为了表征HNSCC的蛋白质蛋白质间相(PPI)景观,我们基于从HNSCC肿瘤的癌症基因组图谱分析中鉴定出的分子途径选择了蛋白质。基于具有相对点突变的基因或与HNSCC的先前发表的关联添加了其他细节。pik3ca(编码腓骨phoinonositide 3-激酶的α催化亚基的基因)是HNSCC中最常见的突变癌基因,尽管研究了一些规范性突变,但许多非骨突变的理解较少。我们对三个细胞系进行了质谱净化 - 质谱法(AP-MS)分析,用于HNSCC中经常改变的31个基因以及16个PIK3CA突变。两条线是HNSCC细胞系,带有HNSCC患者的RNA谱曲线,一条是食管,非肿瘤性细胞系。
简单的摘要:癌症和代谢疾病代表了开发和发达国家的主要死亡原因。因此,迫切需要新的诊断和预后目标。neu-1是一种唾液酸酶,通过脱酰化来调节许多膜受体,从而导致受体的激活或抑制。在质膜上,neu-1是弹性蛋白受体复合物的催化亚基。这种唾液酸酶不仅需要由弹性蛋白衍生的肽对几种代谢性疾病介导的生物学作用所必需,而且NEU-1也参与了各种癌症的发展。本综述的目的是描述NEU-1在几种代谢疾病和癌症中的作用,并证明在某些情况下可以将该蛋白视为这两种生理病理学环境之间的联系。因此,NEU-1可以代表治疗假定代谢综合征相关的癌症等常见的药理学靶标,例如结直肠癌,肝细胞和绝经后乳腺癌。
内含子GGGGCC(G 4 C 2)在人C 9 ORF 72基因内的六核苷酸重复膨胀是家族性肌营养性侧面硬化症(ALS)和额叶临时痴呆(FTD)(FTD)的最常见原因(C 9 Als/FTD)。重复相关的非aug(RAN)翻译反复含量C 9 ORF 72 RNA导致神经毒性二肽重复蛋白(DPRS)的产生。在这里,我们开发了一个高通量药物筛选,用于鉴定DPR水平的正和负调节剂。我们发现HSP 90抑制剂Geldanamycin和醛固酮拮抗剂螺内乳酮通过分别通过蛋白酶体和自噬途径促进蛋白质降解,从而降低了DPR水平。令人惊讶的是,营地升高化合物增强蛋白激酶A(PKA)活性提高了DPR水平。 通过药理学和遗传方法抑制PKA活性,在C 9 ALS/FTD的果蝇模型中,细胞中的DPR水平降低并挽救了病理表型。 此外,敲低DPR的PKA催化亚基与降低的翻译效率相关,而PKA抑制剂H 89降低了C 9 ALS/FTD患者衍生的IPSC运动神经元的内源性DPR水平。 一起,我们的结果表明,在C 9 ALS/FTD中调节DPR水平的新途径。令人惊讶的是,营地升高化合物增强蛋白激酶A(PKA)活性提高了DPR水平。通过药理学和遗传方法抑制PKA活性,在C 9 ALS/FTD的果蝇模型中,细胞中的DPR水平降低并挽救了病理表型。此外,敲低DPR的PKA催化亚基与降低的翻译效率相关,而PKA抑制剂H 89降低了C 9 ALS/FTD患者衍生的IPSC运动神经元的内源性DPR水平。一起,我们的结果表明,在C 9 ALS/FTD中调节DPR水平的新途径。
CRISPR-CAS9缺失(CRISPR-DEL)是消除哺乳动物细胞中DNA的领先方法,并为各种基因组编辑的应用提供了基础。靶DNA在非同源最终连接(NHEJ)期间由一对双链断裂(DSB)定义。但是,CRISPR-DEL的低效率导致了费力的实验和错误的负面结果。通过使用内源性报告基因系统,我们表明DNA依赖性蛋白激酶催化亚基(DNA-PKC)的抑制作用(NHEJ的早期一步)会大大增加DNA缺失。这是在各种细胞系,基因递送方法,商业抑制剂和引导RNA中观察到的,包括那些表现出可忽略的活性的RNA。我们进一步表明,DNA-PKCS抑制作用可用于提高合并功能屏幕的灵敏度,并检测否则会忽略的真实阳性命中。因此,延迟NHEJ相对于DSB形成的动力学是增强CRISPR损坏的一种简单有效的手段。
基于核酸酶的基因组编辑的治疗应用将受益于通过同源定向修复 (HDR) 进行转基因整合的改进方法。为了提高 HDR 效率,我们筛选了六种 DNA 依赖性蛋白激酶催化亚基 (DNA-PKcs) 的小分子抑制剂,DNA-PKcs 是替代修复途径非同源末端连接 (NHEJ) 中的关键蛋白,可产生基因组插入/缺失 (INDEL)。从这次筛选中,我们确定 AZD7648 是最有效的化合物。使用 AZD7648 可显著增加 HDR(高达 50 倍)并同时降低各种治疗相关的原代人类细胞类型中不同基因组位点的 INDEL。在所有情况下,HDR 与 INDEL 的比率均显著增加,并且在某些情况下,实现了无 INDEL 的高频 (>50%) 靶向整合。这种方法有可能提高基于细胞的疗法的治疗效果并扩大靶向整合作为研究工具的使用范围。
