图表 图 1. Cogent NGS Immune Profiler 分析工作流程。 ........................................................................................................... 7 图 2. immunity_profiler 目录的可视化图,包括文件和文件夹。 ................................................................................ 9 图 3. 如何验证操作系统的 Java 版本 ...................................................................................................................... 10 图 4. 显示成功检查基本 Conda 环境的 Linux 命令行屏幕截图 ............................................................................. 10 图 5. cogentip -h 命令的输出。 ......................................................................................................................... 13 图 6. cogentip report -h 命令的输出。 ........................................................................................................... 17 图 7. 示例 umi_group_sizes_frequency。.png 图。................................................................ 18 图 8. 示例 umi_cutoffs.template.csv 文件内容。...................................................................................... 19 图 9. test_input / 中的文件夹结构和文件。............................................................................................. 25 图 10. test_output/ 文件夹中的文件夹结构和文件......................................................................................... 26
由于可以将分析的程序直接运行在目标硬件上,“指令集模拟器”可用于在隔离且完全受控的环境中运行要分析的程序。使用这种技术的分析器的优点是十分准确,并且可以收集各种各样的指标,但是它们会给分析的程序运行时增加相当大的开销。某些分析器(如 gprof [19])使用的另一种技术是通过添加或修改代码的指令来检测代码,以收集有关其执行的数据。这类分析器可以收集的信息不如指令集模拟器方法那么详尽,但是它们给程序运行时执行增加的开销通常相对较低。最后,某些分析器使用静态分析来收集数据,甚至无需执行程序。对于传统计算机,由于当前传统处理器执行指令的方式非常复杂,这些分析器仅限于指令数及其变化等信息。
由球形栅格组成的减速场分析仪(RFA)可用作二维角分辨光电子能量分析仪(Kanayama等,1989)。然而,传统三栅格RFA的典型分辨力(E / E)为100(Taylor,1969),对于光电子衍射或光电子全息术来说太低了(Matsushita等,2010)。我们之前报道了一种增强E / E的栅格排列(Muro等,2017)。在改进的排列中,第一和第二栅格之间的距离比第二和第三个栅格之间的距离长得多,如图1(a)所示,而在大多数传统RFA中,这些距离是相同的。采用改进布置在 SPring-8 的 BL25SU(Senba 等人,2016 年)上开发的 RFA 显示 E / E 为 1100(Muro 等人,2017 年)。第一、第二和第三个栅格的半径分别为 12、40 和 42 毫米。第二个栅格即减速栅格使用目数为 250 的编织钨网。光电子接受角为 49 度,受图 1(a)所示探测器直径的限制。我们的模拟还预测,当网状减速栅格被部分球壳(如带有径向圆柱孔的圆顶)取代时,E / E 可以进一步增强,如图 1(b)所示。以下我们将这样的栅格称为有孔栅格。试验性制作了一个开孔面积较小的网格,对应接收角为7°,圆柱直径为60 mm,深度即球壳厚度为100 mm,相邻两个孔中心位置之间的距离即孔距为100 mm,球壳内半径为40 mm,与网状减速网格相同。装有该网格的RFA
Anja Irmisch 1,* ,Ximena Bonilla 2,3,4,5,* ,Stéphane Chevrier 6,* ,Kjong-Van Lehmann 2,3,4,5,* ,Franziska Singer 4,7,* ,Nora C Toussaint 4,7,* ,Cinzia Esposito 8,* ,Julien Mena 9,* ,Emanuela S Milani 10,* ,Ruben Casanova 6,* ,Daniel J Stekhoven 4,7,* ,Rebekka Wegmann 9,* ,Francis Jacob 11,* ,Bettina Sobottka 12,* ,Sandra Goetze 10,* ,Jack Kuipers 13,* ,Jacobo Sarabia del Castillo 8,*,Michael Prummer 7,Mustafa Tuncel 13,Ulrike Menzel 13,Andrea Jacobs 6,Stefanie Engler 6,Sujana Sivapatham 6,Anja frei 12,Gabriele Gut 8,Gabriele Gut 8,Joanna Ficek 2,Reinhard Dummer 1,Reinhard Dummer 1,肿瘤bac bac bac bac bue the+ beeren+ rudolf beerer+ Beisel 13,+,Bernd Bodenmiller 6,+,Viktor H Koelzer 12,+,Holger Moch 12,+,Lucas Pelkmans 8,+,Berend Snijder 9,+,Markus Tolnay 15,+,Bernd Wollscheid 10,+ 2,3,4,5,+,= ,米切尔·勒维斯克 1,+,=