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World File Search System分叉
芯片供应链：分叉和本地化
在人类历史上大规模提出。高度复杂的半导体供应链是偏重的和互连的，因此很难解开。在最后几个decades中，半导体供应链简单地将三个主要的生产步骤分成了分散，重点是性能和功率效率创新，同时又赋予了成本和芯片大小。首先，工程师设计芯片并精心计划如何构造其电子电路。第二，芯片设计是在洁净室的硅晶片上通过光刻造影等制造的，其中小电路逐层建造。最后，制造的芯片是从晶片上切出的，用保护性壳体包装，并进行了严格测试，以确保在将功能集成到电子设备中之前确保功能（请参阅CSS研究）。
对称性，Hopf分叉和在新型变色龙系统中的增强
摘要：变色龙系统是动态系统，根据参数值表现出自激发或隐藏的振荡。本文对二次变色龙系统进行了全面研究，包括对其对称性，耗散，局部稳定性，HOPF分叉和各种混乱动态的分析，因为控制参数（µ，A，C）各不相同。在这里，µ用作y方向的耗散参数。进行了µ = 0的四个方案的分叉分析，揭示了在不同的参数设置下出现各种动态现象的出现。o ff设置的提升意味着将常数引入系统的一个状态变量之一，以将变量提升到不同的级别。此外，通过不同的µ示出了隐藏的混乱双重性，并具有OFF集的增强性。参数µ既充当HOPF分叉参数和O FF集促进参数，而其他参数（A，C）也作为控制参数起关键作用，从而导致了与自我激发或隐藏混乱吸引者的周期上升的路线。这些发现丰富了我们对二次变色龙系统中非线性动态的理解。
风险行为，向后分叉和疾病动力学的疫苗有效性
许多研究表明，疫苗不是完全有效的，这意味着接种疫苗的人群都包括疫苗免疫的人，尽管接受了疫苗接种疫苗，但疫苗的疫苗也没有。这可能是可能的，因为某些接种疫苗的人可能会错误地认为自己受到了完全保护并且无法获得该疾病。这种看法会显着影响行为，导致一些接种疫苗的人在遵循预防或缓解措施方面的勤奋程度较小。是由上述动机的，我们研究了不产生免疫力的接种疫苗人员的行为变化如何影响直接传播疾病的动力学以及关键指标，例如基本的生殖数和疫苗有效性。我们提出了一个模型，该模型考虑了具有三个失败方面的疫苗：“取”，“学位”和“持续时间”。此外，非免疫接种个体的行为变化是通过一个参数建模的，该参数基于遵守缓解措施来调整其接触率。我们的结果使我们能够可视化行为变化在影响疾病传播动态的各种因素中的作用。首先，我们证明了在不完全有效疫苗的模型中存在的向后分叉存在。第二，我们定义了行为指数阈值，该阈值是确定疾病是否由于行为效应而持续存在的关键指标。最后，我们的结果强调了行为指数和感染的初始值
平衡和马鞍节点分叉
在本文中，我们描述了一种组合组合/数值方法，用于研究系统生物学中引起的网络模型中的平衡和分叉。ode模型具有高维参数，这对通过数值方法研究全局动力学有很大的阻塞。本文的要点是证明，尽管参数尺寸较高，但适应和将经典技术与最近开发的组合方法相结合提供了更丰富的全局动力学图。给定一个网络拓扑描述状态变量，该状态变量通过单调和有界函数相互调节，我们首先使用了由注册网络（DSGRN）软件生成的动态特征来获得动力学的组合摘要。此摘要很粗糙，但全球性，我们将此信息用作第一个通过，以识别要关注的参数的“有趣”子集。我们使用我们的网络动力学建模和分析（NDMA）Python库构建具有高参数维度的关联ODE模型。我们介绍了算法，以有效研究限于这些参数子集的这些ODE模型中的动力学。最后，我们形成了该方法的统计验证以及几个有趣的动态应用程序，包括在54个参数模型中找到鞍节点分叉。
RNA 聚合酶 II 是 DNA 分叉进展的极性障碍
