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尿路感染诊断的精确宏基因组学的优势
尿路感染（UTI）是人类常见的人类疾病，一生中至少有近50％的人影响成年女性（Sihra等，2018）。仅在美国，每年有超过100万人患有困难或慢性UTI。在临床环境中，UTI是成人抗生素处方的主要原因之一，它改变了尿路微生物组，并导致抗菌耐药性 - 近年来对公共卫生的重大挑战（McAdams等人，2019年； Finton等，2020年）。另一个重要的考虑因素是，复杂的感染性可以引发有害伤害的全身感染（Neugent等，2020； Kaushik等，2021）。此外，由于对大多数β-内酰胺抗生素的抵抗，UTI的临床管理变得更加困难（Rajabnia等，2019）。毫无疑问，尿路感染性会导致昂贵且无效的治疗和复发性疾病，并引发不良生活质量的结果（Zhang等，2022）。，很可能会有很多UTI诊断挑战来自配对一个矩阵和微生物组，该基质和微生物组有利于大量潜在病原体具有分子测试的当前限制（Mouraviev和McDonald，2018; Lee等人，2020; 2020; Jones-Freeman et; Jones-Freeman et al。，2021）。标准的肝病诊断方法通常是微生物培养和敏感性测试。但是，由于先前的抗生素暴露，敏感性差，难以培养或不可养殖的微生物的诊断产量经常受到影响，因此多达50％的症状女性（Price等，
两名女性出现对称性皮疹
因为它与某些类人猿的红色臀部相似。5 特定部位（如腋窝和腹股沟）出现特征性皮疹，而没有全身症状或粘膜受累，仍然难以解释。我们的两名患者均在 5 月底就诊，那时是意大利相对炎热潮湿的季节，因此体温和摩擦可能有利于部位受累。过去，SDRIFE 被认为是一种全身性接触性皮炎（IV 型迟发型超敏反应），与先前对接触过敏原（如镍、汞或外用抗生素）的致敏有关，随后在摄入或注射相同过敏原后出现反应。2,6 斑贴试验在大约 50% 的患者中呈阳性反应，尽管它不是诊断的必需条件，诊断主要是临床诊断，在排除皮疹的其他原因后。 6 然而，包括我们的两名患者在内的较近期病例表明，SDRIFE 可以在没有先前接触过敏原致敏的情况下发生，而与全身药物给药有关。5 几位作者报告说，常见的致病药物包括某些抗生素（例如β-内酰胺类、磺胺类和大环内酯类）、抗惊厥药（例如卡马西平和苯妥英）和非甾体抗炎药。5,7,8 阿霉素和其他蒽环类药物用于治疗不同的血液系统恶性肿瘤和实体肿瘤，皮肤和粘膜反应相对频繁，包括脱发、粘膜溃疡、丘疹和黄斑疹。9 据我们所知，这是第一例在阿霉素化疗期间报告的 SDRIFE 病例，而阿莫西林以前曾与 SDRIFE 和其他皮疹有关。8
TAG 邮件：2024 年 1 月至 6 月报告、出版物、药物安全累计清单 每两周 TAG 邮件 - 资源列表 2024 年 6 月 20 日
新南威尔士州 TAG 活动 当前的电子邮件讨论 -COVID-19 抗病毒药物的本地协议。截止日期为 2024 年 6 月 28 日 -TGA 拟议的药品标签规则更新反馈。截止日期为 2024 年 7 月 8 日 -实施年轻人从儿科到成人护理的复杂和/或昂贵药物过渡指导原则。截止日期为 2024 年 7 月 12 日 最近完成的电子邮件讨论 -为出院患者提供虚拟药房服务 -Shingrix（7 月 19 日 TAG 大会后更新） 即将推出：关于重症监护药物协议的调查。请联系 Sasha Bennett，邮箱地址为 sasha.bennett@svha.org.au，了解有关任何电子邮件讨论、出版物或即将召开的会议的更多信息。编辑精选 AA：临床决策支持作为预防手术室用药错误的工具 - 链接 AJHP：电子健康记录的评估 药物相互作用定制编辑器 (DICE) - 链接 AJHP：2021 年有关用药过程的实践增强出版物 - 链接 AJHP：重症监护药剂师对最佳实践模式和专业活动优先排序的看法 - 链接 AP：社论：药品的质量使用：现在谁拥有它？ - 链接 AP：减少体弱老年人的抗高血压药物处方 - 链接 BJCP：应对甲氨蝶呤毒性：研究亚叶酸和葡萄糖苷酶的治疗作用 - 链接 BJCP：改进缬更昔洛韦在实体器官移植中预防的挑战以及治疗药物监测在成人中可能发挥的作用 - 链接 BMJ：更广泛地使用氨甲环酸来减少手术出血可能使患者和卫生系统受益 - 链接 BMJ：探索非劣效性试验中的不同目标 - 链接 BMJ：阿片类药物巨头如何部署剧本来塑造医生的思想 - 链接 BMJ QS：社论：提高成人和儿童的用药安全：需要做些什么？ – 链接 CADTH：英夫利昔单抗用于免疫检查点抑制剂治疗相关毒性 - 链接 CADTH：抗细胞因子疗法和皮质类固醇用于 CRS 和 T 细胞接合剂或 CAR-T 细胞疗法后的神经毒性 - 链接 DrugSaf：与儿童用药错误相关的风险因素 - 链接 EHJ：低剂量阿司匹林用于预防动脉粥样硬化性心血管疾病 - 链接 EHJ：何时应停用心血管药物 - 链接 EJCP：SGLT2 抑制剂相关糖尿病酮症酸中毒的住院病例特征 - 链接 IJCP：描述药剂师对慢性非癌症疼痛护理的干预措施 - 链接 JAGS：药物审查和停用对老年住院患者的临床影响 - 链接 JAMA：脓毒症或感染性休克成人患者长期与间歇性输注 β-内酰胺类抗生素 - 链接 JAMA：连续与间歇性输注脓毒症危重患者间歇性 β-内酰胺类抗生素输注 - 链接
社区获得性延伸疾病的人口结构...
抗生素耐药性是一个全球性的健康问题，其中产超广谱 β -内酰胺酶的大肠杆菌 (ESBL-Ec) 和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 尤其令人担忧。对从社区中分离出的细菌进行全基因组测序分析对于了解这些多重耐药细菌的传播至关重要。我们的主要目标是确定在法国某个社区环境中分离出的临床 ESBL-Ec 和 MRSA 的种群结构。为此，我们从勃艮第-弗朗什-孔泰地区 6 家私人医学生物实验室的 23 个地点收集了分离株。使用 Illumina 技术对 190 个 ESBL-Ec 和 67 个 MRSA 进行了测序。进行了基因组分析以确定细菌分型、抗生素耐药基因、金属耐药基因以及毒力基因的存在。分析显示，ST131 是该地区的主要 ESBL-Ec 克隆，占 ESBL-Ec 分离株的 42.1%。bla CTX-M 基因占 bla ESBL 的 98%，其中大多数是 bla CTX-M-15 (53.9%)。MRSA 群体主要由 CC8 (50.7%) 和 CC5 (38.8%) 克隆复合体组成。有趣的是，我们发现 MRSA 群体中锌抗性基因 czrC 的流行率为 40%。我们观察到法国地区城市和农村地区的 ESBL-Ec 或 MRSA 群体没有差异，这表明人口密度或农村环境没有影响。
共价化学在靶向蛋白质降解中的应用
用于治疗各种临床适应症，包括癌症、抗感染、胃肠道、中枢神经系统和心血管疾病。1–3 例如，阿司匹林是一种已使用了 100 多年的止痛药，它共价乙酰化环氧合酶-1 (COX-1) 的活性丝氨酸残基，而 COX-1 是一种在前列腺素生物合成中起关键作用的酶。4–6 除阿司匹林外，青霉素类抗生素是另一个经典的共价抑制剂例子，其中 β-内酰胺支架不可逆地与细菌 DD-转肽酶 (也称为青霉素结合蛋白) 的活性位点丝氨酸结合，从而使负责细菌细胞壁合成的酶失活。 7,8 尽管共价药物取得了成功，但在 2013 年首个共价激酶抑制剂依鲁替尼获批之前，共价药物在药物化学和药物开发中一直被忽视。人们之所以不愿使用共价药物，主要是因为人们担心由于反应性混乱、半抗原化和特异性药物相关毒性而导致的潜在脱靶毒性。9–11 研究表明，化学反应性药物代谢物可以与肝脏蛋白共价结合，从而引起肝毒性。12,13 放射性标记研究表明，产生的反应性物质与各种细胞蛋白共价结合，这可能导致细胞毒性。14 在某些情况下，反应性药物代谢物与蛋白质的共价结合可能具有免疫原性，导致患者出现过敏反应。1,15
在英国持久的医院爆发期间检测到的稀有ESBL ST628肺炎肺炎的遗传分析
