XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System免疫诊断
单细胞转录组学揭示了细胞层次结构和1
抽象动机：识别抗原表位在医疗应用中至关重要，例如免疫诊断试剂发现，疫苗设计和药物开发。计算方法可以补充低吞吐量，耗时和代价高昂的表位实验确定。当前可用的预测方法在预测表位上具有适度的成功，这限制了其适用性。表位预测可能会使多个表位位于相同的抗原上，并且完全不可用的实验数据更加复杂。结果：在这里，我们介绍了抗原表位预测程序ISPIPAB，该程序结合了来自两种基于特征方法的信息和一种基于对接的方法。我们证明，ISPIPAB的表现优于其每个分类器以及其他最先进的方法，包括专门为表位预测设计的方法。通过将预测算法与层次聚类相结合，我们表明我们可以有效捕获与可用的实验数据一致的表位，同时还揭示了未来实验研究的其他新颖目标。联系人：raji@yu.edu补充信息：可通过BioInformatics在线获得补充数据。
Weimiao YU PhD
Yu 博士在新加坡国立大学 (NUS) 获得博士学位，主修图像处理和机器视觉。随后，他加入 A*STAR，担任生物信息学研究所 (BII) 成像信息学部门的博士后研究员。2010 年，他转入 IMCB，担任中央成像设施的研究科学家。目前，他是 IMCB 的 CMPL 负责人。他的研究课题是计算图像分析和定量成像信息学。Yu 博士与本地和国际合作者建立了密切的联系。为了促进生物发现，他的研究整合了多个领域的方法，例如图像处理、核机器学习和计算机视觉技术。在过去的几年里，他成功获得了研究经费。他为各种生物项目开发了许多算法/软件包。他还与不同的行业伙伴建立了许多外部合作关系。为了加强机器学习和人工智能在临床诊断/预后中的应用，他与他人共同创立了一家名为 A!maginostic Pte 的生物科技公司。 Ltd. 他与 A!maginostic 和 IMCB 建立了一个联合实验室，用于组织层面的免疫诊断。该平台允许研究人员、临床医生和制药公司分析患者的免疫特征，以用于诊断、预后和药物反应研究。
微生物-12-01151.pdf
在某些分枝杆菌科和麻风分枝杆菌中，结核病的免疫诊断对其在结核病的特异性诊断中的应用造成了限制。因此，为了提高基于 ESAT- 6/CFP 10 的细胞介导免疫 (CMI) 检测的特异性，已将 esx-1 基因座的 RD 1 区域内外基因编码的其他蛋白质评估为 CMI 的候选抗原，以及研究与 ESAT-6 和/或 CFP 10 结合的体液反应，结果具有不同的特异性和敏感性。因此，在本研究中，我们评估了 NCBI 数据库中可用的各种非结核分枝杆菌 (NTM)、分枝杆菌、分枝杆菌和分枝杆菌种基因组，以了解 esx-1 基因座 RD1 区域的存在和组成。此外，我们还通过聚合酶链式反应 (PCR) 和测序对我们培养物保藏中的分枝杆菌科细菌进行检测，以确定编码 ESAT-6 和 CFP 10 的 esxA 和 esxB 基因的存在和序列多样性。全基因组序列 (WGS) 数据分析表明，在已发表的 100 多个除结核病以外的致病性和非致病性分枝杆菌科细菌基因组中，有 70 个存在 RD 1 基因直系同源物。在我们培养物保藏中评估的物种中，除了之前报道的某些分枝杆菌中存在 esxA 和 esxB 之外，还发现败血性分枝杆菌/分枝杆菌、猪分枝杆菌和分枝杆菌属 N845T 也含有这两个基因的直系同源物。仅在 Mycobacterium brasiliensis 、 Mycolicibacterium elephantis 和 Mycolicibacterium fluroantheinivorans 中检测到 esxA 的直系同源物，而在 Mycolicibacter engbackii 、 Mycolicibacterium mageritense 和 Mycobacterium paraffinicum 中仅检测到 esxB 直系同源物。基于 esxA 和 esxB 序列的系统发育分析将缓慢生长的细菌与快速生长的细菌区分开来。这些发现强化了先前的观点，即 esxA 和 esxB 可能在大多数分枝杆菌科中编码。Esx-1 系统在致病性和非致病性分枝杆菌科中的作用需要进一步研究，因为这些物种可能会限制结核病的免疫学检测。
TRM 2025附件XII imementas和建议的参考书目证明...
