【产品简介】 本产品是从高度耐热菌 Thermus aquaticus 中克隆其 DNA 聚合酶基因,原核表达后经柱层析纯化获得的超纯、高效、耐热 DNA 聚合 酶, SDS-PAGE 显示为一条 94kD 的蛋白条带。该酶除具有 5 ' -3 ' DNA 聚合活性外,还具有少量的 5 ' -3 ' DNA 外切活性,但不 具有 3 ' -5 ' DNA 外切活性(校读活性),适用于常规 PCR 扩增。 M5 HiPer plus Taq DNA Polymerase 扩增得到的 PCR 产物含有 3'-A 碱基,可直接用于 TA 克隆 ( 聚合美 TOPO-TA 克隆载体货号: MF019 或 MF020) 。
摘要:β-内酰胺酶抑制蛋白(BLIP)能有效灭活A类β-内酰胺酶,但效力程度差异很大。了解BLIP在A类β-内酰胺酶抑制中的不同作用可以为抑制剂设计提供参考。然而,基于X射线晶体学获得的静态结构,这个问题很难得到解决。在本研究中,离子迁移质谱、氢氘交换质谱和分子动力学模拟揭示了三种A类β-内酰胺酶的构象动力学,BLIP对它们的抑制效率不同。与TEM1和SHV1相比,PC1的构象更长。几个重要的环区域的局部动力学不同,即突出环、H10环、Ω环和SDN环。与BLIP结合后,这些环协同重排以增强结合界面并使催化位点失活。具体来说,在 SHV1 和 PC1 的突出环中发现构象动力学的不利变化,从而导致结合效果降低。有趣的是,BLIP 上的单个突变可以补偿该区域的不利变化,从而表现出对 SHV1 和 PC1 的增强的抑制作用。此外,还揭示了 H10 区域是一个重要的变构位点,可以调节 A 类 β-内酰胺酶的抑制作用。这表明刚性的突出环和灵活的 H10 区域可能是有效抑制 TEM1 的决定因素。我们的研究结果为 β-内酰胺酶的构象动力学及其与 BLIP 的结合提供了独特而明确的见解。这项工作可以扩展到其他感兴趣的 β-内酰胺酶并启发新型抑制剂的设计。
1孟加拉国达卡1342的Jahangirnagar大学微生物学系; shantamicro44@gmail.com(A.S.S. ); nahidulmicro44@gmail.com(N.I。 ); ronniebge22@gmail.com(M.A.A。 ); akterkakoli948@gmail.com(K.A。 ); marnusamomo@gmail.com(M.B.H。 ); nahar@juniv.edu(s.n.) 2卫生创新,研究,行动和学习中心 - 孟加拉国1205年,孟加拉国孟加拉国(手性孟加拉国); contact.jubayerhossain@gmail.com 3 Strathclyde药学与生物医学科学研究所,Strathclyde大学,格拉斯哥大学,格拉斯哥G4 0RE,英国4,公共卫生药房和管理部,塞法科·马克加索健康科学大学,塞法科·马克加索健康科学大学,Pretora悉尼,新南威尔士州2052,澳大利亚 *通信:brian.godman@smu.ac.za(B.G. ); salequl@juniv.edu(S.I. );电话。 : +880-1715029136(S.I. );传真: +880-2-7791052(S.I.)1孟加拉国达卡1342的Jahangirnagar大学微生物学系; shantamicro44@gmail.com(A.S.S.); nahidulmicro44@gmail.com(N.I。); ronniebge22@gmail.com(M.A.A。); akterkakoli948@gmail.com(K.A。); marnusamomo@gmail.com(M.B.H。); nahar@juniv.edu(s.n.)2卫生创新,研究,行动和学习中心 - 孟加拉国1205年,孟加拉国孟加拉国(手性孟加拉国); contact.jubayerhossain@gmail.com 3 Strathclyde药学与生物医学科学研究所,Strathclyde大学,格拉斯哥大学,格拉斯哥G4 0RE,英国4,公共卫生药房和管理部,塞法科·马克加索健康科学大学,塞法科·马克加索健康科学大学,Pretora悉尼,新南威尔士州2052,澳大利亚 *通信:brian.godman@smu.ac.za(B.G.); salequl@juniv.edu(S.I.);电话。: +880-1715029136(S.I.);传真: +880-2-7791052(S.I.)