摘要：对英国遍布医院的爆发的肺炎（K.肺炎）培养，持续了12个月以上。我们试图对爆发菌株进行序列和遗传表征。抗生素敏感性测试（AST）是在从暴发中保存的65 k肺炎分离株上进行的。使用牛津纳米孔技术（ONT）奴才流循环对所有分离株进行了测序：10个分离株，包括2017年最早收集日期的分离株，在Novaseq 6000平台上还测序，以构建高准确性纳米孔 - 小颗粒组件。在测序菌株中，60个键入ST628。96.6％（n = 58/60）ST628菌株具有大约247-kb fib（k）质粒，含有多达11种抗微生物抗性基因，包括扩展的谱β-内酰胺氨基氨基氨基氨基氨基酶（ESBL）基因，BLA CTX-M-15。使用单核苷酸多态性（SNP）键入爆发分离株之间的克隆性。暴发菌株在爆发前6年的2012年与临床ST628菌株有关。在持久的医学医学医学爆发期间，在多个独立的病房中检测到了具有多药抗药性（MDR）质粒的稀有ESBL K.肺炎K2 ST628菌株。建议对这种菌株进行监视，以防止未来的医院暴发。
使用定量抗体方法评估法国医院中产生ESBL的肠杆菌的医生传播
抗菌抗性（AMR）是一个令人震惊的公共卫生威胁。最近的报告并不乐观，并且在全球范围内强调了归因于AMR [1,2]的高度发病率 /死亡率。在2017年，该世卫组织发表了一份详细的优先病原体清单，包括产生扩展的谱β-内酰胺酶（EESBL）。自1980年代以来，Eesbl在全球范围内出现并传播[3]。减少EESBL影响的公共卫生战略依赖于卫生措施，特别是在医疗机构中，依赖于抗生素管理和感染控制。在EESBL，ESBL - 产生大肠杆菌（ESBL -EC）和ESBL-产生肺炎克雷伯氏菌（ESBL -KP）是EESBL表型的两个主要物种[4]，即使它们表现出不同的流行病学特征。ESBL-EC在社区环境中是地方性的，但在医院中矛盾的跨跨风险却很低[5]。相比之下，ESBL-KP几乎局限于医院环境，并且具有显着的流行能力，如多次医院暴发所证明的[6-9]。迄今为止，申请控制EESBL的卫生措施的类型，即标准或接触预防措施仍在争论[10]中。主要问题之一是接触预防措施是否应系统地应用于殖民或感染的患者[11-14]。自2015年以来，根据比利时的建议[15]，以及我们在雷恩大学医院的流行病学事件专业知识，在ESBL-KP的情况下，接触预防措施仍然适用，而在ESBL-EC殖民化或感染的情况下则应用标准预防措施。
使用真实世界医疗保健数据库识别糖尿病药物：丹麦和澳大利亚对称性分析
S03CA | 皮质类固醇和抗感染药物的复方药 S02CA | 皮质类固醇和抗感染药物的复方药 S | 感觉器官 R06AD | 吩噻嗪衍生物 R05FA | 鸦片衍生物和祛痰药 R03DC | 白三烯受体拮抗剂 R03DA | 黄嘌呤 R03CC | 选择性β-2-肾上腺素受体激动剂 R03BB | 抗胆碱能药物 R03BA | 糖皮质激素 R03AL | 肾上腺素能药物与抗胆碱能药物的复方药 R03AK | 吸入性β-肾上腺素能药物和皮质类固醇 R03AC | 选择性β-2-肾上腺素能受体激动剂 R02AX | 其他咽喉制剂 R01AD | 皮质类固醇 R | 呼吸系统 P02CA | 苯并咪唑衍生物 P | 抗寄生虫产品 N07BB |用于治疗酒精依赖的药物 N07BA | 用于治疗尼古丁依赖的药物 N07AA | 抗胆碱酯酶药物 N02CX | 其他抗偏头痛药物 N | 神经系统 M03BB | 恶唑、噻嗪和三嗪衍生物 M03BA | 氨基甲酸酯 M01AX | 其他非甾体抗炎和抗风湿药 M01AE | 丙酸衍生物 M01AB | 乙酸衍生物和相关物质 M | 肌肉骨骼系统 L01AA | 氮芥类似物 L | 抗肿瘤和免疫调节剂 J02AC | 三唑衍生物 J01FA | 大环内酯类 J01CR | 青霉素组合，包括β内酰胺酶抑制剂 J01CE | 对β内酰胺酶敏感的青霉素 J01AA | 四环素类 J |全身用抗感染药 H02AB | 糖皮质激素 H | 全身激素 G03FB | 孕激素和雌激素，序贯制剂 G03FA | 孕激素和雌激素，固定组合 G03DC | 雌二醇衍生物 G03DA | 孕烯（4）衍生物 G03CX | 其他雌激素 G03CB | 合成雌激素，普通 G03AC | 孕激素 G03AA | 孕激素和雌激素，固定组合 G01AF | 咪唑衍生物 G | 生殖泌尿系统和性激素 