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World File Search System凸起
木糖基转移酶凸起和孔工程，以化学操纵哺乳动物细胞的蛋白聚糖
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2024年6月27日。 https://doi.org/10.1101/2023.12.20.572522 doi：Biorxiv Preprint
实施蒙哥马利模块化减少到模块化凸起的加速⋆
大型整数上的抽象模块化凸起涉及多个模块化乘法，这在计算上非常昂贵。许多处理系统使用Montgomery模块化乘法方法，从而减少了软件和硬件实现的延迟。提供了软件开发的主要方向和用于实施的蒙哥马利模块化乘法部分的大纲。使用蒙哥马利模块化乘法的四种方法实现了大整数上的蒙哥马利算术。我们使用左右二进制式凸起方法对模块化的计算进行了固定的计算，并使用模块化的蒙特哥马利乘法制定了一组减少的剩余部分的预发行。进行了三个函数变体的运行时间，用于计算大整数上的模块化启动。与MMIMPIR的模块化凸起的函数相比，使用Montgomery模块化乘法的固定碱基的算法提供了更快的模块化凸起计算，OpenSSL库的大数量比1K位更多。
生成，建模和评估一组大规模的CRISPR/CAS9凸起的站点
CRISPR/CAS9系统是一种高度准确的基因编辑技术，但也可能导致脱离靶向位点（OTS）。因此，已经开发了许多高通量测定方法来以全基因组的方式测量OT，并且它们的数据用于训练机器学习模型以预测OT。但是，与没有凸起的OT相比，由于数据有限，这些模型在考虑凸起的OT时是不准确的。最近，一种用于检测OTS的新型体外技术Change-Seq用于生产前所未有的规模和质量的数据集。此外，在Belula Guide-seq实验中产生的同一研究，但这些实验都没有包含凸起。在这里，我们生成了具有凸起的最全面的指南seq数据集，并培训和评估了最先进的机器学习模型，这些模型考虑了凸起的OT。我们首先重新处理了Change-Seq研究的公开实验原始数据，以发电20个新的Guide-Seq实验，并在原始和新的Guide-Seq实验中进行了数百个具有凸起的OT。然后，我们训练了多个机器学习模型，并在体外和整体上都展示了其最先进的性能，并在关注凸起的OT上时。最后，我们可以看到模型在独特代表中凸起的OT上学到的关键特征。
在没有凸起的沼泽的数据的情况下，使用Gest方法估计温室气体吸收或排放
摘要：本文旨在提出一种在没有泥炭沼泽地区数据的情况下估算温室气体（GHG）吸收或排放的方法（Gest方法）。该论文介绍了一个项目，该项目“通过在东欧平原上和中欧平原上的泥炭沼泽重新释放来限制CO 2排放”。研究区域包括三个泥炭沼泽：克鲁基，塞米斯基·布塔（CiemińskieBłota）和维尔基·巴诺（Wielkie Bagno）（Słowiński国家公园）。gest方法取决于研究文献中提供的每种给定栖息地类型的植被和水位以及温室气体系数的估计。假设缺乏人类影响，并且考虑到以泥炭沼泽保存形式的人类影响，则计算了基线场景的温室气体余额。初步研究结果表明，在研究的沼泽区域中总共有41个gest，而CO 2的降低将减少约12％，这是在被提高地下水水平，在沼泽中砍伐树木的耕种，并在生境中变化，将发生约12％。
创伤性脑损伤小鼠模型中毛囊凸起衍生干细胞的多模态成像
摘要 创伤性脑损伤 (TBI) 是一种毁灭性的事件，目前治疗方法有限。干细胞移植可通过不同的机制恢复功能，例如通过分化进行细胞替换、刺激血管生成和支持微环境。成人毛囊凸起衍生干细胞 (HFBSC) 具有神经元分化能力，易于采集且相对免疫特权，这使它们成为自体干细胞治疗的潜在候选者。在本研究中，我们应用体内多模态、光学和磁共振成像技术来研究小鼠 TBI 模型中小鼠 HFBSC 的行为。HFBSC 表达 Luc2 和 copGFP，并在体外检查其分化能力。随后，在受伤 2 天后，将预装了 ferumoxytol 的转导 HFBSC 移植到裸鼠的 TBI 病变（皮质区域）旁边。移植后 58 天将大脑固定以进行免疫组织化学检测。表达 Luc2 和 copGFP、载有 ferumoxytol 的 HFBSC 在体外表现出足够的神经元分化潜能。受损大脑的生物发光显示 HFBSC 存活，磁共振成像确定了它们在移植区域的定位。免疫组织化学显示移植细胞染色为巢蛋白和神经丝蛋白 (NF-Pan)。细胞还表达层粘连蛋白和纤连蛋白，但未检测到细胞外基质团块。58 天后，可以在脑组织切片中的 HFBSC 中检测到 ferumoxytol。这些结果表明 HFBSC 能够在脑移植后存活，并表明细胞可能向神经元细胞谱系分化，这支持了它们在 TBI 细胞治疗中的潜在用途。