氨苄西林* 类别:β-内酰胺 概述 氨苄西林,俗称广谱青霉素,是一种氨基青霉素,是一类半合成的 β-内酰胺,专门用于对抗革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌。氨基青霉素是通过将青霉素与氨基或侧链连接而生成的。添加侧链会显著改变药物对某些细菌的活性。最初,这些抗菌药物对奇异变形杆菌、大肠杆菌、志贺氏菌、沙门氏菌、嗜血杆菌和奈瑟菌有效。然而由于易感性的变化,氨苄西林不再是治疗这些菌感染(如大肠杆菌尿路感染)的首选药物,除非培养和药敏结果表明易感。氨苄西林的作用机制是通过附着于青霉素结合蛋白 (PBP) 来干扰细胞壁合成,抑制细胞壁肽聚糖合成和使自溶酶抑制剂失活。耐药性 氨苄西林通常也被 β-内酰胺酶灭活(有关获得对 β-内酰胺的耐药性的信息,请参阅青霉素部分。)。近年来,屎肠球菌和肺炎链球菌开始通过突变表现出低亲和力 PBP,这是对氨基青霉素的耐药机制。有效性 氨苄西林和阿莫西林具有相同的活性谱,尽管阿莫西林的特点是生物利用度更高。对氨苄西林和阿莫西林普遍敏感的菌属包括葡萄球菌、链球菌、棒状杆菌、梭状芽孢杆菌、大肠杆菌、克雷伯氏菌、志贺氏菌、沙门氏菌、变形杆菌和巴氏杆菌,尽管其中许多细菌已获得耐药性。氨苄西林通常用于治疗革兰氏阴性肠道细菌引起的泌尿道感染。该药物还用于治疗呼吸道感染。此外,氨苄西林对 B 组链球菌均有效,但对肠杆菌、流感嗜血杆菌、假单胞菌和吲哚阳性变形杆菌感染无效。有关体液和脑脊液吸收的解释,请参阅青霉素部分。 *可根据要求提供参考资料。致电路易斯安那州卫生与医院部公共卫生办公室传染病流行病学科 (504-219-4563)
a Max Mousseron 生物分子研究所,UMR5247 CNRS,蒙彼利埃大学,ENSCM,药学院,15 avenue Charles Flahault,34093 Montpellier cedex 5,法国。 b 列日大学蛋白质工程中心生物大分子实验室,Allée du 6 août B6,Sart-Tilman,4000 列日,比利时。 c 意大利锡耶纳大学医学生物技术系,I-53100 锡耶纳。来自结构生物学研究所 - Jean-Pierre Ebel,UMR5075 CNRS,CEA,约瑟夫傅立叶大学,41 rue Jules Horowitz,38027 Grenoble cedex 1,法国。 e EMBL Outstation c/o DESY,Notkestrasse 85,D-22603 汉堡,德国。 f 安纳多鲁大学药学院药物化学系,26470 埃斯基谢希尔,土耳其。 g 德国尤斯图斯李比希大学跨学科研究中心生物化学与分子生物学系主任,Heinrich-Buff-Ring 26-32,D-35392 吉森,德国。 h UMR8226,法国国家科研中心,皮埃尔和玛丽居里大学,物理化学生物学研究所,皮埃尔和玛丽居里街 13 号,75005 巴黎,法国。 i UMR8261,法国国家科研中心,巴黎狄德罗大学,物理化学生物学研究所,皮埃尔和玛丽居里街 13 号,75005 巴黎,法国。 1 现地址:Symbiose Biomaterials SA,GIGA Bât. B34, 1 avenue de l'Hôpital, 4000 列日, 比利时。 2 现地址:法国克莱蒙费朗化学研究所,UMR6296 CNRS,克莱蒙奥弗涅大学,63000 克莱蒙费朗,法国。 3 现地址:昆士兰大学化学与分子生物科学学院,圣卢西亚,布里斯班,昆士兰州 4072,澳大利亚。 4 现地址:CERN,HSE/SEE/SI,CH-1211 Geneva 23,瑞士。 *通讯作者:电话:+33-(0)4 11 75 96 03;传真:+33-(0)4 11 75 96 41。电子邮件地址:jean-francois.hernandez@umontpellier.fr (J.-F. Hernandez); laurent.gavara@umontpellier.fr(L.加瓦拉)。
