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World File Search System凝胶电泳
凝胶电泳：排序并参见DNA前类活动
21,226 23,130 16,841 19,329 18,170 19,044 7,421 9,416 7,233 16,380 14,083 12,434 5,804 6,557 6,770 4,572 7,054 7,888 5,643 4,361 6,527 4,254 4,641 6,995 4.878 2.322 5.626 3.965 4.55 $ 3.530 2.527 5,527 564 5660 1860
讲座27：用于DNA分析的琼脂糖凝胶电泳
A。DNA浓度，电压和缓冲液浓度。B.凝胶百分比，缓冲液浓度和电压。C. DNA的大小，凝胶浓度和DNA构象。D.凝胶的长度，缓冲液浓度和DNA浓度。
使用碱性单细胞凝胶电泳（SCGE）彗星测定的氧化DNA损伤以及N-乙酰基半决赛的保护作用
Zearalenone（ZEN）是一种由几种在谷物和农产品中发现的镰刀菌产生的非甾体雌激素霉菌毒素。Zen与农场动物和人类的霉菌毒性有关。ZEN的毒性作用众所周知，但是尚未确定碱性彗星测定法评估Zen诱导的Chang肝细胞中氧化DNA损伤的能力。这项研究的第一个目的是评估彗星测定法测定Zen Toxin诱导的细胞毒性和DNA大坝的程度，第二个目的是研究N-乙酰半胱氨酸酰胺（NACA）保护细胞以保护细胞免受Zen诱导的毒性的能力。在彗星测定中，通过量化尾部范围矩（TEM；任意单位）和尾部长度（TL；任意单位）来评估DNA损伤，这些损伤用作SCGE中DNA链断裂的指标。通过抑制细胞增殖并诱导氧化DNA损伤，介导Zen在变肝细胞中的细胞毒性作用。增加ZEN的集中度增加了DNA损伤的程度。用Zen毒素治疗后，DNA迁移的程度和尾部的细胞百分比显着增加（P <0.05）。与高浓度的Zen毒素（250 p m）的细胞治疗相比，用低浓度的Zen毒素（25 p m）处理Zen毒素（25 p m）的治疗诱导的DNA损伤水平相对较低。氧化DNA损伤似乎是Chang肝细胞中Zen诱导的毒性的关键决定因素。在暴露于任何浓度的ZEN之前先用NACA预先处理细胞时，观察到细胞溶解性的显着降低和氧化DNA损伤。我们的数据表明ZEN在Chang肝细胞中诱导DNA损伤，NACA的抗氧化活性可能有助于通过消除氧化应激减少Zen诱导的DNA损伤和细胞毒性。
电泳迁移率分析，以分离超螺旋，融合和打结的DNA分子
可以通过所谓的单分子方法（例如染色质纤维自显影术[1]，动态分子梳理[2]，透射电子显微镜[3-5]，原子力显微镜[6]和磁性Tweeezer [7,8]来分析具有不同拓扑的DNA分子的DNA分子。DNA特性很难通过计算机模拟[9-13]研究实验上的DNA特性。二维（2D）琼脂糖凝胶电泳是当前可用的最佳实验方法，可以同时鉴定具有不同拓扑的DNA分子[例如，超涂层（SC），catenated（catss），打结（cats）和打结（KN）分子（kN）分子]。该技术由在不同条件下进行的两个连续电泳分离组成，并在两个正交方向上运行（4-8）。在相对较低的电压（〜1 v/cm）下，在低度（〜0.4％）琼脂糖凝胶电泳中解析了第一维。第二维垂直于第一个维度，因此将整个凝胶的整个泳道用作凝胶井的替换，但在高度（〜1％）琼脂糖凝胶电泳（〜5–6.6 V/cm）处的高度（〜1％）琼脂糖凝胶电泳。2D凝胶最初是由Bell和Byers设计的，用于分离分支和线性分子[14]，并且早期注意到该方法也可以成功地应用于研究DNA拓扑。2D凝胶被调整以同时检查具有不同DNA拓扑的成千上万个分子，例如SC形式，KN形式，部分复制的形式（命名为前蛋白酶），有或没有反向的叉子，完全重复的Catenanes（Cats）（cats）和复制中间体（RIS），以及包含针（RIS）（RIS）（RIS）[4,6,6,6,6,6,6,6,6,6,6,6,6,6,58]。2D琼脂糖凝胶电泳已广泛用于研究拓扑异构酶体外和体内的活性[29,30]。另外，2D凝胶也可以用作富集特定DNA分子的样品的制备方法，以后可以通过不同的技术进行检查[4,6,18,19,31,32]。质粒是研究DNA拓扑模型的宝贵工具。质粒的优势包括它们的易于分离，以及在纯化的DNA样品中定量测量DNA超串联，打结和搭配的能力[33]。在这里，我们提出了一种协议，其中2D凝胶用于分析三个
