NK、BK 和 EW 生成了 DMD 猪并饲养了该群体。LF、AB、KK、RH 和 CK 进行了猪的转导、结构和功能分析。PH、CJ 和 EM 进行了高分辨率电生理映射并分析了数据。TB、KK、RH、IJ、KV、VJ、FAR、SR 和 SK 进行了猪组织的表达测定和组织学分析。,. FG、WW 生成了 intein-split Cas9 和 gRNA，HB、AG、SK、GS 和 FG 对 DNA 样本进行了测序和分析以进行基因组编辑和脱靶研究。TB、TZ 和 AW 生成并饲养了 AAV9 载体。SL、TZ 和 MO 在体外和体内引入了 G2 优化。AS 生成并分析了 dTomato 猪以进行 AAV-Cre 转导。 AM 和 K.-LL 构思并监督了 iPSC 研究，并提供了资金支持。ABM、DS、TH 和 SS 使用 iPSC 及其肌肉衍生物进行了所有实验。BC 生成、表征和分化了 iPSC 系。ABM 生成同源 hDMDΔ51-52 hiPSC。DS、RD 和 TD 分析了数据。TF 和 FF 进行了质谱分析。CMS、AD 和 DS 在心脏切片上进行了体外实验并分析了数据。SK 和 MW 提供了人类患者血液用于重新编程和概念建议。CK 和 AM 撰写了论文。所有作者都对稿件进行了评论和编辑。
局灶性皮质发育不良 I 型和 II 型的基因组学和表观遗传学进展：范围综述
结果：在 1,156 篇候选论文中，有 39 篇符合研究标准并被纳入本综述。新一代测序技术的出现使得在切除的 FCD 组织中检测胚胎皮质发生过程中发生的低水平脑体细胞突变成为可能。哺乳动物雷帕霉素靶蛋白 (mTOR) 信号通路参与神经元的生长和迁移，是 FCD II 发病机制的关键因素。据报道，MTOR 及其激活剂的体细胞功能获得变异以及其相关抑制因子的种系、体细胞和二次打击镶嵌功能丧失变异。然而，FCD I 型的遗传背景仍然难以捉摸，受影响的基因库多种多样。DNA 甲基化和 microRNA 是两种表观遗传机制，它们被证明在 FCD 中具有功能性作用，可能代表分子生物标记。
拉丁伊比利亚髓母细胞瘤的体细胞突变分析和驱动基因的临床影响：迈向精准医疗
髓母细胞瘤 (MB) 是儿童中最常见的恶性脑肿瘤，以其异质性和治疗相关毒性而闻名，迫切需要新的治疗靶点。我们使用 Illumina TruSight Tumor 15 面板分析了 69 例拉丁-伊比利亚分子特征化的髓母细胞瘤中 15 个驱动基因的体细胞突变谱。我们根据变异的临床影响和致癌性对其进行了分类。在患者中，66.7% 为 MB SHH ，13.0% 为 MB WNT ，7.3% 为 MB Grp3 ，13.0% 为 MB Grp4 。在发现的 63 个变异中，54% 被归类为 I/II 级，31.7% 为致癌/可能致癌。我们观察到 33.3% 的病例至少有一个突变。 TP53（23.2%，16/69）是突变最多的基因，其次是 PIK3CA（5.8%，4/69）、KIT（4.3%，3/69）、PDGFRA（2.9%，2/69）、EGFR（1.4%，1/69）、ERBB2（1.4%，1/69）和 NRAS（1.4%，1/69）。约 41% 的 MB SHH 肿瘤表现出突变，TP53（32.6%）是突变最多的基因。I/II 级和致癌/可能致癌的 TP53 变异与复发、进展和较低的生存率有关。PIK3CA 和 KIT 基因中可能可操作的变异是