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大肠杆菌不匹配维修系统能够识别DNA中的非分配基础对，显然是通过局部切除和重新合成的，以取代错误的基础（有关审查，请参见参考，请参见参考文献1）。DNA的区域GATC序列是完全腺嘌呤 - 甲基化的似乎是对不匹配修复的难治性（2，3），并且似乎是在复制叉后紧接在复制后立即将新合成的GATC序列的短暂甲基化，从而使修复的重复修复仅可重复进行新的合成，从而将其撤离了新的合成和错误。大肠杆菌不匹配修复系统没有识别和/或维修所有不匹配的效率（6，7）。两个过渡不匹配（G-T和CGA）都很容易予以修复和修复，而六个转移不匹配中的三个不是（6）。这种模式可以部分解释，因为发现在大肠杆菌，mutl，muts和mutu突变体中观察到的突变效应，这些突变体缺乏不匹配修复（参考文献。2-8;有关评论，请参见参考。1）和未指向不匹配修复的大坝突变体（2，6）主要是由于过渡和移码突变的增加（1）。不匹配维修不足的突变体显示移码突变的频率增加，这表明大肠杆菌不匹配修复系统可以识别和修复一个或多个未配对的碱基 - i.e。，移交/野生型型异源杂质。该假设进行了检验。结果表明，具有一个未配对基碱的异源型可以通过大肠杆菌不匹配修复系统识别和修复。
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