DNA 复制和转录同时发生在同一 DNA 模板上，导致复制体和 RNA 聚合酶之间不可避免地发生冲突。这些冲突会阻碍复制叉并威胁基因组稳定性。尽管许多研究表明正面冲突比同向冲突更有害，也更容易促进 R 环形成，但 RNA 聚合酶障碍极性的根本原因仍不清楚，这些 R 环的结构也只是推测。在这项工作中，我们使用一个简单的模型系统来解决这个复杂的问题，通过检查 Pol II 障碍到通过机械解压缩前进的 DNA 叉来模拟复制体的进展。我们发现，即使转录本大小最小，Pol II 也能更稳定地结合以抵抗正面配置中的移除，这表明 Pol II 障碍具有固有的极性。然而，具有长 RNA 转录本的延长 Pol II 在保留极性的同时成为更强大和持久的障碍，而 RNA-DNA 杂交的形成介导了这种增强。令人惊讶的是，我们发现当 Pol II 与 DNA 叉正面碰撞并回溯时，RNA-DNA 杂合体会在 Pol II 前方的滞后链上形成，形成拓扑锁，将 Pol II 困在叉上。TFIIS 通过切断 Pol II 与杂合体的连接来促进 RNA-DNA 杂合体的去除。我们进一步证明，当 Pol II 仍与 DNA 结合时，这种 RNA-DNA 杂合体可以通过 T7 DNA 聚合酶引发滞后链复制。我们的研究结果捕捉到了 Pol II 与 DNA 叉相互作用的基本特性，揭示了转录-复制冲突的重要意义。
芯片供应链：分叉与本土化
这是人类历史上规模最大的制造业。高度复杂的半导体供应链是周期性的和相互关联的，因此很难理清。在过去的几十年里，半导体供应链已经简单地分为三个主要生产步骤，专注于性能和能效创新，同时降低成本和缩小芯片尺寸。首先，工程师设计芯片并精心规划如何构建其电子电路。其次，通过光刻等工艺将芯片设计制造到洁净室中的硅晶片上，微小电路被一层层构建起来。最后，将制造好的芯片从晶片上切下来，封装在保护外壳中，并经过严格测试以确保功能，然后才能集成到电子设备中（参见 CSS 研究）。
使用符号计算分析多项式差异系统的零-HOPF分叉
2特征方程式| λi -d f（x，µ）| = 0，其中d f（x，µ）是（x，µ）系统的雅各布矩阵，具有一对假想的根（λ（x，µ），λ（x，x，µ）），没有其他根部的根。99k（x，µ）Hopf Equilibria
腔体诱导的经典速率理论分叉
为此取得成功的是优化库的可用性，例如Abinit [8]，Quantum Espresso [9]，VASP [10]，Berkleygw [11]，Yambo [12]，Triqs [13]和更多[14]，并利用了一遍又一遍地开发复杂的代码。如果没有这样的公共代码，每个研究人员都必须自己实施该方法，从而与最有可能的次级最佳结果创造了许多冗余工作。因此，方法的广泛适用性是拥有可用的公共代码的广泛适用性，以及有关实施中最佳实践的有记录的知识。在相关材料的研究中，上面提到的基于AB-Initio的治疗方法包含许多重要特征。但是，来自电子相互作用的超导顺序以及在多体schrödinger方程的近似So中产生的远程相互作用的其他效果仅包括部分或根本不包括。这创造了对我们可以连接到这些开发的方法和代码的需求，并通过添加缺失的作品来表达现状。在计算凝结物理学中，从有效的低能描述开始，仅保留少数相关的频带，它已被证明有效。如何到达这样的折叠模型的过程构成了第一个障碍。随后，我们仍然必须求解一个模型，其中包括一些频段，并具有相互作用的相互作用。要解决此类问题，我们通常需要引入近似值，这应该得到很好的控制。库基于通用模型接口（参见对于一类宽类材料，我们可以使用缠扰性方法，例如随机相位近似（RPA），Parquet近似[15]和FRG [16，17]。前者仅包含特定的图形通道，而二线却是图形的，因此是扩展Ab-Initio机械的主要候选者；问题是，整个方程式，结合其所有依赖项的实施超出了我们目前的影响力。在本文中，我们提出了分歧1 - 开源，高性能（多节点CPU＆Multi-gpu）C / C ++ / Python库（在[18]上可用），该库实现了FRG的不同口味[16，17]。第3节）和三个不同的计算后端：（i）网格frg [19，20]，（ii）截断的unity frg（tu 2 frg）[21 - 23]和（iii）轨道空间n-patch frg [24 - 26]。每个中央方程都执行不同的近似值，从而产生不同的数值复杂性，如附录d所述。本文被设计为动手介绍分歧的使用。因此，我们将FRG简要概括为第2节中的数值方法，介绍了第3节中的模型结构，解释了如何在第4节中求解流程方程以及如何在第5节中分析结果。