nuc-off核酸酶和DNA去除喷雾
图1。在去除RNase和dNase中，MP生物医学Nuc-Off核酸酶和DNA去除喷雾剂和竞争者T溶液的性能比较。A. RNase消除。在室温下孵育5分钟，将4μl的去除试剂和不同量的RNase（以1μl为单位）的混合物孵育；之后，加入1μlRNA，并在室温下进一步孵育15分钟，然后在含有甲醛的琼脂糖凝胶中变性和最终混合物的电泳。B. DNase消除。在室温下孵育4μl的去除试剂和不同量的DNase（以1μl）的混合物5分钟；之后，将1μl10X反应缓冲液和1μgDNA和无核酸酶的水加入总体积10μl，并在室温下进一步孵育15分钟，然后是最终混合物的琼脂糖凝胶电泳。C.去除试剂对DNA稳定性的影响。在室温下孵育15分钟，将4μl的去除试剂和1μl基因组DNA的混合物进行孵育，然后通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。D.去除试剂对RNA稳定性的影响。在室温下孵育4μl的去除试剂和1μlRNA的混合物，然后变性添加含有甲醛的琼脂糖凝胶电泳。此处显示的图仅供参考，它可能会根据不同的实验条件而有所不同。
2025学期1 Life Sciences ATP和课程计划者
RNA位置p。 13-互动凝胶电泳实验室 - 观看有用的视频：蛋白质；转录；翻译 - 使用此文档进行修订的主要概念：ENG / AFR-在此处对DNA和RNA上的自我标记测验 - 在此处找到有关此主题的修订练习 - 在p上修改此主题的术语。 113单元1RNA位置p。 13-互动凝胶电泳实验室 - 观看有用的视频：蛋白质；转录；翻译 - 使用此文档进行修订的主要概念：ENG / AFR-在此处对DNA和RNA上的自我标记测验 - 在此处找到有关此主题的修订练习 - 在p上修改此主题的术语。 113单元1
nuc-off核酸酶和DNA去除喷雾
图1。在去除RNase和dNase中，MP生物医学Nuc-Off核酸酶和DNA去除喷雾剂和竞争者T溶液的性能比较。A. RNase消除。在室温下孵育5分钟，将4μl的去除试剂和不同量的RNase（以1μl为单位）的混合物孵育；之后，加入1μlRNA，并在室温下进一步孵育15分钟，然后在含有甲醛的琼脂糖凝胶中变性和最终混合物的电泳。B. DNase消除。在室温下孵育4μl的去除试剂和不同量的DNase（以1μl）的混合物5分钟；之后，将1μl10X反应缓冲液和1μgDNA和无核酸酶的水加入总体积10μl，并在室温下进一步孵育15分钟，然后是最终混合物的琼脂糖凝胶电泳。C.去除试剂对DNA稳定性的影响。在室温下孵育15分钟，将4μl的去除试剂和1μl基因组DNA的混合物进行孵育，然后通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。D.去除试剂对RNA稳定性的影响。在室温下孵育4μl的去除试剂和1μlRNA的混合物，然后变性添加含有甲醛的琼脂糖凝胶电泳。此处显示的图仅供参考，它可能会根据不同的实验条件而有所不同。
利用 PCR 毛细管凝胶电泳高通量基因分型追踪苹果中 CRISPR/Cas12a 介导的基因组编辑事件
摘要：使用新型 CRISPR/Cas12a 系统具有优势，因为它与常用的 CRISPR/Cas9 系统相比具有不同的特点，从而扩展了基因组编辑 (GE) 应用的可能性。在这项工作中，CRISPR/Cas12a 系统首次应用于苹果，以研究其在 GE 应用中的普遍可用性。通过体外切割试验预先筛选出针对内源报告基因 MdPDS 不同外显子的有效引导 RNA，该基因的破坏会导致白化表型。将一个构建体转移到苹果中，该构建体编码 CRISPR/Cas12a 系统，该系统同时靶向 MdPDS 中的两个基因座。使用荧光 PCR 毛细管电泳和扩增子深度测序，所有已鉴定的再生白化芽的 GE 事件都被描述为缺失。未观察到两个相邻靶位点之间的大量缺失。此外，还经常观察到表现出多个 GE 事件的再生体和芽的嵌合组成。通过比较两种分析方法，结果表明荧光 PCR 毛细管凝胶电泳是一种灵敏的高通量基因分型方法，可以同时准确预测多个位点的插入/缺失突变的大小和比例。特别是对于表现出高嵌合频率的物种，可以推荐将其作为有效选择同型组蛋白 GE 系的经济有效的方法。