主题：生物学第一部分 - 生物化学，细胞生物学和活生生，pH和缓冲。氨基酸，蛋白质和蛋白质组学。酶。生物能学。糖酵解。发酵。糖酮发生。糖原的合成和降解。克雷布斯周期。呼吸链和氧化磷酸化。脂质代谢。氨基酸代谢。整合和代谢调节。起源，原核生物和真核细胞的成分和一般特征。化学成分：化学物质维持稳态的功能重要性。动物和植物细胞：组织，代谢，功能以及细胞结构与细胞器之间的相互作用。细胞繁殖：有丝分裂和减数分裂。一般特征。各种生物：五个王国的分类系统，分类类别，物种概念和命名法规则。主要群体的一般特征：病毒，莫奈托，原生物，真菌，植物学和动物II部分 - 组织学，解剖学以及动物以及植物生理学结构和功能概念。组织的胚胎起源。生物的内部和外部解剖学。人类解剖学。生物的比较解剖学。动物和植物组织的主要类型，特征和功能。器官和系统。呼吸和气态交流。循环：气体和养分的运输。营养：营养，消化和吸收；疾病故障。排泄。支持和运动系统。整合机制：神经和内分泌；神经生物学：神经解剖学，神经化学和神经生理学。对环境刺激的反应。繁殖：无性和性。防御系统：细胞和体液免疫机制。先天和获得的免疫力。疫苗，单克隆抗体和免疫诊断。第三部分 - 分子生物学，遗传学和进化基本概念：术语，交叉和概率。mendelism and Neomendelism：单声道和二元主义，polylia，基因相互作用和性遗传。染色体异常。多倍肌，非整倍体，多态性和行为遗传学。细胞遗传学基本原理：遗传密码，基因和染色体。基因工程的概念：克隆，聚合酶链反应（PCR），CRISPR技术，转基因生物，分子诊断和基因治疗。主要理论和进化过程的证据。进化机制。遗传变异性的来源：突变和基因重组。统一漂移，地理障碍，杂交，表观遗传学，自然和人工选择。基因组，转录瘤，基因比对，分子进化。
使用内部血清组检查来自多个商业和 1 实验室平台的 SARS-CoV-2 血清学检测结果 2 3
摘要 严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒 2（SARS-CoV-2）是一种 2019 年发现的新型人类冠状病毒。SARS-CoV-2 感染会导致一种急性、严重的呼吸道疾病，称为 2019 年冠状病毒病（COVID-19）。SARS-CoV-2 的出现和迅速传播已导致全球公共卫生危机，并持续影响全球人口。实时逆转录聚合酶链反应 (rRT-PCR) 是 COVID-19 诊断的参考标准测试。血清学检测是血清监测计划和建立疾病保护相关性的宝贵工具。本研究评估了一种内部酶联免疫吸附试验（ELISA）的性能，该试验利用了 SARS-CoV-2 刺突（S）的预融合稳定胞外结构域，两种市售化学发光试验 Ortho VITROS 免疫诊断产品抗 SARS- CoV-2 总试剂包和 Abbott SARS-CoV-2 IgG 试验以及一种市售替代病毒中和试验（sVNT）、GenScript USA Inc.、cPass SARS-CoV-2 中和抗体检测试剂盒，用于检测 SARS-CoV-2 特异性抗体。使用一组 rRT-PCR 确诊的 COVID-19 患者血清和阴性对照组作为参考标准，所有三种免疫测定法均显示出较高的可比阳性率和较低的不一致率。三种免疫测定法均具有高度敏感性，估计敏感性为 95.4%-96.6%。ROC 曲线分析表明，三种免疫测定法均具有较高的诊断准确度，曲线下面积 (AUC) 值范围为 0.9698-0.9807。常规 54 微量中和试验 (MNT) 滴度与 sVNT 抑制百分比值之间表现出高度正相关性。我们的研究 55 表明，需要进行独立评估以优化血清学检测的整体效用和 56 结果的解释。总体而言，我们证明本研究中评估的所有血清学检测都适用于检测 SARS-CoV-2 抗体。58 59 60 数据摘要 61 62 本研究中未生成新的外部数据、工具、软件或代码。63