新型B-丙氨酸酶抑制剂(BLIS)的抽象设计是应对革兰氏阴性细菌中头孢菌素和碳青霉烯耐药性威胁的当前接受的策略之一。硼酸过渡状态抑制剂(BATSIS)是竞争性的,可逆的BLI,可以作为新型治疗剂提供希望。在这项研究中,两种A-氨基二氧二氧二苯甲酰烷酸转变状态抑制剂(S02030和MB_076)的活性针对代表KPC(KPC-2)和CTX-M(CTX-M-96,CTX-M-15--15-type-type-Spectrum B-bb-bb-bb-bb-casse)[ES)[ES)在纳摩尔范围内测量了两种抑制剂的50%抑制浓度(IC 50 s)(2至135 nm)。对于S02030,CTX-M-96(24,000 M 2 1 S 2 1)的K 2 / K是KPC-2的报告值的两倍(12,000 M 2 1 S 2 1);对于MB_076,K 2 / K值范围从1,200 m 2 1 S 2 1(KPC-2)到3,900 m 2 1 S 2 1(CTX-M-96)。具有MB_076(1.38-Å分辨率)和S02030的KPC-2的晶体结构,以及CTX-M-96的硅模型中,这两个蝙蝠表明,CTX-M-96 - 96 - S02030和CTX-M-96和CTX-M-96 - CTX-M-96 - CTX-M-96 - MB_076复合物的相互作用总体上是2级的结构。 KPC-2 - MB_076。S02030和MB_076围绕硼原子的四面体相互作用,与S70,S130,N132,N170和S237创建了一个有利的氢键网络。但是,从KPC-2中的W105到CTX-M-96中的Y105和CTX-M-96中缺失的残基R220改变了抑制剂在CTX-M-96的活性位点的排列,部分解释了动力学参数的差异。在这里研究的新型BATSI脚手架提高了我们对结构活性关系(SARS)的理解,并说明了B-乳糖果酶抑制剂设计的新方法的重要性。
背景:几种属于伽马变形菌的细菌种群具有内在的 A 类 β-内酰胺酶基因,这些基因可能是进一步传播和获得其他革兰氏阴性菌种的来源。我们在此描述了 KSA-1 A 类 β-内酰胺酶,该基因是在环境肠杆菌目物种 Kosakonia sacchari 的染色体内发现的,该物种最近还被鉴定为 MCR 样粘菌素抗性决定簇的前体。方法:使用 GenBank 数据库进行计算机分析,在 K. sacchari SP1 的染色体内发现了 A 类 β-内酰胺酶基因(GenBank 登录号 WP_017456759)。相应的蛋白质 KSA- 1 与 Citrobacter koseri 的内在 CKO-1 有 63% 的氨基酸同一性,与 TEM-1 有 53% 的氨基酸同一性。使用 K. sacchari DSM 100203 参考菌株作为模板,扩增 bla KSA-1,克隆到质粒 pUCp24 中并在大肠杆菌 TOP10 中表达。从纯化的酶中获得最小抑制浓度和动力学参数。结果:K. sacchari 菌株 SP1 仅对氨基、羧基和脲基青霉素产生抗性。一旦在大肠杆菌中产生,KSA-1 就会表现出典型的克拉维酸抑制广谱 β-内酰胺酶,并伴有特殊的替莫西林抗性特征。使用纯化的 KSA-1 提取物进行动力学测定,结果显示对青霉素和哌拉西林以及弱广谱头孢菌素具有高水解率。抑制常数的测定表明,克拉维酸、他唑巴坦和阿维巴坦的 50% 抑制浓度分别为 2.2、3 和 1.8 nM。对 bla KSA-1 基因周围序列的分析未发现任何可能参与该物种获得这种 β-内酰胺酶基因的移动元素。结论:KSA-1 是一种 A 类广谱 β-内酰胺酶,与已知的广谱或广谱 Ambler A 类 β-内酰胺酶远亲,对替莫西林具有高度耐药性。bla KSA-1 基因可被视为该物种固有的。© 2024 作者。由 Elsevier Ltd 代表国际抗菌化疗协会出版。这是一篇根据 CC BY 许可开放获取的文章(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)
