线虫秀丽隐杆线虫在其环境中以细菌为食,并已成为微生物组研究的模型生物。然而,尽管在其自然栖息地中存在许多真菌物种,但秀丽隐杆线虫是否以及如何与同时发生的真菌相互作用仍然很大。在这里,我们将酵母Barnettozyma californica与秀丽隐杆线虫的中cosm隔离,并表征其基因组和与线虫的相互作用。我们发现B. californica被秀丽隐杆线虫摄入,可以用作食物来源的唯一,尽管很差。然而,当与大肠杆菌OP50一起使用时,真菌会导致人口增长和觅食行为改变,这表明这种真菌 - 细菌混合物比单独的细菌提供了更好的食物来源。这种效果在不同的天然秀丽隐杆线虫菌株之间有所不同,这表明线虫与加利福尼亚州的相互作用是基因组基础。分离的加州菌菌株的完全组装和注释的基因组并未表明其与秀丽隐杆线虫和/或大肠杆菌OP50相互作用的任何明显的候选基因。总的来说,我们的结果提供了一个有趣的例子,说明了自然相互作用的真菌,细菌和动物之间的复杂性和多层关系。
图 8 LHY1 和 bHLH28 在 SNC1 表达调控中的作用。(a)来自 DAP-seq 数据库的 SNC1 基因座中两个转录因子 LHY1 和 bHLH28 的结合。这是从浏览器图像中重新绘制的。结合用彩色块表示,高度代表检测到的结合水平。(b)野生型或 bon1 中突变体 bhlh28 和 lhy1 的生长表型。植物在 22°C 下 16 小时/8 小时光照下生长。(c)通过定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) 测定 bhlh28 和 lhy1 单突变体和双突变体与 bon1 的相对 SNC1 表达。肌动蛋白被用作参考基因,并将表达水平与 Col-0 进行比较。显示的是三次生物学重复的平均值,误差线表示标准差。不同字母表示基因型之间的统计学显著差异(p < 0.05,学生 t 检验)。(d)LHY1-GFP 和 bHLH28-GFP 与 SNC1 启动子区的染色质免疫沉淀 (ChIP)-qPCR 分析。分别在“A”位点和“B”位点(如 a 所示)检测到 LHY1-GFP 和 bHLH28-GFP 的结合。显示了两个独立生物学重复的数据。“N”位点(如 a 所示)是 SNC1 基因体上的一个区域,在 DAP-seq 数据库中未检测到 LHY1 或 bHLH28 的结合信号。“GFP”是用抗 GFP 抗体孵育的样品,“NoAb”是不含抗 GFP 抗体的样品。不同字母表示通过单因素方差分析(ANOVA)得出的基因型间统计学差异具有显著性(p < 0.05)[彩色图可在 wileyonlinelibrary.com 上查看]
上升节点的本地时间:上午10:30。轨道类型:太阳同步。重复期(Nadir):101天。Revisita期间:4天,卷35°。身高:645,80 km重量:1000 kg
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heliophysics部门的准备好于前所未有:•利用我们独特的机会,与全球的太阳能和太空物理社区合作研究太阳及其在整个地壳中的影响板载空间环境预测所需的功能,用于长期深空探索任务所需的功能。
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