人乳头瘤病毒阳性 (HPV + ) 扁桃体和舌根鳞状细胞癌 (TSCC/BOTSCC) 是口咽鳞状细胞癌 (OPSCC) 的主要亚型,其预后通常比相应的 HPV 阴性 (HPV - ) 癌症要好,而且其发病率有所增加 ( 1 – 12 )。为了为这些患者开发个性化医疗,人们尝试寻找预后生物标志物,其中大多数(但不是全部)是通过免疫组织化学来确定的 ( 12 – 26 )。然而,通过下一代测序,磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸 3-激酶催化亚基 α (PIK3CA) 和成纤维细胞生长因子受体 3 (FGFR3) 突变在 HPV + TSCC/BOTSCC 中频繁被发现 ( 27 – 29 )。 HPV + TSCC/BOTSCC/OPSCC 中也报告了 FGFR3 过表达,此外,FGFR3 和 PI3K3CA 突变与预后较差有关(29 – 32)。使用 FGFR 和磷酸肌醇 3-激酶 (PI3K) 抑制剂的疗法已用于治疗其他具有 FGFR3 和 PIK3CA 突变的癌症,因此我们测试了 HPV + UM-SCC-47 和 UPCI-SCC-154,以及 HPV -
病毒RNA依赖性RNA聚合酶(RDRP)均编码在所有RNA病毒中,并在病毒RNA复制中起着至关重要的作用。在SARS-COV-2的蛋白质组中,与辅因子NSP7和NSP8一起表达的催化亚基NSP12构成RDRP [8]。RDRP通常由核苷酸类似物抑制剂(NAI)靶向[9]。这类抗病毒药可以通过充当延迟的链终结剂或引起病毒RNA的遗传腐败来抑制复制,其中包括对Covid-19患者治疗的第一个FDA批准的抗病毒药物,Remdesivir [10]和Molnupiravir [11]。NAI的可用性可能在很大程度上取决于代谢激活,并且还与天然核苷三磷酸盐(NTPS)的细胞内池竞争。非核苷酸模拟抑制剂(NNAIS)在与活性的RDRP的活性相结合时不会面临这些挑战,因此它们代表了有希望的NAI替代方案[12]。
§CDKS水平通常是恒定的。§CDK是不活跃的。§cdks通过与细胞周期蛋白结合并受磷酸化和去磷酸化的调节而激活。§CDK将受到G 1,G 2和M检查点的调节。Cyclin-CDK复合物的一个例子是促进因子(MPF,也称为有丝分裂因子 - 促进因子或M期促进因子),该因子由调节亚基-Cyclin b和催化亚基 - Cyclin依赖性激酶(CDK1,CDC2或P34 KINS)组成,该型和P34 KIN酶是刺激的。MPF通过磷酸化有丝分裂过程中所需的多种蛋白质来促进从G 2期进入有丝分裂的入口。MPF在G 2的末尾被磷酸酶酶激活,该酶消除了较早添加的抑制性磷酸组。外部信号生长因子是某些刺激其他细胞分裂的人体细胞释放的蛋白质。密度依赖性抑制 - 拥挤的细胞停止分裂时的现象。锚定依赖性 - 何时必须将细胞分开的现象必须连接到底层。锚固与质膜蛋白有关。
进行了本研究,以研究c-大环亚钠肽(C-ANP 4-23)对人脂肪衍生的干细胞在10天内分化为脂肪细胞的人(1 m m m m)。在存在或不存在C-ANP 4-23的情况下,分别通过QRT-PCR和Western印迹确定了细胞内cAMP,CGMP和蛋白激酶A水平的水平,分别通过QRT-PCR和Western印迹确定蛋白质表达。还确定了脂解和葡萄糖摄取的水平。c-ANP 4-23治疗显着增加了细胞内cAMP水平和葡萄糖转运蛋白4型(GLUT4)和蛋白激酶的基因表达,AMP激活,α1催化亚基(AMPK)。Western印迹显示GLUT4和磷光体A水平的显着增加。重要的是,腺苷酸环化酶抑制剂SQ22536废除了这些影响。此外,C-ANP 4-23增加了葡萄糖摄取2倍。我们的结果表明,C-ANP 4-23增强了葡萄糖代谢,并可能有助于开发基于肽的新代谢疾病疗法。©2016 Elsevier Ireland Ltd.保留所有权利。
(a)SMARCA2和SMARCA4是SWI/SNF复合物的核心催化亚基,它们通过重塑染色质在控制基因表达中起着重要作用。Smarca4在多种癌症中突变,而缺乏Smarca4的癌细胞可以高度依赖Smarca2的生存。因此,使用选择性smarca2降解器在Smarca4删除的癌症中靶向Smarca2会诱导合成的致死性,同时避免Smarca4野生型正常细胞。 (b)具有SMARCA4破坏突变或低表达的细胞系显示较高的SMARCA2基因依赖性评分,表明靶向Smarca2和Smarca4缺陷的合成致死关系; (c)不同类型癌症中SMARCA4突变的百分比。数据集来自混合研究(2021年8月从CBIOPORTAL提取的数据); (d)除了破坏突变(“ Smarca4蛋白的丧失”)之外,一些肿瘤在其ATP结合位点或DNA结合位点附近表达Smarca4热点错义突变,从而可能改变Smarca4的生物学功能。正在研究表达这种突变的癌细胞的敏感性。