抗菌剂的广泛使用导致抗药性细菌迅速增加。在这种背景下,以革兰氏阴性杆菌为代表的多药抗性细菌的检测率正在增加,这对临床实践中的抗感染治疗构成了巨大挑战。根据Chinet(www.chinets.com)的数据,抗菌监测网络,肺炎肺炎的抗性率从2005年的2.9%增加到2021年的24.4%。对于大肠杆菌,对美皮烯的抗性率达到1.4% - 2.1%。肠杆菌对β-内酰胺抗生素的抗性的主要机制是β-内酰胺酶的产生。根据Ambler分类系统:A类(例如,扩展的光谱β-乳糖酰胺酶,ESBLS;和K. pneumoniae Carbapenemases,KPCS,KPCS),B级(E.G. B(E.G.,New Delhi Metallo-Beta-lactacamase s clange n n s Clance),头孢菌素酶)和D类(例如奥沙素酶,奥沙西斯)。对碳苯甲酸肠杆菌(CRE)的一项大型研究调查显示,KPC是最普遍的β-内酰胺酶,NDMS是K.肺炎K.肺炎的第二普遍β-内酰胺酶(Wang等,2018)。近年来,在耐碳青霉烯烃的碳青霉烯氏菌中已经变得越来越普遍(Tangden和Giske,2015; Yin等,2017)。考虑到上述β-乳糖酶的多样性,研究人员已密切关注新型广谱β-内酰胺酶抑制剂的发展(Shlaes,2013; Bush,2015; Vanscoy等,2016; 2016; Bhagwat等,2019)。目前,已销售了非贝氏乳酰胺结构的新型β-内酰胺酶抑制剂,包括阿维比巴坦,里贝塔姆和瓦博尔巴氏菌。Relebactam和Vaborbactam都不能抑制D类β-内酰胺酶。fl058是一种新型的焦油二氯辛烷(DBO)β-内酰胺酶抑制剂,其结构和活性类似于Avibactam。它主要抑制A类,C类和某些D类β-内酰胺酶,但不抑制NDMS(Sharma等,2016)。一项体外敏感性研究(待发表)表明,与阿维巴丹不同,仅FL058在大肠杆菌上具有某些抑制活性。Meropenem与4μg/ml FL058结合使用NDM-生产大肠杆菌(MIC 90 = 0.5 mg/l)的最小抑制浓度(MIC)的显着较低,对NDM产生的NDM抑制作用的作用显着降低,而NDM产生的K. pneumoniae(MIC 50 = 0.25 mg/l,MIC 90 = 4 MIC 90 = 4 MIC 90 = 4 MIC 90 = 4 MIC 90 = 4 M MIC 90 = 4 M MIC 90。一项完整的I期临床试验显示,FL058具有良好的安全性,耐受性和药代动力学(PK)特征(Huang等,2023)。体外药代动力学/药效学(PK/PD)模型已成为筛查β-内酰胺抗生素/β-内酰胺酶抑制剂疗法的剂量方案的重要工具(MacGowan等,2016; Vanscoy et al。,2016; MacGowan et al。它们也可以用来评估暴露于β-内酰胺抗生素/β-乳酰胺酶抑制剂的相关性与菌落计数的变化之间的相关性。随后对暴露响应关系的分析又可以支持剂量选择。鉴于此,这项研究模拟了FL058与MeropeNem在体外模型中结合使用的临床给药方案,以发现两种药物的最佳成分比和最佳的PK/PD指数和两种药物组合治疗的靶标。鉴于此,这项研究模拟了FL058与MeropeNem在体外模型中结合使用的临床给药方案,以发现两种药物的最佳成分比和最佳的PK/PD指数和两种药物组合治疗的靶标。