D10BA | 用于治疗痤疮的类视黄酸 D07CC | 皮质类固醇，强效，与抗生素复方 D07CB | 皮质类固醇，中效，与抗生素复方 D07CA | 皮质类固醇，弱效，与抗生素复方 D07BC |强效皮质类固醇，与防腐剂复方 D07BB | 中效皮质类固醇，与防腐剂复方 D07AD | 强效皮质类固醇（IV 类） D01AC | 咪唑和三唑衍生物 D01AA | 抗生素 D | 皮肤病学药物 C08DB | 苯并噻嗪类衍生物 C07CB | 选择性β受体阻滞剂和其他利尿剂 C07BB | 选择性β受体阻滞剂和噻嗪类 C07AB | β受体阻滞剂 C07AA | β受体阻滞剂，非选择性 C05AA | 皮质类固醇 C03EA | 低限利尿剂和保钾剂 C03DA | 醛固酮拮抗剂 C03CB | 磺胺类和钾复方药 C03CA | 袢利尿剂 C03AB | 噻嗪类和钾 C01AA | 洋地黄苷 C | 心血管系统 B02BA | 维生素 K B01AF | 直接 Xa 因子抑制剂 B01AA | 维生素 K 拮抗剂 B | 血液和造血器官 A12BA | 钾 A07AC | 咪唑衍生物 A02BC | 质子泵抑制剂 A02BA | H2 受体拮抗剂 A01AD | 其他局部口服治疗药物 A01AB | 用于局部口服治疗的抗感染药和防腐药 A | 消化系统
SMR 3879
系统生物学，基因组科学中心，UNAM-México细菌，持续受到不断变化的环境的影响，已经发展出了“记忆”机制，这些机制诱导了可以持续存在的独特的转录特征，这些机制可以持续存在[1,2]。我们的研究探讨了大肠杆菌MG1655中的这些机制，并经过间歇性暴露于β-内酰胺抗生素。使用荧光转录记者[3]，我们评估了基因调节动力学，该动力学响应于预期刺激，以鉴定具有滞后行为的基因，其中许多与氧化应激有关。我们还采用了时间分辨的流式细胞术来分析Oxyr（一种关键的氧化应激调节剂），在无应力恢复期后发现其表达中的双峰分布。值得注意的是，维持高氧气表达水平的亚群在重新引入抗生素后对多种类别的抗生素的耐受性提高。这个结果表明，细菌种群可以实施围困策略，大多数人群都从压力中迅速恢复，而独特的亚群则保持了应力的转录概况，从而增强了他们对未来压力遭遇的容忍度。最后，我们使用了数学模型和计算机模拟来检查不同的压力遗传机制的影响，从而提供了对波动环境中细菌生存策略的见解。[1] Bheda，P。代谢转录记忆。分子代谢38，100955（2020）。[2] Govers，S。K.，Mortier，J.，Adam，A。＆Aertsen，A。PLOS生物学16，E2003853（2018）。蛋白质聚集体编码各个大肠杆菌细胞中应力遭遇的表观遗传记忆。[3] Zaslaver，A。等。大肠杆菌的荧光转录记者的综合库。自然方法3，623–628（2006）。
非O1/non ...
摘要：非O1和非O139弧菌霍乱（NOVC）会引起人类胃肠道感染。被污染的食物，尤其是海鲜，是人类感染的重要来源。在这项研究中，从零售海鲜中分离出的63个NOVC菌株的毒力潜力在基因型和表型水平上被表征。尽管没有菌株编码霍乱毒素（CTX）和毒素调节的pilus（TCP），但包括Hlya Hymolysin，cholix Toxin CHXA，热稳定的肠毒素STN，以及针对3型和6型分泌系统编码的基因。所有菌株均表现出针对人和绵羊红细胞的溶血活性：90％（n = 57）形成强生生物膜，52％（n = 33）在37℃时高度运动，只有8％（n = 5）和14％（n = 9）可以抗拒60％和≥40％的人类血清。生物膜形成和毒素调节基因。CGMLST分析表明，来自临床NOVC菌株的海鲜簇的NOVC菌株。抗菌易感性测试（AST）导致对五种菌株的鉴定，这些菌株针对β-内酰胺类（包括青霉素，碳碳素，碳酸苯甲酸酯和头孢菌素），多酰氧蛋白，多酰氧蛋白和硫酰胺和硫酰胺的物质产生了非wildtype表型（中和耐药性）。表型抗性模式可以部分归因于在计算机分析中通过鉴定的获得的耐药性决定因素。我们的结果表明，从零售海鲜产品中分离出的分析的NOVC的毒力潜力差异，可以考虑进一步的致病性评估以及对未来海鲜监测中NOVC分离株的风险评估。